EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000003986 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3353 bases
Position: chrLWHD01000082.1:1334374-1337726
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000005263	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	2.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000005355	-	864	-	ENSKMAP00000005263	287 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.857	ENSG00000152464	RPP38	88	47.651	Homo_sapiens
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	63.019	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	64.388	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.935	ENSAMEG00000018832	RPP38	88	40.856	Ailuropoda_melanoleuca
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	69.884	ENSACIG00000011592	rpp38	93	70.270	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	61.151	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	61.512	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	64.751	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	65.328	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	62.593	ENSATEG00000000731	rpp38	93	61.069	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.923	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	39.313	Anas_platyrhynchos
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	67.704	ENSACLG00000016962	rpp38	91	67.315	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.093	ENSACLG00000016958	rpp38	91	67.704	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.961	ENSAMXG00000025023	rpp38	88	42.248	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.424	ENSBTAG00000007702	RPP38	88	41.241	Bos_taurus
ENSKMAG00000003986	rpp38	95	42.143	ENSCAFG00000024373	RPP38	88	41.065	Canis_familiaris
ENSKMAG00000003986	rpp38	95	42.143	ENSCAFG00020008008	RPP38	88	41.065	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.045	ENSCHIG00000012484	RPP38	88	40.876	Capra_hircus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	43.110	ENSCPOG00000003981	RPP38	88	43.609	Cavia_porcellus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	42.254	ENSCLAG00000010194	RPP38	88	42.007	Chinchilla_lanigera
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	43.223	ENSCSAG00000019055	RPP38	88	44.318	Chlorocebus_sabaeus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	42.349	ENSCHOG00000004335	RPP38	88	42.697	Choloepus_hoffmanni
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.860	ENSCGRG00001001395	Rpp38	87	41.085	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.860	ENSCGRG00000017441	Rpp38	87	41.085	Cricetulus_griseus_crigri
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	61.686	ENSCSEG00000001721	rpp38	92	61.450	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	59.551	ENSCVAG00000001676	rpp38	91	59.176	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	47.510	ENSDARG00000040350	rpp38	89	48.077	Danio_rerio
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	39.286	ENSDNOG00000040314	RPP38	88	40.672	Dasypus_novemcinctus
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	41.697	ENSDORG00000009783	Rpp38	87	41.699	Dipodomys_ordii
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.509	ENSETEG00000002839	RPP38	88	38.745	Echinops_telfairi
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.304	ENSEASG00005019783	RPP38	87	41.065	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000003986	rpp38	96	40.559	ENSEEUG00000014677	RPP38	88	40.149	Erinaceus_europaeus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	50.357	ENSELUG00000010160	rpp38	92	49.643	Esox_lucius
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	40.977	ENSFCAG00000022449	RPP38	88	40.234	Felis_catus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.146	ENSFALG00000014804	RPP38	88	42.636	Ficedula_albicollis
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	40.959	ENSFDAG00000018669	RPP38	88	41.339	Fukomys_damarensis
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	62.313	ENSFHEG00000013741	rpp38	91	63.060	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	44.106	ENSGALG00000008794	RPP38	86	44.106	Gallus_gallus
ENSKMAG00000003986	rpp38	53	67.105	ENSGACG00000009258	rpp38	92	67.105	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.482	ENSHBUG00000010937	rpp38	91	68.093	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.901	ENSHGLG00000012144	RPP38	88	42.007	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	45.560	ENSIPUG00000022879	rpp38	90	45.038	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	40.520	ENSSTOG00000025699	RPP38	85	41.948	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	44.737	ENSJJAG00000007523	Rpp38	89	43.130	Jaculus_jaculus
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	67.286	ENSLBEG00000006853	rpp38	92	65.019	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000003986	rpp38	87	41.045	ENSLACG00000006502	RPP38	88	40.824	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	44.569	ENSLOCG00000018347	rpp38	90	43.511	Lepisosteus_oculatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.319	ENSLAFG00000000509	RPP38	88	42.379	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	42.857	ENSMMUG00000007679	RPP38	88	43.939	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000003986	rpp38	91	63.396	ENSMAMG00000012774	rpp38	90	62.308	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.482	ENSMZEG00005003189	rpp38	91	68.093	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.093	ENSMZEG00005003200	rpp38	91	67.704	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	43.295	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	43.295	Meleagris_gallopavo
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	40.684	ENSMAUG00000003644	Rpp38	87	40.152	Mesocricetus_auratus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.963	ENSMOCG00000007020	Rpp38	88	42.642	Microtus_ochrogaster
ENSKMAG00000003986	rpp38	94	56.667	ENSMMOG00000003446	rpp38	91	57.634	Mola_mola
ENSKMAG00000003986	rpp38	91	40.520	ENSMODG00000024091	RPP38	90	38.258	Monodelphis_domestica
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	60.791	ENSMALG00000002356	rpp38	92	61.423	Monopterus_albus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	43.446	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	88	43.561	Mus_caroli
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.697	ENSMUSG00000049950	Rpp38	88	42.803	Mus_musculus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	44.151	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	43.939	Mus_pahari
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.322	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	42.424	Mus_spretus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.091	ENSMPUG00000018523	RPP38	88	40.385	Mustela_putorius_furo
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	40.441	ENSMLUG00000002153	RPP38	88	41.379	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	44.944	ENSNGAG00000011066	Rpp38	88	45.522	Nannospalax_galili
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.482	ENSNBRG00000006994	rpp38	92	68.482	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.093	ENSONIG00000020467	rpp38	90	68.093	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000003986	rpp38	87	41.502	ENSOCUG00000024367	-	87	42.520	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000003986	rpp38	87	40.239	ENSOCUG00000022768	-	87	42.126	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	64.479	ENSORLG00000009219	rpp38	92	64.479	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	65.385	ENSORLG00020011503	rpp38	88	65.385	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	63.462	ENSORLG00015017702	rpp38	88	63.462	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	62.791	ENSOMEG00000005414	rpp38	91	62.835	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.912	ENSOGAG00000008059	RPP38	88	41.797	Otolemur_garnettii
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.424	ENSOARG00000004534	RPP38	88	41.241	Ovis_aries
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	42.806	ENSPPAG00000041577	RPP38	80	43.295	Pan_paniscus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	40.977	ENSPPRG00000015329	RPP38	88	40.234	Panthera_pardus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	40.580	ENSPTIG00000007188	RPP38	88	40.234	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	43.609	ENSPTRG00000002318	RPP38	80	43.295	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	46.642	ENSPKIG00000025652	rpp38	89	45.769	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	39.068	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	38.868	Pelodiscus_sinensis
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.803	ENSPEMG00000008375	Rpp38	88	42.803	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSKMAG00000003986	rpp38	96	43.554	ENSPCIG00000009096	RPP38	85	43.561	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000003986	rpp38	74	61.792	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	60.396	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	58.484	ENSPLAG00000007626	rpp38	92	58.427	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	52.809	ENSPMEG00000020392	rpp38	91	53.558	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	59.636	ENSPREG00000017744	rpp38	93	59.542	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	42.446	ENSPPYG00000002113	RPP38	88	42.748	Pongo_abelii
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	42.029	ENSPVAG00000007155	RPP38	88	41.948	Pteropus_vampyrus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	68.482	ENSPNYG00000004293	rpp38	91	68.093	Pundamilia_nyererei
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	43.359	ENSPNAG00000010633	rpp38	90	43.629	Pygocentrus_nattereri
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	44.118	ENSRNOG00000038025	Rpp38	88	45.385	Rattus_norvegicus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	39.416	ENSSHAG00000015529	RPP38	90	39.394	Sarcophilus_harrisii
ENSKMAG00000003986	rpp38	92	59.851	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	59.004	Scophthalmus_maximus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	62.835	ENSSDUG00000001651	rpp38	92	64.202	Seriola_dumerili
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	66.406	ENSSLDG00000014355	rpp38	92	66.406	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	39.245	ENSSARG00000012099	RPP38	87	37.647	Sorex_araneus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	43.273	ENSSPUG00000005237	-	89	43.561	Sphenodon_punctatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	91	40.892	ENSSPUG00000008560	-	90	40.530	Sphenodon_punctatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	43.636	ENSSPUG00000018363	-	89	43.939	Sphenodon_punctatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	90	59.690	ENSSPAG00000020387	rpp38	91	58.621	Stegastes_partitus
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	43.273	ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.221	Sus_scrofa
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.923	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	42.636	Taeniopygia_guttata
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	58.519	ENSTNIG00000001334	rpp38	92	58.779	Tetraodon_nigroviridis
ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.697	ENSTTRG00000004420	RPP38	88	41.729	Tursiops_truncatus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	42.500	ENSUAMG00000002618	RPP38	88	40.530	Ursus_americanus
ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.993	ENSUMAG00000012382	RPP38	88	42.023	Ursus_maritimus
ENSKMAG00000003986	rpp38	95	40.141	ENSVVUG00000005272	RPP38	88	40.769	Vulpes_vulpes
ENSKMAG00000003986	rpp38	91	39.850	ENSXETG00000003419	rpp38	91	39.615	Xenopus_tropicalis