EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000007622 (Gene tree)
Gene ID: 108239000
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4187 bases
Position: chrLWHD01000059.1:404782-408968
Accession: 108239000
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000010144	RRM_1	PF00076.22	9.2e-15	1	2
ENSKMAP00000010144	RRM_1	PF00076.22	9.2e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000010306	-	2059	XM_017421424	ENSKMAP00000010144	449 (aa)	XP_017276913	UPI0007F8938B

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.368	ENSG00000102241	HTATSF1	100	57.490	Homo_sapiens
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	81.195	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	81.195	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.819	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	85.022	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	79.739	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	80.392	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	80.921	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	81.140	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000007622	htatsf1	93	83.254	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	83.254	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	92	62.381	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.619	Anas_platyrhynchos
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	62.432	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.199	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.159	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	83.260	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	70.065	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	70.563	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	57.207	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	61.735	Bos_taurus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	77	38.418	WBGene00022025	Y65B4A.1	76	37.853	Caenorhabditis_elegans
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.910	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	56	60.225	Canis_familiaris
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.910	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	55	60.225	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000007622	htatsf1	95	59.310	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	50	64.541	Carlito_syrichta
ENSKMAG00000007622	htatsf1	80	63.957	ENSCCAG00000025329	-	57	61.962	Cebus_capucinus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.594	ENSCATG00000029963	HTATSF1	55	59.594	Cercocebus_atys
ENSKMAG00000007622	htatsf1	91	60.714	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	51	60.890	Chinchilla_lanigera
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.594	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	55	59.594	Chlorocebus_sabaeus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	61.404	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	61.422	Chrysemys_picta_bellii
ENSKMAG00000007622	htatsf1	84	44.882	ENSCING00000005914	-	91	44.619	Ciona_intestinalis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	92	43.411	ENSCSAVG00000000371	-	78	42.377	Ciona_savignyi
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.819	ENSCANG00000028495	HTATSF1	55	59.819	Colobus_angolensis_palliatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	83.073	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	85.301	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	68.043	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	68.261	Danio_rerio
ENSKMAG00000007622	htatsf1	78	46.067	FBgn0037081	barc	62	46.328	Drosophila_melanogaster
ENSKMAG00000007622	htatsf1	94	52.425	ENSEBUG00000001534	htatsf1	86	52.425	Eptatretus_burgeri
ENSKMAG00000007622	htatsf1	95	60.321	ENSEASG00005003440	HTATSF1	53	60.321	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	95	60.321	ENSECAG00000009156	HTATSF1	54	60.364	Equus_caballus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	64.655	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	65.517	Esox_lucius
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.009	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	56	59.009	Felis_catus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	60.430	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	60.430	Ficedula_albicollis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	95	59.453	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	55	59.132	Fukomys_damarensis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.588	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	85.588	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	75.616	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	75.616	Gadus_morhua
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	61.572	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	62.445	Gallus_gallus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	84.187	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	84.187	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	78.667	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	78.667	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.368	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	55	59.594	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	81.938	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	83.040	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	68.597	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	69.933	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	64.842	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	67.300	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.096	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.721	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	78.289	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.289	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	62.168	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.947	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	47.046	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	46.234	Lepisosteus_oculatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.326	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.183	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.594	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	55	59.594	Macaca_fascicularis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.594	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	55	59.594	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.594	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	61	59.594	Macaca_nemestrina
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.594	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	55	59.594	Mandrillus_leucophaeus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	79.688	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	80.134	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.159	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	83.260	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000007622	htatsf1	93	62.617	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	97	62.383	Meleagris_gallopavo
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.706	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.557	Mesocricetus_auratus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	62.434	ENSMICG00000009348	HTATSF1	50	63.131	Microcebus_murinus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.706	ENSMOCG00000023007	-	50	65.306	Microtus_ochrogaster
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	79.065	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	79.065	Mola_mola
ENSKMAG00000007622	htatsf1	57	60.076	ENSMODG00000000199	-	91	58.264	Monodelphis_domestica
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	62.500	ENSMODG00000014087	-	98	62.500	Monodelphis_domestica
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	79.510	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	79.510	Monopterus_albus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.706	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	65.561	Mus_caroli
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.459	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	55	59.775	Mustela_putorius_furo
ENSKMAG00000007622	htatsf1	94	58.904	ENSMLUG00000028418	-	55	58.904	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	95	58.295	ENSMLUG00000009234	-	57	58.430	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.439	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.051	Nannospalax_galili
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.159	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	83.260	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.819	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	55	59.819	Nomascus_leucogenys
ENSKMAG00000007622	htatsf1	94	61.072	ENSMEUG00000004133	-	92	64.411	Notamacropus_eugenii
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.599	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	83.700	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	91	59.666	ENSOANG00000011674	-	99	59.666	Ornithorhynchus_anatinus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	58.916	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	55	58.916	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	80.837	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	81.057	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	79.825	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	80.263	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	80.617	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	81.057	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	81.678	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	81.457	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.368	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	55	59.594	Pan_paniscus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.234	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	64.631	Panthera_pardus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	86	59.794	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	51	59.794	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.368	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	55	59.594	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	67.686	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	67.686	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000007622	htatsf1	73	68.060	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	95	67.442	Pelodiscus_sinensis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	73.894	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	73.894	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	90	62.319	ENSPCIG00000030173	-	91	62.319	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	56.291	ENSPCIG00000018896	-	99	56.291	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.078	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	85.078	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	84.855	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	84.855	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.301	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	85.301	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.078	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	85.078	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.819	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	55	59.819	Pongo_abelii
ENSKMAG00000007622	htatsf1	84	59.115	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	51	59.375	Procavia_capensis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.864	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	55	59.864	Propithecus_coquereli
ENSKMAG00000007622	htatsf1	85	63.427	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	63.427	Pteropus_vampyrus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.379	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	83.480	Pundamilia_nyererei
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	68.017	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	70.905	Pygocentrus_nattereri
ENSKMAG00000007622	htatsf1	96	59.594	ENSRROG00000021939	HTATSF1	55	59.594	Rhinopithecus_roxellana
ENSKMAG00000007622	htatsf1	94	58.588	ENSSBOG00000017914	-	54	58.865	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	88	64.339	ENSSHAG00000006440	-	100	64.339	Sarcophilus_harrisii
ENSKMAG00000007622	htatsf1	98	60.352	ENSSHAG00000018908	-	97	60.352	Sarcophilus_harrisii
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	61.064	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.006	Scleropages_formosus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	76.419	ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	76.856	Scophthalmus_maximus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	77.283	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	76.615	Seriola_dumerili
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	81.514	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.514	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	92	57.309	ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	57.309	Sorex_araneus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	58.734	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	59.519	Sphenodon_punctatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.857	ENSSPAG00000000732	htatsf1	100	83.077	Stegastes_partitus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	63.733	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	55.464	Sus_scrofa
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	60.738	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	61.087	Taeniopygia_guttata
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	78.000	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	78.222	Takifugu_rubripes
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	76.169	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.169	Tetraodon_nigroviridis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	78	63.889	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	62.570	Tursiops_truncatus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.459	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	56	59.775	Ursus_americanus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.459	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	55	59.775	Ursus_maritimus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.459	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	55	59.459	Vulpes_vulpes
ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	58.991	ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.590	Xenopus_tropicalis
ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	82.719	ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	82.719	Xiphophorus_couchianus
ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	84.633	ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	84.633	Xiphophorus_maculatus