EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000007880 (Gene tree)
Gene ID: 108241745
Gene Symbol: gemin2
Alias: sip1|wu:fc52a05|zgc:110274
Full Name: gem nuclear organelle associated protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2631 bases
Position: chrLWHD01000090.1:924551-927181
Accession: 108241745
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000010517	SIP1	PF04938.12	2.3e-75	1	1
ENSKMAP00000010537	SIP1	PF04938.12	2.2e-66	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000010699	-	795	-	ENSKMAP00000010537	264 (aa)	-	-
ENSKMAT00000010679	-	1266	XM_017426123	ENSKMAP00000010517	266 (aa)	XP_017281612	UPI0007F89B19

Gene Model

Click here to download ENSKMAG00000007880's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
kmr03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSKMAG00000007880's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSG00000092208	GEMIN2	95	76.190	Homo_sapiens
ENSKMAG00000007880	gemin2	50	90.299	ENSAPOG00000012870	gemin2	82	90.299	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.283	ENSAMEG00000003856	GEMIN2	94	65.283	Ailuropoda_melanoleuca
ENSKMAG00000007880	gemin2	97	84.884	ENSACIG00000014430	gemin2	95	84.884	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	88.722	ENSAOCG00000012349	gemin2	100	88.722	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	88.346	ENSAPEG00000002529	gemin2	100	88.346	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	81.955	ENSATEG00000009574	gemin2	100	81.955	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000007880	gemin2	86	64.192	ENSAPLG00000012052	GEMIN2	99	64.192	Anas_platyrhynchos
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	62.264	ENSACAG00000015872	GEMIN2	98	62.264	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	49.813	ENSANAG00000026213	GEMIN2	96	49.813	Aotus_nancymaae
ENSKMAG00000007880	gemin2	91	84.647	ENSACLG00000024473	gemin2	99	80.556	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	67.557	ENSAMXG00000033969	gemin2	100	67.557	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.394	ENSBTAG00000020930	GEMIN2	93	64.394	Bos_taurus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.015	ENSCJAG00000016248	GEMIN2	94	64.015	Callithrix_jacchus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSCAFG00000013859	GEMIN2	97	65.152	Canis_familiaris
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSCAFG00020022243	GEMIN2	97	65.152	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSCHIG00000009881	GEMIN2	97	65.152	Capra_hircus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	63.359	ENSTSYG00000032612	-	98	63.359	Carlito_syrichta
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.530	ENSTSYG00000003528	-	93	65.530	Carlito_syrichta
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	57.854	ENSCPOG00000011338	GEMIN2	97	57.854	Cavia_porcellus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSCCAG00000035944	GEMIN2	94	64.773	Cebus_capucinus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	50.190	ENSCCAG00000030361	-	89	50.190	Cebus_capucinus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSCATG00000042473	GEMIN2	97	64.773	Cercocebus_atys
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	46.591	ENSCATG00000031373	-	91	46.591	Cercocebus_atys
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	63.636	ENSCLAG00000008967	GEMIN2	98	63.636	Chinchilla_lanigera
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	46.212	ENSCSAG00000016872	-	92	46.212	Chlorocebus_sabaeus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	53.788	ENSCHOG00000011644	GEMIN2	94	53.788	Choloepus_hoffmanni
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSCPBG00000026207	GEMIN2	99	64.773	Chrysemys_picta_bellii
ENSKMAG00000007880	gemin2	88	32.975	ENSCING00000012240	-	85	32.975	Ciona_intestinalis
ENSKMAG00000007880	gemin2	89	34.058	ENSCSAVG00000009875	-	85	34.058	Ciona_savignyi
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSCANG00000035266	GEMIN2	94	64.773	Colobus_angolensis_palliatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	45.833	ENSCANG00000033060	-	87	45.833	Colobus_angolensis_palliatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSCGRG00001017720	Gemin2	97	65.152	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSCGRG00000007060	Gemin2	97	65.152	Cricetulus_griseus_crigri
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	74.436	ENSCSEG00000016057	gemin2	100	74.436	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	83.137	ENSCVAG00000003125	gemin2	100	83.137	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	67.547	ENSDARG00000015638	gemin2	100	67.547	Danio_rerio
ENSKMAG00000007880	gemin2	75	62.121	ENSDNOG00000018278	GEMIN2	89	62.121	Dasypus_novemcinctus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.394	ENSDORG00000003814	Gemin2	97	64.394	Dipodomys_ordii
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.286	ENSETEG00000006463	GEMIN2	94	64.286	Echinops_telfairi
ENSKMAG00000007880	gemin2	87	42.797	ENSEBUG00000002198	gemin2	77	43.830	Eptatretus_burgeri
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSEASG00005007617	GEMIN2	93	64.773	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	64.961	ENSECAG00000007554	GEMIN2	84	64.961	Equus_caballus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	59.848	ENSEEUG00000008438	GEMIN2	94	59.848	Erinaceus_europaeus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	70.412	ENSELUG00000005266	gemin2	100	70.412	Esox_lucius
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSFCAG00000029921	GEMIN2	94	64.773	Felis_catus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.394	ENSFALG00000006169	GEMIN2	93	64.394	Ficedula_albicollis
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	62.738	ENSFDAG00000001562	GEMIN2	97	62.738	Fukomys_damarensis
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	80.899	ENSFHEG00000020705	gemin2	100	80.899	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000007880	gemin2	89	74.468	ENSGMOG00000009379	gemin2	99	74.468	Gadus_morhua
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.151	ENSGALG00000010154	GEMIN2	99	64.151	Gallus_gallus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	76.208	ENSGAFG00000019641	gemin2	100	76.208	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	83.083	ENSGACG00000012444	gemin2	99	83.083	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	88	63.675	ENSGAGG00000003982	GEMIN2	98	63.675	Gopherus_agassizii
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	55.303	ENSGGOG00000016691	GEMIN2	92	55.303	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	46.212	ENSGGOG00000043428	-	78	46.212	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	86.842	ENSHBUG00000016285	gemin2	100	86.842	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	63.878	ENSHGLG00000004890	GEMIN2	97	63.878	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	63.878	ENSHGLG00100009949	GEMIN2	97	63.878	Heterocephalus_glaber_male
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	78.947	ENSHCOG00000012786	gemin2	100	78.947	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000007880	gemin2	97	68.482	ENSIPUG00000012821	gemin2	100	68.482	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.660	ENSSTOG00000006357	GEMIN2	97	65.660	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSJJAG00000022975	Gemin2	97	65.152	Jaculus_jaculus
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	70.866	ENSLBEG00000022377	gemin2	100	70.866	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.918	ENSLACG00000004723	GEMIN2	100	65.918	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	67.170	ENSLOCG00000009221	gemin2	99	67.170	Lepisosteus_oculatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.019	ENSLAFG00000010321	GEMIN2	97	65.019	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSMFAG00000014362	GEMIN2	94	64.773	Macaca_fascicularis
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	47.529	ENSMFAG00000003283	-	89	47.529	Macaca_fascicularis
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSMMUG00000021028	GEMIN2	97	64.773	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	48.289	ENSMMUG00000001073	-	87	48.289	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSMNEG00000033286	GEMIN2	97	64.773	Macaca_nemestrina
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	48.289	ENSMNEG00000033555	-	89	48.289	Macaca_nemestrina
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	45.833	ENSMLEG00000008946	-	89	45.833	Mandrillus_leucophaeus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSMLEG00000035575	GEMIN2	94	64.773	Mandrillus_leucophaeus
ENSKMAG00000007880	gemin2	96	79.688	ENSMAMG00000012985	gemin2	99	79.688	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	86.090	ENSMZEG00005007915	gemin2	100	86.090	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000007880	gemin2	86	64.629	ENSMGAG00000012566	GEMIN2	99	64.629	Meleagris_gallopavo
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSMAUG00000017447	Gemin2	97	64.773	Mesocricetus_auratus
ENSKMAG00000007880	gemin2	97	65.504	ENSMICG00000004811	-	90	65.504	Microcebus_murinus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	51.321	ENSMICG00000043979	-	96	51.321	Microcebus_murinus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	65.019	ENSMOCG00000023031	Gemin2	97	65.019	Microtus_ochrogaster
ENSKMAG00000007880	gemin2	94	85.542	ENSMMOG00000004604	gemin2	91	85.542	Mola_mola
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	66.288	ENSMODG00000011946	GEMIN2	99	66.288	Monodelphis_domestica
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	83.083	ENSMALG00000021507	gemin2	100	83.083	Monopterus_albus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	63.740	MGP_CAROLIEiJ_G0017777	Gemin2	97	63.740	Mus_caroli
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	63.740	ENSMUSG00000060121	Gemin2	97	63.740	Mus_musculus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	63.740	MGP_PahariEiJ_G0029533	Gemin2	97	63.740	Mus_pahari
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	63.359	MGP_SPRETEiJ_G0018622	Gemin2	97	63.359	Mus_spretus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	65.517	ENSMPUG00000016240	GEMIN2	96	65.517	Mustela_putorius_furo
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	62.030	ENSMLUG00000002619	GEMIN2	99	62.030	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	64.885	ENSNGAG00000001053	Gemin2	97	64.885	Nannospalax_galili
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSNLEG00000004013	GEMIN2	96	64.773	Nomascus_leucogenys
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	59.921	ENSMEUG00000011734	-	92	59.921	Notamacropus_eugenii
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	58.333	ENSOPRG00000007714	GEMIN2	93	58.333	Ochotona_princeps
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	63.636	ENSODEG00000000272	GEMIN2	97	63.636	Octodon_degus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	85.714	ENSONIG00000019495	gemin2	100	85.714	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000007880	gemin2	97	63.707	ENSOANG00000014013	-	94	63.707	Ornithorhynchus_anatinus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	61.069	ENSOCUG00000000673	GEMIN2	93	61.364	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	72.830	ENSORLG00000017666	gemin2	100	72.830	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	77.736	ENSORLG00020016613	gemin2	100	77.736	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	78.113	ENSORLG00015013224	gemin2	100	78.113	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	80.377	ENSOMEG00000011576	gemin2	100	80.377	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSOGAG00000007906	GEMIN2	93	64.773	Otolemur_garnettii
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.906	ENSOARG00000008466	GEMIN2	93	64.906	Ovis_aries
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	59.286	ENSPPAG00000043467	GEMIN2	94	59.286	Pan_paniscus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	47.348	ENSPPAG00000033797	-	79	51.261	Pan_paniscus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSPPRG00000009485	GEMIN2	94	64.773	Panthera_pardus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSPTIG00000018115	GEMIN2	97	64.773	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	47.348	ENSPTRG00000045455	-	78	47.348	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSPTRG00000006291	GEMIN2	93	64.773	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	46.591	ENSPANG00000034146	-	89	46.591	Papio_anubis
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	53.409	ENSPANG00000011343	-	94	53.409	Papio_anubis
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	70.943	ENSPKIG00000010339	gemin2	100	70.943	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.015	ENSPSIG00000013560	GEMIN2	87	64.015	Pelodiscus_sinensis
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	75.379	ENSPMGG00000008763	gemin2	100	75.379	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSPEMG00000008079	Gemin2	97	64.773	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSKMAG00000007880	gemin2	83	52.066	ENSPMAG00000009804	gemin2	91	52.066	Petromyzon_marinus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	66.288	ENSPCIG00000025754	GEMIN2	79	66.288	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	82.836	ENSPFOG00000014660	gemin2	100	82.836	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	83.146	ENSPLAG00000020265	gemin2	100	83.146	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	82.397	ENSPMEG00000011134	gemin2	100	82.397	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	78.277	ENSPREG00000007692	gemin2	100	78.277	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSPPYG00000005764	GEMIN2	94	64.773	Pongo_abelii
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	56.107	ENSPCAG00000005387	GEMIN2	93	56.107	Procavia_capensis
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	60.606	ENSPCOG00000016964	GEMIN2	93	60.606	Propithecus_coquereli
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	64.961	ENSPVAG00000002586	GEMIN2	95	64.961	Pteropus_vampyrus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	86.090	ENSPNYG00000022626	gemin2	100	86.090	Pundamilia_nyererei
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	69.663	ENSPNAG00000017346	gemin2	100	69.663	Pygocentrus_nattereri
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	64.504	ENSRNOG00000004360	Gemin2	97	64.504	Rattus_norvegicus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSRBIG00000034601	GEMIN2	97	64.773	Rhinopithecus_bieti
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	43.083	ENSRBIG00000038026	-	85	43.083	Rhinopithecus_bieti
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.773	ENSRROG00000042627	GEMIN2	94	64.773	Rhinopithecus_roxellana
ENSKMAG00000007880	gemin2	95	64.706	ENSSBOG00000022280	GEMIN2	97	64.706	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSKMAG00000007880	gemin2	59	60.256	ENSSHAG00000000156	-	95	60.256	Sarcophilus_harrisii
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	71.483	ENSSFOG00015012315	gemin2	99	71.483	Scleropages_formosus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	81.579	ENSSMAG00000011151	gemin2	100	81.579	Scophthalmus_maximus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	86.090	ENSSDUG00000017275	gemin2	100	86.090	Seriola_dumerili
ENSKMAG00000007880	gemin2	96	85.547	ENSSLDG00000023429	gemin2	98	85.547	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSKMAG00000007880	gemin2	94	63.889	ENSSARG00000010294	GEMIN2	93	63.889	Sorex_araneus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	59.023	ENSSPUG00000017222	GEMIN2	99	59.023	Sphenodon_punctatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	87.594	ENSSPAG00000001354	gemin2	100	87.594	Stegastes_partitus
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	64.615	ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	63.878	Sus_scrofa
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.151	ENSTGUG00000012039	GEMIN2	99	64.151	Taeniopygia_guttata
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	74.812	ENSTRUG00000021760	gemin2	98	74.812	Takifugu_rubripes
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	77.820	ENSTNIG00000016875	gemin2	100	77.820	Tetraodon_nigroviridis
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	66.792	ENSTBEG00000002654	GEMIN2	94	66.792	Tupaia_belangeri
ENSKMAG00000007880	gemin2	98	56.061	ENSTTRG00000017126	GEMIN2	93	56.061	Tursiops_truncatus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.660	ENSUAMG00000021811	GEMIN2	97	65.660	Ursus_americanus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSUMAG00000008366	GEMIN2	97	65.152	Ursus_maritimus
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	64.639	ENSVPAG00000006856	GEMIN2	93	64.639	Vicugna_pacos
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.152	ENSVVUG00000020954	GEMIN2	93	65.152	Vulpes_vulpes
ENSKMAG00000007880	gemin2	99	65.019	ENSXETG00000000298	gemin2	96	65.019	Xenopus_tropicalis
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	77.903	ENSXCOG00000014021	gemin2	100	77.903	Xiphophorus_couchianus
ENSKMAG00000007880	gemin2	100	77.736	ENSXMAG00000009532	gemin2	100	77.736	Xiphophorus_maculatus