EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000012408 (Gene tree)
Gene ID: 108231474
Gene Symbol: mars
Alias: id:ibd5106
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22026 bases
Position: chrLWHD01000012.1:1620227-1642252
Accession: 108231474
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000016741	tRNA-synt_1g	PF09334.11	1.4e-150	1	1
ENSKMAP00000016702	tRNA-synt_1g	PF09334.11	1.8e-150	1	1
ENSKMAP00000016669	tRNA-synt_1g	PF09334.11	1.8e-150	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000016903	-	4132	XM_017408535	ENSKMAP00000016669	928 (aa)	XP_017264024	UPI0007F8C56B
ENSKMAT00000016936	-	3123	XM_017408536	ENSKMAP00000016702	919 (aa)	XP_017264025	UPI0007F8D8A4
ENSKMAT00000016975	-	2511	-	ENSKMAP00000016741	836 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSKMAG00000012408's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
kmr00450	Selenocompound metabolism	KEGG
kmr00970	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSKMAG00000012408's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSG00000166986	MARS	99	62.907	Homo_sapiens
ENSKMAG00000012408	mars	100	86.961	ENSAPOG00000020238	mars	99	86.961	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000012408	mars	99	65.264	ENSAMEG00000004962	MARS	99	63.774	Ailuropoda_melanoleuca
ENSKMAG00000012408	mars	99	86.402	ENSACIG00000016271	mars	100	86.111	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000012408	mars	100	87.160	ENSAOCG00000011411	mars	99	87.160	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000012408	mars	100	86.853	ENSAPEG00000008610	mars	99	86.853	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000012408	mars	100	86.645	ENSATEG00000025019	mars	100	86.645	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000012408	mars	92	66.926	ENSAPLG00000014821	MARS	100	65.000	Anas_platyrhynchos
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.064	ENSACAG00000006698	MARS	99	60.984	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.226	ENSANAG00000027589	MARS	100	62.690	Aotus_nancymaae
ENSKMAG00000012408	mars	100	87.269	ENSACLG00000018937	mars	100	87.269	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000012408	mars	99	77.229	ENSAMXG00000017335	mars	100	69.687	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.106	ENSBTAG00000018405	MARS	99	62.622	Bos_taurus
ENSKMAG00000012408	mars	69	58.824	WBGene00003415	mars-1	85	58.824	Caenorhabditis_elegans
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.226	ENSCJAG00000007249	MARS	99	62.907	Callithrix_jacchus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.466	ENSCAFG00000000229	MARS	99	62.907	Canis_familiaris
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.466	ENSCAFG00020023661	MARS	99	62.907	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.226	ENSCHIG00000027023	MARS	99	62.730	Capra_hircus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.663	ENSTSYG00000005193	MARS	99	62.907	Carlito_syrichta
ENSKMAG00000012408	mars	91	60.654	ENSCAPG00000014448	MARS	99	61.024	Cavia_aperea
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.423	ENSCPOG00000012866	MARS	99	62.473	Cavia_porcellus
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.647	ENSCCAG00000032206	MARS	97	64.923	Cebus_capucinus
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.919	ENSCATG00000038907	MARS	99	62.826	Cercocebus_atys
ENSKMAG00000012408	mars	96	65.337	ENSCLAG00000012164	MARS	99	63.870	Chinchilla_lanigera
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.365	ENSCSAG00000004852	MARS	99	62.177	Chlorocebus_sabaeus
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.133	ENSCPBG00000017136	MARS	99	61.413	Chrysemys_picta_bellii
ENSKMAG00000012408	mars	71	63.062	ENSCING00000018550	-	99	59.249	Ciona_intestinalis
ENSKMAG00000012408	mars	68	64.675	ENSCSAVG00000006145	-	97	64.675	Ciona_savignyi
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.466	ENSCANG00000034583	MARS	99	63.124	Colobus_angolensis_palliatus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.346	ENSCGRG00001019238	Mars	99	62.907	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.346	ENSCGRG00000017321	Mars	99	62.907	Cricetulus_griseus_crigri
ENSKMAG00000012408	mars	99	84.736	ENSCSEG00000010816	mars	99	83.569	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000012408	mars	100	86.725	ENSCVAG00000009314	mars	99	86.616	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000012408	mars	99	74.548	ENSDARG00000034396	mars	97	72.688	Danio_rerio
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.346	ENSDNOG00000017502	MARS	99	62.581	Dasypus_novemcinctus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.988	ENSDORG00000007127	Mars	99	63.203	Dipodomys_ordii
ENSKMAG00000012408	mars	99	49.762	FBgn0034401	MetRS	87	48.026	Drosophila_melanogaster
ENSKMAG00000012408	mars	60	67.450	ENSETEG00000007106	MARS	99	67.089	Echinops_telfairi
ENSKMAG00000012408	mars	76	54.331	ENSEBUG00000010439	mars	97	54.331	Eptatretus_burgeri
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSEASG00005007208	MARS	99	63.341	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSECAG00000015175	MARS	99	63.341	Equus_caballus
ENSKMAG00000012408	mars	89	60.284	ENSEEUG00000015503	MARS	89	60.284	Erinaceus_europaeus
ENSKMAG00000012408	mars	99	79.376	ENSELUG00000010453	mars	100	76.882	Esox_lucius
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.931	ENSFCAG00000002083	MARS	99	63.499	Felis_catus
ENSKMAG00000012408	mars	100	61.388	ENSFDAG00000010217	MARS	99	61.497	Fukomys_damarensis
ENSKMAG00000012408	mars	99	88.462	ENSFHEG00000016374	mars	100	87.392	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000012408	mars	99	80.385	ENSGMOG00000007987	mars	100	78.152	Gadus_morhua
ENSKMAG00000012408	mars	99	62.275	ENSGALG00000039315	MARS	95	60.327	Gallus_gallus
ENSKMAG00000012408	mars	99	86.899	ENSGAFG00000013461	mars	100	82.397	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000012408	mars	99	85.938	ENSGACG00000006474	mars	100	83.896	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000012408	mars	95	66.667	ENSGAGG00000011640	MARS	97	65.017	Gopherus_agassizii
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSGGOG00000001982	MARS	99	62.907	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000012408	mars	91	92.449	ENSHBUG00000009575	mars	96	88.394	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000012408	mars	96	55.528	ENSHGLG00000019739	-	93	54.247	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSHGLG00000013493	MARS	100	62.907	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSHGLG00100006885	MARS	100	62.907	Heterocephalus_glaber_male
ENSKMAG00000012408	mars	96	54.410	ENSHGLG00100004906	-	93	53.228	Heterocephalus_glaber_male
ENSKMAG00000012408	mars	99	82.593	ENSHCOG00000001090	mars	100	80.978	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000012408	mars	99	73.976	ENSIPUG00000024410	mars	98	74.213	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000012408	mars	68	82.777	ENSIPUG00000024413	mars	98	79.008	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.625	ENSSTOG00000001128	MARS	99	61.972	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.866	ENSJJAG00000018827	Mars	99	62.690	Jaculus_jaculus
ENSKMAG00000012408	mars	100	85.745	ENSLBEG00000013609	mars	100	85.745	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000012408	mars	99	65.830	ENSLACG00000018854	MARS	99	64.208	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.106	ENSLAFG00000013525	MARS	99	62.405	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000012408	mars	100	64.005	ENSMFAG00000010123	MARS	99	63.232	Macaca_fascicularis
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSMMUG00000011277	MARS	99	63.124	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.505	ENSMNEG00000044464	MARS	99	62.148	Macaca_nemestrina
ENSKMAG00000012408	mars	89	71.253	ENSMLEG00000034638	MARS	99	67.134	Mandrillus_leucophaeus
ENSKMAG00000012408	mars	95	85.607	ENSMAMG00000010012	mars	97	84.122	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000012408	mars	100	87.051	ENSMZEG00005007092	mars	100	87.051	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.866	ENSMAUG00000011482	Mars	99	62.256	Mesocricetus_auratus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.586	ENSMICG00000032056	MARS	99	62.690	Microcebus_murinus
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.666	ENSMOCG00000010941	Mars	99	63.124	Microtus_ochrogaster
ENSKMAG00000012408	mars	100	82.656	ENSMMOG00000007461	mars	99	80.610	Mola_mola
ENSKMAG00000012408	mars	100	85.342	ENSMALG00000010005	mars	99	86.715	Monopterus_albus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.183	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.095	Mus_caroli
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.062	ENSMUSG00000040354	Mars	99	62.987	Mus_musculus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.183	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.771	Mus_pahari
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.183	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.095	Mus_spretus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.784	ENSMPUG00000001831	MARS	99	63.124	Mustela_putorius_furo
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.663	ENSMLUG00000001037	MARS	99	62.907	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.303	ENSNGAG00000018824	Mars	99	62.907	Nannospalax_galili
ENSKMAG00000012408	mars	93	88.626	ENSNBRG00000004105	mars	100	86.104	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.346	ENSNLEG00000017297	MARS	99	62.473	Nomascus_leucogenys
ENSKMAG00000012408	mars	89	64.933	ENSMEUG00000007195	MARS	99	63.365	Notamacropus_eugenii
ENSKMAG00000012408	mars	100	61.063	ENSOPRG00000006518	MARS	99	60.629	Ochotona_princeps
ENSKMAG00000012408	mars	99	65.024	ENSODEG00000001752	MARS	99	63.449	Octodon_degus
ENSKMAG00000012408	mars	100	86.853	ENSONIG00000005090	mars	100	86.853	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000012408	mars	79	63.964	ENSOANG00000013318	MARS	100	63.964	Ornithorhynchus_anatinus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.226	ENSOCUG00000007373	MARS	99	62.771	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000012408	mars	99	86.538	ENSORLG00000005405	mars	100	84.914	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000012408	mars	99	86.659	ENSORLG00020017397	mars	100	85.129	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000012408	mars	99	86.659	ENSORLG00015012976	mars	100	84.875	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000012408	mars	99	87.740	ENSOMEG00000018411	mars	100	85.991	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.723	ENSOGAG00000005226	MARS	100	61.946	Otolemur_garnettii
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.226	ENSOARG00000006477	MARS	99	62.581	Ovis_aries
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.723	ENSPPAG00000025147	MARS	99	62.975	Pan_paniscus
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.784	ENSPPRG00000023243	MARS	99	63.351	Panthera_pardus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.713	ENSPTIG00000006721	MARS	99	63.243	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.543	ENSPTRG00000005135	MARS	99	62.907	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.886	ENSPANG00000009140	MARS	99	63.124	Papio_anubis
ENSKMAG00000012408	mars	99	73.887	ENSPKIG00000002833	mars	100	72.234	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000012408	mars	80	45.946	ENSPSIG00000013607	MARS	99	41.046	Pelodiscus_sinensis
ENSKMAG00000012408	mars	99	84.053	ENSPMGG00000014847	mars	99	82.205	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSKMAG00000012408	mars	99	65.024	ENSPEMG00000000046	Mars	99	63.774	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.029	ENSPCIG00000023765	MARS	99	62.581	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000012408	mars	99	87.260	ENSPFOG00000006998	mars	100	85.991	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000012408	mars	99	87.500	ENSPLAG00000017870	mars	100	86.072	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000012408	mars	99	87.139	ENSPMEG00000008197	mars	100	85.854	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000012408	mars	99	86.899	ENSPREG00000008123	mars	100	85.637	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.423	ENSPPYG00000004691	MARS	99	62.798	Pongo_abelii
ENSKMAG00000012408	mars	88	65.994	ENSPCAG00000016037	MARS	88	63.520	Procavia_capensis
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.586	ENSPCOG00000017598	MARS	99	63.015	Propithecus_coquereli
ENSKMAG00000012408	mars	80	60.303	ENSPVAG00000012112	MARS	80	60.870	Pteropus_vampyrus
ENSKMAG00000012408	mars	100	86.616	ENSPNYG00000013809	mars	100	86.616	Pundamilia_nyererei
ENSKMAG00000012408	mars	99	78.193	ENSPNAG00000017290	mars	100	77.524	Pygocentrus_nattereri
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.183	ENSRNOG00000025459	Mars	99	62.798	Rattus_norvegicus
ENSKMAG00000012408	mars	99	63.658	ENSRBIG00000044782	MARS	99	62.500	Rhinopithecus_bieti
ENSKMAG00000012408	mars	100	63.799	ENSRROG00000042331	MARS	99	63.261	Rhinopithecus_roxellana
ENSKMAG00000012408	mars	70	52.284	YGR264C	MES1	78	52.284	Saccharomyces_cerevisiae
ENSKMAG00000012408	mars	100	60.476	ENSSBOG00000022875	MARS	99	60.130	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.868	ENSSHAG00000007182	MARS	99	63.015	Sarcophilus_harrisii
ENSKMAG00000012408	mars	99	73.735	ENSSFOG00015011038	mars	99	72.361	Scleropages_formosus
ENSKMAG00000012408	mars	99	86.058	ENSSMAG00000012409	mars	100	84.565	Scophthalmus_maximus
ENSKMAG00000012408	mars	99	88.822	ENSSDUG00000019070	mars	100	88.043	Seriola_dumerili
ENSKMAG00000012408	mars	99	88.849	ENSSLDG00000005561	mars	96	89.581	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSKMAG00000012408	mars	90	72.704	ENSSARG00000002477	MARS	92	67.629	Sorex_araneus
ENSKMAG00000012408	mars	89	63.235	ENSSPUG00000007756	MARS	99	68.519	Sphenodon_punctatus
ENSKMAG00000012408	mars	100	87.160	ENSSPAG00000022691	mars	100	87.160	Stegastes_partitus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.269	ENSSSCG00000023318	MARS	95	63.164	Sus_scrofa
ENSKMAG00000012408	mars	99	82.091	ENSTRUG00000014774	mars	100	80.522	Takifugu_rubripes
ENSKMAG00000012408	mars	99	78.099	ENSTNIG00000007060	mars	100	76.185	Tetraodon_nigroviridis
ENSKMAG00000012408	mars	74	63.079	ENSTBEG00000000303	MARS	87	62.583	Tupaia_belangeri
ENSKMAG00000012408	mars	76	69.540	ENSTTRG00000013088	MARS	75	69.154	Tursiops_truncatus
ENSKMAG00000012408	mars	56	57.962	ENSUAMG00000019284	-	94	58.174	Ursus_americanus
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.904	ENSUMAG00000019826	MARS	99	63.243	Ursus_maritimus
ENSKMAG00000012408	mars	64	72.549	ENSVPAG00000008665	MARS	66	72.549	Vicugna_pacos
ENSKMAG00000012408	mars	99	64.106	ENSVVUG00000017940	MARS	99	62.473	Vulpes_vulpes
ENSKMAG00000012408	mars	64	76.504	ENSXETG00000025174	mars	99	71.955	Xenopus_tropicalis
ENSKMAG00000012408	mars	99	87.349	ENSXCOG00000013878	mars	100	84.875	Xiphophorus_couchianus
ENSKMAG00000012408	mars	99	87.740	ENSXMAG00000017920	mars	100	86.422	Xiphophorus_maculatus