EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000013856 (Gene tree)
Gene ID: 108232767
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6042 bases
Position: chrLWHD01000002.1:1011888-1017929
Accession: 108232767
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000018648	SYF2	PF08231.12	5.8e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000018907	-	1902	XM_017410790	ENSKMAP00000018648	237 (aa)	XP_017266279	UPI0007F8A8F9

Gene Model

Click here to download ENSKMAG00000013856's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
kmr03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSKMAG00000013856's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	ENSG00000117614	SYF2	98	76.987	Homo_sapiens
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.597	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.132	ENSAMEG00000010115	-	99	76.132	Ailuropoda_melanoleuca
ENSKMAG00000013856	syf2	82	82.051	ENSAMEG00000010134	-	100	82.051	Ailuropoda_melanoleuca
ENSKMAG00000013856	syf2	99	91.489	ENSACIG00000023688	syf2	94	91.489	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	ENSAOCG00000022046	syf2	100	90.336	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000013856	syf2	93	90.498	ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.498	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	ENSAPEG00000018858	syf2	92	91.176	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.756	ENSATEG00000007745	syf2	100	92.857	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000013856	syf2	84	83.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.500	Anas_platyrhynchos
ENSKMAG00000013856	syf2	70	69.461	ENSACAG00000026777	-	100	69.461	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000013856	syf2	86	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.870	ENSANAG00000032473	SYF2	99	76.667	Aotus_nancymaae
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	ENSACLG00000019916	syf2	100	92.017	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000013856	syf2	100	82.773	ENSAMXG00000004051	syf2	100	82.773	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000013856	syf2	98	79.310	ENSBTAG00000001651	SYF2	97	79.310	Bos_taurus
ENSKMAG00000013856	syf2	88	52.857	WBGene00019402	syf-2	100	48.305	Caenorhabditis_elegans
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.870	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.569	Callithrix_jacchus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	72.532	ENSCAFG00000030331	-	99	72.532	Canis_familiaris
ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.481	ENSCAFG00000012895	-	96	77.119	Canis_familiaris
ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.481	ENSCAFG00020021091	-	96	77.119	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000013856	syf2	67	78.616	ENSCAFG00020021094	-	84	78.616	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000013856	syf2	98	78.879	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	77.178	Capra_hircus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.500	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.500	Carlito_syrichta
ENSKMAG00000013856	syf2	84	81.818	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	Cavia_aperea
ENSKMAG00000013856	syf2	100	77.869	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.869	Cavia_porcellus
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.870	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	76.667	Cebus_capucinus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	ENSCATG00000026917	SYF2	99	76.250	Cercocebus_atys
ENSKMAG00000013856	syf2	97	80.870	ENSCLAG00000008474	SYF2	93	80.870	Chinchilla_lanigera
ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.447	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	77.447	Chlorocebus_sabaeus
ENSKMAG00000013856	syf2	70	63.855	ENSCHOG00000005273	-	91	63.855	Choloepus_hoffmanni
ENSKMAG00000013856	syf2	96	82.018	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	80.591	Chrysemys_picta_bellii
ENSKMAG00000013856	syf2	89	54.460	ENSCING00000003017	-	89	54.930	Ciona_intestinalis
ENSKMAG00000013856	syf2	89	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSKMAG00000013856	syf2	99	67.500	ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.966	ENSCGRG00001020733	Syf2	96	77.966	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSKMAG00000013856	syf2	83	82.143	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	Cricetulus_griseus_crigri
ENSKMAG00000013856	syf2	92	88.532	ENSCSEG00000000117	syf2	99	85.654	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.632	ENSCVAG00000019543	syf2	100	92.050	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	82.773	ENSDARG00000004706	syf2	100	82.773	Danio_rerio
ENSKMAG00000013856	syf2	98	79.310	ENSDNOG00000047605	SYF2	93	79.310	Dasypus_novemcinctus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.390	ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.390	Dipodomys_ordii
ENSKMAG00000013856	syf2	95	55.263	FBgn0033556	CG12343	99	55.263	Drosophila_melanogaster
ENSKMAG00000013856	syf2	87	67.633	ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	Echinops_telfairi
ENSKMAG00000013856	syf2	83	58.883	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSKMAG00000013856	syf2	99	69.874	ENSEASG00005004232	-	99	69.874	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	79.487	ENSEASG00005004224	-	95	79.487	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.860	ENSECAG00000012023	-	99	76.860	Equus_caballus
ENSKMAG00000013856	syf2	95	80.702	ENSECAG00000010440	-	95	80.702	Equus_caballus
ENSKMAG00000013856	syf2	68	70.807	ENSEEUG00000015084	SYF2	88	70.807	Erinaceus_europaeus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	83.544	ENSELUG00000003465	syf2	99	83.544	Esox_lucius
ENSKMAG00000013856	syf2	99	79.237	ENSFCAG00000010324	-	81	79.237	Felis_catus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	78.632	ENSFCAG00000043095	-	95	78.632	Felis_catus
ENSKMAG00000013856	syf2	86	80.392	ENSFALG00000000460	SYF2	96	76.596	Ficedula_albicollis
ENSKMAG00000013856	syf2	97	76.349	ENSFDAG00000008310	SYF2	99	76.349	Fukomys_damarensis
ENSKMAG00000013856	syf2	95	78.761	ENSFHEG00000007238	syf2	100	78.761	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000013856	syf2	91	88.372	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.372	Gadus_morhua
ENSKMAG00000013856	syf2	94	82.883	ENSGALG00000013639	SYF2	88	82.883	Gallus_gallus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	ENSGAFG00000019435	syf2	100	91.176	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000013856	syf2	94	90.541	ENSGACG00000007305	syf2	100	87.866	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	81.739	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	80.591	Gopherus_agassizii
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	ENSGGOG00000012796	SYF2	98	76.987	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000013856	syf2	97	93.013	ENSHBUG00000020477	syf2	100	92.017	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000013856	syf2	94	81.532	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.532	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000013856	syf2	93	71.946	ENSHGLG00000004304	-	99	68.354	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000013856	syf2	94	81.532	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.532	Heterocephalus_glaber_male
ENSKMAG00000013856	syf2	100	88.235	ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.235	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000013856	syf2	100	83.264	ENSIPUG00000019859	syf2	100	83.264	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000013856	syf2	62	76.712	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.712	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSKMAG00000013856	syf2	84	82.412	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	Jaculus_jaculus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.916	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000013856	syf2	93	82.353	ENSLACG00000012064	SYF2	93	82.353	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000013856	syf2	100	84.100	ENSLOCG00000002728	syf2	95	84.100	Lepisosteus_oculatus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	76.735	ENSLAFG00000023150	-	100	76.735	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000013856	syf2	77	54.348	ENSLAFG00000030814	-	100	54.348	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	76.250	Macaca_fascicularis
ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.481	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	75.833	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	76.250	Macaca_nemestrina
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	76.250	Mandrillus_leucophaeus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.076	ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	ENSMZEG00005006429	syf2	100	91.597	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000013856	syf2	84	83.417	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.417	Meleagris_gallopavo
ENSKMAG00000013856	syf2	99	79.237	ENSMAUG00000018974	Syf2	96	79.237	Mesocricetus_auratus
ENSKMAG00000013856	syf2	84	81.910	ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	Microcebus_murinus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.814	ENSMOCG00000022938	Syf2	96	78.814	Microtus_ochrogaster
ENSKMAG00000013856	syf2	99	86.975	ENSMMOG00000002396	syf2	99	86.975	Mola_mola
ENSKMAG00000013856	syf2	94	77.232	ENSMODG00000013951	-	98	77.232	Monodelphis_domestica
ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.212	ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	Monopterus_albus
ENSKMAG00000013856	syf2	94	82.432	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	82.432	Mus_caroli
ENSKMAG00000013856	syf2	94	82.432	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	82.432	Mus_musculus
ENSKMAG00000013856	syf2	94	82.432	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	82.432	Mus_pahari
ENSKMAG00000013856	syf2	94	82.432	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	82.432	Mus_spretus
ENSKMAG00000013856	syf2	93	81.364	ENSMPUG00000015801	-	89	81.364	Mustela_putorius_furo
ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.481	ENSMPUG00000015802	-	92	78.448	Mustela_putorius_furo
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.667	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	77.215	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.119	ENSNGAG00000007912	Syf2	96	77.119	Nannospalax_galili
ENSKMAG00000013856	syf2	100	81.818	ENSNBRG00000010720	syf2	99	81.818	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	76.667	Nomascus_leucogenys
ENSKMAG00000013856	syf2	100	76.132	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	76.132	Ochotona_princeps
ENSKMAG00000013856	syf2	97	78.696	ENSODEG00000017664	-	95	78.696	Octodon_degus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	69.565	ENSODEG00000014338	-	94	69.565	Octodon_degus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	ENSONIG00000008213	syf2	100	91.597	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000013856	syf2	85	82.178	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	Ornithorhynchus_anatinus
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.870	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	79.149	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	91.266	ENSORLG00000028820	syf2	98	91.266	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.336	ENSORLG00020018333	syf2	100	90.336	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.756	ENSORLG00015014665	syf2	100	90.756	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	ENSOMEG00000013911	syf2	100	91.597	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.481	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.481	Otolemur_garnettii
ENSKMAG00000013856	syf2	98	78.205	ENSOARG00000006348	-	93	78.205	Ovis_aries
ENSKMAG00000013856	syf2	82	55.385	ENSOARG00000006269	-	100	55.385	Ovis_aries
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	ENSPPAG00000036579	SYF2	98	76.987	Pan_paniscus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.814	ENSPPRG00000001638	-	96	78.814	Panthera_pardus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	78.632	ENSPPRG00000001651	-	95	78.632	Panthera_pardus
ENSKMAG00000013856	syf2	91	83.333	ENSPTIG00000005711	-	83	80.519	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000013856	syf2	97	78.632	ENSPTIG00000007036	-	95	78.632	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	ENSPTRG00000000352	SYF2	98	76.987	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	ENSPANG00000008139	SYF2	99	76.250	Papio_anubis
ENSKMAG00000013856	syf2	100	81.435	ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.435	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000013856	syf2	97	79.828	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	79.828	Pelodiscus_sinensis
ENSKMAG00000013856	syf2	93	89.593	ENSPMGG00000008755	syf2	86	89.593	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.390	ENSPEMG00000008283	Syf2	96	78.390	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSKMAG00000013856	syf2	94	81.982	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	81.982	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.958	ENSPFOG00000004116	syf2	99	89.958	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000013856	syf2	97	91.739	ENSPLAG00000006691	syf2	99	91.739	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000013856	syf2	100	88.655	ENSPMEG00000011684	syf2	100	88.655	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.756	ENSPREG00000003009	syf2	100	90.756	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.667	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	76.667	Pongo_abelii
ENSKMAG00000013856	syf2	96	55.263	ENSPCOG00000027011	SYF2	89	55.263	Propithecus_coquereli
ENSKMAG00000013856	syf2	97	71.304	ENSPVAG00000005841	SYF2	92	71.304	Pteropus_vampyrus
ENSKMAG00000013856	syf2	94	93.274	ENSPNYG00000004979	syf2	100	91.597	Pundamilia_nyererei
ENSKMAG00000013856	syf2	100	82.353	ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.353	Pygocentrus_nattereri
ENSKMAG00000013856	syf2	94	82.432	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	82.432	Rattus_norvegicus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	74.167	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	74.167	Rhinopithecus_bieti
ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	ENSRROG00000001347	SYF2	99	76.250	Rhinopithecus_roxellana
ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	ENSSBOG00000020184	SYF2	96	77.637	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSKMAG00000013856	syf2	94	80.631	ENSSHAG00000015630	-	89	80.631	Sarcophilus_harrisii
ENSKMAG00000013856	syf2	86	82.039	ENSSHAG00000007152	-	100	82.039	Sarcophilus_harrisii
ENSKMAG00000013856	syf2	100	81.435	ENSSFOG00015023647	syf2	100	81.435	Scleropages_formosus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.076	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.076	Scophthalmus_maximus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.496	ENSSDUG00000013072	syf2	100	89.916	Seriola_dumerili
ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.496	ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSKMAG00000013856	syf2	99	59.751	ENSSARG00000012889	SYF2	99	59.751	Sorex_araneus
ENSKMAG00000013856	syf2	99	79.237	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	79.237	Sphenodon_punctatus
ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	ENSSPAG00000009626	syf2	100	91.597	Stegastes_partitus
ENSKMAG00000013856	syf2	93	81.448	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.448	Sus_scrofa
ENSKMAG00000013856	syf2	71	54.118	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	55.152	Taeniopygia_guttata
ENSKMAG00000013856	syf2	100	86.250	ENSTRUG00000001499	syf2	90	89.333	Takifugu_rubripes
ENSKMAG00000013856	syf2	94	88.288	ENSTNIG00000016912	syf2	99	88.288	Tetraodon_nigroviridis
ENSKMAG00000013856	syf2	96	60.965	ENSTBEG00000017370	SYF2	90	60.965	Tupaia_belangeri
ENSKMAG00000013856	syf2	97	76.446	ENSTTRG00000003550	SYF2	93	79.310	Tursiops_truncatus
ENSKMAG00000013856	syf2	97	77.350	ENSUAMG00000002897	SYF2	95	77.350	Ursus_americanus
ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.019	ENSUMAG00000013108	SYF2	95	76.923	Ursus_maritimus
ENSKMAG00000013856	syf2	94	80.631	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.631	Vicugna_pacos
ENSKMAG00000013856	syf2	86	81.463	ENSVVUG00000027181	-	90	80.717	Vulpes_vulpes
ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.481	ENSVVUG00000027175	-	96	77.119	Vulpes_vulpes
ENSKMAG00000013856	syf2	97	77.253	ENSXETG00000022797	syf2	94	77.253	Xenopus_tropicalis
ENSKMAG00000013856	syf2	100	88.235	ENSXMAG00000022698	syf2	100	90.756	Xiphophorus_maculatus