EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000014997 (Gene tree)
Gene ID: 108234442
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC108234442
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9137 bases
Position: chrLWHD01000027.1:910785-919921
Accession: 108234442
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000020170	MMR_HSR1	PF01926.23	8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000020437	-	1407	XM_017413640	ENSKMAP00000020170	448 (aa)	XP_017269129	UPI0007F8A386

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.000	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.444

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	57.871	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.871	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.129	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.186	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.912	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.912	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	79	60.674	ENSCING00000020807	-	94	60.674	Ciona_intestinalis
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	98	55.227	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.682	Ciona_savignyi
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.142	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.980	Danio_rerio
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	98	82.955	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.955	Danio_rerio
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	77	57.061	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	93	57.061	Eptatretus_burgeri
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	80.942	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.942	Esox_lucius
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.758	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	89	54.863	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.863	Gadus_morhua
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	92.188	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	81	65.205	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	60.599	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	58.628	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.444	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	83.559	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.559	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	96	59.122	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.986	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	77.951	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.951	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	81	59.003	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	59.003	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	61.470	ENSLACG00000004899	-	99	61.470	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	69.369	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.369	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	61.798	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.798	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	74.273	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.273	Lepisosteus_oculatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	96	59.217	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.217	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	57.965	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.186	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	57.428	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.428	Mola_mola
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Monopterus_albus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	98	88.383	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.383	Monopterus_albus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	96	59.122	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	99	58.986	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	93.750	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	93.750	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.628	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.628	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	87.054	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.054	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	57.461	ENSPKIG00000023918	-	98	57.461	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	57.734	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	58.628	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	58.628	Periophthalmus_magnuspinnatus
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