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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000018195 (Gene tree)
Gene ID: 108242598
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30016 bases
Position: chrLWHD01000103.1:1368443-1398458
Accession: 108242598
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000024599	IBN_N	PF03810.19	4.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000024908	-	5761	XM_017427529	ENSKMAP00000024599	890 (aa)	XP_017283018	UPI0007F9314A

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	84.104	ENSKMAG00000021274	TNPO2	99	84.104
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	86.374	ENSKMAG00000018430	TNPO2	99	86.374

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.596	Homo_sapiens
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.865	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.865	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	92.650	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.762	Ailuropoda_melanoleuca
ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	96.382	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.382	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.753	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.753	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.753	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.753	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.865	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.865	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	89.515	ENSAPLG00000009619	-	97	90.367	Anas_platyrhynchos
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.596	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	83.371	ENSANAG00000025351	-	99	83.371	Aotus_nancymaae
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.146	ENSANAG00000022453	-	99	93.146	Aotus_nancymaae
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	58.463	ENSANAG00000027118	-	99	61.086	Aotus_nancymaae
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.944	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.944	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.058	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.058	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.483	Bos_taurus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.258	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.258	Callithrix_jacchus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	93.466	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.466	Canis_familiaris
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	91.011	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.011	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.371	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.371	Capra_hircus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	89.944	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.281	Carlito_syrichta
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.146	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.146	Cebus_capucinus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.596	Cercocebus_atys
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.146	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.146	Chinchilla_lanigera
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.596	Chlorocebus_sabaeus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	94	82.002	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.002	Choloepus_hoffmanni
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.270	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.270	Chrysemys_picta_bellii
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	75.870	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.645	Ciona_savignyi
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.596	Colobus_angolensis_palliatus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.483	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	93.567	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.567	Cricetulus_griseus_crigri
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	95.618	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.618	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.966	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.966	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.388	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.827	Danio_rerio
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	88.018	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	88.018	Dasypus_novemcinctus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	93	93.494	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.486	Dipodomys_ordii
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	58.963	FBgn0035693	CG8219	99	58.850	Drosophila_melanogaster
ENSKMAG00000018195	tnpo1	86	94.007	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	Echinops_telfairi
ENSKMAG00000018195	tnpo1	94	85.000	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	Eptatretus_burgeri
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.596	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.596	Equus_caballus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	88.562	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.562	Esox_lucius
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.596	Felis_catus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.933	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.933	Ficedula_albicollis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.258	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.258	Fukomys_damarensis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.857	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.857	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	92.945	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.609	Gadus_morhua
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.258	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.258	Gallus_gallus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.637	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.637	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.180	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.180	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.157	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.157	Gopherus_agassizii
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	78.587	ENSGGOG00000022535	-	98	78.587	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.596	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.742	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.742	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	92.921	ENSHGLG00000000970	-	99	92.921	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000018195	tnpo1	97	72.791	ENSHGLG00100000963	-	99	72.209	Heterocephalus_glaber_male
ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	92.874	ENSHGLG00100017090	-	99	92.874	Heterocephalus_glaber_male
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.708	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.708	Jaculus_jaculus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	91	93.465	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.588	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	87.326	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.326	Latimeria_chalumnae
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	95.056	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.056	Lepisosteus_oculatus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	97	92.956	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.956	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.596	Macaca_fascicularis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.567	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.596	Macaca_nemestrina
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.596	Mandrillus_leucophaeus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.640	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.640	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.292	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.292	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	89.888	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.888	Microcebus_murinus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.483	Microtus_ochrogaster
ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	95.876	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.876	Mola_mola
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	93.617	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.617	Monodelphis_domestica
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.180	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.180	Monopterus_albus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.258	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.556	Mus_caroli
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.804	Mus_musculus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.371	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.680	Mus_pahari
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.804	Mus_spretus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.596	Mustela_putorius_furo
ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	93.132	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.132	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.483	Nannospalax_galili
ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	96.124	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.124	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.596	Nomascus_leucogenys
ENSKMAG00000018195	tnpo1	90	87.859	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.859	Ochotona_princeps
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	92.921	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.921	Octodon_degus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	95.982	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.982	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	92	94.512	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	87.266	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.266	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	96.239	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.239	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	96.505	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.505	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	96.843	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.843	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	96.843	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.843	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.596	Otolemur_garnettii
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.483	Ovis_aries
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.596	Pan_paniscus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.596	Panthera_pardus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.596	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.596	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000018195	tnpo1	94	82.873	ENSPTRG00000047731	-	100	82.873	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.596	Papio_anubis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	91.236	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.236	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.157	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.157	Pelodiscus_sinensis
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.266	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.154	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	93.567	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.567	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.157	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.157	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.865	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.865	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.865	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.865	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.303	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	97.303	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.085	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.085	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.483	Pongo_abelii
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ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.708	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.708	Pteropus_vampyrus
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ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.970	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.970	Xiphophorus_maculatus