EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000020736 (Gene tree)
Gene ID: 108240823
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4799 bases
Position: chrLWHD01000080.1:1528540-1533338
Accession: 108240823
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000027956	MMR_HSR1	PF01926.23	1.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000028309	-	3143	XM_017424612	ENSKMAP00000027956	266 (aa)	XP_017280101	UPI0007F88889

Gene Model

Click here to download ENSKMAG00000020736's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
kmr03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSKMAG00000020736's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSKMAG00000020736	srprb	65	31.034	ENSKMAG00000021494	-	90	31.034
ENSKMAG00000020736	srprb	60	30.625	ENSKMAG00000018315	-	83	30.625
ENSKMAG00000020736	srprb	60	31.875	ENSKMAG00000007316	arf2b	83	31.875
ENSKMAG00000020736	srprb	60	31.250	ENSKMAG00000004334	-	84	31.250
ENSKMAG00000020736	srprb	65	31.034	ENSKMAG00000019525	arf3b	90	31.034

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000020736	srprb	98	88.168	ENSAPOG00000021219	srprb	95	88.168	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	84.962	ENSACIG00000014621	srprb	100	84.962	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	86.194	ENSAOCG00000017265	srprb	97	86.194	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000020736	srprb	100	86.194	ENSAPEG00000024541	srprb	86	86.194	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000020736	srprb	100	83.459	ENSATEG00000014016	srprb	97	83.459	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	83.895	ENSACLG00000016748	srprb	97	83.895	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000020736	srprb	94	71.315	ENSAMXG00000044118	srprb	94	71.315	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	80.827	ENSCSEG00000017194	srprb	97	80.827	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000020736	srprb	100	84.962	ENSCVAG00000004221	srprb	100	84.962	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	66.165	ENSDARG00000030949	srprb	100	66.165	Danio_rerio
ENSKMAG00000020736	srprb	97	80.309	ENSELUG00000009740	srprb	96	80.309	Esox_lucius
ENSKMAG00000020736	srprb	100	86.466	ENSFHEG00000006004	srprb	100	86.466	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000020736	srprb	94	84.064	ENSGMOG00000002081	srprb	93	84.064	Gadus_morhua
ENSKMAG00000020736	srprb	99	85.227	ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.227	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000020736	srprb	100	85.714	ENSGACG00000009891	srprb	98	85.714	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	83.895	ENSHBUG00000002145	srprb	97	83.895	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000020736	srprb	98	81.679	ENSHCOG00000007732	srprb	98	81.679	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000020736	srprb	94	66.932	ENSIPUG00000004177	srprb	94	66.932	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	84.586	ENSLBEG00000021483	srprb	97	84.586	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000020736	srprb	95	69.685	ENSLOCG00000009740	srprb	86	69.531	Lepisosteus_oculatus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	87.218	ENSMAMG00000011876	srprb	97	87.218	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000020736	srprb	96	85.156	ENSMZEG00005016621	srprb	99	85.156	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000020736	srprb	100	84.211	ENSMMOG00000012550	srprb	98	84.211	Mola_mola
ENSKMAG00000020736	srprb	100	86.466	ENSMALG00000012595	srprb	97	86.466	Monopterus_albus
ENSKMAG00000020736	srprb	74	84.772	ENSNBRG00000004699	srprb	84	84.772	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000020736	srprb	100	83.835	ENSONIG00000003788	srprb	79	83.835	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	80.827	ENSORLG00000006430	srprb	97	80.827	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000020736	srprb	100	81.203	ENSORLG00020003413	srprb	97	81.203	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000020736	srprb	100	81.203	ENSORLG00015000166	srprb	97	81.203	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000020736	srprb	100	81.955	ENSOMEG00000012735	srprb	97	81.955	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000020736	srprb	94	69.721	ENSPKIG00000013147	srprb	95	69.721	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000020736	srprb	100	78.195	ENSPMGG00000014061	srprb	97	78.195	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSKMAG00000020736	srprb	99	85.606	ENSPFOG00000011347	srprb	96	85.606	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000020736	srprb	97	87.209	ENSPLAG00000001156	srprb	100	87.209	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000020736	srprb	97	86.434	ENSPMEG00000012169	srprb	100	86.434	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000020736	srprb	97	85.659	ENSPREG00000001449	srprb	100	85.659	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000020736	srprb	100	83.895	ENSPNYG00000005911	srprb	97	83.895	Pundamilia_nyererei
ENSKMAG00000020736	srprb	100	68.797	ENSPNAG00000009983	srprb	100	68.797	Pygocentrus_nattereri
ENSKMAG00000020736	srprb	95	72.835	ENSSFOG00015019355	srprb	95	72.835	Scleropages_formosus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	85.338	ENSSMAG00000013202	srprb	97	85.338	Scophthalmus_maximus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	85.338	ENSSDUG00000018746	srprb	91	85.338	Seriola_dumerili
ENSKMAG00000020736	srprb	100	84.962	ENSSLDG00000020560	srprb	97	84.962	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSKMAG00000020736	srprb	100	85.448	ENSSPAG00000008898	srprb	95	86.641	Stegastes_partitus
ENSKMAG00000020736	srprb	100	81.955	ENSTRUG00000022463	srprb	97	81.955	Takifugu_rubripes
ENSKMAG00000020736	srprb	98	80.916	ENSTNIG00000007725	srprb	100	80.916	Tetraodon_nigroviridis
ENSKMAG00000020736	srprb	97	87.209	ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.209	Xiphophorus_couchianus
ENSKMAG00000020736	srprb	97	86.822	ENSXMAG00000028725	srprb	100	86.822	Xiphophorus_maculatus