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Description

Ensembl ID: ENSKMAG00000021305 (Gene tree)
Gene ID: 108246756
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Kryptolebias_marmoratus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8405 bases
Position: chrLWHD01000005.1:8757679-8766083
Accession: 108246756
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSKMAP00000028747	eRF1_2	PF03464.15	5.7e-34	1	1
ENSKMAP00000028772	eRF1_2	PF03464.15	5.8e-34	1	1
ENSKMAP00000028747	eRF1_3	PF03465.15	1.4e-25	1	1
ENSKMAP00000028772	eRF1_3	PF03465.15	2.5e-10	1	1
ENSKMAP00000028772	eRF1_1	PF03463.15	2.5e-51	1	1
ENSKMAP00000028747	eRF1_1	PF03463.15	2.5e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSKMAT00000029109	-	2976	XM_017434462	ENSKMAP00000028747	385 (aa)	XP_017289951	UPI0007F93E1B
ENSKMAT00000029135	-	1131	-	ENSKMAP00000028772	376 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
kmr03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSG00000152684	PELO	100	81.039	Homo_sapiens
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.727	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000021305	pelo	66	92.713	ENSAPOG00000023700	-	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000021305	pelo	66	92.713	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.039	Ailuropoda_melanoleuca
ENSKMAG00000021305	pelo	97	88.204	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.491	Amphilophus_citrinellus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.987	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.987	Amphiprion_ocellaris
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.987	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.987	Amphiprion_percula
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.727	ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	Anabas_testudineus
ENSKMAG00000021305	pelo	77	72.819	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.819	Anas_platyrhynchos
ENSKMAG00000021305	pelo	97	80.533	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.000	Anolis_carolinensis
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.558	Aotus_nancymaae
ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	Astatotilapia_calliptera
ENSKMAG00000021305	pelo	97	91.957	ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.649	Astyanax_mexicanus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	Bos_taurus
ENSKMAG00000021305	pelo	99	60.630	WBGene00011280	pelo-1	100	60.630	Caenorhabditis_elegans
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	Callithrix_jacchus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.299	Canis_lupus_dingo
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	Capra_hircus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	ENSTSYG00000005203	PELO	100	81.558	Carlito_syrichta
ENSKMAG00000021305	pelo	100	82.078	ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	Cavia_porcellus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.299	Cebus_capucinus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.039	Cercocebus_atys
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.558	Chinchilla_lanigera
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.039	Chlorocebus_sabaeus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSCHOG00000000523	PELO	100	81.299	Choloepus_hoffmanni
ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.333	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.779	Chrysemys_picta_bellii
ENSKMAG00000021305	pelo	97	64.343	ENSCING00000001979	-	100	64.416	Ciona_intestinalis
ENSKMAG00000021305	pelo	100	66.494	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.494	Ciona_savignyi
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.039	Colobus_angolensis_palliatus
ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.769	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.558	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSKMAG00000021305	pelo	97	82.574	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.338	Cricetulus_griseus_crigri
ENSKMAG00000021305	pelo	100	91.688	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.688	Cynoglossus_semilaevis
ENSKMAG00000021305	pelo	100	93.766	ENSCVAG00000016082	pelo	100	93.766	Cyprinodon_variegatus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	89.091	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.091	Danio_rerio
ENSKMAG00000021305	pelo	100	77.979	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.979	Dasypus_novemcinctus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	82.078	ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.078	Dipodomys_ordii
ENSKMAG00000021305	pelo	96	68.108	FBgn0011207	pelo	96	67.282	Drosophila_melanogaster
ENSKMAG00000021305	pelo	71	77.193	ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.193	Eptatretus_burgeri
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.299	Equus_asinus_asinus
ENSKMAG00000021305	pelo	99	91.623	ENSELUG00000023229	pelo	99	91.623	Esox_lucius
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.299	Felis_catus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	ENSFALG00000004559	PELO	100	81.558	Ficedula_albicollis
ENSKMAG00000021305	pelo	76	82.394	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.394	Fukomys_damarensis
ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.026	ENSFHEG00000009769	pelo	100	94.026	Fundulus_heteroclitus
ENSKMAG00000021305	pelo	98	89.655	ENSGMOG00000005849	pelo	100	89.351	Gadus_morhua
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.987	ENSGAFG00000019350	pelo	100	92.987	Gambusia_affinis
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.208	ENSGACG00000007245	pelo	100	92.208	Gasterosteus_aculeatus
ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.333	ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.779	Gopherus_agassizii
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.039	Gorilla_gorilla
ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.649	Haplochromis_burtoni
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.818	ENSHGLG00000005932	PELO	100	81.818	Heterocephalus_glaber_female
ENSKMAG00000021305	pelo	100	80.260	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.260	Heterocephalus_glaber_male
ENSKMAG00000021305	pelo	100	89.870	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.870	Hippocampus_comes
ENSKMAG00000021305	pelo	100	88.831	ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.831	Ictalurus_punctatus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.818	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	79.481	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	79.481	Jaculus_jaculus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.468	ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.468	Labrus_bergylta
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSLAFG00000020551	PELO	100	81.039	Loxodonta_africana
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSMFAG00000000651	PELO	100	81.039	Macaca_fascicularis
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSMMUG00000039101	PELO	100	81.039	Macaca_mulatta
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSMNEG00000035538	PELO	100	81.039	Macaca_nemestrina
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSMLEG00000039113	PELO	100	81.039	Mandrillus_leucophaeus
ENSKMAG00000021305	pelo	97	94.638	ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.026	Mastacembelus_armatus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.649	Maylandia_zebra
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	81.558	Mesocricetus_auratus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.299	Microcebus_murinus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.818	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	81.818	Microtus_ochrogaster
ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.649	Mola_mola
ENSKMAG00000021305	pelo	100	93.247	ENSMALG00000008194	pelo	100	93.247	Monopterus_albus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	81.558	Mus_caroli
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	81.558	Mus_musculus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.818	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	81.818	Mus_pahari
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	81.558	Mus_spretus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.039	Myotis_lucifugus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.818	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.818	Nannospalax_galili
ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.649	Neolamprologus_brichardi
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSNLEG00000035970	PELO	100	81.039	Nomascus_leucogenys
ENSKMAG00000021305	pelo	100	80.260	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.260	Notamacropus_eugenii
ENSKMAG00000021305	pelo	98	80.739	ENSOPRG00000018793	PELO	100	80.739	Ochotona_princeps
ENSKMAG00000021305	pelo	100	82.078	ENSODEG00000017579	PELO	100	82.078	Octodon_degus
ENSKMAG00000021305	pelo	96	92.162	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.429	Oreochromis_niloticus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.039	Oryctolagus_cuniculus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.468	ENSORLG00000005827	pelo	100	92.468	Oryzias_latipes
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.727	ENSORLG00020016456	pelo	100	92.727	Oryzias_latipes_hni
ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.987	ENSORLG00015014447	pelo	100	93.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSKMAG00000021305	pelo	100	93.766	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.766	Oryzias_melastigma
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.299	Otolemur_garnettii
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.299	Ovis_aries
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.039	Pan_paniscus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.299	Panthera_pardus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.299	Panthera_tigris_altaica
ENSKMAG00000021305	pelo	100	80.779	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.779	Pan_troglodytes
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.039	Papio_anubis
ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.130	ENSPKIG00000015190	pelo	100	90.130	Paramormyrops_kingsleyae
ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.067	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.519	Pelodiscus_sinensis
ENSKMAG00000021305	pelo	69	91.860	ENSPMGG00000014561	pelo	95	91.860	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.818	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.818	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSPCIG00000004880	PELO	100	81.039	Phascolarctos_cinereus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.026	ENSPFOG00000007277	pelo	100	94.026	Poecilia_formosa
ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.286	ENSPLAG00000020787	pelo	100	94.286	Poecilia_latipinna
ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.026	ENSPMEG00000016964	pelo	100	94.026	Poecilia_mexicana
ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.286	ENSPREG00000023071	pelo	100	94.286	Poecilia_reticulata
ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.233	ENSPPYG00000015451	PELO	96	81.039	Pongo_abelii
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	ENSPCOG00000021178	PELO	100	81.299	Propithecus_coquereli
ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	ENSPNYG00000017325	pelo	100	90.649	Pundamilia_nyererei
ENSKMAG00000021305	pelo	97	91.957	ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.649	Pygocentrus_nattereri
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	81.558	Rattus_norvegicus
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.039	Rhinopithecus_bieti
ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.039	Rhinopithecus_roxellana
ENSKMAG00000021305	pelo	97	32.208	YNL001W	-	99	32.208	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSKMAG00000021305	pelo	63	78.279	ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.279	Sarcophilus_harrisii
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