EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000000534 (Gene tree)
Gene ID: 106702270
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 798 bases
Position: chrJH135479.1:2942-3739
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000000602	Transposase_22	PF02994.14	4.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000000605	-	798	-	ENSLACP00000000602	266 (aa)	-	H2ZT81

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000000534's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000000534's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000000534	-	87	36.910	ENSLACG00000010144	-	81	36.910
ENSLACG00000000534	-	95	80.952	ENSLACG00000014952	-	84	80.952
ENSLACG00000000534	-	79	30.841	ENSLACG00000016517	-	95	30.841
ENSLACG00000000534	-	71	33.158	ENSLACG00000000425	-	87	33.158
ENSLACG00000000534	-	81	36.744	ENSLACG00000013090	-	94	36.744
ENSLACG00000000534	-	78	30.288	ENSLACG00000000907	-	96	30.288
ENSLACG00000000534	-	70	47.849	ENSLACG00000000903	-	82	47.849
ENSLACG00000000534	-	81	30.275	ENSLACG00000010705	-	82	30.275
ENSLACG00000000534	-	84	80.804	ENSLACG00000006110	-	100	80.804
ENSLACG00000000534	-	79	33.953	ENSLACG00000003145	-	94	33.953
ENSLACG00000000534	-	91	55.918	ENSLACG00000013987	-	90	55.918
ENSLACG00000000534	-	87	33.476	ENSLACG00000002189	-	97	33.476
ENSLACG00000000534	-	71	34.328	ENSLACG00000001295	-	80	34.328
ENSLACG00000000534	-	85	76.211	ENSLACG00000001298	-	92	76.211
ENSLACG00000000534	-	95	64.683	ENSLACG00000003957	-	87	64.683
ENSLACG00000000534	-	86	36.170	ENSLACG00000011265	-	93	36.170
ENSLACG00000000534	-	96	71.094	ENSLACG00000001559	-	86	71.094
ENSLACG00000000534	-	86	33.766	ENSLACG00000005009	-	92	34.199
ENSLACG00000000534	-	64	41.765	ENSLACG00000007535	-	96	41.765
ENSLACG00000000534	-	89	58.650	ENSLACG00000010080	-	86	58.650
ENSLACG00000000534	-	61	39.521	ENSLACG00000014732	-	91	34.247
ENSLACG00000000534	-	61	42.515	ENSLACG00000010165	-	61	42.515
ENSLACG00000000534	-	79	68.246	ENSLACG00000000465	-	84	68.246
ENSLACG00000000534	-	65	38.122	ENSLACG00000002051	-	82	33.613
ENSLACG00000000534	-	93	76.518	ENSLACG00000012229	-	99	76.518
ENSLACG00000000534	-	81	33.180	ENSLACG00000008859	-	81	33.180
ENSLACG00000000534	-	82	31.050	ENSLACG00000010569	-	96	31.050
ENSLACG00000000534	-	91	49.587	ENSLACG00000001077	-	98	49.587
ENSLACG00000000534	-	59	39.241	ENSLACG00000008643	-	89	38.650
ENSLACG00000000534	-	71	32.642	ENSLACG00000018384	-	94	32.642
ENSLACG00000000534	-	100	69.925	ENSLACG00000003217	-	96	69.925
ENSLACG00000000534	-	81	33.641	ENSLACG00000003451	-	91	33.641
ENSLACG00000000534	-	81	35.185	ENSLACG00000017411	-	95	35.185
ENSLACG00000000534	-	91	31.301	ENSLACG00000010346	-	78	32.114
ENSLACG00000000534	-	96	74.118	ENSLACG00000000668	-	85	74.118
ENSLACG00000000534	-	56	42.282	ENSLACG00000014769	-	83	35.023
ENSLACG00000000534	-	91	30.290	ENSLACG00000006813	-	89	30.290
ENSLACG00000000534	-	95	63.492	ENSLACG00000004508	-	94	63.241
ENSLACG00000000534	-	82	33.772	ENSLACG00000000369	-	76	34.211
ENSLACG00000000534	-	93	48.996	ENSLACG00000016396	-	88	48.996
ENSLACG00000000534	-	96	67.969	ENSLACG00000005344	-	91	67.969
ENSLACG00000000534	-	88	35.833	ENSLACG00000011580	-	90	35.833
ENSLACG00000000534	-	82	36.937	ENSLACG00000017727	-	95	36.937
ENSLACG00000000534	-	88	37.447	ENSLACG00000002451	-	80	36.975
ENSLACG00000000534	-	91	34.855	ENSLACG00000000876	-	98	33.195
ENSLACG00000000534	-	85	38.053	ENSLACG00000001055	-	88	38.053
ENSLACG00000000534	-	100	82.331	ENSLACG00000011552	-	99	82.331
ENSLACG00000000534	-	93	50.394	ENSLACG00000013472	-	99	50.394
ENSLACG00000000534	-	57	34.641	ENSLACG00000016955	-	58	34.211
ENSLACG00000000534	-	84	35.470	ENSLACG00000000643	-	94	35.470
ENSLACG00000000534	-	88	73.391	ENSLACG00000012198	-	99	73.391
ENSLACG00000000534	-	90	30.952	ENSLACG00000010900	-	92	30.952
ENSLACG00000000534	-	50	44.030	ENSLACG00000010633	-	73	44.030
ENSLACG00000000534	-	79	30.189	ENSLACG00000013538	-	92	30.189
ENSLACG00000000534	-	82	31.222	ENSLACG00000005368	-	98	31.222
ENSLACG00000000534	-	90	34.426	ENSLACG00000000077	-	90	34.426
ENSLACG00000000534	-	87	36.052	ENSLACG00000000673	-	86	36.052
ENSLACG00000000534	-	83	35.897	ENSLACG00000012357	-	92	33.476
ENSLACG00000000534	-	86	34.052	ENSLACG00000009393	-	95	34.052
ENSLACG00000000534	-	83	36.036	ENSLACG00000001384	-	99	36.279
ENSLACG00000000534	-	87	31.330	ENSLACG00000011150	-	80	31.330
ENSLACG00000000534	-	100	83.459	ENSLACG00000010859	-	99	83.459
ENSLACG00000000534	-	96	74.609	ENSLACG00000006210	-	99	74.609
ENSLACG00000000534	-	87	72.414	ENSLACG00000006820	-	86	72.414
ENSLACG00000000534	-	82	64.977	ENSLACG00000007340	-	91	64.977
ENSLACG00000000534	-	71	72.487	ENSLACG00000007342	-	92	72.487
ENSLACG00000000534	-	96	60.938	ENSLACG00000011390	-	99	60.938
ENSLACG00000000534	-	88	55.042	ENSLACG00000013072	-	97	55.042
ENSLACG00000000534	-	92	33.725	ENSLACG00000014189	-	86	33.463
ENSLACG00000000534	-	81	32.569	ENSLACG00000000848	-	86	32.569
ENSLACG00000000534	-	85	37.281	ENSLACG00000005266	-	78	37.281
ENSLACG00000000534	-	86	35.897	ENSLACG00000014474	-	85	35.897
ENSLACG00000000534	-	80	30.000	ENSLACG00000004272	-	97	30.000
ENSLACG00000000534	-	89	32.645	ENSLACG00000010019	-	96	33.197