EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000000643 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1414 bases
Position: chrAFYH01277459.1:3729-5142
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000000718	Transposase_22	PF02994.14	4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000000724	-	732	-	ENSLACP00000000718	244 (aa)	-	H2ZTJ7

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000000643's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000000643's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000000643	-	82	32.843	ENSLACG00000022180	-	83	32.843
ENSLACG00000000643	-	86	35.545	ENSLACG00000000848	-	86	35.545
ENSLACG00000000643	-	83	34.804	ENSLACG00000002651	-	84	34.804
ENSLACG00000000643	-	96	36.327	ENSLACG00000011552	-	91	36.327
ENSLACG00000000643	-	66	53.125	ENSLACG00000010633	-	91	53.125
ENSLACG00000000643	-	82	35.821	ENSLACG00000010092	-	97	35.371
ENSLACG00000000643	-	84	33.659	ENSLACG00000016517	-	98	33.659
ENSLACG00000000643	-	82	55.224	ENSLACG00000001384	-	100	52.941
ENSLACG00000000643	-	90	33.784	ENSLACG00000010019	-	91	33.784
ENSLACG00000000643	-	95	36.325	ENSLACG00000010900	-	88	36.325
ENSLACG00000000643	-	94	36.797	ENSLACG00000011150	-	83	36.797
ENSLACG00000000643	-	90	33.617	ENSLACG00000009806	-	86	33.617
ENSLACG00000000643	-	95	35.391	ENSLACG00000011390	-	94	35.391
ENSLACG00000000643	-	82	32.836	ENSLACG00000010705	-	82	32.836
ENSLACG00000000643	-	93	35.217	ENSLACG00000001077	-	88	35.217
ENSLACG00000000643	-	88	36.111	ENSLACG00000011580	-	89	36.111
ENSLACG00000000643	-	86	36.818	ENSLACG00000013987	-	82	36.818
ENSLACG00000000643	-	82	39.048	ENSLACG00000013472	-	82	39.048
ENSLACG00000000643	-	92	37.021	ENSLACG00000000668	-	78	37.021
ENSLACG00000000643	-	77	41.885	ENSLACG00000000465	-	74	41.885
ENSLACG00000000643	-	80	38.265	ENSLACG00000013538	-	87	38.265
ENSLACG00000000643	-	78	47.644	ENSLACG00000010165	-	73	47.644
ENSLACG00000000643	-	96	42.553	ENSLACG00000006813	-	88	42.553
ENSLACG00000000643	-	86	47.619	ENSLACG00000013090	-	97	47.619
ENSLACG00000000643	-	88	33.921	ENSLACG00000011265	-	92	33.921
ENSLACG00000000643	-	97	35.714	ENSLACG00000006473	-	88	36.134
ENSLACG00000000643	-	94	37.815	ENSLACG00000003217	-	87	37.815
ENSLACG00000000643	-	89	37.555	ENSLACG00000004508	-	85	36.681
ENSLACG00000000643	-	88	38.667	ENSLACG00000006210	-	88	38.667
ENSLACG00000000643	-	84	30.180	ENSLACG00000012896	-	82	30.180
ENSLACG00000000643	-	96	35.510	ENSLACG00000010859	-	91	35.510
ENSLACG00000000643	-	94	32.759	ENSLACG00000007888	-	95	32.759
ENSLACG00000000643	-	88	40.553	ENSLACG00000017727	-	93	40.553
ENSLACG00000000643	-	90	37.555	ENSLACG00000006820	-	85	37.555
ENSLACG00000000643	-	87	36.150	ENSLACG00000003451	-	93	36.150
ENSLACG00000000643	-	96	37.143	ENSLACG00000014952	-	82	37.143
ENSLACG00000000643	-	86	37.327	ENSLACG00000010569	-	91	37.327
ENSLACG00000000643	-	89	35.874	ENSLACG00000005344	-	81	35.874
ENSLACG00000000643	-	68	60.241	ENSLACG00000007535	-	96	60.241
ENSLACG00000000643	-	96	35.169	ENSLACG00000002471	-	79	35.169
ENSLACG00000000643	-	92	50.222	ENSLACG00000005266	-	78	50.222
ENSLACG00000000643	-	82	40.476	ENSLACG00000012229	-	85	40.476
ENSLACG00000000643	-	86	37.089	ENSLACG00000001298	-	89	37.089
ENSLACG00000000643	-	84	37.864	ENSLACG00000008859	-	81	37.864
ENSLACG00000000643	-	88	36.818	ENSLACG00000009393	-	93	36.818
ENSLACG00000000643	-	97	36.134	ENSLACG00000010346	-	81	36.134
ENSLACG00000000643	-	81	36.364	ENSLACG00000004272	-	94	36.364
ENSLACG00000000643	-	91	32.589	ENSLACG00000014493	-	75	32.589
ENSLACG00000000643	-	91	43.891	ENSLACG00000012357	-	90	43.891
ENSLACG00000000643	-	82	36.000	ENSLACG00000002135	-	89	36.000
ENSLACG00000000643	-	84	37.019	ENSLACG00000003145	-	91	37.019
ENSLACG00000000643	-	90	37.668	ENSLACG00000000077	-	84	37.668
ENSLACG00000000643	-	86	46.411	ENSLACG00000005368	-	98	46.411
ENSLACG00000000643	-	94	49.345	ENSLACG00000002451	-	81	49.345
ENSLACG00000000643	-	74	40.331	ENSLACG00000016955	-	70	40.331
ENSLACG00000000643	-	85	45.894	ENSLACG00000014769	-	97	45.894
ENSLACG00000000643	-	82	36.634	ENSLACG00000009013	-	61	36.634
ENSLACG00000000643	-	83	42.647	ENSLACG00000012198	-	85	42.647
ENSLACG00000000643	-	70	45.143	ENSLACG00000010080	-	75	45.143
ENSLACG00000000643	-	75	35.294	ENSLACG00000000425	-	96	35.294
ENSLACG00000000643	-	66	45.399	ENSLACG00000007342	-	79	45.399
ENSLACG00000000643	-	80	38.384	ENSLACG00000007340	-	81	38.384
ENSLACG00000000643	-	79	41.837	ENSLACG00000002051	-	71	41.837
ENSLACG00000000643	-	94	45.415	ENSLACG00000014474	-	85	45.415
ENSLACG00000000643	-	79	40.933	ENSLACG00000001295	-	78	40.933
ENSLACG00000000643	-	96	32.365	ENSLACG00000006865	-	87	35.437
ENSLACG00000000643	-	89	33.486	ENSLACG00000005009	-	92	33.486
ENSLACG00000000643	-	92	68.889	ENSLACG00000000673	-	87	68.889
ENSLACG00000000643	-	78	47.644	ENSLACG00000014732	-	85	47.644
ENSLACG00000000643	-	73	36.313	ENSLACG00000018384	-	90	36.313
ENSLACG00000000643	-	80	40.306	ENSLACG00000000907	-	96	40.306
ENSLACG00000000643	-	73	36.898	ENSLACG00000000903	-	83	36.898
ENSLACG00000000643	-	79	35.567	ENSLACG00000016319	-	73	35.567
ENSLACG00000000643	-	73	58.192	ENSLACG00000001055	-	78	58.192
ENSLACG00000000643	-	96	33.878	ENSLACG00000016396	-	86	33.878
ENSLACG00000000643	-	65	52.830	ENSLACG00000008643	-	93	52.830
ENSLACG00000000643	-	85	51.442	ENSLACG00000013182	-	93	51.442
ENSLACG00000000643	-	79	35.961	ENSLACG00000017411	-	96	35.961
ENSLACG00000000643	-	91	45.946	ENSLACG00000000369	-	78	45.946
ENSLACG00000000643	-	89	38.793	ENSLACG00000003957	-	80	38.793
ENSLACG00000000643	-	94	38.655	ENSLACG00000001559	-	81	38.655
ENSLACG00000000643	-	89	38.636	ENSLACG00000006110	-	95	38.636
ENSLACG00000000643	-	93	48.246	ENSLACG00000000876	-	97	48.246
ENSLACG00000000643	-	92	62.500	ENSLACG00000010144	-	82	62.500
ENSLACG00000000643	-	91	35.874	ENSLACG00000007821	-	75	35.874
ENSLACG00000000643	-	77	41.799	ENSLACG00000013072	-	77	41.799
ENSLACG00000000643	-	89	35.616	ENSLACG00000002189	-	92	35.616
ENSLACG00000000643	-	94	35.470	ENSLACG00000000534	-	84	35.470
ENSLACG00000000643	-	94	43.668	ENSLACG00000014189	-	80	43.668

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000000643	-	90	30.909	ENSACIG00000013512	-	68	30.909	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000000643	-	77	32.461	ENSACIG00000018891	-	56	32.461	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000000643	-	77	32.461	ENSACIG00000014541	-	57	32.461	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000000643	-	72	33.523	ENSAPEG00000023573	-	58	33.523	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000643	-	84	35.981	ENSAPEG00000022657	-	59	35.981	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000643	-	77	34.555	ENSAPEG00000013155	-	59	34.555	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000643	-	72	33.523	ENSAPEG00000008945	-	58	33.523	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000643	-	77	31.937	ENSAPEG00000002130	-	57	31.937	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000643	-	78	32.812	ENSCVAG00000003346	-	52	32.812	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000000643	-	90	37.557	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	79	37.557	Danio_rerio
ENSLACG00000000643	-	77	36.224	ENSFHEG00000006296	-	59	36.224	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000000643	-	88	30.556	ENSKMAG00000012954	-	64	30.556	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000000643	-	92	35.556	ENSLBEG00000017145	-	68	35.556	Labrus_bergylta
ENSLACG00000000643	-	91	39.013	ENSMZEG00005020773	-	74	39.013	Maylandia_zebra
ENSLACG00000000643	-	62	38.961	ENSONIG00000021329	-	67	38.961	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000000643	-	93	31.405	ENSONIG00000020618	-	96	31.405	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000000643	-	79	38.614	ENSORLG00000020512	-	66	38.614	Oryzias_latipes
ENSLACG00000000643	-	84	34.300	ENSPKIG00000001458	-	82	34.300	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000000643	-	84	38.164	ENSPKIG00000009100	-	61	38.164	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000000643	-	85	34.259	ENSPMGG00000001874	-	75	34.259	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000000643	-	90	37.104	ENSPFOG00000020584	-	81	37.104	Poecilia_formosa
ENSLACG00000000643	-	90	32.273	ENSPFOG00000020665	-	79	32.273	Poecilia_formosa
ENSLACG00000000643	-	88	31.839	ENSPFOG00000020560	-	83	31.839	Poecilia_formosa
ENSLACG00000000643	-	93	31.004	ENSPMEG00000022872	-	69	31.004	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000000643	-	90	31.818	ENSPMEG00000014224	-	75	31.818	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000000643	-	77	31.937	ENSPMEG00000021431	-	66	31.937	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000000643	-	86	38.967	ENSPNYG00000003325	-	70	38.967	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000000643	-	89	35.616	ENSPNAG00000017685	-	65	35.616	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000000643	-	84	37.198	ENSSLDG00000008663	-	83	37.198	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000000643	-	77	32.984	ENSXMAG00000021250	-	56	32.984	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000000643	-	80	33.500	ENSXMAG00000023095	-	52	33.500	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000000643	-	76	36.508	ENSXMAG00000029285	-	72	34.112	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000000643	-	77	32.984	ENSXMAG00000026781	-	52	32.984	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000000643	-	77	32.984	ENSXMAG00000024802	-	58	32.984	Xiphophorus_maculatus