EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000000673 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1874 bases
Position: chrJH133715.1:3997-5870
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000000751	Transposase_22	PF02994.14	1.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000000757	-	774	-	ENSLACP00000000751	258 (aa)	-	H2ZTN0

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000000673's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000000673's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000000673	-	60	46.835	ENSLACG00000010080	-	68	46.541
ENSLACG00000000673	-	81	46.154	ENSLACG00000010165	-	80	46.154
ENSLACG00000000673	-	86	30.942	ENSLACG00000006865	-	86	33.171
ENSLACG00000000673	-	79	44.928	ENSLACG00000000668	-	67	44.928
ENSLACG00000000673	-	80	48.792	ENSLACG00000013182	-	93	48.792
ENSLACG00000000673	-	83	36.111	ENSLACG00000011580	-	89	36.111
ENSLACG00000000673	-	77	43.939	ENSLACG00000006813	-	77	43.939
ENSLACG00000000673	-	62	50.625	ENSLACG00000010633	-	99	47.458
ENSLACG00000000673	-	67	51.744	ENSLACG00000007535	-	100	51.744
ENSLACG00000000673	-	89	32.189	ENSLACG00000007888	-	96	32.189
ENSLACG00000000673	-	92	33.195	ENSLACG00000010900	-	89	33.195
ENSLACG00000000673	-	84	43.860	ENSLACG00000014952	-	76	43.860
ENSLACG00000000673	-	81	38.208	ENSLACG00000000077	-	80	38.208
ENSLACG00000000673	-	82	48.341	ENSLACG00000001384	-	100	47.549
ENSLACG00000000673	-	80	40.000	ENSLACG00000002051	-	76	40.000
ENSLACG00000000673	-	74	46.316	ENSLACG00000014769	-	92	46.316
ENSLACG00000000673	-	87	36.481	ENSLACG00000016396	-	83	36.481
ENSLACG00000000673	-	86	40.086	ENSLACG00000011552	-	87	40.086
ENSLACG00000000673	-	63	49.383	ENSLACG00000008643	-	94	49.383
ENSLACG00000000673	-	75	30.653	ENSLACG00000016319	-	74	30.653
ENSLACG00000000673	-	80	45.894	ENSLACG00000014732	-	92	45.894
ENSLACG00000000673	-	78	45.366	ENSLACG00000012198	-	85	45.366
ENSLACG00000000673	-	86	48.879	ENSLACG00000000876	-	95	48.879
ENSLACG00000000673	-	89	37.447	ENSLACG00000010346	-	78	37.447
ENSLACG00000000673	-	87	68.889	ENSLACG00000000643	-	92	68.889
ENSLACG00000000673	-	82	37.727	ENSLACG00000013987	-	82	37.727
ENSLACG00000000673	-	92	32.636	ENSLACG00000006473	-	82	36.150
ENSLACG00000000673	-	66	36.416	ENSLACG00000018384	-	94	36.416
ENSLACG00000000673	-	82	38.667	ENSLACG00000005344	-	79	38.667
ENSLACG00000000673	-	69	38.889	ENSLACG00000016955	-	69	38.889
ENSLACG00000000673	-	77	34.171	ENSLACG00000003451	-	88	34.171
ENSLACG00000000673	-	81	45.192	ENSLACG00000012357	-	88	45.192
ENSLACG00000000673	-	84	38.356	ENSLACG00000003145	-	95	38.356
ENSLACG00000000673	-	73	50.000	ENSLACG00000001055	-	83	50.000
ENSLACG00000000673	-	84	35.945	ENSLACG00000017727	-	93	35.945
ENSLACG00000000673	-	80	43.062	ENSLACG00000006110	-	91	43.062
ENSLACG00000000673	-	83	35.135	ENSLACG00000009013	-	67	35.135
ENSLACG00000000673	-	84	38.596	ENSLACG00000004508	-	85	38.596
ENSLACG00000000673	-	70	42.623	ENSLACG00000013072	-	72	42.623
ENSLACG00000000673	-	79	33.171	ENSLACG00000013538	-	93	33.171
ENSLACG00000000673	-	81	41.784	ENSLACG00000001298	-	89	41.784
ENSLACG00000000673	-	67	39.535	ENSLACG00000001295	-	72	39.535
ENSLACG00000000673	-	81	43.192	ENSLACG00000006210	-	80	43.192
ENSLACG00000000673	-	90	43.777	ENSLACG00000014189	-	81	43.777
ENSLACG00000000673	-	83	39.910	ENSLACG00000003957	-	78	39.732
ENSLACG00000000673	-	83	39.013	ENSLACG00000006820	-	83	39.013
ENSLACG00000000673	-	88	35.169	ENSLACG00000013472	-	93	35.169
ENSLACG00000000673	-	86	31.416	ENSLACG00000014493	-	75	31.416
ENSLACG00000000673	-	83	35.160	ENSLACG00000011265	-	89	35.160
ENSLACG00000000673	-	73	34.031	ENSLACG00000010705	-	78	34.031
ENSLACG00000000673	-	83	41.379	ENSLACG00000003217	-	84	40.336
ENSLACG00000000673	-	89	34.348	ENSLACG00000011150	-	83	34.348
ENSLACG00000000673	-	79	35.294	ENSLACG00000008859	-	81	35.294
ENSLACG00000000673	-	74	44.211	ENSLACG00000005368	-	90	44.211
ENSLACG00000000673	-	83	33.488	ENSLACG00000010019	-	88	33.488
ENSLACG00000000673	-	73	42.632	ENSLACG00000000465	-	74	42.632
ENSLACG00000000673	-	79	34.634	ENSLACG00000002651	-	84	34.634
ENSLACG00000000673	-	96	37.600	ENSLACG00000007340	-	98	37.600
ENSLACG00000000673	-	60	46.835	ENSLACG00000007342	-	77	46.835
ENSLACG00000000673	-	86	35.217	ENSLACG00000011390	-	90	35.217
ENSLACG00000000673	-	84	36.000	ENSLACG00000001077	-	92	36.000
ENSLACG00000000673	-	78	39.216	ENSLACG00000000848	-	83	39.216
ENSLACG00000000673	-	73	51.323	ENSLACG00000013090	-	90	51.323
ENSLACG00000000673	-	77	34.848	ENSLACG00000004272	-	94	34.848
ENSLACG00000000673	-	86	32.743	ENSLACG00000002471	-	75	32.743
ENSLACG00000000673	-	86	47.748	ENSLACG00000005266	-	77	47.748
ENSLACG00000000673	-	90	63.948	ENSLACG00000010144	-	85	63.948
ENSLACG00000000673	-	86	36.052	ENSLACG00000000534	-	87	36.052
ENSLACG00000000673	-	81	46.635	ENSLACG00000014474	-	79	46.635
ENSLACG00000000673	-	79	30.732	ENSLACG00000016517	-	98	30.732
ENSLACG00000000673	-	79	33.495	ENSLACG00000010092	-	97	32.468
ENSLACG00000000673	-	92	38.735	ENSLACG00000001559	-	78	40.084
ENSLACG00000000673	-	78	34.300	ENSLACG00000017411	-	96	34.300
ENSLACG00000000673	-	66	37.222	ENSLACG00000000903	-	80	37.222
ENSLACG00000000673	-	73	37.766	ENSLACG00000000907	-	85	37.766
ENSLACG00000000673	-	81	43.269	ENSLACG00000000369	-	73	43.269
ENSLACG00000000673	-	81	33.333	ENSLACG00000022180	-	87	33.333
ENSLACG00000000673	-	85	37.333	ENSLACG00000005009	-	93	37.333
ENSLACG00000000673	-	84	43.182	ENSLACG00000012229	-	83	43.182
ENSLACG00000000673	-	77	33.333	ENSLACG00000002135	-	89	33.333
ENSLACG00000000673	-	86	34.667	ENSLACG00000007821	-	76	34.667
ENSLACG00000000673	-	73	37.374	ENSLACG00000010569	-	87	37.374
ENSLACG00000000673	-	84	32.569	ENSLACG00000009806	-	80	32.569
ENSLACG00000000673	-	87	35.398	ENSLACG00000009393	-	97	35.398
ENSLACG00000000673	-	81	36.111	ENSLACG00000002189	-	96	36.111
ENSLACG00000000673	-	81	49.761	ENSLACG00000002451	-	76	49.761
ENSLACG00000000673	-	86	37.931	ENSLACG00000010859	-	86	37.931

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000000673	-	73	34.021	ENSAPEG00000002130	-	57	34.021	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000673	-	65	30.539	ENSAPEG00000023573	-	56	30.539	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000673	-	73	36.082	ENSAPEG00000013155	-	58	36.082	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000673	-	82	35.211	ENSAPEG00000022657	-	59	35.211	Amphiprion_percula
ENSLACG00000000673	-	71	32.065	ENSCVAG00000003346	-	52	32.065	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000000673	-	84	35.945	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	78	35.945	Danio_rerio
ENSLACG00000000673	-	78	33.990	ENSFHEG00000006296	-	59	33.990	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000000673	-	89	39.130	ENSLBEG00000017145	-	69	39.130	Labrus_bergylta
ENSLACG00000000673	-	69	33.149	ENSMZEG00005024824	-	57	33.149	Maylandia_zebra
ENSLACG00000000673	-	86	35.874	ENSMZEG00005020773	-	74	35.874	Maylandia_zebra
ENSLACG00000000673	-	56	35.616	ENSONIG00000021329	-	63	35.616	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000000673	-	76	33.500	ENSONIG00000020618	-	79	33.500	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000000673	-	75	40.000	ENSORLG00000020512	-	64	40.000	Oryzias_latipes
ENSLACG00000000673	-	74	32.995	ENSPKIG00000009100	-	57	32.995	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000000673	-	76	36.181	ENSPKIG00000001458	-	78	36.181	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000000673	-	55	35.417	ENSPMGG00000001874	-	50	35.417	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000000673	-	83	33.778	ENSPFOG00000020560	-	84	33.778	Poecilia_formosa
ENSLACG00000000673	-	70	32.222	ENSPFOG00000020665	-	65	32.222	Poecilia_formosa
ENSLACG00000000673	-	80	34.300	ENSPFOG00000020584	-	76	34.300	Poecilia_formosa
ENSLACG00000000673	-	70	32.222	ENSPMEG00000014224	-	60	32.222	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000000673	-	86	34.513	ENSPNYG00000003325	-	74	34.513	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000000673	-	84	36.986	ENSPNAG00000017685	-	64	36.986	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000000673	-	83	35.484	ENSSLDG00000008663	-	85	35.484	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000000673	-	78	35.468	ENSXMAG00000029285	-	69	35.468	Xiphophorus_maculatus