EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000000848 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 869 bases
Position: chrJH133392.1:5772-6640
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000000950	Transposase_22	PF02994.14	3.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000000959	-	708	-	ENSLACP00000000950	236 (aa)	-	H2ZU79

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000000848's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000000848's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000000848	-	86	32.569	ENSLACG00000000534	-	81	32.569
ENSLACG00000000848	-	78	30.303	ENSLACG00000012896	-	73	30.303
ENSLACG00000000848	-	90	35.556	ENSLACG00000013072	-	89	35.556
ENSLACG00000000848	-	83	35.455	ENSLACG00000006820	-	81	35.455
ENSLACG00000000848	-	86	35.648	ENSLACG00000013472	-	83	36.111
ENSLACG00000000848	-	79	36.318	ENSLACG00000014732	-	88	36.946
ENSLACG00000000848	-	84	30.374	ENSLACG00000022508	-	70	30.233
ENSLACG00000000848	-	88	73.934	ENSLACG00000011580	-	89	73.934
ENSLACG00000000848	-	78	38.220	ENSLACG00000010705	-	78	38.220
ENSLACG00000000848	-	72	39.106	ENSLACG00000002051	-	72	37.255
ENSLACG00000000848	-	88	45.161	ENSLACG00000011150	-	79	45.161
ENSLACG00000000848	-	85	43.541	ENSLACG00000010900	-	79	43.062
ENSLACG00000000848	-	71	38.857	ENSLACG00000005368	-	82	38.857
ENSLACG00000000848	-	87	66.986	ENSLACG00000010019	-	87	66.986
ENSLACG00000000848	-	86	73.077	ENSLACG00000000077	-	80	73.558
ENSLACG00000000848	-	83	34.975	ENSLACG00000001384	-	100	34.975
ENSLACG00000000848	-	80	37.436	ENSLACG00000007340	-	81	37.436
ENSLACG00000000848	-	77	36.702	ENSLACG00000007342	-	81	39.521
ENSLACG00000000848	-	84	41.063	ENSLACG00000010092	-	88	41.148
ENSLACG00000000848	-	86	38.528	ENSLACG00000016396	-	80	38.528
ENSLACG00000000848	-	96	33.858	ENSLACG00000011552	-	85	34.914
ENSLACG00000000848	-	87	35.874	ENSLACG00000011390	-	86	35.874
ENSLACG00000000848	-	84	30.374	ENSLACG00000005767	-	70	30.233
ENSLACG00000000848	-	76	35.450	ENSLACG00000013090	-	89	35.450
ENSLACG00000000848	-	69	31.928	ENSLACG00000016319	-	63	31.928
ENSLACG00000000848	-	69	32.353	ENSLACG00000022180	-	69	32.353
ENSLACG00000000848	-	76	40.526	ENSLACG00000004272	-	89	40.526
ENSLACG00000000848	-	86	35.681	ENSLACG00000005266	-	74	35.681
ENSLACG00000000848	-	78	34.615	ENSLACG00000014769	-	86	38.462
ENSLACG00000000848	-	84	39.423	ENSLACG00000010144	-	75	39.423
ENSLACG00000000848	-	85	41.429	ENSLACG00000006473	-	82	40.952
ENSLACG00000000848	-	92	72.523	ENSLACG00000003145	-	100	72.523
ENSLACG00000000848	-	84	31.308	ENSLACG00000008432	-	70	31.163
ENSLACG00000000848	-	90	72.300	ENSLACG00000009393	-	95	72.300
ENSLACG00000000848	-	82	38.889	ENSLACG00000010165	-	74	38.889
ENSLACG00000000848	-	87	39.906	ENSLACG00000001559	-	70	39.906
ENSLACG00000000848	-	78	37.563	ENSLACG00000001055	-	86	37.563
ENSLACG00000000848	-	65	33.533	ENSLACG00000000903	-	74	33.533
ENSLACG00000000848	-	75	33.854	ENSLACG00000000907	-	94	33.854
ENSLACG00000000848	-	85	38.095	ENSLACG00000014189	-	72	38.095
ENSLACG00000000848	-	89	68.837	ENSLACG00000005009	-	87	68.837
ENSLACG00000000848	-	87	36.321	ENSLACG00000012229	-	84	36.321
ENSLACG00000000848	-	80	35.385	ENSLACG00000000465	-	77	35.385
ENSLACG00000000848	-	78	35.897	ENSLACG00000001298	-	83	35.897
ENSLACG00000000848	-	87	37.736	ENSLACG00000006210	-	81	37.736
ENSLACG00000000848	-	87	37.264	ENSLACG00000003217	-	76	37.264
ENSLACG00000000848	-	86	62.981	ENSLACG00000010569	-	84	62.981
ENSLACG00000000848	-	78	38.860	ENSLACG00000016517	-	90	38.860
ENSLACG00000000848	-	87	37.559	ENSLACG00000000668	-	69	37.559
ENSLACG00000000848	-	78	42.708	ENSLACG00000008859	-	76	42.708
ENSLACG00000000848	-	86	36.406	ENSLACG00000014952	-	72	36.406
ENSLACG00000000848	-	81	39.698	ENSLACG00000002651	-	82	39.698
ENSLACG00000000848	-	90	78.802	ENSLACG00000011265	-	89	78.802
ENSLACG00000000848	-	82	38.500	ENSLACG00000010080	-	82	38.500
ENSLACG00000000848	-	85	38.756	ENSLACG00000006865	-	87	38.647
ENSLACG00000000848	-	84	31.068	ENSLACG00000013182	-	92	32.020
ENSLACG00000000848	-	92	36.017	ENSLACG00000001077	-	93	36.017
ENSLACG00000000848	-	88	43.836	ENSLACG00000002471	-	73	43.379
ENSLACG00000000848	-	86	35.023	ENSLACG00000006813	-	83	35.023
ENSLACG00000000848	-	64	39.103	ENSLACG00000010633	-	88	39.103
ENSLACG00000000848	-	69	68.293	ENSLACG00000018384	-	85	68.293
ENSLACG00000000848	-	71	38.728	ENSLACG00000007535	-	98	38.728
ENSLACG00000000848	-	81	41.500	ENSLACG00000003451	-	88	41.500
ENSLACG00000000848	-	81	36.058	ENSLACG00000014474	-	76	36.058
ENSLACG00000000848	-	82	33.498	ENSLACG00000009013	-	61	33.498
ENSLACG00000000848	-	65	34.545	ENSLACG00000001295	-	65	34.545
ENSLACG00000000848	-	87	38.967	ENSLACG00000012198	-	89	38.967
ENSLACG00000000848	-	85	44.019	ENSLACG00000010346	-	71	43.541
ENSLACG00000000848	-	84	30.841	ENSLACG00000010803	-	70	30.698
ENSLACG00000000848	-	82	31.944	ENSLACG00000017411	-	99	30.556
ENSLACG00000000848	-	78	39.583	ENSLACG00000002135	-	96	38.073
ENSLACG00000000848	-	86	35.545	ENSLACG00000000643	-	86	35.545
ENSLACG00000000848	-	64	33.742	ENSLACG00000002891	-	74	33.742
ENSLACG00000000848	-	78	36.979	ENSLACG00000000369	-	68	36.410
ENSLACG00000000848	-	87	37.089	ENSLACG00000013987	-	77	37.089
ENSLACG00000000848	-	87	39.286	ENSLACG00000003957	-	77	39.286
ENSLACG00000000848	-	85	37.198	ENSLACG00000005344	-	72	37.198
ENSLACG00000000848	-	81	37.688	ENSLACG00000009806	-	72	37.688
ENSLACG00000000848	-	78	42.932	ENSLACG00000016955	-	74	42.408
ENSLACG00000000848	-	85	39.512	ENSLACG00000014493	-	69	39.512
ENSLACG00000000848	-	85	42.105	ENSLACG00000007821	-	70	42.105
ENSLACG00000000848	-	86	33.641	ENSLACG00000012357	-	84	36.453
ENSLACG00000000848	-	83	72.637	ENSLACG00000002189	-	87	72.637
ENSLACG00000000848	-	86	36.493	ENSLACG00000002451	-	76	36.019
ENSLACG00000000848	-	86	38.942	ENSLACG00000000876	-	89	38.942
ENSLACG00000000848	-	89	71.963	ENSLACG00000017727	-	94	71.963
ENSLACG00000000848	-	87	36.792	ENSLACG00000006110	-	93	36.792
ENSLACG00000000848	-	83	39.216	ENSLACG00000000673	-	78	39.216
ENSLACG00000000848	-	87	33.190	ENSLACG00000010859	-	85	33.190
ENSLACG00000000848	-	68	36.310	ENSLACG00000008643	-	94	38.272
ENSLACG00000000848	-	87	38.393	ENSLACG00000004508	-	83	38.393