EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000001295 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1216 bases
Position: chrJH126955.1:14688-15903
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000001449	Transposase_22	PF02994.14	9.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000001461	-	693	-	ENSLACP00000001449	231 (aa)	-	H2ZVM8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000001295's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000001295's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000001295	-	74	34.270	ENSLACG00000010900	-	67	34.270
ENSLACG00000001295	-	68	41.718	ENSLACG00000001384	-	82	42.945
ENSLACG00000001295	-	61	40.000	ENSLACG00000013072	-	61	40.000
ENSLACG00000001295	-	73	34.659	ENSLACG00000005009	-	70	34.659
ENSLACG00000001295	-	79	32.536	ENSLACG00000010346	-	71	32.536
ENSLACG00000001295	-	80	44.737	ENSLACG00000002051	-	70	44.737
ENSLACG00000001295	-	65	36.129	ENSLACG00000003145	-	69	36.129
ENSLACG00000001295	-	79	33.684	ENSLACG00000013987	-	66	33.684
ENSLACG00000001295	-	79	33.824	ENSLACG00000016955	-	79	33.824
ENSLACG00000001295	-	79	38.144	ENSLACG00000000876	-	82	38.144
ENSLACG00000001295	-	79	47.872	ENSLACG00000014769	-	88	48.087
ENSLACG00000001295	-	74	37.853	ENSLACG00000007821	-	59	37.853
ENSLACG00000001295	-	60	31.875	ENSLACG00000010569	-	67	31.875
ENSLACG00000001295	-	72	35.556	ENSLACG00000012229	-	73	35.556
ENSLACG00000001295	-	69	34.731	ENSLACG00000009013	-	50	34.731
ENSLACG00000001295	-	79	36.508	ENSLACG00000001077	-	76	36.508
ENSLACG00000001295	-	72	39.535	ENSLACG00000000673	-	67	39.535
ENSLACG00000001295	-	80	34.328	ENSLACG00000000534	-	71	34.328
ENSLACG00000001295	-	73	32.759	ENSLACG00000002651	-	71	32.759
ENSLACG00000001295	-	72	47.674	ENSLACG00000014732	-	76	47.674
ENSLACG00000001295	-	78	46.774	ENSLACG00000010165	-	70	46.774
ENSLACG00000001295	-	72	33.333	ENSLACG00000010705	-	70	33.333
ENSLACG00000001295	-	75	44.693	ENSLACG00000005266	-	62	44.693
ENSLACG00000001295	-	51	47.541	ENSLACG00000007535	-	71	49.180
ENSLACG00000001295	-	64	38.462	ENSLACG00000017727	-	66	38.462
ENSLACG00000001295	-	78	40.933	ENSLACG00000000643	-	79	40.933
ENSLACG00000001295	-	81	35.096	ENSLACG00000006820	-	76	36.408
ENSLACG00000001295	-	79	45.989	ENSLACG00000002451	-	68	45.989
ENSLACG00000001295	-	80	33.010	ENSLACG00000003957	-	71	33.981
ENSLACG00000001295	-	64	38.065	ENSLACG00000010080	-	84	32.420
ENSLACG00000001295	-	71	36.813	ENSLACG00000002189	-	73	36.813
ENSLACG00000001295	-	71	36.932	ENSLACG00000000077	-	66	36.932
ENSLACG00000001295	-	81	75.521	ENSLACG00000014474	-	73	75.521
ENSLACG00000001295	-	75	35.714	ENSLACG00000011265	-	72	35.714
ENSLACG00000001295	-	78	45.161	ENSLACG00000000369	-	65	45.161
ENSLACG00000001295	-	76	34.921	ENSLACG00000006210	-	74	34.921
ENSLACG00000001295	-	79	44.920	ENSLACG00000001055	-	73	44.920
ENSLACG00000001295	-	77	36.066	ENSLACG00000016517	-	85	36.066
ENSLACG00000001295	-	72	32.979	ENSLACG00000000903	-	84	32.979
ENSLACG00000001295	-	64	36.184	ENSLACG00000009806	-	55	36.184
ENSLACG00000001295	-	64	40.260	ENSLACG00000002135	-	69	40.260
ENSLACG00000001295	-	71	35.955	ENSLACG00000008859	-	70	35.955
ENSLACG00000001295	-	80	42.857	ENSLACG00000000907	-	89	42.857
ENSLACG00000001295	-	75	46.369	ENSLACG00000005368	-	85	46.369
ENSLACG00000001295	-	74	34.054	ENSLACG00000006473	-	72	34.595
ENSLACG00000001295	-	80	34.375	ENSLACG00000001298	-	83	34.375
ENSLACG00000001295	-	74	40.984	ENSLACG00000010144	-	67	40.984
ENSLACG00000001295	-	73	35.632	ENSLACG00000004272	-	83	35.632
ENSLACG00000001295	-	79	33.810	ENSLACG00000002471	-	70	33.810
ENSLACG00000001295	-	93	32.340	ENSLACG00000000668	-	78	32.340
ENSLACG00000001295	-	80	32.367	ENSLACG00000005344	-	73	32.367
ENSLACG00000001295	-	80	33.659	ENSLACG00000001559	-	70	34.634
ENSLACG00000001295	-	81	33.173	ENSLACG00000003217	-	76	34.135
ENSLACG00000001295	-	71	34.503	ENSLACG00000014493	-	59	34.503
ENSLACG00000001295	-	51	43.200	ENSLACG00000000465	-	50	43.200
ENSLACG00000001295	-	76	35.263	ENSLACG00000013472	-	74	35.263
ENSLACG00000001295	-	62	38.562	ENSLACG00000012198	-	66	38.562
ENSLACG00000001295	-	80	35.678	ENSLACG00000011552	-	72	35.678
ENSLACG00000001295	-	70	36.471	ENSLACG00000018384	-	88	36.471
ENSLACG00000001295	-	51	38.400	ENSLACG00000007340	-	53	38.400
ENSLACG00000001295	-	51	39.200	ENSLACG00000007342	-	61	39.200
ENSLACG00000001295	-	79	43.316	ENSLACG00000013090	-	89	43.316
ENSLACG00000001295	-	72	33.880	ENSLACG00000010019	-	74	33.880
ENSLACG00000001295	-	80	36.181	ENSLACG00000014952	-	64	36.181
ENSLACG00000001295	-	65	34.545	ENSLACG00000000848	-	65	34.545
ENSLACG00000001295	-	78	47.826	ENSLACG00000006813	-	72	47.826
ENSLACG00000001295	-	72	39.429	ENSLACG00000009393	-	75	39.429
ENSLACG00000001295	-	68	33.537	ENSLACG00000010092	-	76	32.418
ENSLACG00000001295	-	66	46.203	ENSLACG00000010633	-	97	44.118
ENSLACG00000001295	-	78	46.486	ENSLACG00000012357	-	78	46.486
ENSLACG00000001295	-	64	38.889	ENSLACG00000011580	-	63	38.889
ENSLACG00000001295	-	74	33.690	ENSLACG00000003451	-	82	33.690
ENSLACG00000001295	-	77	31.795	ENSLACG00000007888	-	78	31.795
ENSLACG00000001295	-	73	33.714	ENSLACG00000006865	-	68	35.802
ENSLACG00000001295	-	77	36.216	ENSLACG00000011150	-	65	36.216
ENSLACG00000001295	-	76	33.333	ENSLACG00000016319	-	70	33.333
ENSLACG00000001295	-	69	36.207	ENSLACG00000006110	-	78	36.207
ENSLACG00000001295	-	74	38.286	ENSLACG00000013182	-	80	38.286
ENSLACG00000001295	-	80	46.939	ENSLACG00000014189	-	69	46.701
ENSLACG00000001295	-	79	31.841	ENSLACG00000011390	-	77	31.841
ENSLACG00000001295	-	80	37.696	ENSLACG00000016396	-	68	37.696