EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000001298 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1676 bases
Position: chrJH128809.1:14817-16492
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000001453	Transposase_22	PF02994.14	1.7e-07	1	1
ENSLACP00000001452	Transposase_22	PF02994.14	1.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000001465	-	690	-	ENSLACP00000001453	230 (aa)	-	H2ZVN2
ENSLACT00000001464	-	711	-	ENSLACP00000001452	237 (aa)	-	H2ZVN1

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000001298's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000001298's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000001298	-	98	32.479	ENSLACG00000016955	-	89	32.479
ENSLACG00000001298	-	87	58.411	ENSLACG00000013987	-	80	58.411
ENSLACG00000001298	-	85	33.173	ENSLACG00000007821	-	68	33.173
ENSLACG00000001298	-	95	79.911	ENSLACG00000000668	-	79	76.170
ENSLACG00000001298	-	84	35.859	ENSLACG00000003145	-	85	35.859
ENSLACG00000001298	-	93	33.953	ENSLACG00000010900	-	79	33.953
ENSLACG00000001298	-	87	37.915	ENSLACG00000001384	-	93	38.776
ENSLACG00000001298	-	64	48.322	ENSLACG00000007535	-	85	48.322
ENSLACG00000001298	-	84	32.673	ENSLACG00000002135	-	89	32.673
ENSLACG00000001298	-	87	33.010	ENSLACG00000016517	-	97	33.010
ENSLACG00000001298	-	83	35.897	ENSLACG00000000848	-	78	35.897
ENSLACG00000001298	-	87	40.594	ENSLACG00000005266	-	69	40.594
ENSLACG00000001298	-	80	59.898	ENSLACG00000013072	-	81	59.898
ENSLACG00000001298	-	83	34.375	ENSLACG00000001295	-	80	34.375
ENSLACG00000001298	-	98	47.699	ENSLACG00000016396	-	85	47.699
ENSLACG00000001298	-	98	69.874	ENSLACG00000005344	-	86	69.874
ENSLACG00000001298	-	87	30.806	ENSLACG00000006865	-	86	30.806
ENSLACG00000001298	-	93	84.581	ENSLACG00000010859	-	85	84.581
ENSLACG00000001298	-	82	34.826	ENSLACG00000013182	-	86	33.668
ENSLACG00000001298	-	97	38.393	ENSLACG00000001055	-	95	38.393
ENSLACG00000001298	-	84	33.171	ENSLACG00000002651	-	83	32.857
ENSLACG00000001298	-	91	38.571	ENSLACG00000000876	-	91	38.571
ENSLACG00000001298	-	92	76.211	ENSLACG00000000534	-	85	76.211
ENSLACG00000001298	-	94	66.087	ENSLACG00000003957	-	80	66.087
ENSLACG00000001298	-	87	34.328	ENSLACG00000004272	-	94	34.328
ENSLACG00000001298	-	83	39.594	ENSLACG00000011580	-	82	39.594
ENSLACG00000001298	-	68	42.675	ENSLACG00000008643	-	87	42.675
ENSLACG00000001298	-	98	33.333	ENSLACG00000000369	-	82	33.333
ENSLACG00000001298	-	84	39.394	ENSLACG00000011265	-	80	39.394
ENSLACG00000001298	-	85	50.490	ENSLACG00000000903	-	96	48.165
ENSLACG00000001298	-	89	30.660	ENSLACG00000000907	-	96	30.660
ENSLACG00000001298	-	85	36.453	ENSLACG00000003451	-	89	36.453
ENSLACG00000001298	-	97	34.764	ENSLACG00000010346	-	78	34.764
ENSLACG00000001298	-	93	38.009	ENSLACG00000012357	-	90	38.182
ENSLACG00000001298	-	99	71.488	ENSLACG00000001559	-	82	71.488
ENSLACG00000001298	-	66	80.263	ENSLACG00000007342	-	75	80.263
ENSLACG00000001298	-	86	33.500	ENSLACG00000009013	-	60	32.663
ENSLACG00000001298	-	84	35.052	ENSLACG00000000425	-	96	35.052
ENSLACG00000001298	-	88	36.139	ENSLACG00000010569	-	86	36.139
ENSLACG00000001298	-	92	64.889	ENSLACG00000004508	-	84	64.889
ENSLACG00000001298	-	83	78.155	ENSLACG00000012229	-	84	78.155
ENSLACG00000001298	-	92	84.444	ENSLACG00000011552	-	84	84.444
ENSLACG00000001298	-	89	41.784	ENSLACG00000000673	-	81	41.784
ENSLACG00000001298	-	85	40.796	ENSLACG00000017727	-	87	40.796
ENSLACG00000001298	-	92	60.000	ENSLACG00000011390	-	88	60.000
ENSLACG00000001298	-	94	33.929	ENSLACG00000014189	-	80	33.906
ENSLACG00000001298	-	96	36.000	ENSLACG00000010165	-	82	36.000
ENSLACG00000001298	-	87	38.679	ENSLACG00000000077	-	81	38.679
ENSLACG00000001298	-	85	37.561	ENSLACG00000008859	-	80	37.561
ENSLACG00000001298	-	95	71.552	ENSLACG00000003217	-	85	71.552
ENSLACG00000001298	-	77	72.396	ENSLACG00000012198	-	82	72.396
ENSLACG00000001298	-	98	35.043	ENSLACG00000011150	-	82	35.043
ENSLACG00000001298	-	81	84.000	ENSLACG00000006110	-	90	84.000
ENSLACG00000001298	-	84	35.859	ENSLACG00000010019	-	82	35.859
ENSLACG00000001298	-	88	35.577	ENSLACG00000006473	-	75	36.765
ENSLACG00000001298	-	81	31.795	ENSLACG00000010092	-	86	32.692
ENSLACG00000001298	-	95	31.696	ENSLACG00000010705	-	90	31.696
ENSLACG00000001298	-	96	92.982	ENSLACG00000014952	-	77	92.982
ENSLACG00000001298	-	98	72.385	ENSLACG00000006820	-	89	72.385
ENSLACG00000001298	-	87	36.232	ENSLACG00000002189	-	91	36.232
ENSLACG00000001298	-	94	38.249	ENSLACG00000002451	-	78	38.249
ENSLACG00000001298	-	93	36.111	ENSLACG00000014474	-	81	36.111
ENSLACG00000001298	-	88	40.191	ENSLACG00000010144	-	75	40.191
ENSLACG00000001298	-	95	30.213	ENSLACG00000016319	-	86	30.213
ENSLACG00000001298	-	87	36.816	ENSLACG00000014732	-	88	36.816
ENSLACG00000001298	-	81	39.037	ENSLACG00000017411	-	88	39.037
ENSLACG00000001298	-	95	32.143	ENSLACG00000006813	-	86	32.143
ENSLACG00000001298	-	97	33.617	ENSLACG00000002471	-	78	33.617
ENSLACG00000001298	-	87	37.561	ENSLACG00000009393	-	88	37.561
ENSLACG00000001298	-	87	30.918	ENSLACG00000022180	-	84	30.918
ENSLACG00000001298	-	89	37.089	ENSLACG00000000643	-	86	37.089
ENSLACG00000001298	-	79	37.037	ENSLACG00000018384	-	94	38.547
ENSLACG00000001298	-	68	39.241	ENSLACG00000010633	-	95	36.994
ENSLACG00000001298	-	88	37.379	ENSLACG00000005009	-	85	37.379
ENSLACG00000001298	-	81	32.258	ENSLACG00000009806	-	67	32.258
ENSLACG00000001298	-	65	45.033	ENSLACG00000014769	-	98	37.619
ENSLACG00000001298	-	90	39.048	ENSLACG00000013090	-	98	39.048
ENSLACG00000001298	-	75	64.706	ENSLACG00000007340	-	80	64.706
ENSLACG00000001298	-	55	48.462	ENSLACG00000002051	-	69	38.974
ENSLACG00000001298	-	85	31.633	ENSLACG00000013538	-	92	31.633
ENSLACG00000001298	-	94	37.156	ENSLACG00000005368	-	98	37.156
ENSLACG00000001298	-	73	67.760	ENSLACG00000000465	-	74	67.760
ENSLACG00000001298	-	94	31.034	ENSLACG00000014493	-	75	31.034
ENSLACG00000001298	-	86	50.711	ENSLACG00000013472	-	83	50.711
ENSLACG00000001298	-	98	62.389	ENSLACG00000010080	-	88	62.389
ENSLACG00000001298	-	87	50.235	ENSLACG00000001077	-	87	50.235
ENSLACG00000001298	-	87	75.814	ENSLACG00000006210	-	84	75.814