EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000001384 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 750 bases
Position: chrJH128894.1:17652-18401
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000001548	Transposase_22	PF02994.14	1.3e-06	1	1
ENSLACP00000001547	Transposase_22	PF02994.14	1.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000001560	-	690	-	ENSLACP00000001547	230 (aa)	-	H2ZVX6
ENSLACT00000001561	-	597	-	ENSLACP00000001548	199 (aa)	-	H2ZVX7

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000001384's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000001384's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000001384	-	98	35.238	ENSLACG00000011390	-	82	35.545
ENSLACG00000001384	-	91	38.947	ENSLACG00000007340	-	77	39.683
ENSLACG00000001384	-	76	45.283	ENSLACG00000007342	-	77	46.835
ENSLACG00000001384	-	90	31.795	ENSLACG00000008432	-	73	30.357
ENSLACG00000001384	-	89	34.254	ENSLACG00000022180	-	79	34.197
ENSLACG00000001384	-	98	33.168	ENSLACG00000010346	-	71	33.971
ENSLACG00000001384	-	98	39.524	ENSLACG00000006820	-	78	40.476
ENSLACG00000001384	-	99	36.279	ENSLACG00000000534	-	83	36.036
ENSLACG00000001384	-	93	33.508	ENSLACG00000016517	-	94	33.333
ENSLACG00000001384	-	100	37.561	ENSLACG00000011580	-	85	37.561
ENSLACG00000001384	-	79	36.478	ENSLACG00000018384	-	81	37.423
ENSLACG00000001384	-	100	51.961	ENSLACG00000005266	-	72	53.302
ENSLACG00000001384	-	99	31.707	ENSLACG00000009013	-	70	31.602
ENSLACG00000001384	-	99	37.073	ENSLACG00000002189	-	86	37.561
ENSLACG00000001384	-	90	31.285	ENSLACG00000004272	-	91	30.890
ENSLACG00000001384	-	98	33.014	ENSLACG00000014493	-	69	33.014
ENSLACG00000001384	-	99	38.208	ENSLACG00000013987	-	79	38.182
ENSLACG00000001384	-	100	64.216	ENSLACG00000000876	-	91	64.186
ENSLACG00000001384	-	90	31.667	ENSLACG00000002651	-	81	31.313
ENSLACG00000001384	-	87	37.143	ENSLACG00000002135	-	88	34.146
ENSLACG00000001384	-	99	37.264	ENSLACG00000011552	-	84	36.726
ENSLACG00000001384	-	98	33.168	ENSLACG00000007821	-	68	34.123
ENSLACG00000001384	-	100	37.850	ENSLACG00000013472	-	86	38.356
ENSLACG00000001384	-	99	39.512	ENSLACG00000012198	-	85	40.777
ENSLACG00000001384	-	84	32.609	ENSLACG00000000425	-	98	31.937
ENSLACG00000001384	-	91	50.538	ENSLACG00000001055	-	90	48.372
ENSLACG00000001384	-	95	42.051	ENSLACG00000014732	-	87	43.590
ENSLACG00000001384	-	95	42.784	ENSLACG00000012357	-	81	45.026
ENSLACG00000001384	-	82	50.307	ENSLACG00000010633	-	94	49.697
ENSLACG00000001384	-	98	34.450	ENSLACG00000010900	-	80	33.649
ENSLACG00000001384	-	97	44.444	ENSLACG00000014474	-	81	43.868
ENSLACG00000001384	-	100	33.816	ENSLACG00000003145	-	90	34.466
ENSLACG00000001384	-	82	42.945	ENSLACG00000001295	-	68	41.718
ENSLACG00000001384	-	93	38.776	ENSLACG00000001298	-	87	37.915
ENSLACG00000001384	-	74	43.791	ENSLACG00000008643	-	89	46.405
ENSLACG00000001384	-	100	36.098	ENSLACG00000011265	-	84	36.190
ENSLACG00000001384	-	90	32.308	ENSLACG00000022508	-	73	30.804
ENSLACG00000001384	-	99	40.094	ENSLACG00000003957	-	78	40.088
ENSLACG00000001384	-	99	40.488	ENSLACG00000001559	-	72	40.183
ENSLACG00000001384	-	100	33.649	ENSLACG00000005009	-	91	32.273
ENSLACG00000001384	-	96	34.826	ENSLACG00000017411	-	94	34.826
ENSLACG00000001384	-	98	32.673	ENSLACG00000011150	-	85	32.618
ENSLACG00000001384	-	99	39.906	ENSLACG00000006210	-	82	41.038
ENSLACG00000001384	-	100	37.089	ENSLACG00000016396	-	78	36.818
ENSLACG00000001384	-	95	40.686	ENSLACG00000013072	-	84	40.686
ENSLACG00000001384	-	89	44.505	ENSLACG00000014769	-	88	46.703
ENSLACG00000001384	-	92	30.049	ENSLACG00000012896	-	80	30.556
ENSLACG00000001384	-	98	33.663	ENSLACG00000002471	-	70	33.971
ENSLACG00000001384	-	100	34.783	ENSLACG00000010019	-	87	34.272
ENSLACG00000001384	-	98	30.198	ENSLACG00000010092	-	91	33.333
ENSLACG00000001384	-	100	36.585	ENSLACG00000017727	-	88	37.255
ENSLACG00000001384	-	96	34.818	ENSLACG00000002051	-	77	36.620
ENSLACG00000001384	-	100	32.367	ENSLACG00000007888	-	85	32.367
ENSLACG00000001384	-	100	33.173	ENSLACG00000010569	-	91	32.719
ENSLACG00000001384	-	100	33.803	ENSLACG00000001077	-	90	34.247
ENSLACG00000001384	-	100	34.975	ENSLACG00000000848	-	83	34.975
ENSLACG00000001384	-	94	43.005	ENSLACG00000014189	-	81	39.485
ENSLACG00000001384	-	86	45.930	ENSLACG00000005368	-	82	49.419
ENSLACG00000001384	-	99	40.000	ENSLACG00000003217	-	82	38.496
ENSLACG00000001384	-	90	35.000	ENSLACG00000003451	-	87	33.838
ENSLACG00000001384	-	99	38.967	ENSLACG00000000668	-	71	39.091
ENSLACG00000001384	-	99	39.906	ENSLACG00000014952	-	75	39.648
ENSLACG00000001384	-	99	37.736	ENSLACG00000004508	-	79	37.736
ENSLACG00000001384	-	98	52.239	ENSLACG00000010144	-	76	52.885
ENSLACG00000001384	-	91	46.774	ENSLACG00000013090	-	100	45.238
ENSLACG00000001384	-	99	37.321	ENSLACG00000005344	-	81	36.607
ENSLACG00000001384	-	95	45.128	ENSLACG00000000369	-	84	41.841
ENSLACG00000001384	-	88	36.364	ENSLACG00000016955	-	77	34.518
ENSLACG00000001384	-	77	31.169	ENSLACG00000002891	-	78	31.034
ENSLACG00000001384	-	100	48.039	ENSLACG00000002451	-	82	46.222
ENSLACG00000001384	-	90	31.282	ENSLACG00000010803	-	63	31.282
ENSLACG00000001384	-	89	39.512	ENSLACG00000000907	-	97	39.512
ENSLACG00000001384	-	77	38.650	ENSLACG00000000903	-	76	39.181
ENSLACG00000001384	-	90	30.270	ENSLACG00000013538	-	89	30.769
ENSLACG00000001384	-	91	40.526	ENSLACG00000000465	-	73	41.799
ENSLACG00000001384	-	90	33.333	ENSLACG00000010705	-	78	31.937
ENSLACG00000001384	-	97	39.904	ENSLACG00000006110	-	93	40.580
ENSLACG00000001384	-	100	39.901	ENSLACG00000009393	-	88	39.901
ENSLACG00000001384	-	90	31.795	ENSLACG00000014503	-	73	30.357
ENSLACG00000001384	-	98	34.783	ENSLACG00000009806	-	73	36.232
ENSLACG00000001384	-	99	38.028	ENSLACG00000010859	-	84	37.445
ENSLACG00000001384	-	99	41.004	ENSLACG00000006813	-	93	41.004
ENSLACG00000001384	-	78	79.375	ENSLACG00000007535	-	91	82.803
ENSLACG00000001384	-	90	32.308	ENSLACG00000005767	-	73	30.804
ENSLACG00000001384	-	97	41.584	ENSLACG00000010080	-	83	42.786
ENSLACG00000001384	-	100	52.941	ENSLACG00000000643	-	82	55.224
ENSLACG00000001384	-	99	39.151	ENSLACG00000012229	-	86	39.151
ENSLACG00000001384	-	90	35.556	ENSLACG00000008859	-	78	34.343
ENSLACG00000001384	-	95	43.814	ENSLACG00000010165	-	73	46.073
ENSLACG00000001384	-	100	37.561	ENSLACG00000000077	-	78	37.073
ENSLACG00000001384	-	98	34.158	ENSLACG00000006473	-	80	35.071
ENSLACG00000001384	-	100	65.500	ENSLACG00000013182	-	91	65.500
ENSLACG00000001384	-	100	47.549	ENSLACG00000000673	-	82	48.341

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000001384	-	93	34.555	ENSACIG00000013512	-	66	33.023	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000001384	-	98	32.673	ENSACIG00000018891	-	63	31.481	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000001384	-	98	32.673	ENSACIG00000014541	-	64	31.481	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000001384	-	93	31.122	ENSAPEG00000002130	-	61	31.905	Amphiprion_percula
ENSLACG00000001384	-	97	32.836	ENSAPEG00000013155	-	62	33.810	Amphiprion_percula
ENSLACG00000001384	-	96	33.171	ENSAPEG00000022657	-	57	33.659	Amphiprion_percula
ENSLACG00000001384	-	98	32.110	ENSCVAG00000003346	-	62	32.110	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000001384	-	100	35.407	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	79	34.978	Danio_rerio
ENSLACG00000001384	-	90	31.731	ENSFHEG00000006296	-	60	31.731	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000001384	-	93	32.632	ENSKMAG00000012954	-	61	33.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000001384	-	88	33.523	ENSKMAG00000000861	-	74	32.161	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000001384	-	98	32.500	ENSKMAG00000000253	-	62	31.163	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000001384	-	100	36.275	ENSLBEG00000017145	-	62	36.538	Labrus_bergylta
ENSLACG00000001384	-	100	35.514	ENSMZEG00005020773	-	68	35.211	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001384	-	74	30.409	ENSMZEG00005024824	-	54	30.409	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001384	-	98	31.429	ENSONIG00000020618	-	82	32.381	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000001384	-	82	37.059	ENSONIG00000021329	-	71	38.235	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000001384	-	92	35.789	ENSORLG00000020512	-	68	34.783	Oryzias_latipes
ENSLACG00000001384	-	94	32.124	ENSOMEG00000019152	-	73	32.642	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000001384	-	98	33.990	ENSPKIG00000009100	-	60	34.483	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000001384	-	93	38.426	ENSPKIG00000001458	-	79	38.693	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000001384	-	76	39.394	ENSPMGG00000001874	-	57	40.606	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000001384	-	100	30.516	ENSPFOG00000020560	-	79	30.516	Poecilia_formosa
ENSLACG00000001384	-	98	39.604	ENSPFOG00000020584	-	74	40.594	Poecilia_formosa
ENSLACG00000001384	-	93	32.461	ENSPFOG00000020665	-	77	30.769	Poecilia_formosa
ENSLACG00000001384	-	98	32.000	ENSPLAG00000016026	-	72	32.000	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000001384	-	93	30.890	ENSPMEG00000014224	-	73	30.233	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000001384	-	89	32.086	ENSPMEG00000021431	-	65	31.313	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000001384	-	95	32.821	ENSPMEG00000022872	-	67	31.507	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000001384	-	98	40.099	ENSPNYG00000003325	-	71	38.605	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000001384	-	100	34.146	ENSPNAG00000017685	-	56	35.644	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000001384	-	100	39.512	ENSSLDG00000008663	-	84	38.140	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000001384	-	93	31.222	ENSXMAG00000023095	-	58	31.674	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000001384	-	98	33.663	ENSXMAG00000021250	-	63	32.407	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000001384	-	98	34.314	ENSXMAG00000029285	-	70	34.742	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000001384	-	98	33.663	ENSXMAG00000024802	-	64	32.407	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000001384	-	98	33.663	ENSXMAG00000026781	-	58	32.407	Xiphophorus_maculatus