EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSLACG00000001597 (Gene tree)
Gene ID: 102347514
Gene Symbol: ZMAT5
Alias: SNRNP20|ZC3H19
Full Name: zinc finger matrin-type 5
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 51580 bases
Position: chrJH130554.1:23691-75270
Accession: 102347514
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000001790	zf-U1	PF06220.12	3.9e-07	1	1
ENSLACP00000022912	zf-U1	PF06220.12	3.9e-07	1	1
ENSLACP00000001790	zf-CCCH	PF00642.24	3.9e-09	1	1
ENSLACP00000022912	zf-CCCH	PF00642.24	3.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000026183	ZMAT5-201	1610	-	ENSLACP00000022912	174 (aa)	-	H2ZWL9
ENSLACT00000001803	ZMAT5-202	1466	XM_006013250	ENSLACP00000001790	174 (aa)	XP_006013312	H2ZWL9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSG00000100319	ZMAT5	100	54.023	Homo_sapiens
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	55.000	ENSAPOG00000000944	zmat5	100	54.749	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	49.724	ENSAMEG00000008059	ZMAT5	100	49.724	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.846	ENSACIG00000015828	zmat5	100	53.552	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	55.307	ENSAOCG00000003009	zmat5	100	55.307	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	55.307	ENSAPEG00000011779	zmat5	100	55.307	Amphiprion_percula
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	50.276	ENSATEG00000020071	zmat5	100	50.276	Anabas_testudineus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	91	39.157	ENSAPLG00000007232	ZMAT5	100	37.430	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000001597	ZMAT5	71	57.364	ENSACAG00000000796	ZMAT5	96	58.730	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSANAG00000032394	ZMAT5	100	54.023	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	51.724	ENSAMXG00000006979	zmat5	100	51.724	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.598	ENSBTAG00000017890	ZMAT5	100	54.598	Bos_taurus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSCJAG00000021763	ZMAT5	100	53.448	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSCAFG00000012343	ZMAT5	100	52.299	Canis_familiaris
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSCAFG00020000699	ZMAT5	100	52.299	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	45.455	ENSCHIG00000014766	ZMAT5	100	46.023	Capra_hircus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSTSYG00000032219	ZMAT5	100	54.023	Carlito_syrichta
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	48.276	ENSCAPG00000017916	ZMAT5	100	48.276	Cavia_aperea
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.874	ENSCPOG00000035759	ZMAT5	100	52.874	Cavia_porcellus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSCCAG00000027039	ZMAT5	100	54.023	Cebus_capucinus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSCATG00000041346	ZMAT5	100	54.023	Cercocebus_atys
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.107	ENSCLAG00000011728	ZMAT5	100	52.874	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSCSAG00000009611	ZMAT5	100	54.023	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	56.322	ENSCPBG00000007737	ZMAT5	100	56.322	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000001597	ZMAT5	86	35.065	ENSCING00000024695	-	85	35.065	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	40.113	ENSCSAVG00000011080	-	81	40.278	Ciona_savignyi
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSCANG00000027205	ZMAT5	100	54.023	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSCGRG00001006990	Zmat5	100	53.448	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSCGRG00000013989	Zmat5	100	53.448	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000001597	ZMAT5	90	48.765	ENSCSEG00000015698	zmat5	100	48.066	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.514	ENSCVAG00000021521	zmat5	100	52.514	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	50.000	ENSDARG00000035434	zmat5	100	50.857	Danio_rerio
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	55.172	ENSDNOG00000000899	ZMAT5	100	55.172	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSDORG00000005655	Zmat5	100	53.448	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.874	ENSETEG00000003789	ZMAT5	100	52.874	Echinops_telfairi
ENSLACG00000001597	ZMAT5	89	40.645	ENSEBUG00000015692	zmat5	67	39.474	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSEASG00005010189	ZMAT5	100	53.448	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSECAG00000017576	ZMAT5	100	53.448	Equus_caballus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	50.575	ENSEEUG00000000936	ZMAT5	100	50.575	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	46.196	ENSELUG00000000943	zmat5	100	50.847	Esox_lucius
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSFCAG00000004251	ZMAT5	100	52.299	Felis_catus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	55.747	ENSFALG00000007011	ZMAT5	100	55.747	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.874	ENSFDAG00000019792	ZMAT5	100	52.874	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.409	ENSFHEG00000020879	zmat5	100	53.409	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	69	57.851	ENSGMOG00000012163	zmat5	71	56.452	Gadus_morhua
ENSLACG00000001597	ZMAT5	90	57.325	ENSGALG00000008070	ZMAT5	100	55.172	Gallus_gallus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	51.955	ENSGAFG00000009069	zmat5	100	51.955	Gambusia_affinis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	66	56.140	ENSGACG00000016940	zmat5	67	56.140	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	56.897	ENSGAGG00000012370	ZMAT5	100	56.897	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSGGOG00000003792	ZMAT5	100	54.023	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.747	ENSHBUG00000019402	zmat5	100	52.459	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.874	ENSHGLG00000018180	ZMAT5	100	52.874	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSHGLG00100014927	ZMAT5	100	52.299	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	48.276	ENSHCOG00000001727	zmat5	100	48.276	Hippocampus_comes
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	47.701	ENSIPUG00000006633	zmat5	100	47.701	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSSTOG00000005457	ZMAT5	100	54.023	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.514	ENSKMAG00000007209	zmat5	100	52.222	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	49.153	ENSLBEG00000017297	zmat5	100	49.153	Labrus_bergylta
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	56.322	ENSLOCG00000003675	zmat5	100	56.322	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	54.023	Loxodonta_africana
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSMFAG00000040309	ZMAT5	100	54.023	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSMMUG00000040034	ZMAT5	100	54.023	Macaca_mulatta
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSMNEG00000033419	ZMAT5	100	54.023	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSMLEG00000043289	ZMAT5	100	54.023	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSMAMG00000011505	zmat5	100	52.299	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.190	ENSMZEG00005018406	zmat5	100	54.190	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001597	ZMAT5	74	60.938	ENSMGAG00000009818	ZMAT5	99	60.938	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSMAUG00000021576	Zmat5	100	53.448	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSMICG00000027135	ZMAT5	100	54.023	Microcebus_murinus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSMOCG00000014203	Zmat5	100	53.448	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	50.279	ENSMMOG00000009336	zmat5	100	50.279	Mola_mola
ENSLACG00000001597	ZMAT5	90	57.325	ENSMODG00000009007	ZMAT5	100	55.172	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.841	ENSMALG00000011581	zmat5	100	52.841	Monopterus_albus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSMUSG00000009076	Zmat5	100	53.448	Mus_musculus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.000	ENSMPUG00000013253	ZMAT5	100	52.000	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	46.552	ENSMLUG00000017398	ZMAT5	100	46.552	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSNGAG00000019083	Zmat5	100	54.023	Nannospalax_galili
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSNLEG00000003391	ZMAT5	100	54.023	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000001597	ZMAT5	90	38.854	ENSMEUG00000002484	ZMAT5	100	38.506	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.874	ENSODEG00000017389	ZMAT5	100	52.874	Octodon_degus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.333	ENSONIG00000013964	zmat5	100	52.174	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSOCUG00000005282	ZMAT5	100	53.448	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	99	48.045	ENSORLG00000008131	zmat5	78	51.064	Oryzias_latipes
ENSLACG00000001597	ZMAT5	79	51.773	ENSORLG00020017564	zmat5	78	51.773	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000001597	ZMAT5	99	48.045	ENSORLG00015004714	zmat5	78	51.064	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	49.432	ENSOMEG00000002536	zmat5	100	48.889	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSOGAG00000016378	ZMAT5	100	53.448	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.714	ENSOARG00000005488	ZMAT5	100	53.714	Ovis_aries
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSPPAG00000029148	ZMAT5	100	54.023	Pan_paniscus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSPPRG00000016453	ZMAT5	100	52.299	Panthera_pardus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSPTIG00000021188	ZMAT5	100	52.299	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSPTRG00000014229	ZMAT5	100	54.023	Pan_troglodytes
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSPANG00000020624	ZMAT5	100	54.023	Papio_anubis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSPKIG00000023667	zmat5	100	53.448	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	38.587	ENSPSIG00000005043	ZMAT5	100	38.587	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	51.685	ENSPMGG00000016190	zmat5	100	51.685	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSPEMG00000007232	Zmat5	100	53.448	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000001597	ZMAT5	90	56.688	ENSPCIG00000026919	ZMAT5	100	55.172	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.631	ENSPFOG00000019788	zmat5	100	53.631	Poecilia_formosa
ENSLACG00000001597	ZMAT5	99	53.371	ENSPLAG00000022833	zmat5	99	53.371	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000001597	ZMAT5	99	53.371	ENSPMEG00000008885	zmat5	99	53.371	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.073	ENSPREG00000012981	zmat5	100	53.073	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSPPYG00000011696	ZMAT5	100	54.023	Pongo_abelii
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	50.000	ENSPCAG00000009438	ZMAT5	100	50.000	Procavia_capensis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSPCOG00000020052	ZMAT5	100	54.023	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	46.552	ENSPVAG00000017880	ZMAT5	100	46.552	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.190	ENSPNYG00000008778	zmat5	100	54.190	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	48.276	ENSPNAG00000008209	zmat5	100	48.276	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSRNOG00000007849	Zmat5	100	53.448	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSRBIG00000018881	ZMAT5	100	54.023	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSRROG00000023979	ZMAT5	100	54.023	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	ENSSBOG00000016696	ZMAT5	100	54.023	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.448	ENSSFOG00015017242	zmat5	100	53.448	Scleropages_formosus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	51.397	ENSSMAG00000001901	zmat5	100	52.222	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	79	53.901	ENSSDUG00000018849	zmat5	82	53.901	Seriola_dumerili
ENSLACG00000001597	ZMAT5	79	53.571	ENSSLDG00000012409	zmat5	81	53.237	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	44.253	ENSSARG00000013381	ZMAT5	100	44.828	Sorex_araneus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	57.542	ENSSPUG00000018968	ZMAT5	100	57.542	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	55.114	ENSSPAG00000006369	zmat5	100	55.307	Stegastes_partitus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.598	ENSSSCG00000024279	ZMAT5	100	54.598	Sus_scrofa
ENSLACG00000001597	ZMAT5	91	56.962	ENSTGUG00000010490	ZMAT5	100	55.172	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	49.451	ENSTRUG00000012501	zmat5	100	49.451	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000001597	ZMAT5	73	58.462	ENSTNIG00000009066	zmat5	91	52.632	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	45.977	ENSTBEG00000012568	ZMAT5	100	45.977	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.874	ENSTTRG00000000554	ZMAT5	100	52.874	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSUAMG00000015558	ZMAT5	100	52.299	Ursus_americanus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSUMAG00000016813	ZMAT5	74	52.299	Ursus_maritimus
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	52.299	ENSVVUG00000003593	ZMAT5	100	52.299	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	53.073	ENSXMAG00000001402	zmat5	100	53.073	Xiphophorus_maculatus