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Description

Ensembl ID: ENSLACG00000001758 (Gene tree)
Gene ID: 102365756
Gene Symbol: REXO5
Alias: NEF-sp
Full Name: RNA exonuclease 5
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35322 bases
Position: chrJH127100.1:29215-64536
Accession: 102365756
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000001968	RRM_1	PF00076.22	4.3e-21	1	2
ENSLACP00000001968	RRM_1	PF00076.22	4.3e-21	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000001982	REXO5-201	1815	XM_005999616	ENSLACP00000001968	604 (aa)	XP_005999678	H2ZX47

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.942	ENSG00000005189	REXO5	97	69.565	Homo_sapiens
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.405	ENSAPOG00000008514	REXO5	78	37.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.875	ENSAMEG00000006178	REXO5	77	45.875	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000001758	REXO5	99	39.778	ENSAPEG00000010627	REXO5	78	39.778	Amphiprion_percula
ENSLACG00000001758	REXO5	68	45.652	ENSATEG00000004682	REXO5	87	44.519	Anabas_testudineus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.252	ENSAPLG00000015740	REXO5	82	46.252	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.405	ENSACAG00000009744	REXO5	79	46.405	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.620	ENSANAG00000034379	REXO5	77	45.620	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.785	ENSACLG00000004778	REXO5	99	37.785	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.950	ENSBTAG00000006449	REXO5	75	45.950	Bos_taurus
ENSLACG00000001758	REXO5	89	56.863	ENSCJAG00000009363	REXO5	75	56.863	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.446	ENSCAFG00000017924	REXO5	82	46.078	Canis_familiaris
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.695	ENSCAFG00020021846	REXO5	77	45.695	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.107	ENSCHIG00000022443	REXO5	77	47.107	Capra_hircus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	43.377	ENSCPOG00000008940	REXO5	69	56.604	Cavia_porcellus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.612	ENSCCAG00000034936	REXO5	77	46.612	Cebus_capucinus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.273	ENSCATG00000044063	REXO5	77	47.273	Cercocebus_atys
ENSLACG00000001758	REXO5	100	44.481	ENSCLAG00000008033	REXO5	73	44.481	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.273	ENSCSAG00000007562	REXO5	77	47.273	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000001758	REXO5	63	49.351	ENSCHOG00000009146	-	50	49.351	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000001758	REXO5	99	47.191	ENSCPBG00000019062	REXO5	77	47.191	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.273	ENSCANG00000035776	REXO5	77	47.273	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	45.289	ENSCGRG00001016179	-	77	45.289	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000001758	REXO5	99	45.289	ENSCGRG00000010868	-	77	44.959	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000001758	REXO5	57	45.559	ENSCSEG00000002060	-	99	35.434	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.932	ENSEASG00005007266	REXO5	98	50.664	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.932	ENSECAG00000018769	REXO5	68	46.932	Equus_caballus
ENSLACG00000001758	REXO5	87	64.319	ENSEEUG00000003572	REXO5	71	64.319	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.612	ENSFCAG00000015160	REXO5	77	46.612	Felis_catus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	45.701	ENSFALG00000014026	REXO5	82	45.701	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000001758	REXO5	97	37.121	ENSFHEG00000013388	REXO5	78	37.121	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.815	ENSGALG00000002239	REXO5	78	47.428	Gallus_gallus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	38.081	ENSGAFG00000011045	REXO5	78	38.081	Gambusia_affinis
ENSLACG00000001758	REXO5	99	47.343	ENSGAGG00000008242	REXO5	77	47.343	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.942	ENSGGOG00000004539	REXO5	77	46.942	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000001758	REXO5	99	38.240	ENSHBUG00000017976	REXO5	79	38.240	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000001758	REXO5	100	44.132	ENSHGLG00000012652	REXO5	89	44.132	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000001758	REXO5	100	43.636	ENSHGLG00100013255	REXO5	99	46.799	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000001758	REXO5	62	43.700	ENSHCOG00000008648	REXO5	64	43.700	Hippocampus_comes
ENSLACG00000001758	REXO5	80	48.963	ENSSTOG00000007071	REXO5	70	48.963	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.370	ENSJJAG00000023821	-	78	46.370	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.785	ENSKMAG00000009488	REXO5	79	37.785	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.557	ENSLBEG00000009276	REXO5	78	37.557	Labrus_bergylta
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.777	ENSLAFG00000006157	REXO5	77	46.777	Loxodonta_africana
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.438	ENSMFAG00000036613	REXO5	77	47.438	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.438	ENSMMUG00000016748	REXO5	77	47.438	Macaca_mulatta
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.438	ENSMNEG00000045028	REXO5	77	47.438	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.273	ENSMLEG00000029851	REXO5	77	47.273	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000001758	REXO5	98	38.661	ENSMAMG00000006915	REXO5	75	39.210	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.557	ENSMZEG00005013657	REXO5	79	37.557	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001758	REXO5	99	48.142	ENSMGAG00000010369	REXO5	82	48.465	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.446	ENSMICG00000014886	REXO5	77	46.446	Microcebus_murinus
ENSLACG00000001758	REXO5	75	49.339	ENSMOCG00000010062	-	98	49.339	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000001758	REXO5	62	42.359	ENSMMOG00000011330	-	65	42.627	Mola_mola
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.253	ENSMODG00000007059	REXO5	73	45.253	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000001758	REXO5	100	43.234	MGP_CAROLIEiJ_G0030385	-	77	43.234	Mus_caroli
ENSLACG00000001758	REXO5	100	43.967	ENSMUSG00000030924	Rexo5	98	46.563	Mus_musculus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	43.967	MGP_SPRETEiJ_G0031499	-	77	43.967	Mus_spretus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.281	ENSMPUG00000013643	REXO5	77	46.281	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000001758	REXO5	99	45.156	ENSNGAG00000002025	-	98	49.002	Nannospalax_galili
ENSLACG00000001758	REXO5	67	40.670	ENSNBRG00000006877	REXO5	64	40.670	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.107	ENSNLEG00000012334	REXO5	77	47.107	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000001758	REXO5	99	43.863	ENSMEUG00000015298	REXO5	82	43.863	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000001758	REXO5	89	43.470	ENSOPRG00000011398	REXO5	68	43.470	Ochotona_princeps
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.255	ENSONIG00000000148	REXO5	78	44.201	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	48.226	ENSOANG00000014291	REXO5	83	48.226	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.603	ENSOCUG00000009913	REXO5	76	47.603	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	38.605	ENSORLG00000009738	REXO5	79	38.605	Oryzias_latipes
ENSLACG00000001758	REXO5	99	38.665	ENSORLG00020010270	REXO5	79	38.665	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000001758	REXO5	99	38.258	ENSORLG00015009678	REXO5	79	38.258	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000001758	REXO5	99	40.923	ENSOMEG00000019491	REXO5	78	41.077	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.156	ENSOGAG00000011564	REXO5	77	45.156	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.777	ENSOARG00000013401	REXO5	78	46.546	Ovis_aries
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.107	ENSPPAG00000035005	REXO5	77	47.107	Pan_paniscus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	44.868	ENSPPRG00000022345	REXO5	76	44.719	Panthera_pardus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.358	ENSPTIG00000012096	REXO5	77	46.205	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.107	ENSPTRG00000007851	REXO5	77	47.107	Pan_troglodytes
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.273	ENSPANG00000006898	REXO5	77	47.273	Papio_anubis
ENSLACG00000001758	REXO5	99	44.572	ENSPKIG00000014406	REXO5	79	44.572	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000001758	REXO5	99	47.352	ENSPSIG00000012172	REXO5	77	47.352	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000001758	REXO5	88	67.421	ENSPCIG00000029238	-	61	67.421	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	36.953	ENSPFOG00000012767	REXO5	79	37.500	Poecilia_formosa
ENSLACG00000001758	REXO5	99	36.802	ENSPLAG00000006408	REXO5	79	37.349	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000001758	REXO5	99	36.937	ENSPMEG00000007726	REXO5	79	37.331	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.237	ENSPREG00000000146	REXO5	79	37.931	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.942	ENSPPYG00000007163	REXO5	77	46.942	Pongo_abelii
ENSLACG00000001758	REXO5	97	45.377	ENSPCAG00000006265	REXO5	83	45.377	Procavia_capensis
ENSLACG00000001758	REXO5	99	45.771	ENSPCOG00000018775	REXO5	77	45.771	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.370	ENSPVAG00000003293	REXO5	82	46.370	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000001758	REXO5	74	44.494	ENSPNYG00000006922	REXO5	67	40.952	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000001758	REXO5	99	40.098	ENSPNAG00000018866	-	79	40.098	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000001758	REXO5	100	43.636	ENSRNOG00000014513	Rexo5	78	43.636	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.603	ENSRBIG00000035163	REXO5	69	47.603	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.603	ENSRROG00000034741	REXO5	77	47.603	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.777	ENSSBOG00000029650	REXO5	95	46.777	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.746	ENSSHAG00000005042	REXO5	77	45.746	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000001758	REXO5	100	44.318	ENSSFOG00015007581	REXO5	78	44.318	Scleropages_formosus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.252	ENSSMAG00000000709	REXO5	78	38.052	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.900	ENSSDUG00000014528	REXO5	78	37.670	Seriola_dumerili
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.139	ENSSLDG00000007641	REXO5	78	36.834	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.346	ENSSSCG00000007855	REXO5	77	46.325	Sus_scrofa
ENSLACG00000001758	REXO5	99	46.613	ENSTGUG00000009219	REXO5	82	46.613	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.500	ENSTRUG00000015295	-	78	37.004	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000001758	REXO5	87	44.472	ENSTBEG00000008797	REXO5	68	44.472	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.950	ENSTTRG00000016439	REXO5	77	45.950	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.289	ENSUAMG00000017756	REXO5	90	45.289	Ursus_americanus
ENSLACG00000001758	REXO5	64	36.340	ENSUMAG00000010466	-	91	36.340	Ursus_maritimus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	41.791	ENSVPAG00000003459	REXO5	77	41.791	Vicugna_pacos
ENSLACG00000001758	REXO5	100	46.446	ENSVVUG00000023257	REXO5	77	46.446	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000001758	REXO5	99	45.242	ENSXETG00000016735	rexo5	80	45.242	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001758	REXO5	79	37.757	ENSXCOG00000015997	REXO5	66	37.757	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000001758	REXO5	99	37.631	ENSXMAG00000014770	REXO5	79	37.631	Xiphophorus_maculatus