EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000001984 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1155 bases
Position: chrJH131071.1:36667-37821
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000002222	Exo_endo_phos	PF03372.23	2.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000002240	-	1140	-	ENSLACP00000002222	379 (aa)	-	H2ZXV1

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000001984's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000001984's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000001984	-	97	30.263	ENSLACG00000004872	-	85	30.263
ENSLACG00000001984	-	94	39.889	ENSLACG00000013797	-	96	39.889
ENSLACG00000001984	-	69	31.801	ENSLACG00000003798	-	98	35.632
ENSLACG00000001984	-	97	32.533	ENSLACG00000010026	-	78	32.533
ENSLACG00000001984	-	93	30.939	ENSLACG00000007576	-	99	31.215
ENSLACG00000001984	-	97	41.935	ENSLACG00000008451	-	79	41.935
ENSLACG00000001984	-	96	33.333	ENSLACG00000005942	-	85	33.333
ENSLACG00000001984	-	90	34.203	ENSLACG00000009073	-	92	34.203
ENSLACG00000001984	-	97	33.681	ENSLACG00000004681	-	87	33.681
ENSLACG00000001984	-	79	33.770	ENSLACG00000009787	-	93	33.770
ENSLACG00000001984	-	98	34.656	ENSLACG00000002807	-	82	34.656
ENSLACG00000001984	-	79	34.091	ENSLACG00000002295	-	86	34.091

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000001984	-	97	32.086	ENSAPOG00000016904	-	83	32.086	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000001984	-	97	34.218	ENSAPOG00000021898	-	79	34.218	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000001984	-	98	34.400	ENSAPOG00000012457	-	87	34.400	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000001984	-	96	30.811	ENSAPOG00000010713	-	93	30.811	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000001984	-	82	36.624	ENSACIG00000019184	-	77	36.624	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000001984	-	90	36.467	ENSACIG00000012844	-	84	36.467	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000001984	-	95	34.795	ENSACIG00000008906	-	81	34.795	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000001984	-	91	30.791	ENSACAG00000025708	-	96	30.791	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001984	-	99	30.208	ENSACAG00000010540	-	94	30.208	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001984	-	77	30.769	ENSACAG00000026784	-	81	30.820	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001984	-	77	31.773	ENSACAG00000026859	-	79	31.773	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001984	-	63	32.773	ENSACAG00000024104	-	90	32.773	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001984	-	97	30.239	ENSACAG00000004720	-	74	30.239	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000001984	-	97	34.309	ENSACLG00000023741	-	80	34.309	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001984	-	70	30.909	ENSACLG00000027777	-	96	30.909	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001984	-	94	34.153	ENSACLG00000001415	-	82	34.153	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001984	-	83	35.423	ENSACLG00000004195	-	76	35.423	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001984	-	60	38.865	ENSACLG00000005243	-	91	38.865	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001984	-	97	32.527	ENSACLG00000003105	-	81	32.527	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001984	-	84	37.423	ENSACLG00000001544	-	91	37.423	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000001984	-	85	30.091	ENSCAFG00020005033	-	50	30.091	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000001984	-	96	32.609	ENSCVAG00000008582	-	84	32.609	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000001984	-	97	34.225	ENSFHEG00000007794	-	82	34.225	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000001984	-	93	34.637	ENSKMAG00000002817	-	76	34.637	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000001984	-	74	30.556	ENSMZEG00005026934	-	99	30.556	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001984	-	54	35.784	ENSMZEG00005019175	-	89	35.784	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001984	-	97	33.067	ENSMZEG00005021840	-	82	33.067	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001984	-	97	34.409	ENSMZEG00005016749	-	86	34.409	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001984	-	84	36.449	ENSMZEG00005013453	-	90	36.449	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001984	-	71	30.797	ENSMZEG00005015499	-	99	30.797	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001984	-	83	35.423	ENSMZEG00005017035	-	83	35.423	Maylandia_zebra
ENSLACG00000001984	-	83	30.312	ENSMMOG00000005815	-	75	30.312	Mola_mola
ENSLACG00000001984	-	83	34.375	ENSNBRG00000010546	-	83	34.375	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000001984	-	74	37.413	ENSNBRG00000020944	-	86	37.413	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000001984	-	73	31.119	ENSONIG00000021276	-	99	31.119	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000001984	-	60	31.278	ENSOCUG00000029503	-	96	31.278	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000001984	-	86	32.641	ENSOCUG00000029537	-	50	32.641	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000001984	-	54	39.024	ENSORLG00015005588	-	72	39.024	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000001984	-	64	32.794	ENSORLG00015009902	-	84	32.794	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000001984	-	97	36.364	ENSORLG00015008034	-	85	36.364	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000001984	-	97	30.894	ENSOMEG00000005845	-	85	30.894	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000001984	-	83	33.028	ENSPMGG00000010085	-	96	33.028	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000001984	-	92	32.955	ENSPLAG00000019722	-	90	33.239	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000001984	-	63	34.177	ENSPLAG00000014958	-	70	34.177	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000001984	-	63	34.599	ENSPMEG00000017446	-	69	34.599	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000001984	-	97	33.155	ENSPMEG00000000053	-	95	33.422	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000001984	-	83	34.906	ENSPNYG00000002207	-	97	34.906	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000001984	-	85	35.758	ENSPNAG00000016867	-	78	35.758	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000001984	-	97	34.225	ENSSDUG00000013762	-	86	34.225	Seriola_dumerili
ENSLACG00000001984	-	87	40.476	ENSSDUG00000018238	-	95	40.476	Seriola_dumerili
ENSLACG00000001984	-	99	34.987	ENSSPAG00000002492	-	99	34.987	Stegastes_partitus
ENSLACG00000001984	-	96	30.458	ENSXETG00000033118	-	78	30.458	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.027	ENSXETG00000032168	-	91	30.027	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	31.117	ENSXETG00000031025	-	93	31.117	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	98	33.858	ENSXETG00000019951	-	96	33.858	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	31.234	ENSXETG00000033835	-	92	31.234	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	98	31.579	ENSXETG00000031573	-	85	32.632	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.400	ENSXETG00000027781	-	97	30.400	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	99	32.987	ENSXETG00000031844	-	95	32.987	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	96	30.458	ENSXETG00000031237	-	78	30.458	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	81	33.228	ENSXETG00000033886	-	96	33.228	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	60	31.169	ENSXETG00000033389	-	97	31.169	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.319	ENSXETG00000031893	-	90	30.319	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	99	33.247	ENSXETG00000032017	-	87	33.247	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	99	30.729	ENSXETG00000033714	-	86	30.729	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	80	31.949	ENSXETG00000031978	-	90	31.250	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	96	30.458	ENSXETG00000031161	-	78	30.458	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	60	31.169	ENSXETG00000032028	-	97	31.169	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	84	32.407	ENSXETG00000031821	-	87	32.407	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	60	31.624	ENSXETG00000032255	-	99	31.624	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.831	ENSXETG00000023937	-	92	30.831	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.688	ENSXETG00000032090	-	77	30.688	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	54	34.146	ENSXETG00000032507	-	99	34.146	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	32.021	ENSXETG00000031547	-	94	32.021	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.871	ENSXETG00000032834	-	93	30.871	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	31.026	ENSXETG00000033395	-	92	37.143	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	85	31.454	ENSXETG00000034308	-	93	31.454	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.184	ENSXETG00000033739	-	89	30.184	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	99	31.865	ENSXETG00000034064	-	87	31.865	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	60	33.043	ENSXETG00000025636	-	98	33.043	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	86	32.024	ENSXETG00000023159	-	99	32.024	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	32.987	ENSXETG00000031535	-	85	32.987	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	32.021	ENSXETG00000033292	-	92	32.021	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	58	31.222	ENSXETG00000034353	-	99	31.222	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	98	30.709	ENSXETG00000033765	-	85	30.709	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.079	ENSXETG00000033763	-	91	30.079	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	99	30.130	ENSXETG00000030078	-	93	30.130	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.591	ENSXETG00000030767	-	85	30.591	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	60	30.702	ENSXETG00000030935	-	97	30.702	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	85	30.887	ENSXETG00000032180	-	89	30.887	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	60	33.621	ENSXETG00000026017	-	97	33.621	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	31.496	ENSXETG00000025558	-	91	31.496	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.526	ENSXETG00000032474	-	92	30.526	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.667	ENSXETG00000033336	-	77	30.667	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	60	31.739	ENSXETG00000031013	-	97	31.739	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	30.446	ENSXETG00000030293	-	91	30.446	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	31.496	ENSXETG00000020006	-	91	31.496	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	31.300	ENSXETG00000033090	-	92	31.300	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000001984	-	97	32.888	ENSXCOG00000012940	-	98	33.690	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000001984	-	97	33.069	ENSXCOG00000009068	-	85	33.069	Xiphophorus_couchianus