EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000002038 (Gene tree)
Gene ID: 102345530
Gene Symbol: URB2
Alias: KIAA0133|NET10|NPA2
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 42387 bases
Position: chrJH128307.1:38482-80868
Accession: 102345530
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000002281	Urb2	PF10441.9	3e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000002299	URB2-201	6044	XM_006008320	ENSLACP00000002281	1538 (aa)	XP_006008382	H2ZY10

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.164	ENSG00000135763	URB2	99	63.953	Homo_sapiens
ENSLACG00000002038	URB2	89	37.354	ENSAPOG00000000608	urb2	94	37.310	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.907	ENSAMEG00000009206	URB2	99	46.208	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000002038	URB2	99	38.675	ENSAOCG00000019961	urb2	99	38.876	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000002038	URB2	99	38.539	ENSAPEG00000005263	urb2	99	38.817	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002038	URB2	99	38.537	ENSATEG00000020930	urb2	99	38.479	Anabas_testudineus
ENSLACG00000002038	URB2	97	51.966	ENSAPLG00000002998	URB2	100	51.966	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000002038	URB2	100	50.737	ENSACAG00000001285	URB2	100	50.737	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.585	ENSANAG00000033963	URB2	100	46.645	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000002038	URB2	89	36.824	ENSACLG00000009254	urb2	94	36.731	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000002038	URB2	100	40.970	ENSAMXG00000003474	urb2	100	40.857	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000002038	URB2	99	45.525	ENSBTAG00000010180	URB2	99	45.460	Bos_taurus
ENSLACG00000002038	URB2	97	64.583	ENSCJAG00000010968	URB2	100	46.907	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.727	ENSCAFG00000012118	URB2	100	46.085	Canis_familiaris
ENSLACG00000002038	URB2	94	45.318	ENSCAFG00020027217	URB2	99	44.634	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000002038	URB2	99	45.519	ENSCHIG00000014513	URB2	99	45.145	Capra_hircus
ENSLACG00000002038	URB2	99	45.670	ENSTSYG00000006924	URB2	99	45.344	Carlito_syrichta
ENSLACG00000002038	URB2	62	55.352	ENSCPOG00000020777	-	99	55.352	Cavia_porcellus
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.778	ENSCCAG00000023932	URB2	100	46.778	Cebus_capucinus
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.585	ENSCATG00000043366	URB2	100	46.585	Cercocebus_atys
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.945	ENSCLAG00000006268	URB2	100	44.997	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.392	ENSCSAG00000010599	URB2	100	46.392	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000002038	URB2	68	48.587	ENSCHOG00000010163	URB2	70	48.587	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000002038	URB2	100	55.421	ENSCPBG00000006191	URB2	100	55.421	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.521	ENSCANG00000023711	URB2	100	46.521	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.622	ENSCGRG00001009591	Urb2	100	44.161	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.622	ENSCGRG00000011259	Urb2	100	44.161	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000002038	URB2	99	35.867	ENSCSEG00000000299	urb2	99	36.045	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.714	ENSCVAG00000011011	urb2	99	37.469	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000002038	URB2	99	41.613	ENSDARG00000003217	urb2	98	66.019	Danio_rerio
ENSLACG00000002038	URB2	97	38.117	ENSDNOG00000043064	URB2	99	38.391	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.786	ENSDORG00000014975	Urb2	100	44.530	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000002038	URB2	95	43.357	ENSETEG00000002869	URB2	95	43.357	Echinops_telfairi
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.903	ENSEASG00005012060	URB2	99	46.645	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000002038	URB2	95	53.968	ENSECAG00000012338	URB2	99	53.968	Equus_caballus
ENSLACG00000002038	URB2	92	61.111	ENSEEUG00000002669	URB2	92	61.111	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000002038	URB2	99	44.015	ENSELUG00000014647	urb2	99	43.774	Esox_lucius
ENSLACG00000002038	URB2	100	45.887	ENSFCAG00000007662	URB2	100	45.566	Felis_catus
ENSLACG00000002038	URB2	100	51.644	ENSFALG00000003385	URB2	100	51.644	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.574	ENSFDAG00000021079	URB2	100	44.201	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000002038	URB2	99	36.817	ENSFHEG00000010357	urb2	99	36.839	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000002038	URB2	91	40.702	ENSGMOG00000012459	urb2	100	38.861	Gadus_morhua
ENSLACG00000002038	URB2	100	53.530	ENSGALG00000011101	URB2	100	53.530	Gallus_gallus
ENSLACG00000002038	URB2	99	39.570	ENSGACG00000016179	urb2	99	39.621	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000002038	URB2	100	55.032	ENSGAGG00000021879	URB2	100	55.032	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.035	ENSGGOG00000025643	URB2	100	46.099	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.581	ENSHBUG00000018469	urb2	99	37.500	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000002038	URB2	97	43.576	ENSHGLG00000016561	URB2	99	43.263	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000002038	URB2	100	43.649	ENSHGLG00100001838	URB2	100	43.344	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000002038	URB2	99	41.229	ENSIPUG00000020315	urb2	99	41.011	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000002038	URB2	100	45.273	ENSSTOG00000025323	URB2	100	44.952	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000002038	URB2	100	45.769	ENSJJAG00000011998	Urb2	100	45.437	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000002038	URB2	99	36.920	ENSKMAG00000020129	urb2	99	37.099	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000002038	URB2	100	47.521	ENSLOCG00000015462	urb2	100	47.328	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.139	ENSLAFG00000012484	URB2	100	46.075	Loxodonta_africana
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.392	ENSMFAG00000039905	URB2	100	46.392	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.521	ENSMMUG00000009509	URB2	100	46.521	Macaca_mulatta
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.585	ENSMNEG00000038762	URB2	100	46.585	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.456	ENSMLEG00000043252	URB2	100	46.456	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000002038	URB2	99	36.870	ENSMAMG00000020365	urb2	99	36.986	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.330	ENSMZEG00005011027	urb2	96	57.229	Maylandia_zebra
ENSLACG00000002038	URB2	94	48.812	ENSMGAG00000012073	URB2	100	48.812	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000002038	URB2	96	61.111	ENSMAUG00000017980	Urb2	100	53.933	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.327	ENSMICG00000033302	URB2	99	45.956	Microcebus_murinus
ENSLACG00000002038	URB2	100	45.221	ENSMOCG00000020369	Urb2	100	45.016	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000002038	URB2	99	38.104	ENSMALG00000006529	urb2	99	38.246	Monopterus_albus
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.764	ENSMUSG00000031976	Urb2	100	44.622	Mus_musculus
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.109	ENSMPUG00000012438	URB2	100	45.606	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.817	ENSNGAG00000016524	Urb2	100	46.817	Nannospalax_galili
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.461	ENSNLEG00000014450	URB2	100	46.461	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000002038	URB2	91	50.224	ENSMEUG00000016434	URB2	94	50.224	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000002038	URB2	91	47.066	ENSOPRG00000009906	URB2	92	47.066	Ochotona_princeps
ENSLACG00000002038	URB2	100	45.484	ENSODEG00000005593	URB2	100	45.238	Octodon_degus
ENSLACG00000002038	URB2	99	39.593	ENSONIG00000017078	urb2	99	39.631	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000002038	URB2	100	41.203	ENSOANG00000013732	URB2	100	41.203	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.825	ENSOCUG00000010700	URB2	99	46.564	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.929	ENSORLG00000010915	urb2	99	37.921	Oryzias_latipes
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.937	ENSORLG00020003361	urb2	99	37.929	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.867	ENSORLG00015001534	urb2	99	37.755	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.742	ENSOMEG00000010076	urb2	99	38.150	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000002038	URB2	99	45.209	ENSOGAG00000003021	URB2	99	45.109	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000002038	URB2	99	45.161	ENSOARG00000003102	URB2	99	45.045	Ovis_aries
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.293	ENSPPAG00000040629	URB2	100	46.293	Pan_paniscus
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.114	ENSPPRG00000012767	URB2	100	45.793	Panthera_pardus
ENSLACG00000002038	URB2	95	62.121	ENSPTIG00000012577	URB2	100	62.121	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.035	ENSPTRG00000002092	URB2	100	46.035	Pan_troglodytes
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.968	ENSPANG00000002245	URB2	100	44.968	Papio_anubis
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.074	ENSPKIG00000005787	urb2	100	43.854	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000002038	URB2	100	55.109	ENSPSIG00000002690	URB2	100	55.109	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000002038	URB2	96	43.901	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	43.420	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000002038	URB2	100	48.265	ENSPCIG00000030071	URB2	100	48.329	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.903	ENSPFOG00000014330	urb2	99	37.984	Poecilia_formosa
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.062	ENSPLAG00000014654	urb2	99	37.569	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.331	ENSPMEG00000012356	urb2	99	37.608	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000002038	URB2	99	36.621	ENSPREG00000010268	urb2	99	36.884	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.065	ENSPPYG00000000123	URB2	99	46.065	Pongo_abelii
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.208	ENSPCOG00000023537	URB2	99	45.892	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000002038	URB2	100	41.677	ENSPVAG00000002108	URB2	100	41.446	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000002038	URB2	89	36.824	ENSPNYG00000016840	urb2	94	36.731	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000002038	URB2	100	42.416	ENSPNAG00000013684	urb2	100	42.122	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000002038	URB2	100	44.865	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	44.402	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.585	ENSRBIG00000037937	URB2	100	46.546	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.456	ENSRROG00000039854	URB2	100	46.417	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.456	ENSSBOG00000023055	URB2	100	46.080	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000002038	URB2	100	48.238	ENSSHAG00000014735	URB2	100	48.110	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000002038	URB2	98	44.938	ENSSFOG00015015432	urb2	98	44.581	Scleropages_formosus
ENSLACG00000002038	URB2	89	36.705	ENSSMAG00000004984	urb2	95	36.687	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.680	ENSSDUG00000000902	urb2	99	37.615	Seriola_dumerili
ENSLACG00000002038	URB2	100	53.743	ENSSPUG00000018549	URB2	100	53.414	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000002038	URB2	99	39.347	ENSSPAG00000013632	urb2	99	39.156	Stegastes_partitus
ENSLACG00000002038	URB2	99	45.484	ENSSSCG00000010186	URB2	99	45.302	Sus_scrofa
ENSLACG00000002038	URB2	100	51.859	ENSTGUG00000009990	URB2	100	51.731	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.222	ENSTRUG00000008173	urb2	99	37.250	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000002038	URB2	99	38.765	ENSTNIG00000017689	urb2	99	38.882	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000002038	URB2	99	42.214	ENSTTRG00000014864	URB2	99	42.075	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.649	ENSUAMG00000015022	URB2	99	46.015	Ursus_americanus
ENSLACG00000002038	URB2	99	46.461	ENSUMAG00000004728	URB2	99	45.828	Ursus_maritimus
ENSLACG00000002038	URB2	50	61.538	ENSVPAG00000001750	-	52	61.538	Vicugna_pacos
ENSLACG00000002038	URB2	100	46.371	ENSVVUG00000006747	URB2	100	45.793	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000002038	URB2	100	45.566	ENSXETG00000023331	urb2	100	45.566	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000002038	URB2	99	37.715	ENSXMAG00000015059	urb2	99	37.815	Xiphophorus_maculatus