EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000002135 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1834 bases
Position: chrJH129506.1:40991-42824
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000002389	Transposase_22	PF02994.14	8.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000002409	-	672	-	ENSLACP00000002389	224 (aa)	-	H2ZYB8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000002135's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000002135's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000002135	-	89	32.195	ENSLACG00000006110	-	87	32.195
ENSLACG00000002135	-	96	40.092	ENSLACG00000003145	-	85	42.188
ENSLACG00000002135	-	89	31.731	ENSLACG00000013987	-	77	31.731
ENSLACG00000002135	-	89	30.516	ENSLACG00000010859	-	78	32.057
ENSLACG00000002135	-	84	78.307	ENSLACG00000016955	-	74	78.307
ENSLACG00000002135	-	93	34.562	ENSLACG00000000876	-	89	34.826
ENSLACG00000002135	-	58	35.821	ENSLACG00000000425	-	68	35.821
ENSLACG00000002135	-	91	31.651	ENSLACG00000014769	-	97	33.831
ENSLACG00000002135	-	88	67.347	ENSLACG00000007821	-	69	65.366
ENSLACG00000002135	-	86	37.824	ENSLACG00000010569	-	76	37.824
ENSLACG00000002135	-	79	34.066	ENSLACG00000012229	-	63	36.646
ENSLACG00000002135	-	86	45.596	ENSLACG00000017727	-	83	45.596
ENSLACG00000002135	-	83	34.759	ENSLACG00000009013	-	56	34.759
ENSLACG00000002135	-	81	32.065	ENSLACG00000001077	-	76	31.915
ENSLACG00000002135	-	89	33.333	ENSLACG00000000673	-	77	33.333
ENSLACG00000002135	-	78	30.688	ENSLACG00000002051	-	69	31.383
ENSLACG00000002135	-	83	34.595	ENSLACG00000014732	-	82	34.595
ENSLACG00000002135	-	88	34.848	ENSLACG00000010165	-	75	34.848
ENSLACG00000002135	-	88	76.020	ENSLACG00000010346	-	66	76.020
ENSLACG00000002135	-	90	31.841	ENSLACG00000002451	-	73	31.841
ENSLACG00000002135	-	86	35.417	ENSLACG00000010705	-	79	35.417
ENSLACG00000002135	-	86	32.663	ENSLACG00000005266	-	69	32.663
ENSLACG00000002135	-	89	36.000	ENSLACG00000000643	-	82	36.000
ENSLACG00000002135	-	87	32.212	ENSLACG00000006820	-	76	32.212
ENSLACG00000002135	-	87	31.731	ENSLACG00000003957	-	71	31.731
ENSLACG00000002135	-	81	34.184	ENSLACG00000010080	-	82	34.184
ENSLACG00000002135	-	89	41.206	ENSLACG00000002189	-	84	41.206
ENSLACG00000002135	-	85	43.158	ENSLACG00000000077	-	72	43.158
ENSLACG00000002135	-	86	38.860	ENSLACG00000014474	-	69	39.560
ENSLACG00000002135	-	86	42.487	ENSLACG00000011265	-	77	42.487
ENSLACG00000002135	-	71	32.121	ENSLACG00000002891	-	75	32.121
ENSLACG00000002135	-	69	38.217	ENSLACG00000006210	-	61	38.217
ENSLACG00000002135	-	88	33.503	ENSLACG00000001055	-	86	33.503
ENSLACG00000002135	-	87	65.641	ENSLACG00000016517	-	92	65.641
ENSLACG00000002135	-	71	31.609	ENSLACG00000000903	-	75	31.609
ENSLACG00000002135	-	84	32.979	ENSLACG00000000907	-	92	32.979
ENSLACG00000002135	-	89	30.500	ENSLACG00000009806	-	67	32.432
ENSLACG00000002135	-	89	69.500	ENSLACG00000008859	-	79	69.500
ENSLACG00000002135	-	81	36.813	ENSLACG00000005368	-	86	36.813
ENSLACG00000002135	-	69	40.260	ENSLACG00000001295	-	64	40.260
ENSLACG00000002135	-	89	32.673	ENSLACG00000001298	-	84	32.673
ENSLACG00000002135	-	83	37.097	ENSLACG00000010144	-	67	37.097
ENSLACG00000002135	-	87	64.103	ENSLACG00000004272	-	92	64.103
ENSLACG00000002135	-	88	77.551	ENSLACG00000002471	-	67	76.500
ENSLACG00000002135	-	89	33.981	ENSLACG00000000668	-	65	33.981
ENSLACG00000002135	-	87	34.314	ENSLACG00000001559	-	69	34.314
ENSLACG00000002135	-	87	33.838	ENSLACG00000003217	-	69	33.838
ENSLACG00000002135	-	88	83.163	ENSLACG00000014493	-	65	83.163
ENSLACG00000002135	-	71	37.126	ENSLACG00000000465	-	67	37.126
ENSLACG00000002135	-	88	31.000	ENSLACG00000013472	-	78	31.000
ENSLACG00000002135	-	67	39.216	ENSLACG00000012198	-	65	39.216
ENSLACG00000002135	-	89	32.536	ENSLACG00000011552	-	78	32.536
ENSLACG00000002135	-	82	36.612	ENSLACG00000000369	-	64	36.612
ENSLACG00000002135	-	72	40.994	ENSLACG00000018384	-	81	40.994
ENSLACG00000002135	-	79	31.868	ENSLACG00000007340	-	75	31.868
ENSLACG00000002135	-	67	33.758	ENSLACG00000007342	-	75	33.758
ENSLACG00000002135	-	85	30.000	ENSLACG00000013090	-	90	30.000
ENSLACG00000002135	-	86	39.378	ENSLACG00000010019	-	79	39.378
ENSLACG00000002135	-	89	30.986	ENSLACG00000014952	-	70	30.986
ENSLACG00000002135	-	96	38.073	ENSLACG00000000848	-	78	39.583
ENSLACG00000002135	-	92	30.734	ENSLACG00000004508	-	78	30.734
ENSLACG00000002135	-	97	34.821	ENSLACG00000006813	-	75	35.897
ENSLACG00000002135	-	89	39.196	ENSLACG00000009393	-	85	39.196
ENSLACG00000002135	-	86	75.000	ENSLACG00000010092	-	83	75.000
ENSLACG00000002135	-	73	33.537	ENSLACG00000010633	-	99	33.708
ENSLACG00000002135	-	83	36.757	ENSLACG00000012357	-	78	36.757
ENSLACG00000002135	-	80	76.667	ENSLACG00000006473	-	70	76.667
ENSLACG00000002135	-	72	35.714	ENSLACG00000005344	-	59	35.714
ENSLACG00000002135	-	99	41.071	ENSLACG00000011580	-	80	44.041
ENSLACG00000002135	-	91	67.476	ENSLACG00000003451	-	91	67.476
ENSLACG00000002135	-	89	31.068	ENSLACG00000005767	-	67	31.068
ENSLACG00000002135	-	88	66.327	ENSLACG00000006865	-	81	66.146
ENSLACG00000002135	-	88	73.469	ENSLACG00000011150	-	71	73.469
ENSLACG00000002135	-	66	36.486	ENSLACG00000008643	-	85	36.486
ENSLACG00000002135	-	83	34.409	ENSLACG00000013182	-	78	34.286
ENSLACG00000002135	-	87	34.673	ENSLACG00000014189	-	69	34.673
ENSLACG00000002135	-	87	31.250	ENSLACG00000011390	-	79	31.250
ENSLACG00000002135	-	87	30.303	ENSLACG00000016396	-	70	30.303
ENSLACG00000002135	-	89	77.000	ENSLACG00000010900	-	75	77.000
ENSLACG00000002135	-	88	34.146	ENSLACG00000001384	-	87	37.143
ENSLACG00000002135	-	88	65.816	ENSLACG00000002651	-	80	65.816
ENSLACG00000002135	-	88	34.848	ENSLACG00000013072	-	81	34.848
ENSLACG00000002135	-	77	34.483	ENSLACG00000007535	-	88	37.908
ENSLACG00000002135	-	99	38.667	ENSLACG00000005009	-	79	41.237