EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000002451 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 825 bases
Position: chrJH127645.1:49431-50255
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000002741	Transposase_22	PF02994.14	1.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000002763	-	825	-	ENSLACP00000002741	275 (aa)	-	H2ZZC0

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000002451's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000002451's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000002451	-	70	36.410	ENSLACG00000013538	-	89	36.410
ENSLACG00000002451	-	59	44.242	ENSLACG00000000465	-	67	44.242
ENSLACG00000002451	-	72	32.663	ENSLACG00000010705	-	82	32.663
ENSLACG00000002451	-	76	38.710	ENSLACG00000006110	-	98	38.710
ENSLACG00000002451	-	83	40.351	ENSLACG00000000369	-	80	40.351
ENSLACG00000002451	-	75	34.300	ENSLACG00000009806	-	75	34.300
ENSLACG00000002451	-	59	55.828	ENSLACG00000007535	-	95	55.828
ENSLACG00000002451	-	79	40.183	ENSLACG00000010080	-	91	39.908
ENSLACG00000002451	-	81	49.345	ENSLACG00000000643	-	94	49.345
ENSLACG00000002451	-	78	35.185	ENSLACG00000010900	-	82	35.185
ENSLACG00000002451	-	84	33.761	ENSLACG00000000077	-	88	33.761
ENSLACG00000002451	-	77	39.462	ENSLACG00000012229	-	87	39.462
ENSLACG00000002451	-	83	42.982	ENSLACG00000010165	-	86	42.982
ENSLACG00000002451	-	82	42.489	ENSLACG00000014189	-	90	40.698
ENSLACG00000002451	-	72	45.178	ENSLACG00000005368	-	93	45.178
ENSLACG00000002451	-	79	34.703	ENSLACG00000009393	-	94	34.703
ENSLACG00000002451	-	75	40.845	ENSLACG00000012198	-	87	40.845
ENSLACG00000002451	-	82	46.222	ENSLACG00000001384	-	100	48.039
ENSLACG00000002451	-	83	32.314	ENSLACG00000006473	-	86	32.751
ENSLACG00000002451	-	75	42.995	ENSLACG00000013182	-	93	42.995
ENSLACG00000002451	-	76	49.761	ENSLACG00000000673	-	81	49.761
ENSLACG00000002451	-	83	37.295	ENSLACG00000010859	-	91	37.295
ENSLACG00000002451	-	80	36.709	ENSLACG00000006820	-	88	36.709
ENSLACG00000002451	-	84	33.476	ENSLACG00000011390	-	91	33.476
ENSLACG00000002451	-	68	38.298	ENSLACG00000007340	-	80	38.298
ENSLACG00000002451	-	59	44.848	ENSLACG00000007342	-	81	44.848
ENSLACG00000002451	-	95	32.075	ENSLACG00000010346	-	88	32.075
ENSLACG00000002451	-	80	36.975	ENSLACG00000000534	-	88	37.447
ENSLACG00000002451	-	72	32.161	ENSLACG00000016517	-	95	32.161
ENSLACG00000002451	-	77	34.272	ENSLACG00000011580	-	88	34.272
ENSLACG00000002451	-	72	36.500	ENSLACG00000016319	-	74	36.500
ENSLACG00000002451	-	67	36.022	ENSLACG00000018384	-	94	36.022
ENSLACG00000002451	-	80	77.626	ENSLACG00000005266	-	76	77.626
ENSLACG00000002451	-	93	31.955	ENSLACG00000009013	-	76	31.835
ENSLACG00000002451	-	73	33.831	ENSLACG00000004272	-	96	33.831
ENSLACG00000002451	-	94	30.000	ENSLACG00000014493	-	87	30.000
ENSLACG00000002451	-	79	33.051	ENSLACG00000013987	-	87	33.051
ENSLACG00000002451	-	82	45.259	ENSLACG00000000876	-	99	45.259
ENSLACG00000002451	-	80	32.143	ENSLACG00000002651	-	92	32.143
ENSLACG00000002451	-	73	31.841	ENSLACG00000002135	-	90	31.841
ENSLACG00000002451	-	83	37.449	ENSLACG00000011552	-	91	37.449
ENSLACG00000002451	-	88	36.032	ENSLACG00000007821	-	82	36.032
ENSLACG00000002451	-	80	37.991	ENSLACG00000013472	-	87	37.991
ENSLACG00000002451	-	65	34.225	ENSLACG00000000425	-	94	34.225
ENSLACG00000002451	-	90	70.565	ENSLACG00000001055	-	100	70.565
ENSLACG00000002451	-	75	45.411	ENSLACG00000014732	-	92	45.411
ENSLACG00000002451	-	78	46.262	ENSLACG00000012357	-	90	46.262
ENSLACG00000002451	-	59	84.568	ENSLACG00000010633	-	99	79.096
ENSLACG00000002451	-	75	34.466	ENSLACG00000008859	-	81	34.466
ENSLACG00000002451	-	95	44.061	ENSLACG00000014474	-	94	44.061
ENSLACG00000002451	-	76	35.071	ENSLACG00000003145	-	93	35.071
ENSLACG00000002451	-	71	32.843	ENSLACG00000022180	-	83	32.843
ENSLACG00000002451	-	82	33.921	ENSLACG00000002189	-	96	33.921
ENSLACG00000002451	-	68	45.989	ENSLACG00000001295	-	79	45.989
ENSLACG00000002451	-	78	38.249	ENSLACG00000001298	-	94	38.249
ENSLACG00000002451	-	57	48.734	ENSLACG00000008643	-	92	48.734
ENSLACG00000002451	-	84	33.761	ENSLACG00000011265	-	93	33.761
ENSLACG00000002451	-	96	36.630	ENSLACG00000003957	-	81	38.197
ENSLACG00000002451	-	87	38.521	ENSLACG00000001559	-	87	38.521
ENSLACG00000002451	-	77	32.710	ENSLACG00000005009	-	87	32.710
ENSLACG00000002451	-	72	38.806	ENSLACG00000017411	-	95	38.806
ENSLACG00000002451	-	88	34.156	ENSLACG00000011150	-	88	34.156
ENSLACG00000002451	-	75	40.000	ENSLACG00000006210	-	84	40.000
ENSLACG00000002451	-	85	38.400	ENSLACG00000016396	-	89	38.400
ENSLACG00000002451	-	67	37.186	ENSLACG00000013072	-	82	37.186
ENSLACG00000002451	-	77	42.453	ENSLACG00000014769	-	97	43.284
ENSLACG00000002451	-	95	31.343	ENSLACG00000002471	-	88	31.343
ENSLACG00000002451	-	84	31.760	ENSLACG00000010019	-	95	31.760
ENSLACG00000002451	-	80	32.000	ENSLACG00000006865	-	88	31.905
ENSLACG00000002451	-	71	34.694	ENSLACG00000010092	-	91	32.870
ENSLACG00000002451	-	79	34.247	ENSLACG00000017727	-	94	34.247
ENSLACG00000002451	-	81	39.224	ENSLACG00000002051	-	85	39.224
ENSLACG00000002451	-	81	31.556	ENSLACG00000007888	-	93	31.556
ENSLACG00000002451	-	74	30.660	ENSLACG00000010569	-	94	30.660
ENSLACG00000002451	-	76	36.019	ENSLACG00000000848	-	86	36.493
ENSLACG00000002451	-	80	40.336	ENSLACG00000003217	-	86	40.336
ENSLACG00000002451	-	73	35.821	ENSLACG00000003451	-	89	35.821
ENSLACG00000002451	-	80	38.655	ENSLACG00000000668	-	79	38.655
ENSLACG00000002451	-	97	35.664	ENSLACG00000014952	-	93	35.664
ENSLACG00000002451	-	82	36.889	ENSLACG00000006813	-	87	36.889
ENSLACG00000002451	-	83	35.931	ENSLACG00000004508	-	85	36.245
ENSLACG00000002451	-	78	35.714	ENSLACG00000001077	-	92	35.714
ENSLACG00000002451	-	82	47.788	ENSLACG00000010144	-	92	45.600
ENSLACG00000002451	-	76	88.095	ENSLACG00000013090	-	100	88.095
ENSLACG00000002451	-	80	35.043	ENSLACG00000005344	-	85	35.043
ENSLACG00000002451	-	89	31.301	ENSLACG00000016955	-	93	31.301
ENSLACG00000002451	-	75	34.783	ENSLACG00000000907	-	95	34.783
ENSLACG00000002451	-	66	35.025	ENSLACG00000000903	-	88	34.518

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000002451	-	82	33.778	ENSACIG00000018891	-	65	33.778	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000002451	-	82	33.778	ENSACIG00000014541	-	66	33.778	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000002451	-	71	35.025	ENSAPEG00000013155	-	60	35.025	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002451	-	79	33.624	ENSAPEG00000023573	-	76	33.624	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002451	-	68	37.968	ENSAPEG00000022657	-	52	37.968	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002451	-	71	32.995	ENSAPEG00000002130	-	59	32.995	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002451	-	80	33.333	ENSAPEG00000008945	-	77	33.333	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002451	-	86	31.373	ENSCVAG00000003346	-	71	31.373	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000002451	-	79	38.249	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	78	38.249	Danio_rerio
ENSLACG00000002451	-	73	32.524	ENSFHEG00000006296	-	61	32.524	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000002451	-	73	31.343	ENSKMAG00000012954	-	59	31.343	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000002451	-	78	30.233	ENSKMAG00000000861	-	78	30.233	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000002451	-	87	32.636	ENSKMAG00000000253	-	67	32.636	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000002451	-	86	33.197	ENSLBEG00000017145	-	73	33.197	Labrus_bergylta
ENSLACG00000002451	-	79	36.697	ENSMZEG00005020773	-	72	36.697	Maylandia_zebra
ENSLACG00000002451	-	81	32.314	ENSMZEG00005024824	-	71	33.190	Maylandia_zebra
ENSLACG00000002451	-	76	33.019	ENSONIG00000020618	-	85	33.019	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000002451	-	57	36.250	ENSONIG00000021329	-	70	36.250	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000002451	-	76	41.232	ENSORLG00000020512	-	67	41.232	Oryzias_latipes
ENSLACG00000002451	-	77	30.516	ENSORLG00015021275	-	64	30.516	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000002451	-	88	31.429	ENSPKIG00000009100	-	72	31.429	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000002451	-	77	35.211	ENSPKIG00000001458	-	81	35.211	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000002451	-	53	35.570	ENSPMGG00000001874	-	52	35.570	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000002451	-	76	33.333	ENSPFOG00000020665	-	75	33.333	Poecilia_formosa
ENSLACG00000002451	-	74	39.512	ENSPFOG00000020584	-	76	39.512	Poecilia_formosa
ENSLACG00000002451	-	77	38.028	ENSPFOG00000020560	-	79	38.028	Poecilia_formosa
ENSLACG00000002451	-	57	39.744	ENSPLAG00000016026	-	57	39.744	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000002451	-	75	33.014	ENSPMEG00000021431	-	70	33.014	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000002451	-	77	31.754	ENSPMEG00000022872	-	66	31.754	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000002451	-	76	33.014	ENSPMEG00000014224	-	71	33.014	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000002451	-	83	35.622	ENSPNYG00000003325	-	73	35.622	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000002451	-	76	37.321	ENSPNAG00000017685	-	62	37.321	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000002451	-	72	38.119	ENSSLDG00000008663	-	83	38.119	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000002451	-	73	35.294	ENSXMAG00000029285	-	75	33.032	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000002451	-	86	34.177	ENSXMAG00000021250	-	69	34.177	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000002451	-	86	34.177	ENSXMAG00000024802	-	71	34.177	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000002451	-	86	34.177	ENSXMAG00000026781	-	64	34.177	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000002451	-	76	34.862	ENSXMAG00000023095	-	56	34.862	Xiphophorus_maculatus