EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000002471 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 894 bases
Position: chrJH126974.1:49978-50871
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000002762	Transposase_22	PF02994.14	2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000002784	-	894	-	ENSLACP00000002762	298 (aa)	-	H2ZZE1

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000002471's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000002471's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000002471	-	69	74.634	ENSLACG00000003451	-	90	74.634
ENSLACG00000002471	-	98	86.007	ENSLACG00000010346	-	99	86.007
ENSLACG00000002471	-	78	43.103	ENSLACG00000011265	-	92	43.103
ENSLACG00000002471	-	70	31.507	ENSLACG00000001077	-	89	31.507
ENSLACG00000002471	-	80	36.250	ENSLACG00000010569	-	97	36.250
ENSLACG00000002471	-	76	33.333	ENSLACG00000004508	-	92	32.800
ENSLACG00000002471	-	71	33.784	ENSLACG00000011552	-	82	33.784
ENSLACG00000002471	-	87	82.171	ENSLACG00000006473	-	95	82.171
ENSLACG00000002471	-	86	31.698	ENSLACG00000000668	-	86	31.698
ENSLACG00000002471	-	76	44.889	ENSLACG00000017727	-	95	44.889
ENSLACG00000002471	-	70	33.784	ENSLACG00000006820	-	81	33.790
ENSLACG00000002471	-	74	32.751	ENSLACG00000011390	-	88	32.751
ENSLACG00000002471	-	72	34.884	ENSLACG00000010165	-	82	34.884
ENSLACG00000002471	-	81	30.204	ENSLACG00000013472	-	94	30.204
ENSLACG00000002471	-	80	34.310	ENSLACG00000003217	-	83	34.310
ENSLACG00000002471	-	79	35.169	ENSLACG00000000643	-	96	35.169
ENSLACG00000002471	-	73	32.727	ENSLACG00000013987	-	81	32.727
ENSLACG00000002471	-	73	35.294	ENSLACG00000013072	-	81	35.294
ENSLACG00000002471	-	96	70.979	ENSLACG00000011150	-	100	70.979
ENSLACG00000002471	-	78	33.617	ENSLACG00000001298	-	97	33.617
ENSLACG00000002471	-	70	33.810	ENSLACG00000001295	-	79	33.810
ENSLACG00000002471	-	75	37.946	ENSLACG00000010019	-	92	37.946
ENSLACG00000002471	-	70	33.493	ENSLACG00000013182	-	90	33.493
ENSLACG00000002471	-	80	85.654	ENSLACG00000010092	-	100	85.654
ENSLACG00000002471	-	77	40.351	ENSLACG00000009393	-	97	40.351
ENSLACG00000002471	-	61	39.227	ENSLACG00000001055	-	79	39.227
ENSLACG00000002471	-	68	34.483	ENSLACG00000010705	-	83	34.483
ENSLACG00000002471	-	88	31.136	ENSLACG00000014952	-	91	31.136
ENSLACG00000002471	-	64	38.743	ENSLACG00000018384	-	97	38.743
ENSLACG00000002471	-	53	33.962	ENSLACG00000008643	-	92	33.962
ENSLACG00000002471	-	72	31.416	ENSLACG00000016396	-	79	31.416
ENSLACG00000002471	-	78	32.468	ENSLACG00000000369	-	80	32.468
ENSLACG00000002471	-	72	43.519	ENSLACG00000002189	-	92	43.519
ENSLACG00000002471	-	88	31.343	ENSLACG00000002451	-	95	31.343
ENSLACG00000002471	-	81	35.950	ENSLACG00000014474	-	92	35.950
ENSLACG00000002471	-	77	36.364	ENSLACG00000010144	-	83	36.681
ENSLACG00000002471	-	77	35.088	ENSLACG00000012357	-	95	35.111
ENSLACG00000002471	-	93	32.990	ENSLACG00000001559	-	95	32.990
ENSLACG00000002471	-	77	34.914	ENSLACG00000006110	-	99	34.914
ENSLACG00000002471	-	67	35.500	ENSLACG00000014732	-	88	35.500
ENSLACG00000002471	-	73	30.804	ENSLACG00000017411	-	97	30.804
ENSLACG00000002471	-	81	33.471	ENSLACG00000006813	-	93	33.471
ENSLACG00000002471	-	64	32.653	ENSLACG00000000425	-	100	32.653
ENSLACG00000002471	-	68	37.379	ENSLACG00000012198	-	85	37.379
ENSLACG00000002471	-	66	34.928	ENSLACG00000012229	-	84	34.928
ENSLACG00000002471	-	75	32.743	ENSLACG00000000673	-	86	32.743
ENSLACG00000002471	-	55	35.976	ENSLACG00000010633	-	94	36.145
ENSLACG00000002471	-	80	39.241	ENSLACG00000005009	-	93	39.241
ENSLACG00000002471	-	76	32.340	ENSLACG00000010859	-	90	32.653
ENSLACG00000002471	-	80	39.076	ENSLACG00000000077	-	90	39.076
ENSLACG00000002471	-	70	34.615	ENSLACG00000014769	-	99	34.634
ENSLACG00000002471	-	82	68.571	ENSLACG00000008859	-	92	68.571
ENSLACG00000002471	-	57	36.047	ENSLACG00000007342	-	83	36.047
ENSLACG00000002471	-	68	32.870	ENSLACG00000007340	-	91	32.870
ENSLACG00000002471	-	90	30.435	ENSLACG00000002051	-	83	33.186
ENSLACG00000002471	-	67	36.683	ENSLACG00000005368	-	94	36.683
ENSLACG00000002471	-	73	43.379	ENSLACG00000000848	-	88	43.836
ENSLACG00000002471	-	98	76.289	ENSLACG00000014493	-	98	76.289
ENSLACG00000002471	-	54	39.264	ENSLACG00000010080	-	70	39.264
ENSLACG00000002471	-	71	31.982	ENSLACG00000006210	-	86	31.982
ENSLACG00000002471	-	70	65.385	ENSLACG00000004272	-	99	65.385
ENSLACG00000002471	-	88	84.791	ENSLACG00000016955	-	100	84.791
ENSLACG00000002471	-	97	62.284	ENSLACG00000007821	-	97	62.284
ENSLACG00000002471	-	79	33.617	ENSLACG00000000876	-	98	33.617
ENSLACG00000002471	-	73	42.922	ENSLACG00000003145	-	95	42.922
ENSLACG00000002471	-	83	86.694	ENSLACG00000010900	-	94	86.694
ENSLACG00000002471	-	72	33.645	ENSLACG00000013090	-	99	33.645
ENSLACG00000002471	-	56	39.286	ENSLACG00000007535	-	96	39.286
ENSLACG00000002471	-	77	44.105	ENSLACG00000011580	-	94	44.105
ENSLACG00000002471	-	67	76.500	ENSLACG00000002135	-	88	77.551
ENSLACG00000002471	-	70	63.462	ENSLACG00000016517	-	99	63.462
ENSLACG00000002471	-	77	34.649	ENSLACG00000005266	-	78	34.649
ENSLACG00000002471	-	58	30.814	ENSLACG00000002891	-	78	30.814
ENSLACG00000002471	-	65	32.394	ENSLACG00000000903	-	91	32.394
ENSLACG00000002471	-	65	32.308	ENSLACG00000000907	-	95	32.308
ENSLACG00000002471	-	78	30.992	ENSLACG00000005344	-	84	30.992
ENSLACG00000002471	-	86	63.035	ENSLACG00000006865	-	100	63.008
ENSLACG00000002471	-	66	36.869	ENSLACG00000009013	-	60	36.869
ENSLACG00000002471	-	70	33.971	ENSLACG00000001384	-	98	33.663
ENSLACG00000002471	-	80	63.291	ENSLACG00000002651	-	97	63.291
ENSLACG00000002471	-	82	31.301	ENSLACG00000009806	-	89	31.301
ENSLACG00000002471	-	87	32.184	ENSLACG00000003957	-	89	32.184
ENSLACG00000002471	-	58	35.714	ENSLACG00000000465	-	73	35.714

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000002471	-	70	31.280	ENSAPEG00000022657	-	58	31.280	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002471	-	74	30.222	ENSAPEG00000013155	-	64	30.222	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002471	-	84	30.159	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	91	30.159	Danio_rerio
ENSLACG00000002471	-	73	31.507	ENSFHEG00000006296	-	63	31.507	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000002471	-	62	31.183	ENSMZEG00005024824	-	59	31.183	Maylandia_zebra
ENSLACG00000002471	-	57	31.792	ENSONIG00000021329	-	75	31.792	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000002471	-	83	32.331	ENSORLG00000020512	-	88	32.331	Oryzias_latipes
ENSLACG00000002471	-	82	30.233	ENSORLG00015021275	-	74	30.233	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000002471	-	69	31.579	ENSOMEG00000019152	-	78	31.579	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000002471	-	74	37.168	ENSPKIG00000001458	-	89	37.168	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000002471	-	81	30.738	ENSPKIG00000009100	-	68	30.738	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000002471	-	53	31.677	ENSPMGG00000001874	-	56	31.677	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000002471	-	87	32.558	ENSPFOG00000020584	-	95	32.558	Poecilia_formosa
ENSLACG00000002471	-	62	31.579	ENSPLAG00000016026	-	69	31.579	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000002471	-	74	36.486	ENSPNYG00000003325	-	73	36.486	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000002471	-	90	30.576	ENSPNAG00000017685	-	79	30.576	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000002471	-	79	36.441	ENSSLDG00000008663	-	92	36.441	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000002471	-	77	30.380	ENSXMAG00000029285	-	76	30.380	Xiphophorus_maculatus