EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSLACG00000002534 (Gene tree)
Gene ID: 102359216
Gene Symbol: RPP30
Alias: TSG15
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18290 bases
Position: chrJH131259.1:51859-70148
Accession: 102359216
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000002836	RNase_P_p30	PF01876.16	1e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000002858	RPP30-201	2033	XM_006013733	ENSLACP00000002836	229 (aa)	XP_006013795	H2ZZL5

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
lcm03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000002534	RPP30	96	62.896	ENSG00000148688	RPP30	84	62.896	Homo_sapiens
ENSLACG00000002534	RPP30	96	48.636	ENSAPOG00000023156	rpp30	66	48.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSAMEG00000016776	RPP30	72	60.731	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000002534	RPP30	96	48.182	ENSACIG00000022810	rpp30	68	48.182	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.273	ENSAOCG00000016438	rpp30	64	47.273	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.727	ENSAPEG00000008697	rpp30	66	47.727	Amphiprion_percula
ENSLACG00000002534	RPP30	96	49.550	ENSATEG00000015263	rpp30	69	49.550	Anabas_testudineus
ENSLACG00000002534	RPP30	72	75.758	ENSAPLG00000009959	RPP30	69	75.758	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000002534	RPP30	96	59.361	ENSACAG00000007996	RPP30	72	59.361	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000002534	RPP30	93	51.415	ENSANAG00000009439	RPP30	60	51.415	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000002534	RPP30	96	46.818	ENSACLG00000015389	-	71	46.818	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.945	ENSAMXG00000040653	rpp30	73	47.642	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSBTAG00000002973	RPP30	72	60.731	Bos_taurus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSCJAG00000011045	RPP30	72	61.644	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	ENSCAFG00000031801	RPP30	72	60.274	Canis_familiaris
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	ENSCAFG00020000258	RPP30	72	60.274	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000002534	RPP30	93	58.879	ENSCHIG00000012901	RPP30	72	58.879	Capra_hircus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSTSYG00000013903	RPP30	72	60.731	Carlito_syrichta
ENSLACG00000002534	RPP30	57	63.504	ENSCAPG00000001326	RPP30	73	63.504	Cavia_aperea
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSCPOG00000033174	RPP30	72	60.731	Cavia_porcellus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSCCAG00000029514	RPP30	72	61.644	Cebus_capucinus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSCATG00000042072	RPP30	72	61.644	Cercocebus_atys
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.187	ENSCLAG00000008595	RPP30	72	61.187	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSCSAG00000006694	RPP30	72	61.644	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000002534	RPP30	74	45.251	ENSCHOG00000007023	-	65	45.251	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000002534	RPP30	95	64.220	ENSCPBG00000026518	RPP30	64	77.576	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSCANG00000041084	RPP30	72	61.644	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	58.904	ENSCGRG00001017068	-	81	58.904	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000002534	RPP30	66	65.132	ENSCGRG00001000834	-	59	65.132	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000002534	RPP30	96	58.904	ENSCGRG00000002508	-	72	58.904	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000002534	RPP30	96	51.142	ENSCGRG00000006196	-	70	51.142	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000002534	RPP30	96	49.315	ENSCSEG00000001779	rpp30	65	49.315	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.727	ENSCVAG00000003139	rpp30	71	47.727	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	51.142	ENSDARG00000027428	rpp30	71	51.142	Danio_rerio
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSDNOG00000010186	RPP30	66	61.644	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	58.904	ENSDORG00000015333	Rpp30	72	58.904	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000002534	RPP30	71	30.539	FBgn0283652	Rpp30	55	30.539	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000002534	RPP30	97	58.371	ENSETEG00000018823	RPP30	72	58.371	Echinops_telfairi
ENSLACG00000002534	RPP30	66	40.397	ENSEBUG00000003989	-	83	40.397	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSEASG00005011050	RPP30	72	60.731	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSECAG00000021917	RPP30	72	60.731	Equus_caballus
ENSLACG00000002534	RPP30	60	59.124	ENSEEUG00000009986	-	52	59.124	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000002534	RPP30	100	52.402	ENSELUG00000003731	rpp30	75	52.402	Esox_lucius
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSFCAG00000029073	RPP30	66	60.731	Felis_catus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	64.384	ENSFALG00000007711	RPP30	72	64.384	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSFDAG00000019241	RPP30	72	60.731	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	46.575	ENSFHEG00000014739	rpp30	68	53.216	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000002534	RPP30	93	45.540	ENSGMOG00000005379	rpp30	77	45.540	Gadus_morhua
ENSLACG00000002534	RPP30	96	62.557	ENSGALG00000006486	RPP30	53	62.557	Gallus_gallus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	45.455	ENSGAFG00000001445	rpp30	71	45.455	Gambusia_affinis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.727	ENSGACG00000010285	rpp30	82	41.379	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000002534	RPP30	95	62.844	ENSGAGG00000000980	RPP30	50	62.844	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSGGOG00000026917	RPP30	67	73.718	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000002534	RPP30	97	46.396	ENSHBUG00000019332	rpp30	72	46.396	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.187	ENSHGLG00000013072	RPP30	72	61.187	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.187	ENSHGLG00100017798	RPP30	72	61.187	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000002534	RPP30	95	46.119	ENSHCOG00000004763	-	67	46.119	Hippocampus_comes
ENSLACG00000002534	RPP30	96	50.455	ENSIPUG00000003863	rpp30	70	50.455	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSSTOG00000027002	RPP30	72	61.644	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSJJAG00000020041	Rpp30	72	60.731	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	48.182	ENSKMAG00000015355	rpp30	71	48.182	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	48.858	ENSLBEG00000019989	rpp30	69	48.858	Labrus_bergylta
ENSLACG00000002534	RPP30	96	57.991	ENSLOCG00000000031	rpp30	71	57.991	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.000	ENSLAFG00000015931	RPP30	72	60.000	Loxodonta_africana
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSMFAG00000031109	RPP30	72	61.644	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSMMUG00000006628	RPP30	72	61.644	Macaca_mulatta
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.187	ENSMNEG00000033838	RPP30	72	61.187	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSMLEG00000037578	RPP30	72	61.644	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	48.636	ENSMAMG00000010934	rpp30	70	48.636	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	46.818	ENSMZEG00005018508	-	71	46.818	Maylandia_zebra
ENSLACG00000002534	RPP30	96	54.795	ENSMGAG00000008452	RPP30	72	54.795	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000002534	RPP30	96	59.817	ENSMAUG00000008797	Rpp30	72	59.817	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.187	ENSMICG00000012019	RPP30	72	61.187	Microcebus_murinus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	57.991	ENSMOCG00000016872	Rpp30	72	57.991	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000002534	RPP30	92	43.128	ENSMMOG00000009266	rpp30	70	43.128	Mola_mola
ENSLACG00000002534	RPP30	96	49.772	ENSMODG00000009342	-	68	49.772	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000002534	RPP30	96	62.100	ENSMODG00000006863	-	72	62.100	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000002534	RPP30	96	48.182	ENSMALG00000011718	rpp30	70	48.182	Monopterus_albus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	72	60.731	Mus_caroli
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	ENSMUSG00000024800	Rpp30	72	60.274	Mus_musculus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	72	60.274	Mus_pahari
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	72	60.274	Mus_spretus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	ENSMPUG00000017258	RPP30	67	60.274	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSMLUG00000017169	RPP30	72	60.731	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSNGAG00000012018	-	72	60.731	Nannospalax_galili
ENSLACG00000002534	RPP30	59	72.794	ENSNGAG00000014392	-	58	72.794	Nannospalax_galili
ENSLACG00000002534	RPP30	92	45.238	ENSNBRG00000024170	-	69	45.238	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.187	ENSNLEG00000012383	RPP30	72	61.187	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000002534	RPP30	96	53.425	ENSMEUG00000015587	-	73	53.425	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000002534	RPP30	96	42.009	ENSODEG00000004560	-	69	42.009	Octodon_degus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	58.447	ENSODEG00000004530	-	73	58.447	Octodon_degus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.273	ENSONIG00000019140	rpp30	93	47.273	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	62.557	ENSOANG00000003415	RPP30	72	62.557	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	59.817	ENSOCUG00000006896	RPP30	66	59.817	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	46.575	ENSORLG00000020420	rpp30	65	46.575	Oryzias_latipes
ENSLACG00000002534	RPP30	96	46.818	ENSORLG00020009037	-	71	46.818	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000002534	RPP30	97	46.396	ENSORLG00015008300	rpp30	67	46.396	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000002534	RPP30	92	45.498	ENSOMEG00000012640	-	98	45.498	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	ENSOGAG00000013963	RPP30	72	60.274	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000002534	RPP30	72	73.333	ENSOARG00000015789	RPP30	62	73.333	Ovis_aries
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSPPAG00000043779	RPP30	72	61.644	Pan_paniscus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSPPRG00000000115	RPP30	72	60.731	Panthera_pardus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSPTIG00000014949	RPP30	72	60.731	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSPTRG00000002742	RPP30	72	59.813	Pan_troglodytes
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSPANG00000021710	RPP30	72	61.644	Papio_anubis
ENSLACG00000002534	RPP30	74	44.970	ENSPKIG00000024858	rpp30	76	44.970	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000002534	RPP30	72	76.647	ENSPSIG00000013213	RPP30	69	76.647	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000002534	RPP30	92	38.095	ENSPMGG00000014872	rpp30	75	38.095	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	44.292	ENSPEMG00000001948	Rpp30	65	44.292	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000002534	RPP30	73	41.279	ENSPMAG00000001855	-	99	41.279	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	62.100	ENSPCIG00000015730	RPP30	67	74.850	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	45.909	ENSPFOG00000000610	rpp30	71	45.909	Poecilia_formosa
ENSLACG00000002534	RPP30	92	44.907	ENSPLAG00000003728	rpp30	65	44.907	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000002534	RPP30	96	45.455	ENSPMEG00000015692	rpp30	71	45.455	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000002534	RPP30	96	45.455	ENSPREG00000001536	rpp30	71	45.455	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSPPYG00000002473	RPP30	72	61.644	Pongo_abelii
ENSLACG00000002534	RPP30	96	38.288	ENSPCAG00000016930	RPP30	75	38.288	Procavia_capensis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.644	ENSPCOG00000017865	RPP30	72	61.644	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000002534	RPP30	96	62.100	ENSPVAG00000010524	RPP30	70	62.100	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000002534	RPP30	92	44.550	ENSPNYG00000016930	-	64	44.550	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000002534	RPP30	96	52.055	ENSPNAG00000014804	rpp30	71	52.055	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	ENSRNOG00000018718	Rpp30	72	60.274	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	56.621	ENSRBIG00000036948	RPP30	61	56.621	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.727	ENSSBOG00000025405	RPP30	62	47.727	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.086	ENSSHAG00000007452	RPP30	72	61.086	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000002534	RPP30	96	55.455	ENSSFOG00015012510	rpp30	71	55.455	Scleropages_formosus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.727	ENSSMAG00000013854	rpp30	70	47.727	Scophthalmus_maximus
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ENSLACG00000002534	RPP30	94	46.047	ENSSLDG00000021234	rpp30	73	46.047	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000002534	RPP30	96	61.187	ENSSARG00000007110	RPP30	72	61.187	Sorex_araneus
ENSLACG00000002534	RPP30	64	64.384	ENSSPUG00000000595	RPP30	71	75.000	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	58.447	ENSSSCG00000010460	RPP30	72	58.447	Sus_scrofa
ENSLACG00000002534	RPP30	72	77.576	ENSTGUG00000008399	RPP30	66	77.576	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000002534	RPP30	96	45.000	ENSTNIG00000018540	rpp30	67	45.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000002534	RPP30	64	73.469	ENSTBEG00000010734	RPP30	66	73.469	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000002534	RPP30	72	62.424	ENSTTRG00000014708	RPP30	62	62.424	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000002534	RPP30	92	59.524	ENSUAMG00000001045	RPP30	90	59.524	Ursus_americanus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	ENSUMAG00000000971	RPP30	72	60.731	Ursus_maritimus
ENSLACG00000002534	RPP30	96	50.685	ENSVPAG00000002077	RPP30	75	50.685	Vicugna_pacos
ENSLACG00000002534	RPP30	92	54.286	ENSVVUG00000021784	RPP30	68	54.286	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000002534	RPP30	76	74.713	ENSXETG00000021785	rpp30	65	74.713	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000002534	RPP30	92	44.550	ENSXCOG00000017864	rpp30	69	44.550	Xiphophorus_couchianus