EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000003217 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 825 bases
Position: chrJH128669.1:74560-75384
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000003610	Transposase_22	PF02994.14	3.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000003643	-	825	-	ENSLACP00000003610	274 (aa)	-	H3A1T9

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000003217's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000003217's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000003217	-	82	41.631	ENSLACG00000011265	-	93	41.631
ENSLACG00000003217	-	78	30.180	ENSLACG00000022180	-	89	30.180
ENSLACG00000003217	-	69	47.340	ENSLACG00000000903	-	84	47.340
ENSLACG00000003217	-	79	32.444	ENSLACG00000016955	-	86	32.444
ENSLACG00000003217	-	81	38.739	ENSLACG00000013090	-	98	38.739
ENSLACG00000003217	-	69	31.746	ENSLACG00000000425	-	87	31.746
ENSLACG00000003217	-	93	86.275	ENSLACG00000006210	-	100	86.275
ENSLACG00000003217	-	85	71.552	ENSLACG00000001298	-	95	71.552
ENSLACG00000003217	-	76	34.135	ENSLACG00000001295	-	81	33.173
ENSLACG00000003217	-	82	40.708	ENSLACG00000001055	-	89	40.708
ENSLACG00000003217	-	95	92.720	ENSLACG00000001559	-	89	92.720
ENSLACG00000003217	-	78	41.364	ENSLACG00000017727	-	95	41.364
ENSLACG00000003217	-	84	40.336	ENSLACG00000000673	-	83	41.379
ENSLACG00000003217	-	59	39.024	ENSLACG00000006473	-	74	37.306
ENSLACG00000003217	-	80	35.747	ENSLACG00000010346	-	72	35.747
ENSLACG00000003217	-	83	41.277	ENSLACG00000010144	-	88	40.741
ENSLACG00000003217	-	84	36.709	ENSLACG00000014189	-	87	36.364
ENSLACG00000003217	-	58	43.827	ENSLACG00000002051	-	85	34.468
ENSLACG00000003217	-	81	71.041	ENSLACG00000007340	-	94	71.041
ENSLACG00000003217	-	68	78.495	ENSLACG00000007342	-	91	78.495
ENSLACG00000003217	-	68	40.107	ENSLACG00000014769	-	71	45.695
ENSLACG00000003217	-	87	37.815	ENSLACG00000000643	-	94	37.815
ENSLACG00000003217	-	94	75.875	ENSLACG00000014952	-	87	75.875
ENSLACG00000003217	-	85	57.627	ENSLACG00000013072	-	97	57.627
ENSLACG00000003217	-	76	37.264	ENSLACG00000000848	-	87	37.264
ENSLACG00000003217	-	96	69.925	ENSLACG00000000534	-	100	69.925
ENSLACG00000003217	-	72	33.171	ENSLACG00000010092	-	86	34.742
ENSLACG00000003217	-	85	32.645	ENSLACG00000006813	-	93	32.645
ENSLACG00000003217	-	75	36.232	ENSLACG00000017411	-	91	36.232
ENSLACG00000003217	-	85	36.596	ENSLACG00000000077	-	86	36.596
ENSLACG00000003217	-	80	37.500	ENSLACG00000010019	-	90	37.500
ENSLACG00000003217	-	73	36.715	ENSLACG00000010900	-	77	36.715
ENSLACG00000003217	-	79	31.963	ENSLACG00000009013	-	61	31.963
ENSLACG00000003217	-	78	36.449	ENSLACG00000014732	-	91	37.104
ENSLACG00000003217	-	86	35.593	ENSLACG00000014474	-	84	35.593
ENSLACG00000003217	-	83	35.371	ENSLACG00000011150	-	79	35.371
ENSLACG00000003217	-	77	39.631	ENSLACG00000011580	-	90	39.631
ENSLACG00000003217	-	86	40.336	ENSLACG00000002451	-	80	40.336
ENSLACG00000003217	-	80	36.986	ENSLACG00000002189	-	95	36.986
ENSLACG00000003217	-	87	53.112	ENSLACG00000013472	-	94	53.556
ENSLACG00000003217	-	85	31.818	ENSLACG00000006865	-	83	35.211
ENSLACG00000003217	-	80	31.364	ENSLACG00000013538	-	99	31.364
ENSLACG00000003217	-	93	68.359	ENSLACG00000011390	-	100	68.359
ENSLACG00000003217	-	69	33.838	ENSLACG00000002135	-	87	33.838
ENSLACG00000003217	-	83	39.474	ENSLACG00000005266	-	74	39.474
ENSLACG00000003217	-	91	70.000	ENSLACG00000004508	-	100	68.284
ENSLACG00000003217	-	85	90.558	ENSLACG00000012198	-	100	90.558
ENSLACG00000003217	-	82	38.496	ENSLACG00000001384	-	99	40.000
ENSLACG00000003217	-	78	31.163	ENSLACG00000016319	-	78	31.163
ENSLACG00000003217	-	98	72.761	ENSLACG00000010859	-	100	72.761
ENSLACG00000003217	-	86	32.068	ENSLACG00000000369	-	77	33.898
ENSLACG00000003217	-	84	34.483	ENSLACG00000012357	-	92	35.088
ENSLACG00000003217	-	95	86.207	ENSLACG00000000668	-	87	86.207
ENSLACG00000003217	-	80	77.169	ENSLACG00000006110	-	99	77.169
ENSLACG00000003217	-	96	77.947	ENSLACG00000005344	-	95	77.947
ENSLACG00000003217	-	84	31.646	ENSLACG00000007821	-	78	31.646
ENSLACG00000003217	-	78	71.963	ENSLACG00000000465	-	86	71.963
ENSLACG00000003217	-	61	47.904	ENSLACG00000007535	-	95	47.904
ENSLACG00000003217	-	83	34.310	ENSLACG00000002471	-	80	34.310
ENSLACG00000003217	-	80	31.222	ENSLACG00000014493	-	70	31.222
ENSLACG00000003217	-	77	40.284	ENSLACG00000000876	-	91	40.191
ENSLACG00000003217	-	58	38.994	ENSLACG00000013182	-	70	38.994
ENSLACG00000003217	-	59	39.264	ENSLACG00000008643	-	91	39.264
ENSLACG00000003217	-	71	36.453	ENSLACG00000005368	-	95	36.453
ENSLACG00000003217	-	78	37.674	ENSLACG00000008859	-	81	37.674
ENSLACG00000003217	-	80	35.909	ENSLACG00000003451	-	91	35.909
ENSLACG00000003217	-	91	50.996	ENSLACG00000016396	-	89	50.996
ENSLACG00000003217	-	83	34.361	ENSLACG00000010569	-	94	34.361
ENSLACG00000003217	-	97	75.281	ENSLACG00000011552	-	100	75.281
ENSLACG00000003217	-	89	51.639	ENSLACG00000001077	-	100	51.639
ENSLACG00000003217	-	82	36.404	ENSLACG00000005009	-	92	36.404
ENSLACG00000003217	-	75	34.450	ENSLACG00000004272	-	94	34.450
ENSLACG00000003217	-	81	33.766	ENSLACG00000002651	-	93	33.766
ENSLACG00000003217	-	68	37.037	ENSLACG00000018384	-	94	37.037
ENSLACG00000003217	-	87	34.568	ENSLACG00000010165	-	90	34.568
ENSLACG00000003217	-	90	81.301	ENSLACG00000012229	-	100	81.301
ENSLACG00000003217	-	88	63.750	ENSLACG00000010080	-	88	63.750
ENSLACG00000003217	-	86	80.169	ENSLACG00000006820	-	88	80.169
ENSLACG00000003217	-	93	69.020	ENSLACG00000003957	-	89	69.020
ENSLACG00000003217	-	89	56.275	ENSLACG00000013987	-	92	56.275
ENSLACG00000003217	-	83	37.229	ENSLACG00000009393	-	94	37.229
ENSLACG00000003217	-	62	33.918	ENSLACG00000002891	-	78	33.918
ENSLACG00000003217	-	75	31.884	ENSLACG00000010705	-	84	31.884
ENSLACG00000003217	-	73	34.783	ENSLACG00000016517	-	97	35.096
ENSLACG00000003217	-	76	38.208	ENSLACG00000003145	-	94	38.208