EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000003416 (Gene tree)
Gene ID: 102363807
Gene Symbol: POLR1E
Alias: FLJ13390|FLJ13970|PAF53|PRAF1
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 34438 bases
Position: chrJH128716.1:82693-117130
Accession: 102363807
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000003838	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	2.8e-96	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000003873	POLR1E-201	3912	XM_006009891	ENSLACP00000003838	362 (aa)	-	H3A2G7

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000003416's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000003416's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.219	ENSG00000137054	POLR1E	85	61.219	Homo_sapiens
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	47.107	ENSAPOG00000012452	polr1e	85	47.107	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	54.054	ENSAMEG00000010193	POLR1E	84	54.054	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.454	ENSACIG00000009884	polr1e	90	49.454	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.862	ENSAOCG00000005665	polr1e	86	49.862	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.862	ENSAPEG00000020581	polr1e	86	49.862	Amphiprion_percula
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	53.168	ENSATEG00000020609	polr1e	86	53.168	Anabas_testudineus
ENSLACG00000003416	POLR1E	93	50.392	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	50.392	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.050	ENSANAG00000038046	POLR1E	85	62.050	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.099	ENSACLG00000013685	polr1e	85	51.099	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.832	ENSAMXG00000018181	polr1e	86	46.832	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.989	ENSBTAG00000012243	POLR1E	85	63.989	Bos_taurus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	57.618	ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	62.461	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.773	ENSCAFG00000002377	POLR1E	85	61.773	Canis_familiaris
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.050	ENSCAFG00020017851	POLR1E	85	62.050	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.881	ENSCHIG00000019479	POLR1E	85	62.881	Capra_hircus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.219	ENSTSYG00000002075	POLR1E	85	61.219	Carlito_syrichta
ENSLACG00000003416	POLR1E	80	61.379	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	61.379	Cavia_aperea
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.604	ENSCPOG00000009965	POLR1E	86	62.604	Cavia_porcellus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	55.956	ENSCCAG00000029460	POLR1E	84	55.956	Cebus_capucinus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSCATG00000031732	POLR1E	82	75.862	Cercocebus_atys
ENSLACG00000003416	POLR1E	85	64.078	ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	64.078	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSCSAG00000010782	POLR1E	85	60.942	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000003416	POLR1E	93	56.716	ENSCHOG00000013024	POLR1E	70	56.716	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	64.444	ENSCPBG00000006923	POLR1E	86	64.444	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.665	ENSCANG00000036112	POLR1E	85	60.665	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.604	ENSCGRG00001006197	Polr1e	82	62.604	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.604	ENSCGRG00000006430	Polr1e	82	62.604	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.556	ENSCSEG00000005121	polr1e	87	46.556	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.727	ENSCVAG00000019759	polr1e	86	49.727	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	96	47.740	ENSDARG00000006434	polr1e	86	47.397	Danio_rerio
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	54.634	ENSDNOG00000010257	POLR1E	87	54.146	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	55.866	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	55.866	Echinops_telfairi
ENSLACG00000003416	POLR1E	53	48.276	ENSEBUG00000010635	-	66	48.276	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSEASG00005000675	POLR1E	85	60.942	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.219	ENSECAG00000014669	POLR1E	85	61.219	Equus_caballus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	52.632	ENSEEUG00000011928	POLR1E	76	52.632	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.366	ENSELUG00000008150	polr1e	85	51.507	Esox_lucius
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.388	ENSFCAG00000013081	POLR1E	85	60.388	Felis_catus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	56.944	ENSFALG00000012950	POLR1E	90	56.944	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.158	ENSFDAG00000016917	POLR1E	86	63.158	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.451	ENSFHEG00000009801	polr1e	86	49.451	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000003416	POLR1E	96	40.845	ENSGMOG00000003336	POLR1E	82	40.282	Gadus_morhua
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	56.944	ENSGALG00000005395	POLR1E	86	56.944	Gallus_gallus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.862	ENSGAFG00000004850	polr1e	86	49.862	Gambusia_affinis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	47.814	ENSGACG00000016087	polr1e	86	47.814	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	57.895	ENSGAGG00000001659	POLR1E	87	57.382	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.219	ENSGGOG00000001882	POLR1E	82	75.862	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.099	ENSHBUG00000002559	polr1e	85	51.099	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.435	ENSHGLG00000002036	POLR1E	86	63.435	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.712	ENSHGLG00100012784	POLR1E	86	63.712	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	47.107	ENSHCOG00000002774	polr1e	86	47.107	Hippocampus_comes
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	47.253	ENSIPUG00000003019	polr1e	86	47.253	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.496	ENSSTOG00000009810	POLR1E	85	61.496	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.604	ENSJJAG00000020731	Polr1e	82	62.604	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.000	ENSKMAG00000000046	polr1e	86	50.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.278	ENSLBEG00000003104	polr1e	85	50.278	Labrus_bergylta
ENSLACG00000003416	POLR1E	100	55.801	ENSLOCG00000012859	polr1e	85	55.956	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.050	ENSLAFG00000012831	POLR1E	85	62.050	Loxodonta_africana
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSMFAG00000045465	POLR1E	82	56.223	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSMMUG00000017892	POLR1E	85	60.942	Macaca_mulatta
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	56.769	ENSMNEG00000040283	POLR1E	86	56.065	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSMLEG00000031135	POLR1E	82	75.862	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.036	ENSMAMG00000001260	polr1e	85	49.036	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.824	ENSMZEG00005021536	polr1e	85	50.824	Maylandia_zebra
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.604	ENSMAUG00000021044	Polr1e	82	62.604	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.435	ENSMICG00000003673	POLR1E	85	63.435	Microcebus_murinus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSMOCG00000012920	Polr1e	82	60.942	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.233	ENSMMOG00000007391	polr1e	88	51.233	Mola_mola
ENSLACG00000003416	POLR1E	96	63.977	ENSMODG00000002884	POLR1E	84	63.977	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.240	ENSMALG00000002665	polr1e	85	51.240	Monopterus_albus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.327	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	88	62.327	Mus_caroli
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.050	ENSMUSG00000028318	Polr1e	88	62.050	Mus_musculus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.604	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	88	62.604	Mus_pahari
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.327	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	88	62.327	Mus_spretus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	55.474	ENSMPUG00000006040	POLR1E	87	54.501	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.050	ENSMLUG00000012688	POLR1E	82	62.050	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.918	ENSNGAG00000002520	Polr1e	82	61.496	Nannospalax_galili
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.099	ENSNBRG00000016822	polr1e	85	51.099	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.496	ENSNLEG00000003616	POLR1E	82	75.862	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000003416	POLR1E	75	71.250	ENSMEUG00000015372	-	71	71.250	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	54.294	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	54.294	Ochotona_princeps
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.435	ENSODEG00000014565	POLR1E	83	63.435	Octodon_degus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.639	ENSONIG00000008921	polr1e	85	51.374	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	64.266	ENSOCUG00000024773	POLR1E	85	64.266	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.315	ENSORLG00000005143	polr1e	86	49.315	Oryzias_latipes
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.978	ENSORLG00020007271	polr1e	92	46.978	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.041	ENSORLG00015000137	polr1e	86	49.041	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	48.077	ENSOMEG00000013264	polr1e	84	48.077	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.219	ENSOGAG00000012981	POLR1E	83	61.219	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.158	ENSOARG00000011465	POLR1E	82	63.158	Ovis_aries
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSPPAG00000034566	POLR1E	85	60.942	Pan_paniscus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.388	ENSPPRG00000005649	POLR1E	85	60.388	Panthera_pardus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.111	ENSPTIG00000009774	POLR1E	85	60.111	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSPTRG00000020944	POLR1E	85	60.942	Pan_troglodytes
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.942	ENSPANG00000025563	POLR1E	85	60.942	Papio_anubis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.913	ENSPKIG00000003562	polr1e	85	51.913	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	58.333	ENSPSIG00000003274	POLR1E	83	58.333	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	47.383	ENSPMGG00000024169	polr1e	86	47.107	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	100	51.381	ENSPEMG00000022300	-	81	50.829	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000003416	POLR1E	100	62.155	ENSPEMG00000019151	-	83	62.155	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000003416	POLR1E	98	62.994	ENSPCIG00000014798	POLR1E	86	62.994	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	47.804	ENSPFOG00000019627	polr1e	86	47.804	Poecilia_formosa
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.689	ENSPLAG00000022679	polr1e	86	50.689	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.240	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	51.240	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.964	ENSPREG00000009470	polr1e	86	50.964	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.219	ENSPPYG00000019061	POLR1E	85	61.219	Pongo_abelii
ENSLACG00000003416	POLR1E	66	58.824	ENSPCAG00000004891	POLR1E	77	58.824	Procavia_capensis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.050	ENSPCOG00000027448	POLR1E	85	62.050	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.158	ENSPVAG00000007940	POLR1E	75	63.158	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.374	ENSPNYG00000001032	polr1e	85	51.374	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.409	ENSPNAG00000006987	polr1e	86	46.409	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000003416	POLR1E	100	62.155	ENSRNOG00000012664	Polr1e	83	62.155	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.665	ENSRBIG00000034214	POLR1E	94	60.665	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	60.665	ENSRROG00000031986	POLR1E	85	60.665	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.219	ENSSBOG00000021415	POLR1E	85	61.219	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.155	ENSSHAG00000016084	POLR1E	99	62.155	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	55.096	ENSSFOG00015002293	polr1e	86	55.096	Scleropages_formosus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.240	ENSSMAG00000011672	polr1e	80	51.240	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.964	ENSSDUG00000022279	polr1e	85	50.964	Seriola_dumerili
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.689	ENSSLDG00000024918	polr1e	85	50.689	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000003416	POLR1E	65	54.468	ENSSARG00000009810	-	58	54.043	Sorex_araneus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.231	ENSSPUG00000009499	POLR1E	85	63.231	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.964	ENSSPAG00000021240	polr1e	86	50.964	Stegastes_partitus
ENSLACG00000003416	POLR1E	100	62.431	ENSSSCG00000005347	POLR1E	86	62.431	Sus_scrofa
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	48.775	ENSTGUG00000007169	POLR1E	91	48.775	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.721	ENSTRUG00000020779	polr1e	95	46.721	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.863	ENSTNIG00000017812	polr1e	86	49.863	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000003416	POLR1E	100	62.155	ENSTBEG00000013786	POLR1E	76	62.327	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.813	ENSTTRG00000008294	POLR1E	77	61.813	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.496	ENSUAMG00000012474	POLR1E	84	63.548	Ursus_americanus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	61.496	ENSUMAG00000011496	POLR1E	85	61.496	Ursus_maritimus
ENSLACG00000003416	POLR1E	78	62.191	ENSVPAG00000009048	POLR1E	66	62.191	Vicugna_pacos
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.327	ENSVVUG00000019954	POLR1E	85	62.327	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	54.496	ENSXETG00000006533	polr1e	86	54.496	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	48.077	ENSXCOG00000013706	polr1e	86	48.077	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.515	ENSXMAG00000012484	polr1e	86	51.515	Xiphophorus_maculatus