EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000004272 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1119 bases
Position: chrJH130549.1:116431-117549
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000004804	Transposase_22	PF02994.14	2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000004845	-	630	-	ENSLACP00000004804	210 (aa)	-	H3A583

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000004272's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000004272's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000004272	-	99	83.173	ENSLACG00000002651	-	85	83.173
ENSLACG00000004272	-	94	33.333	ENSLACG00000011552	-	77	33.333
ENSLACG00000004272	-	97	40.976	ENSLACG00000009393	-	88	40.976
ENSLACG00000004272	-	69	38.776	ENSLACG00000007342	-	72	38.776
ENSLACG00000004272	-	94	34.450	ENSLACG00000003217	-	75	34.450
ENSLACG00000004272	-	70	34.694	ENSLACG00000007535	-	85	34.694
ENSLACG00000004272	-	94	33.019	ENSLACG00000010859	-	77	33.019
ENSLACG00000004272	-	99	81.731	ENSLACG00000006865	-	84	79.808
ENSLACG00000004272	-	92	41.117	ENSLACG00000011580	-	81	41.117
ENSLACG00000004272	-	96	63.861	ENSLACG00000014493	-	67	63.861
ENSLACG00000004272	-	82	37.234	ENSLACG00000004508	-	70	37.234
ENSLACG00000004272	-	98	33.171	ENSLACG00000005266	-	71	33.171
ENSLACG00000004272	-	83	36.649	ENSLACG00000006210	-	75	36.649
ENSLACG00000004272	-	97	30.000	ENSLACG00000000534	-	80	30.000
ENSLACG00000004272	-	92	64.103	ENSLACG00000002135	-	87	64.103
ENSLACG00000004272	-	99	64.904	ENSLACG00000010346	-	71	64.904
ENSLACG00000004272	-	89	43.085	ENSLACG00000003145	-	83	43.085
ENSLACG00000004272	-	98	32.683	ENSLACG00000014769	-	99	32.683
ENSLACG00000004272	-	70	36.000	ENSLACG00000007340	-	64	36.000
ENSLACG00000004272	-	94	34.848	ENSLACG00000000673	-	77	34.848
ENSLACG00000004272	-	89	32.338	ENSLACG00000012229	-	79	32.338
ENSLACG00000004272	-	99	80.769	ENSLACG00000016517	-	99	80.769
ENSLACG00000004272	-	96	72.277	ENSLACG00000007821	-	68	72.277
ENSLACG00000004272	-	99	33.493	ENSLACG00000014189	-	73	33.493
ENSLACG00000004272	-	99	35.407	ENSLACG00000012357	-	88	35.407
ENSLACG00000004272	-	91	36.082	ENSLACG00000012198	-	80	36.082
ENSLACG00000004272	-	89	35.484	ENSLACG00000014732	-	83	35.484
ENSLACG00000004272	-	92	36.410	ENSLACG00000001559	-	64	36.410
ENSLACG00000004272	-	93	42.211	ENSLACG00000017727	-	85	42.211
ENSLACG00000004272	-	91	42.268	ENSLACG00000000077	-	73	42.268
ENSLACG00000004272	-	90	36.170	ENSLACG00000005368	-	89	36.170
ENSLACG00000004272	-	79	43.787	ENSLACG00000005009	-	72	43.787
ENSLACG00000004272	-	98	35.377	ENSLACG00000009806	-	74	35.377
ENSLACG00000004272	-	86	38.122	ENSLACG00000014474	-	69	38.122
ENSLACG00000004272	-	78	34.356	ENSLACG00000010633	-	94	34.545
ENSLACG00000004272	-	99	65.385	ENSLACG00000002471	-	70	65.385
ENSLACG00000004272	-	98	32.195	ENSLACG00000006813	-	79	32.195
ENSLACG00000004272	-	78	32.955	ENSLACG00000000903	-	77	32.955
ENSLACG00000004272	-	87	35.165	ENSLACG00000000907	-	89	35.165
ENSLACG00000004272	-	97	33.810	ENSLACG00000001055	-	92	33.810
ENSLACG00000004272	-	83	35.632	ENSLACG00000001295	-	73	35.632
ENSLACG00000004272	-	94	34.328	ENSLACG00000001298	-	87	34.328
ENSLACG00000004272	-	98	31.905	ENSLACG00000013472	-	82	31.905
ENSLACG00000004272	-	88	32.432	ENSLACG00000002051	-	68	32.432
ENSLACG00000004272	-	94	35.354	ENSLACG00000000369	-	70	35.354
ENSLACG00000004272	-	98	32.093	ENSLACG00000016396	-	76	32.093
ENSLACG00000004272	-	70	39.597	ENSLACG00000000465	-	60	39.597
ENSLACG00000004272	-	96	32.338	ENSLACG00000000876	-	82	32.338
ENSLACG00000004272	-	94	33.333	ENSLACG00000010144	-	73	33.333
ENSLACG00000004272	-	98	33.810	ENSLACG00000006820	-	78	33.810
ENSLACG00000004272	-	94	36.500	ENSLACG00000010705	-	82	36.500
ENSLACG00000004272	-	94	32.093	ENSLACG00000000668	-	72	32.093
ENSLACG00000004272	-	95	41.872	ENSLACG00000002189	-	85	41.872
ENSLACG00000004272	-	92	30.952	ENSLACG00000012896	-	77	30.952
ENSLACG00000004272	-	71	39.474	ENSLACG00000010080	-	64	39.474
ENSLACG00000004272	-	88	32.796	ENSLACG00000009013	-	56	32.796
ENSLACG00000004272	-	96	33.831	ENSLACG00000002451	-	73	33.831
ENSLACG00000004272	-	95	38.424	ENSLACG00000010019	-	82	38.424
ENSLACG00000004272	-	83	43.820	ENSLACG00000018384	-	89	43.820
ENSLACG00000004272	-	89	40.526	ENSLACG00000000848	-	76	40.526
ENSLACG00000004272	-	85	37.436	ENSLACG00000003957	-	68	37.436
ENSLACG00000004272	-	90	34.536	ENSLACG00000013072	-	79	34.536
ENSLACG00000004272	-	95	33.953	ENSLACG00000014952	-	70	33.953
ENSLACG00000004272	-	95	31.731	ENSLACG00000001077	-	85	31.731
ENSLACG00000004272	-	81	31.609	ENSLACG00000002891	-	78	31.609
ENSLACG00000004272	-	96	38.916	ENSLACG00000010569	-	80	38.916
ENSLACG00000004272	-	85	34.359	ENSLACG00000011390	-	76	34.359
ENSLACG00000004272	-	98	57.767	ENSLACG00000010092	-	87	60.194
ENSLACG00000004272	-	93	31.282	ENSLACG00000013182	-	87	31.282
ENSLACG00000004272	-	92	64.948	ENSLACG00000011150	-	71	64.948
ENSLACG00000004272	-	99	62.019	ENSLACG00000016955	-	79	62.019
ENSLACG00000004272	-	94	34.518	ENSLACG00000010165	-	75	34.518
ENSLACG00000004272	-	91	30.890	ENSLACG00000001384	-	90	31.285
ENSLACG00000004272	-	98	32.407	ENSLACG00000005344	-	72	32.407
ENSLACG00000004272	-	89	32.161	ENSLACG00000006110	-	88	32.161
ENSLACG00000004272	-	94	61.307	ENSLACG00000003451	-	88	61.307
ENSLACG00000004272	-	94	60.804	ENSLACG00000008859	-	79	60.804
ENSLACG00000004272	-	95	32.536	ENSLACG00000013987	-	78	32.536
ENSLACG00000004272	-	94	36.364	ENSLACG00000000643	-	81	36.364
ENSLACG00000004272	-	99	62.981	ENSLACG00000010900	-	78	62.981
ENSLACG00000004272	-	95	41.379	ENSLACG00000011265	-	80	41.379
ENSLACG00000004272	-	99	58.654	ENSLACG00000006473	-	76	58.654
ENSLACG00000004272	-	93	33.846	ENSLACG00000013090	-	93	33.846
ENSLACG00000004272	-	68	35.915	ENSLACG00000008643	-	82	35.915