EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000004508 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 804 bases
Position: chrJH127958.1:125911-126714
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000005067	Transposase_22	PF02994.14	3.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000005113	-	804	-	ENSLACP00000005067	268 (aa)	-	H3A5Z6

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000004508's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000004508's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000004508	-	85	39.738	ENSLACG00000005009	-	93	39.738
ENSLACG00000004508	-	77	32.857	ENSLACG00000016517	-	97	32.857
ENSLACG00000004508	-	92	32.800	ENSLACG00000002471	-	76	33.333
ENSLACG00000004508	-	69	38.503	ENSLACG00000014474	-	69	38.503
ENSLACG00000004508	-	87	32.636	ENSLACG00000006813	-	92	32.636
ENSLACG00000004508	-	76	30.583	ENSLACG00000016319	-	75	30.583
ENSLACG00000004508	-	91	31.855	ENSLACG00000006473	-	80	32.589
ENSLACG00000004508	-	85	36.681	ENSLACG00000000643	-	89	37.555
ENSLACG00000004508	-	59	44.654	ENSLACG00000014732	-	83	42.328
ENSLACG00000004508	-	88	51.271	ENSLACG00000016396	-	84	51.271
ENSLACG00000004508	-	89	69.328	ENSLACG00000012229	-	94	69.697
ENSLACG00000004508	-	90	33.607	ENSLACG00000010346	-	79	33.471
ENSLACG00000004508	-	93	66.000	ENSLACG00000014952	-	84	66.000
ENSLACG00000004508	-	59	45.062	ENSLACG00000012357	-	92	36.797
ENSLACG00000004508	-	86	41.810	ENSLACG00000017727	-	96	41.810
ENSLACG00000004508	-	80	70.698	ENSLACG00000006110	-	97	70.698
ENSLACG00000004508	-	78	30.734	ENSLACG00000002135	-	92	30.734
ENSLACG00000004508	-	84	41.558	ENSLACG00000011265	-	96	41.176
ENSLACG00000004508	-	77	39.810	ENSLACG00000003145	-	94	39.810
ENSLACG00000004508	-	79	30.631	ENSLACG00000022180	-	84	30.631
ENSLACG00000004508	-	84	39.394	ENSLACG00000000077	-	88	39.394
ENSLACG00000004508	-	57	37.576	ENSLACG00000010633	-	90	37.576
ENSLACG00000004508	-	85	36.245	ENSLACG00000002451	-	83	35.931
ENSLACG00000004508	-	89	34.728	ENSLACG00000014189	-	80	34.728
ENSLACG00000004508	-	73	34.694	ENSLACG00000016955	-	73	34.694
ENSLACG00000004508	-	87	70.815	ENSLACG00000012198	-	92	73.023
ENSLACG00000004508	-	80	32.093	ENSLACG00000010705	-	82	32.093
ENSLACG00000004508	-	88	77.021	ENSLACG00000010080	-	86	77.021
ENSLACG00000004508	-	72	32.821	ENSLACG00000000425	-	90	32.821
ENSLACG00000004508	-	69	33.155	ENSLACG00000009806	-	68	32.804
ENSLACG00000004508	-	64	41.341	ENSLACG00000002051	-	69	41.026
ENSLACG00000004508	-	85	38.596	ENSLACG00000000673	-	84	38.596
ENSLACG00000004508	-	100	68.284	ENSLACG00000003217	-	91	70.000
ENSLACG00000004508	-	85	35.526	ENSLACG00000010569	-	94	35.526
ENSLACG00000004508	-	74	31.156	ENSLACG00000000907	-	96	31.156
ENSLACG00000004508	-	69	46.739	ENSLACG00000000903	-	82	46.739
ENSLACG00000004508	-	69	35.751	ENSLACG00000009013	-	58	35.751
ENSLACG00000004508	-	94	63.241	ENSLACG00000000534	-	95	63.492
ENSLACG00000004508	-	59	46.203	ENSLACG00000001055	-	69	46.203
ENSLACG00000004508	-	92	69.636	ENSLACG00000006210	-	94	70.000
ENSLACG00000004508	-	79	34.742	ENSLACG00000013182	-	91	34.742
ENSLACG00000004508	-	68	80.328	ENSLACG00000007342	-	87	81.356
ENSLACG00000004508	-	85	76.211	ENSLACG00000007340	-	91	77.103
ENSLACG00000004508	-	80	34.722	ENSLACG00000003451	-	87	37.500
ENSLACG00000004508	-	63	40.828	ENSLACG00000017411	-	80	40.828
ENSLACG00000004508	-	79	37.229	ENSLACG00000000369	-	80	37.229
ENSLACG00000004508	-	84	64.889	ENSLACG00000001298	-	92	64.889
ENSLACG00000004508	-	93	92.800	ENSLACG00000003957	-	87	92.800
ENSLACG00000004508	-	95	69.685	ENSLACG00000001559	-	85	70.000
ENSLACG00000004508	-	96	66.016	ENSLACG00000005344	-	90	66.400
ENSLACG00000004508	-	84	42.222	ENSLACG00000000876	-	95	42.222
ENSLACG00000004508	-	86	36.522	ENSLACG00000010144	-	81	36.522
ENSLACG00000004508	-	90	58.537	ENSLACG00000013072	-	87	62.736
ENSLACG00000004508	-	82	38.739	ENSLACG00000002189	-	96	38.739
ENSLACG00000004508	-	84	37.712	ENSLACG00000005266	-	78	37.712
ENSLACG00000004508	-	75	32.195	ENSLACG00000006865	-	78	32.195
ENSLACG00000004508	-	62	47.619	ENSLACG00000007535	-	96	47.619
ENSLACG00000004508	-	65	37.500	ENSLACG00000018384	-	92	37.288
ENSLACG00000004508	-	83	38.393	ENSLACG00000000848	-	87	38.393
ENSLACG00000004508	-	72	34.343	ENSLACG00000002651	-	76	33.659
ENSLACG00000004508	-	96	67.315	ENSLACG00000011552	-	94	67.600
ENSLACG00000004508	-	81	33.482	ENSLACG00000010092	-	97	32.189
ENSLACG00000004508	-	60	41.104	ENSLACG00000008643	-	91	41.104
ENSLACG00000004508	-	70	37.234	ENSLACG00000004272	-	82	37.234
ENSLACG00000004508	-	79	37.736	ENSLACG00000001384	-	99	37.736
ENSLACG00000004508	-	65	33.708	ENSLACG00000002891	-	75	33.708
ENSLACG00000004508	-	82	39.640	ENSLACG00000010019	-	87	39.732
ENSLACG00000004508	-	94	33.333	ENSLACG00000010900	-	92	33.200
ENSLACG00000004508	-	79	37.850	ENSLACG00000008859	-	80	37.850
ENSLACG00000004508	-	83	33.482	ENSLACG00000011150	-	81	33.482
ENSLACG00000004508	-	96	73.828	ENSLACG00000011390	-	98	74.000
ENSLACG00000004508	-	91	50.000	ENSLACG00000001077	-	93	51.101
ENSLACG00000004508	-	77	33.175	ENSLACG00000007821	-	64	33.175
ENSLACG00000004508	-	79	41.553	ENSLACG00000011580	-	91	41.553
ENSLACG00000004508	-	93	58.498	ENSLACG00000013987	-	90	59.426
ENSLACG00000004508	-	88	52.521	ENSLACG00000013472	-	94	52.521
ENSLACG00000004508	-	94	67.984	ENSLACG00000000668	-	83	68.675
ENSLACG00000004508	-	81	75.926	ENSLACG00000000465	-	84	76.923
ENSLACG00000004508	-	80	37.674	ENSLACG00000005368	-	96	37.674
ENSLACG00000004508	-	78	30.622	ENSLACG00000013538	-	92	30.769
ENSLACG00000004508	-	73	40.513	ENSLACG00000010165	-	71	42.553
ENSLACG00000004508	-	78	34.135	ENSLACG00000013090	-	98	34.135
ENSLACG00000004508	-	86	70.435	ENSLACG00000006820	-	86	70.435
ENSLACG00000004508	-	56	45.695	ENSLACG00000014769	-	85	43.820
ENSLACG00000004508	-	86	38.528	ENSLACG00000009393	-	95	38.528
ENSLACG00000004508	-	94	65.339	ENSLACG00000010859	-	93	65.600