EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000005266 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1960 bases
Position: chrJH130109.1:159688-161647
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000005932	Transposase_22	PF02994.14	1.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000005984	-	861	-	ENSLACP00000005932	287 (aa)	-	H3A8G1

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000005266's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000005266's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000005266	-	76	36.986	ENSLACG00000009393	-	94	36.986
ENSLACG00000005266	-	57	44.048	ENSLACG00000007342	-	82	44.048
ENSLACG00000005266	-	66	38.220	ENSLACG00000007340	-	81	38.220
ENSLACG00000005266	-	63	32.979	ENSLACG00000000425	-	92	32.979
ENSLACG00000005266	-	57	58.282	ENSLACG00000007535	-	95	58.282
ENSLACG00000005266	-	70	32.338	ENSLACG00000003451	-	89	32.338
ENSLACG00000005266	-	74	32.394	ENSLACG00000006865	-	89	32.394
ENSLACG00000005266	-	75	37.674	ENSLACG00000011580	-	89	37.674
ENSLACG00000005266	-	75	36.866	ENSLACG00000005344	-	77	36.866
ENSLACG00000005266	-	77	31.390	ENSLACG00000014493	-	74	31.390
ENSLACG00000005266	-	78	37.712	ENSLACG00000004508	-	84	37.712
ENSLACG00000005266	-	77	37.662	ENSLACG00000006210	-	90	37.662
ENSLACG00000005266	-	78	50.222	ENSLACG00000000643	-	92	50.222
ENSLACG00000005266	-	78	37.281	ENSLACG00000000534	-	85	37.281
ENSLACG00000005266	-	69	32.663	ENSLACG00000002135	-	86	32.663
ENSLACG00000005266	-	74	33.803	ENSLACG00000010346	-	72	33.803
ENSLACG00000005266	-	71	33.171	ENSLACG00000004272	-	98	33.171
ENSLACG00000005266	-	74	35.681	ENSLACG00000003145	-	94	35.681
ENSLACG00000005266	-	72	43.269	ENSLACG00000014769	-	97	44.279
ENSLACG00000005266	-	77	47.748	ENSLACG00000000673	-	86	47.748
ENSLACG00000005266	-	72	31.553	ENSLACG00000016517	-	98	31.553
ENSLACG00000005266	-	74	37.089	ENSLACG00000007821	-	71	37.089
ENSLACG00000005266	-	76	42.466	ENSLACG00000014189	-	76	42.466
ENSLACG00000005266	-	75	46.047	ENSLACG00000012357	-	91	46.047
ENSLACG00000005266	-	78	34.649	ENSLACG00000002471	-	77	34.649
ENSLACG00000005266	-	77	37.975	ENSLACG00000010859	-	88	37.553
ENSLACG00000005266	-	77	38.397	ENSLACG00000014952	-	79	38.397
ENSLACG00000005266	-	74	39.171	ENSLACG00000012198	-	88	39.171
ENSLACG00000005266	-	72	46.377	ENSLACG00000014732	-	92	46.377
ENSLACG00000005266	-	78	39.035	ENSLACG00000001559	-	74	39.035
ENSLACG00000005266	-	77	36.199	ENSLACG00000017727	-	95	36.199
ENSLACG00000005266	-	74	37.383	ENSLACG00000000077	-	81	37.383
ENSLACG00000005266	-	71	45.320	ENSLACG00000005368	-	96	45.320
ENSLACG00000005266	-	78	31.416	ENSLACG00000005009	-	92	31.416
ENSLACG00000005266	-	72	37.019	ENSLACG00000009806	-	76	37.019
ENSLACG00000005266	-	76	47.005	ENSLACG00000014474	-	83	47.005
ENSLACG00000005266	-	57	79.141	ENSLACG00000010633	-	99	74.157
ENSLACG00000005266	-	74	40.271	ENSLACG00000010080	-	90	40.271
ENSLACG00000005266	-	74	39.367	ENSLACG00000012229	-	89	39.367
ENSLACG00000005266	-	72	53.302	ENSLACG00000001384	-	100	51.961
ENSLACG00000005266	-	76	39.286	ENSLACG00000006813	-	87	39.286
ENSLACG00000005266	-	58	35.676	ENSLACG00000000903	-	78	35.676
ENSLACG00000005266	-	68	36.224	ENSLACG00000000907	-	96	36.224
ENSLACG00000005266	-	75	82.870	ENSLACG00000001055	-	86	82.870
ENSLACG00000005266	-	62	44.693	ENSLACG00000001295	-	75	44.693
ENSLACG00000005266	-	69	40.594	ENSLACG00000001298	-	87	40.594
ENSLACG00000005266	-	74	35.814	ENSLACG00000007888	-	88	35.814
ENSLACG00000005266	-	73	38.222	ENSLACG00000013472	-	87	37.104
ENSLACG00000005266	-	75	38.991	ENSLACG00000002051	-	79	39.908
ENSLACG00000005266	-	72	44.231	ENSLACG00000000369	-	75	43.396
ENSLACG00000005266	-	68	34.171	ENSLACG00000013538	-	93	34.171
ENSLACG00000005266	-	82	38.645	ENSLACG00000016396	-	89	37.849
ENSLACG00000005266	-	68	42.786	ENSLACG00000000465	-	77	42.786
ENSLACG00000005266	-	78	49.333	ENSLACG00000000876	-	96	49.333
ENSLACG00000005266	-	76	50.000	ENSLACG00000010144	-	80	50.000
ENSLACG00000005266	-	67	34.673	ENSLACG00000016319	-	74	34.673
ENSLACG00000005266	-	81	33.884	ENSLACG00000006820	-	82	35.586
ENSLACG00000005266	-	71	30.882	ENSLACG00000010705	-	84	30.882
ENSLACG00000005266	-	82	36.179	ENSLACG00000000668	-	82	36.179
ENSLACG00000005266	-	72	44.444	ENSLACG00000013182	-	93	44.444
ENSLACG00000005266	-	74	34.884	ENSLACG00000002189	-	91	34.884
ENSLACG00000005266	-	76	77.626	ENSLACG00000002451	-	80	77.626
ENSLACG00000005266	-	78	39.407	ENSLACG00000003957	-	78	39.407
ENSLACG00000005266	-	74	39.474	ENSLACG00000003217	-	83	39.474
ENSLACG00000005266	-	67	39.234	ENSLACG00000013072	-	85	39.234
ENSLACG00000005266	-	67	31.527	ENSLACG00000022180	-	83	31.527
ENSLACG00000005266	-	73	37.778	ENSLACG00000001077	-	92	37.778
ENSLACG00000005266	-	76	30.000	ENSLACG00000010019	-	90	30.000
ENSLACG00000005266	-	71	30.047	ENSLACG00000010569	-	94	30.047
ENSLACG00000005266	-	78	34.513	ENSLACG00000011390	-	88	34.513
ENSLACG00000005266	-	62	36.667	ENSLACG00000016955	-	70	36.667
ENSLACG00000005266	-	70	32.512	ENSLACG00000010092	-	90	32.864
ENSLACG00000005266	-	74	32.864	ENSLACG00000011150	-	77	32.864
ENSLACG00000005266	-	69	39.303	ENSLACG00000017411	-	95	39.303
ENSLACG00000005266	-	72	32.381	ENSLACG00000009013	-	63	32.381
ENSLACG00000005266	-	75	45.581	ENSLACG00000010165	-	82	45.581
ENSLACG00000005266	-	72	38.889	ENSLACG00000006110	-	97	38.889
ENSLACG00000005266	-	71	32.524	ENSLACG00000008859	-	81	32.524
ENSLACG00000005266	-	74	36.087	ENSLACG00000013987	-	85	36.087
ENSLACG00000005266	-	62	33.702	ENSLACG00000018384	-	95	33.702
ENSLACG00000005266	-	74	34.742	ENSLACG00000010900	-	80	34.742
ENSLACG00000005266	-	78	35.111	ENSLACG00000011265	-	90	35.111
ENSLACG00000005266	-	70	33.333	ENSLACG00000006473	-	79	33.824
ENSLACG00000005266	-	68	76.020	ENSLACG00000013090	-	93	76.020
ENSLACG00000005266	-	55	52.866	ENSLACG00000008643	-	91	52.866
ENSLACG00000005266	-	74	35.681	ENSLACG00000000848	-	86	35.681
ENSLACG00000005266	-	74	33.019	ENSLACG00000002651	-	87	33.019
ENSLACG00000005266	-	77	38.397	ENSLACG00000011552	-	88	38.397

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000005266	-	72	35.749	ENSACIG00000014541	-	62	35.407	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000005266	-	72	35.749	ENSACIG00000018891	-	60	35.749	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000005266	-	84	30.078	ENSAPEG00000008945	-	71	30.137	Amphiprion_percula
ENSLACG00000005266	-	75	32.558	ENSAPEG00000022657	-	60	32.558	Amphiprion_percula
ENSLACG00000005266	-	72	33.493	ENSAPEG00000013155	-	64	33.493	Amphiprion_percula
ENSLACG00000005266	-	72	32.536	ENSAPEG00000002130	-	63	32.536	Amphiprion_percula
ENSLACG00000005266	-	84	31.128	ENSAPEG00000023573	-	71	30.137	Amphiprion_percula
ENSLACG00000005266	-	72	31.696	ENSCVAG00000003346	-	63	31.696	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000005266	-	76	38.356	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	79	38.356	Danio_rerio
ENSLACG00000005266	-	68	32.836	ENSFHEG00000006296	-	60	32.836	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000005266	-	71	31.707	ENSKMAG00000000861	-	76	31.707	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000005266	-	72	33.816	ENSKMAG00000000253	-	60	33.816	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000005266	-	77	33.188	ENSLBEG00000017145	-	69	33.188	Labrus_bergylta
ENSLACG00000005266	-	77	37.387	ENSMZEG00005020773	-	74	37.387	Maylandia_zebra
ENSLACG00000005266	-	56	34.545	ENSONIG00000021329	-	71	34.545	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000005266	-	90	35.379	ENSORLG00000020512	-	64	39.901	Oryzias_latipes
ENSLACG00000005266	-	71	31.863	ENSORLG00015021275	-	62	30.952	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000005266	-	70	41.872	ENSPKIG00000001458	-	77	41.872	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000005266	-	71	34.951	ENSPKIG00000009100	-	61	34.951	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000005266	-	53	36.129	ENSPMGG00000001874	-	54	36.129	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000005266	-	71	40.488	ENSPFOG00000020584	-	76	40.488	Poecilia_formosa
ENSLACG00000005266	-	79	35.088	ENSPFOG00000020560	-	85	35.088	Poecilia_formosa
ENSLACG00000005266	-	55	39.241	ENSPLAG00000016026	-	58	39.241	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000005266	-	63	35.484	ENSPMEG00000021431	-	63	35.106	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000005266	-	74	41.121	ENSPNYG00000003325	-	68	41.121	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000005266	-	73	36.667	ENSPNAG00000017685	-	62	36.667	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000005266	-	69	39.604	ENSSLDG00000008663	-	83	39.604	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000005266	-	70	33.032	ENSXMAG00000023095	-	62	32.911	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000005266	-	72	36.232	ENSXMAG00000026781	-	56	36.232	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000005266	-	72	36.232	ENSXMAG00000024802	-	62	36.232	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000005266	-	77	35.470	ENSXMAG00000029285	-	78	35.470	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000005266	-	72	36.232	ENSXMAG00000021250	-	61	35.885	Xiphophorus_maculatus