EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000005344 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 944 bases
Position: chrJH127842.1:163404-164347
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000006020	Transposase_22	PF02994.14	2.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000006072	-	825	-	ENSLACP00000006020	275 (aa)	-	H3A8P9

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000005344's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000005344's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000005344	-	67	46.277	ENSLACG00000000903	-	84	46.277
ENSLACG00000005344	-	78	69.626	ENSLACG00000000465	-	86	69.626
ENSLACG00000005344	-	79	31.336	ENSLACG00000010705	-	84	31.336
ENSLACG00000005344	-	85	36.709	ENSLACG00000012357	-	93	36.709
ENSLACG00000005344	-	78	79.263	ENSLACG00000006110	-	98	79.263
ENSLACG00000005344	-	81	35.841	ENSLACG00000009393	-	94	35.841
ENSLACG00000005344	-	78	37.443	ENSLACG00000002189	-	95	37.443
ENSLACG00000005344	-	73	32.367	ENSLACG00000001295	-	80	32.367
ENSLACG00000005344	-	86	69.874	ENSLACG00000001298	-	98	69.874
ENSLACG00000005344	-	91	67.969	ENSLACG00000000534	-	96	67.969
ENSLACG00000005344	-	84	39.916	ENSLACG00000011265	-	96	39.916
ENSLACG00000005344	-	97	63.370	ENSLACG00000003957	-	95	63.370
ENSLACG00000005344	-	85	33.191	ENSLACG00000005009	-	91	33.191
ENSLACG00000005344	-	60	45.509	ENSLACG00000007535	-	95	45.509
ENSLACG00000005344	-	76	31.776	ENSLACG00000016517	-	97	31.776
ENSLACG00000005344	-	90	59.919	ENSLACG00000010080	-	93	59.919
ENSLACG00000005344	-	78	58.065	ENSLACG00000013072	-	89	58.065
ENSLACG00000005344	-	81	35.874	ENSLACG00000000643	-	89	35.874
ENSLACG00000005344	-	84	30.992	ENSLACG00000002471	-	78	30.992
ENSLACG00000005344	-	75	32.243	ENSLACG00000010900	-	76	32.243
ENSLACG00000005344	-	88	35.484	ENSLACG00000010165	-	92	35.484
ENSLACG00000005344	-	56	36.250	ENSLACG00000006865	-	64	36.250
ENSLACG00000005344	-	92	33.463	ENSLACG00000014189	-	87	36.187
ENSLACG00000005344	-	61	41.573	ENSLACG00000005368	-	82	41.573
ENSLACG00000005344	-	80	37.281	ENSLACG00000000077	-	87	37.281
ENSLACG00000005344	-	81	36.607	ENSLACG00000001384	-	99	37.321
ENSLACG00000005344	-	71	35.500	ENSLACG00000010569	-	88	35.500
ENSLACG00000005344	-	72	34.466	ENSLACG00000000425	-	97	34.466
ENSLACG00000005344	-	68	35.079	ENSLACG00000006473	-	71	35.079
ENSLACG00000005344	-	87	49.388	ENSLACG00000001077	-	100	49.388
ENSLACG00000005344	-	79	38.667	ENSLACG00000000673	-	82	38.667
ENSLACG00000005344	-	83	33.913	ENSLACG00000003451	-	97	33.913
ENSLACG00000005344	-	77	70.423	ENSLACG00000007340	-	91	70.423
ENSLACG00000005344	-	67	78.689	ENSLACG00000007342	-	90	78.689
ENSLACG00000005344	-	84	32.922	ENSLACG00000010346	-	80	32.922
ENSLACG00000005344	-	84	30.165	ENSLACG00000006813	-	93	30.165
ENSLACG00000005344	-	90	66.400	ENSLACG00000004508	-	96	66.016
ENSLACG00000005344	-	91	71.937	ENSLACG00000010859	-	96	72.093
ENSLACG00000005344	-	80	35.616	ENSLACG00000013090	-	98	35.616
ENSLACG00000005344	-	82	37.555	ENSLACG00000011580	-	91	37.555
ENSLACG00000005344	-	63	38.418	ENSLACG00000018384	-	92	38.418
ENSLACG00000005344	-	77	36.866	ENSLACG00000005266	-	75	36.866
ENSLACG00000005344	-	85	35.043	ENSLACG00000002451	-	80	35.043
ENSLACG00000005344	-	87	30.556	ENSLACG00000014493	-	80	30.556
ENSLACG00000005344	-	88	57.430	ENSLACG00000013987	-	92	57.430
ENSLACG00000005344	-	84	38.095	ENSLACG00000000876	-	96	38.095
ENSLACG00000005344	-	80	36.889	ENSLACG00000000369	-	77	36.889
ENSLACG00000005344	-	92	72.656	ENSLACG00000011552	-	96	72.656
ENSLACG00000005344	-	59	43.030	ENSLACG00000014732	-	83	40.104
ENSLACG00000005344	-	71	30.457	ENSLACG00000009806	-	70	30.457
ENSLACG00000005344	-	73	31.579	ENSLACG00000022180	-	81	31.579
ENSLACG00000005344	-	79	36.323	ENSLACG00000003145	-	94	36.323
ENSLACG00000005344	-	85	79.325	ENSLACG00000012229	-	96	79.325
ENSLACG00000005344	-	75	34.300	ENSLACG00000008859	-	79	34.300
ENSLACG00000005344	-	99	73.571	ENSLACG00000001559	-	95	73.571
ENSLACG00000005344	-	61	38.462	ENSLACG00000017411	-	80	38.462
ENSLACG00000005344	-	86	31.641	ENSLACG00000011150	-	89	31.641
ENSLACG00000005344	-	75	32.692	ENSLACG00000013182	-	90	32.692
ENSLACG00000005344	-	84	34.335	ENSLACG00000014474	-	84	34.335
ENSLACG00000005344	-	88	79.268	ENSLACG00000006210	-	96	79.268
ENSLACG00000005344	-	92	50.980	ENSLACG00000016396	-	90	50.980
ENSLACG00000005344	-	90	82.869	ENSLACG00000006820	-	94	82.869
ENSLACG00000005344	-	92	66.406	ENSLACG00000011390	-	100	66.406
ENSLACG00000005344	-	55	45.455	ENSLACG00000014769	-	85	41.436
ENSLACG00000005344	-	82	35.652	ENSLACG00000010019	-	90	35.652
ENSLACG00000005344	-	57	36.076	ENSLACG00000010092	-	86	31.050
ENSLACG00000005344	-	82	40.351	ENSLACG00000017727	-	95	40.351
ENSLACG00000005344	-	72	37.198	ENSLACG00000000848	-	85	37.198
ENSLACG00000005344	-	95	77.947	ENSLACG00000003217	-	96	77.947
ENSLACG00000005344	-	72	32.407	ENSLACG00000004272	-	98	32.407
ENSLACG00000005344	-	99	75.357	ENSLACG00000000668	-	94	75.357
ENSLACG00000005344	-	59	35.714	ENSLACG00000002135	-	72	35.714
ENSLACG00000005344	-	57	40.764	ENSLACG00000008643	-	87	40.764
ENSLACG00000005344	-	82	38.158	ENSLACG00000010144	-	80	38.158
ENSLACG00000005344	-	85	53.138	ENSLACG00000013472	-	94	53.138
ENSLACG00000005344	-	85	31.325	ENSLACG00000016955	-	95	31.325
ENSLACG00000005344	-	80	76.018	ENSLACG00000012198	-	95	76.018
ENSLACG00000005344	-	98	72.101	ENSLACG00000014952	-	93	72.101
ENSLACG00000005344	-	85	36.752	ENSLACG00000001055	-	88	36.752