EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000005523 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: FTSJ3
Alias: SPB1
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16772 bases
Position: chrJH129102.1:171725-188496
Accession: 17136
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000006227	FtsJ	PF01728.19	2.5e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000006279	FTSJ3-201	2213	-	ENSLACP00000006227	710 (aa)	-	H3A9A6

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000005523's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000005523's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.020	ENSG00000108592	FTSJ3	72	90.476	Homo_sapiens
ENSLACG00000005523	FTSJ3	72	55.072	ENSAPOG00000005543	ftsj3	73	54.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.790	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	81	50.140	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000005523	FTSJ3	77	48.313	ENSACIG00000012880	ftsj3	79	42.416	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.290	ENSAOCG00000023196	ftsj3	80	51.412	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.716	ENSAPEG00000004250	ftsj3	81	51.412	Amphiprion_percula
ENSLACG00000005523	FTSJ3	89	51.347	ENSATEG00000010069	ftsj3	78	51.406	Anabas_testudineus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	50	54.444	ENSAPLG00000010362	-	61	50.308	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000005523	FTSJ3	81	48.980	ENSACAG00000017930	FTSJ3	75	50.441	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.732	ENSANAG00000033774	FTSJ3	82	49.164	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000005523	FTSJ3	82	70.270	ENSACLG00000019137	ftsj3	78	70.270	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.426	ENSAMXG00000021571	ftsj3	78	51.489	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	50.071	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	81	49.502	Bos_taurus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.515	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	81	47.826	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	50.141	ENSCAFG00000012770	FTSJ3	81	50.000	Canis_familiaris
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	50.426	ENSCAFG00020026630	FTSJ3	81	50.284	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.215	ENSCHIG00000025676	FTSJ3	81	49.501	Capra_hircus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	89	45.988	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	79	45.979	Carlito_syrichta
ENSLACG00000005523	FTSJ3	56	69.091	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	54	89.655	Cavia_aperea
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.739	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	82	49.651	Cavia_porcellus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.237	ENSCCAG00000023533	-	97	51.184	Cebus_capucinus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.333	ENSCATG00000018510	FTSJ3	82	47.940	Cercocebus_atys
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.577	ENSCLAG00000003222	FTSJ3	82	49.091	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.527	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	82	48.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	85	77.143	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	75	77.143	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	67	80.000	ENSCING00000025069	-	63	38.095	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.367	ENSCANG00000042921	FTSJ3	82	48.414	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.577	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	81	50.141	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.577	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	81	50.141	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	47.025	ENSCSEG00000013468	ftsj3	80	46.240	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.716	ENSCVAG00000007484	ftsj3	81	49.858	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.438	ENSDARG00000104938	ftsj3	80	48.722	Danio_rerio
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	47.820	ENSDNOG00000002392	FTSJ3	82	47.018	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.282	ENSDORG00000004200	Ftsj3	81	48.459	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.184	ENSETEG00000019228	FTSJ3	82	47.652	Echinops_telfairi
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	43.101	ENSEBUG00000007828	ftsj3	79	41.292	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000005523	FTSJ3	86	81.081	ENSEASG00005013565	FTSJ3	76	78.947	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.150	ENSECAG00000011995	FTSJ3	81	48.873	Equus_caballus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.563	ENSELUG00000013501	ftsj3	79	50.776	Esox_lucius
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.039	ENSFCAG00000013983	FTSJ3	81	49.086	Felis_catus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.980	ENSFALG00000013635	FTSJ3	82	51.257	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.237	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	81	48.821	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.929	ENSFHEG00000007639	ftsj3	80	49.788	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	61	52.252	ENSGMOG00000017184	ftsj3	99	51.802	Gadus_morhua
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	53.324	ENSGALG00000032993	FTSJ3	82	52.966	Gallus_gallus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	61	52.740	ENSGACG00000009841	ftsj3	99	53.196	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	52.557	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	82	52.180	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.329	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	82	48.682	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.356	ENSHBUG00000022331	ftsj3	79	50.498	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.930	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	81	48.815	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.930	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	81	48.815	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.365	ENSHCOG00000018770	ftsj3	80	48.945	Hippocampus_comes
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	50.640	ENSIPUG00000024942	ftsj3	78	50.568	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.729	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	81	49.858	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.790	ENSJJAG00000012822	Ftsj3	81	49.860	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.071	ENSKMAG00000021997	ftsj3	79	50.212	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.511	ENSLBEG00000027142	ftsj3	80	48.801	Labrus_bergylta
ENSLACG00000005523	FTSJ3	95	47.763	ENSLOCG00000008979	ftsj3	79	49.422	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	47.207	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	82	47.838	Loxodonta_africana
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.459	ENSMFAG00000003764	FTSJ3	82	47.934	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	81	51.652	ENSMMUG00000016768	FTSJ3	69	51.652	Macaca_mulatta
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.392	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	82	47.868	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.886	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	82	48.485	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	77	51.818	ENSMAMG00000006408	ftsj3	66	51.455	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.000	ENSMZEG00005001992	ftsj3	79	50.284	Maylandia_zebra
ENSLACG00000005523	FTSJ3	87	77.778	ENSMGAG00000000953	FTSJ3	86	51.279	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.362	ENSMAUG00000015688	Ftsj3	81	49.362	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.860	ENSMICG00000045996	FTSJ3	82	48.531	Microcebus_murinus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.073	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	81	48.502	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	45.798	ENSMMOG00000019522	ftsj3	74	47.125	Mola_mola
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.310	ENSMODG00000009901	FTSJ3	81	48.732	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.718	MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	82	50.000	Mus_caroli
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.000	ENSMUSG00000020706	Ftsj3	82	48.880	Mus_musculus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.282	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	82	48.540	Mus_pahari
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.296	MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	82	48.599	Mus_spretus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.224	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	82	49.224	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.576	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	82	49.367	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	51.052	ENSNGAG00000005899	Ftsj3	81	51.189	Nannospalax_galili
ENSLACG00000005523	FTSJ3	82	70.270	ENSNBRG00000017453	ftsj3	78	70.270	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.577	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	82	48.886	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	46.449	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	81	44.823	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.743	ENSOPRG00000014985	FTSJ3	82	48.743	Ochotona_princeps
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.237	ENSODEG00000008167	FTSJ3	82	49.022	Octodon_degus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.141	ENSONIG00000001654	ftsj3	79	50.423	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.315	ENSOCUG00000004319	FTSJ3	81	47.612	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.504	ENSORLG00000005910	ftsj3	80	49.579	Oryzias_latipes
ENSLACG00000005523	FTSJ3	83	69.444	ENSORLG00020021255	ftsj3	72	69.444	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.574	ENSORLG00015018416	ftsj3	80	50.140	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.284	ENSOMEG00000014432	ftsj3	73	58.571	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	47.961	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	82	48.184	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.929	ENSOARG00000013637	FTSJ3	81	49.218	Ovis_aries
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	47.652	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	82	49.162	Pan_paniscus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.242	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	81	48.945	Panthera_pardus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	47.465	ENSPTIG00000012576	FTSJ3	81	47.759	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.736	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	82	48.611	Pan_troglodytes
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.607	ENSPANG00000020978	FTSJ3	82	48.209	Papio_anubis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.494	ENSPKIG00000012838	ftsj3	66	71.429	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	45.494	ENSPMGG00000012959	ftsj3	79	44.936	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.715	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	81	49.715	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.150	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	81	47.191	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.864	ENSPFOG00000023101	ftsj3	80	49.574	Poecilia_formosa
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.864	ENSPLAG00000003846	ftsj3	80	49.574	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.006	ENSPMEG00000012692	ftsj3	80	49.716	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.000	ENSPREG00000014874	ftsj3	80	49.296	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.668	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	81	48.050	Pongo_abelii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.584	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	81	47.368	Procavia_capensis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.296	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	82	49.720	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.596	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	82	48.811	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	82	70.270	ENSPNYG00000005108	ftsj3	77	70.270	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000005523	FTSJ3	94	49.629	ENSPNAG00000022474	ftsj3	77	50.074	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.071	ENSRNOG00000009857	Ftsj3	82	50.498	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.664	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	82	47.724	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.805	ENSRROG00000045002	FTSJ3	82	47.862	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	47.532	ENSSBOG00000031794	FTSJ3	76	47.989	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.883	ENSSHAG00000013062	FTSJ3	81	49.646	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.994	ENSSFOG00015018053	ftsj3	80	50.710	Scleropages_formosus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	46.230	ENSSMAG00000002863	ftsj3	79	49.502	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.357	ENSSDUG00000003385	ftsj3	79	49.643	Seriola_dumerili
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	50.071	ENSSLDG00000017970	ftsj3	79	49.929	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	54	58.156	ENSSARG00000004332	-	69	58.156	Sorex_araneus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.432	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	88	48.074	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.576	ENSSPAG00000002390	ftsj3	80	50.850	Stegastes_partitus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	50.213	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	81	49.360	Sus_scrofa
ENSLACG00000005523	FTSJ3	83	67.500	ENSTRUG00000017550	ftsj3	71	68.421	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	46.857	ENSTNIG00000015549	ftsj3	82	46.884	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.360	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	81	49.220	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.290	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	81	49.432	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	76	51.781	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	94	49.524	Ursus_americanus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	49.860	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	81	50.419	Ursus_maritimus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	50.710	ENSVVUG00000006106	FTSJ3	81	50.000	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000005523	FTSJ3	91	45.185	ENSXETG00000006939	ftsj3	78	43.982	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	46.809	ENSXCOG00000002999	ftsj3	75	52.441	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.858	ENSXMAG00000018139	ftsj3	80	50.142	Xiphophorus_maculatus