EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000006473 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 810 bases
Position: chrJH126600.1:220033-220842
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000007300	Transposase_22	PF02994.14	3.6e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000007360	-	771	-	ENSLACP00000007300	257 (aa)	-	H3ACC9

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000006473's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000006473's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000006473	-	85	32.174	ENSLACG00000006813	-	89	31.739
ENSLACG00000006473	-	80	32.589	ENSLACG00000004508	-	91	31.855
ENSLACG00000006473	-	74	31.088	ENSLACG00000016319	-	72	31.088
ENSLACG00000006473	-	71	35.079	ENSLACG00000005344	-	68	35.079
ENSLACG00000006473	-	89	42.609	ENSLACG00000011580	-	94	42.609
ENSLACG00000006473	-	86	32.751	ENSLACG00000002451	-	83	32.314
ENSLACG00000006473	-	88	34.667	ENSLACG00000000876	-	93	33.333
ENSLACG00000006473	-	67	35.484	ENSLACG00000000465	-	73	35.484
ENSLACG00000006473	-	97	58.015	ENSLACG00000006865	-	98	59.657
ENSLACG00000006473	-	74	35.602	ENSLACG00000000369	-	67	35.079
ENSLACG00000006473	-	74	37.306	ENSLACG00000011552	-	70	36.041
ENSLACG00000006473	-	94	30.651	ENSLACG00000010859	-	94	30.651
ENSLACG00000006473	-	94	31.557	ENSLACG00000013472	-	91	30.328
ENSLACG00000006473	-	85	32.911	ENSLACG00000006820	-	87	32.911
ENSLACG00000006473	-	82	82.028	ENSLACG00000016955	-	84	82.028
ENSLACG00000006473	-	93	83.465	ENSLACG00000010900	-	96	83.465
ENSLACG00000006473	-	63	36.025	ENSLACG00000010633	-	91	35.404
ENSLACG00000006473	-	68	38.636	ENSLACG00000005368	-	83	38.068
ENSLACG00000006473	-	87	40.179	ENSLACG00000000077	-	85	40.179
ENSLACG00000006473	-	89	41.048	ENSLACG00000009393	-	97	41.048
ENSLACG00000006473	-	80	35.071	ENSLACG00000001384	-	98	34.158
ENSLACG00000006473	-	94	71.311	ENSLACG00000011150	-	89	71.311
ENSLACG00000006473	-	82	36.150	ENSLACG00000000673	-	92	32.636
ENSLACG00000006473	-	96	33.597	ENSLACG00000006210	-	95	33.074
ENSLACG00000006473	-	90	44.156	ENSLACG00000017727	-	98	44.156
ENSLACG00000006473	-	86	32.922	ENSLACG00000011390	-	93	32.922
ENSLACG00000006473	-	88	33.898	ENSLACG00000009806	-	85	33.333
ENSLACG00000006473	-	79	32.727	ENSLACG00000007340	-	91	32.727
ENSLACG00000006473	-	70	35.484	ENSLACG00000007342	-	89	35.484
ENSLACG00000006473	-	88	35.242	ENSLACG00000010019	-	93	35.242
ENSLACG00000006473	-	88	36.134	ENSLACG00000000643	-	97	35.714
ENSLACG00000006473	-	91	35.169	ENSLACG00000013072	-	91	33.473
ENSLACG00000006473	-	82	85.714	ENSLACG00000010092	-	100	81.857
ENSLACG00000006473	-	82	34.906	ENSLACG00000014189	-	74	33.962
ENSLACG00000006473	-	82	40.952	ENSLACG00000000848	-	85	41.429
ENSLACG00000006473	-	71	36.612	ENSLACG00000018384	-	92	36.612
ENSLACG00000006473	-	79	33.824	ENSLACG00000005266	-	70	33.333
ENSLACG00000006473	-	76	58.654	ENSLACG00000004272	-	99	58.654
ENSLACG00000006473	-	84	59.649	ENSLACG00000002651	-	93	59.649
ENSLACG00000006473	-	70	76.667	ENSLACG00000002135	-	80	76.667
ENSLACG00000006473	-	81	38.095	ENSLACG00000010144	-	75	37.321
ENSLACG00000006473	-	95	61.479	ENSLACG00000007821	-	86	61.479
ENSLACG00000006473	-	85	33.188	ENSLACG00000014952	-	73	33.188
ENSLACG00000006473	-	76	57.212	ENSLACG00000016517	-	99	57.212
ENSLACG00000006473	-	70	32.240	ENSLACG00000000425	-	91	31.016
ENSLACG00000006473	-	79	33.005	ENSLACG00000013090	-	96	33.171
ENSLACG00000006473	-	72	37.968	ENSLACG00000001055	-	82	37.433
ENSLACG00000006473	-	67	34.759	ENSLACG00000000903	-	80	33.514
ENSLACG00000006473	-	84	34.722	ENSLACG00000009013	-	64	34.722
ENSLACG00000006473	-	80	33.659	ENSLACG00000010705	-	84	33.659
ENSLACG00000006473	-	89	34.322	ENSLACG00000006110	-	99	34.322
ENSLACG00000006473	-	93	72.112	ENSLACG00000014493	-	84	72.112
ENSLACG00000006473	-	79	41.584	ENSLACG00000003145	-	89	41.584
ENSLACG00000006473	-	80	32.727	ENSLACG00000013987	-	81	31.250
ENSLACG00000006473	-	85	41.553	ENSLACG00000002189	-	92	41.553
ENSLACG00000006473	-	72	34.595	ENSLACG00000001295	-	74	34.054
ENSLACG00000006473	-	75	36.765	ENSLACG00000001298	-	88	35.577
ENSLACG00000006473	-	77	37.688	ENSLACG00000012198	-	83	37.000
ENSLACG00000006473	-	91	42.128	ENSLACG00000011265	-	93	42.128
ENSLACG00000006473	-	90	31.076	ENSLACG00000003957	-	86	31.076
ENSLACG00000006473	-	90	33.761	ENSLACG00000001559	-	72	35.047
ENSLACG00000006473	-	89	40.175	ENSLACG00000005009	-	91	40.175
ENSLACG00000006473	-	65	37.500	ENSLACG00000007535	-	96	36.310
ENSLACG00000006473	-	81	32.035	ENSLACG00000010080	-	97	32.035
ENSLACG00000006473	-	95	82.171	ENSLACG00000002471	-	87	82.171
ENSLACG00000006473	-	76	34.359	ENSLACG00000014732	-	86	33.846
ENSLACG00000006473	-	74	35.602	ENSLACG00000010165	-	73	35.079
ENSLACG00000006473	-	62	37.107	ENSLACG00000002051	-	58	36.709
ENSLACG00000006473	-	87	34.222	ENSLACG00000012357	-	95	33.778
ENSLACG00000006473	-	81	31.280	ENSLACG00000007888	-	81	31.500
ENSLACG00000006473	-	83	35.981	ENSLACG00000014474	-	78	35.514
ENSLACG00000006473	-	82	35.586	ENSLACG00000012229	-	86	35.586
ENSLACG00000006473	-	80	68.807	ENSLACG00000008859	-	86	68.807
ENSLACG00000006473	-	91	38.034	ENSLACG00000010569	-	93	38.034
ENSLACG00000006473	-	80	31.674	ENSLACG00000001077	-	90	31.674
ENSLACG00000006473	-	62	33.333	ENSLACG00000008643	-	92	32.704
ENSLACG00000006473	-	74	37.306	ENSLACG00000003217	-	59	39.024
ENSLACG00000006473	-	81	67.773	ENSLACG00000003451	-	93	67.773
ENSLACG00000006473	-	74	30.500	ENSLACG00000017411	-	94	30.348
ENSLACG00000006473	-	62	35.625	ENSLACG00000000907	-	78	36.250
ENSLACG00000006473	-	76	32.178	ENSLACG00000013182	-	90	31.188
ENSLACG00000006473	-	93	85.375	ENSLACG00000010346	-	86	85.375
ENSLACG00000006473	-	93	33.061	ENSLACG00000000668	-	78	32.653
ENSLACG00000006473	-	79	33.659	ENSLACG00000014769	-	87	37.017

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000006473	-	71	33.514	ENSAPEG00000022657	-	51	32.086	Amphiprion_percula
ENSLACG00000006473	-	82	34.259	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	78	34.259	Danio_rerio
ENSLACG00000006473	-	79	32.227	ENSFHEG00000006296	-	62	30.734	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000006473	-	67	32.370	ENSONIG00000021329	-	75	31.792	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000006473	-	77	33.824	ENSORLG00000020512	-	67	33.824	Oryzias_latipes
ENSLACG00000006473	-	80	36.493	ENSPKIG00000001458	-	83	36.493	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000006473	-	61	31.677	ENSPMGG00000001874	-	56	31.677	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000006473	-	73	37.766	ENSPFOG00000020584	-	69	37.766	Poecilia_formosa
ENSLACG00000006473	-	85	36.000	ENSPNYG00000003325	-	74	36.000	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000006473	-	89	33.624	ENSPNAG00000017685	-	61	33.624	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000006473	-	87	38.865	ENSSLDG00000008663	-	90	38.865	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000006473	-	83	31.364	ENSXMAG00000029285	-	76	30.088	Xiphophorus_maculatus