EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000007535 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 958 bases
Position: chrJH129198.1:282501-283458
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000008515	Transposase_22	PF02994.14	7.8e-06	1	1
ENSLACP00000008514	Transposase_22	PF02994.14	8.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000008583	-	516	-	ENSLACP00000008515	172 (aa)	-	H3AFU4
ENSLACT00000008582	-	525	-	ENSLACP00000008514	175 (aa)	-	H3AFU3

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000007535's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000007535's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000007535	-	98	47.929	ENSLACG00000014732	-	75	47.929
ENSLACG00000007535	-	96	37.500	ENSLACG00000010346	-	57	37.500
ENSLACG00000007535	-	96	39.286	ENSLACG00000002471	-	56	39.286
ENSLACG00000007535	-	94	61.491	ENSLACG00000010144	-	59	61.491
ENSLACG00000007535	-	96	36.310	ENSLACG00000006473	-	65	37.500
ENSLACG00000007535	-	67	44.915	ENSLACG00000018384	-	65	44.915
ENSLACG00000007535	-	95	45.509	ENSLACG00000005344	-	60	45.509
ENSLACG00000007535	-	93	35.404	ENSLACG00000008432	-	52	35.404
ENSLACG00000007535	-	85	39.456	ENSLACG00000016955	-	57	39.456
ENSLACG00000007535	-	96	42.771	ENSLACG00000009393	-	72	42.771
ENSLACG00000007535	-	84	39.041	ENSLACG00000003451	-	64	39.041
ENSLACG00000007535	-	94	50.311	ENSLACG00000012357	-	68	50.000
ENSLACG00000007535	-	93	48.750	ENSLACG00000014474	-	61	48.750
ENSLACG00000007535	-	95	47.590	ENSLACG00000001559	-	56	47.590
ENSLACG00000007535	-	93	57.500	ENSLACG00000001055	-	70	57.500
ENSLACG00000007535	-	96	45.238	ENSLACG00000010859	-	62	45.238
ENSLACG00000007535	-	64	49.107	ENSLACG00000000903	-	50	49.107
ENSLACG00000007535	-	80	49.275	ENSLACG00000000907	-	68	49.275
ENSLACG00000007535	-	96	45.833	ENSLACG00000000668	-	56	45.833
ENSLACG00000007535	-	88	37.908	ENSLACG00000002135	-	77	34.483
ENSLACG00000007535	-	95	46.386	ENSLACG00000013072	-	68	46.386
ENSLACG00000007535	-	63	38.532	ENSLACG00000002891	-	50	38.532
ENSLACG00000007535	-	85	48.322	ENSLACG00000001298	-	64	48.322
ENSLACG00000007535	-	71	49.180	ENSLACG00000001295	-	51	47.541
ENSLACG00000007535	-	96	47.619	ENSLACG00000006210	-	65	47.619
ENSLACG00000007535	-	96	48.214	ENSLACG00000003957	-	58	48.214
ENSLACG00000007535	-	91	48.428	ENSLACG00000006820	-	59	48.428
ENSLACG00000007535	-	85	36.054	ENSLACG00000016517	-	70	36.054
ENSLACG00000007535	-	94	34.969	ENSLACG00000014493	-	54	34.969
ENSLACG00000007535	-	92	40.625	ENSLACG00000002189	-	71	40.625
ENSLACG00000007535	-	95	55.828	ENSLACG00000002451	-	59	55.828
ENSLACG00000007535	-	96	41.916	ENSLACG00000011265	-	68	41.916
ENSLACG00000007535	-	94	48.171	ENSLACG00000010080	-	70	48.171
ENSLACG00000007535	-	83	38.462	ENSLACG00000010705	-	59	38.462
ENSLACG00000007535	-	92	47.170	ENSLACG00000010165	-	61	47.170
ENSLACG00000007535	-	83	55.245	ENSLACG00000005368	-	68	55.245
ENSLACG00000007535	-	95	43.713	ENSLACG00000000465	-	67	43.713
ENSLACG00000007535	-	92	45.283	ENSLACG00000008643	-	93	45.283
ENSLACG00000007535	-	96	44.048	ENSLACG00000007340	-	71	44.048
ENSLACG00000007535	-	95	48.503	ENSLACG00000007342	-	81	48.503
ENSLACG00000007535	-	96	42.515	ENSLACG00000001077	-	68	42.515
ENSLACG00000007535	-	82	53.191	ENSLACG00000013090	-	66	53.191
ENSLACG00000007535	-	85	34.694	ENSLACG00000004272	-	70	34.694
ENSLACG00000007535	-	95	58.282	ENSLACG00000005266	-	57	58.282
ENSLACG00000007535	-	93	35.404	ENSLACG00000022508	-	52	35.404
ENSLACG00000007535	-	92	43.827	ENSLACG00000002051	-	59	43.827
ENSLACG00000007535	-	97	34.911	ENSLACG00000009013	-	52	34.682
ENSLACG00000007535	-	96	75.152	ENSLACG00000000876	-	74	75.152
ENSLACG00000007535	-	93	34.161	ENSLACG00000010803	-	52	34.161
ENSLACG00000007535	-	100	35.429	ENSLACG00000017411	-	83	35.429
ENSLACG00000007535	-	80	34.043	ENSLACG00000022180	-	57	34.043
ENSLACG00000007535	-	96	60.241	ENSLACG00000000643	-	68	60.241
ENSLACG00000007535	-	93	54.375	ENSLACG00000000369	-	56	54.375
ENSLACG00000007535	-	95	45.509	ENSLACG00000013987	-	62	45.509
ENSLACG00000007535	-	91	39.873	ENSLACG00000009806	-	57	39.873
ENSLACG00000007535	-	100	38.068	ENSLACG00000005009	-	75	38.068
ENSLACG00000007535	-	96	46.429	ENSLACG00000012229	-	68	46.429
ENSLACG00000007535	-	94	38.037	ENSLACG00000007821	-	55	38.037
ENSLACG00000007535	-	85	52.055	ENSLACG00000014769	-	71	52.055
ENSLACG00000007535	-	98	39.306	ENSLACG00000003145	-	77	39.306
ENSLACG00000007535	-	95	38.728	ENSLACG00000010569	-	76	38.728
ENSLACG00000007535	-	96	43.976	ENSLACG00000017727	-	76	43.353
ENSLACG00000007535	-	96	47.619	ENSLACG00000006110	-	75	47.619
ENSLACG00000007535	-	84	38.356	ENSLACG00000008859	-	58	38.356
ENSLACG00000007535	-	100	51.744	ENSLACG00000000673	-	67	51.744
ENSLACG00000007535	-	96	47.619	ENSLACG00000004508	-	62	47.619
ENSLACG00000007535	-	97	32.759	ENSLACG00000006865	-	73	32.759
ENSLACG00000007535	-	96	41.765	ENSLACG00000000534	-	64	41.765
ENSLACG00000007535	-	96	47.024	ENSLACG00000012198	-	72	47.024
ENSLACG00000007535	-	81	35.461	ENSLACG00000012896	-	52	35.461
ENSLACG00000007535	-	80	36.429	ENSLACG00000013538	-	66	36.429
ENSLACG00000007535	-	95	50.920	ENSLACG00000014189	-	57	50.920
ENSLACG00000007535	-	98	67.251	ENSLACG00000013182	-	74	67.251
ENSLACG00000007535	-	98	38.728	ENSLACG00000000848	-	71	38.728
ENSLACG00000007535	-	69	42.975	ENSLACG00000000425	-	62	42.975
ENSLACG00000007535	-	100	44.000	ENSLACG00000013472	-	69	44.000
ENSLACG00000007535	-	96	43.114	ENSLACG00000011580	-	70	43.114
ENSLACG00000007535	-	99	47.368	ENSLACG00000006813	-	66	47.368
ENSLACG00000007535	-	95	47.904	ENSLACG00000003217	-	61	47.904
ENSLACG00000007535	-	95	40.120	ENSLACG00000011150	-	61	40.120
ENSLACG00000007535	-	75	55.814	ENSLACG00000010633	-	73	55.814
ENSLACG00000007535	-	99	35.632	ENSLACG00000007888	-	72	35.632
ENSLACG00000007535	-	99	38.506	ENSLACG00000010900	-	66	38.506
ENSLACG00000007535	-	96	48.214	ENSLACG00000014952	-	56	48.214
ENSLACG00000007535	-	94	36.585	ENSLACG00000010019	-	68	36.585
ENSLACG00000007535	-	96	43.114	ENSLACG00000000077	-	64	43.114
ENSLACG00000007535	-	91	82.803	ENSLACG00000001384	-	78	79.375
ENSLACG00000007535	-	85	35.374	ENSLACG00000002651	-	60	35.374
ENSLACG00000007535	-	93	35.404	ENSLACG00000014503	-	52	35.404
ENSLACG00000007535	-	96	35.119	ENSLACG00000010092	-	71	36.310
ENSLACG00000007535	-	97	44.970	ENSLACG00000016396	-	60	44.970
ENSLACG00000007535	-	96	46.429	ENSLACG00000011552	-	63	46.429
ENSLACG00000007535	-	96	45.238	ENSLACG00000011390	-	65	45.238
ENSLACG00000007535	-	93	35.404	ENSLACG00000005767	-	52	35.404
ENSLACG00000007535	-	78	34.559	ENSLACG00000016319	-	53	34.559