EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000007821 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 894 bases
Position: chrJH126775.1:301356-302249
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000008855	Transposase_22	PF02994.14	1.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000008924	-	894	-	ENSLACP00000008855	298 (aa)	-	H3AGT4

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000007821's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000007821's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000007821	-	69	33.333	ENSLACG00000014769	-	99	33.333
ENSLACG00000007821	-	71	37.089	ENSLACG00000005266	-	74	37.089
ENSLACG00000007821	-	72	34.884	ENSLACG00000013090	-	99	34.884
ENSLACG00000007821	-	80	40.084	ENSLACG00000002189	-	99	40.084
ENSLACG00000007821	-	55	38.037	ENSLACG00000007535	-	94	38.037
ENSLACG00000007821	-	63	32.500	ENSLACG00000000425	-	98	32.500
ENSLACG00000007821	-	64	33.175	ENSLACG00000004508	-	77	33.175
ENSLACG00000007821	-	62	42.473	ENSLACG00000018384	-	94	42.473
ENSLACG00000007821	-	73	42.396	ENSLACG00000017727	-	93	42.396
ENSLACG00000007821	-	76	36.123	ENSLACG00000010144	-	82	36.123
ENSLACG00000007821	-	81	30.952	ENSLACG00000000668	-	80	30.952
ENSLACG00000007821	-	88	70.342	ENSLACG00000006865	-	100	69.796
ENSLACG00000007821	-	97	64.828	ENSLACG00000010346	-	98	64.828
ENSLACG00000007821	-	97	62.284	ENSLACG00000002471	-	97	62.284
ENSLACG00000007821	-	68	72.277	ENSLACG00000004272	-	96	72.277
ENSLACG00000007821	-	60	34.054	ENSLACG00000010080	-	77	34.054
ENSLACG00000007821	-	83	67.339	ENSLACG00000010900	-	94	67.339
ENSLACG00000007821	-	79	35.443	ENSLACG00000009806	-	85	35.443
ENSLACG00000007821	-	70	67.308	ENSLACG00000016517	-	99	67.308
ENSLACG00000007821	-	73	59.174	ENSLACG00000008859	-	86	59.174
ENSLACG00000007821	-	73	30.455	ENSLACG00000013987	-	81	30.455
ENSLACG00000007821	-	68	34.123	ENSLACG00000001384	-	98	33.168
ENSLACG00000007821	-	72	42.791	ENSLACG00000011580	-	89	42.791
ENSLACG00000007821	-	70	59.809	ENSLACG00000003451	-	92	59.809
ENSLACG00000007821	-	64	36.082	ENSLACG00000013072	-	79	36.082
ENSLACG00000007821	-	76	30.172	ENSLACG00000006110	-	93	30.172
ENSLACG00000007821	-	75	31.004	ENSLACG00000006210	-	85	31.004
ENSLACG00000007821	-	59	32.768	ENSLACG00000002891	-	81	32.768
ENSLACG00000007821	-	82	36.032	ENSLACG00000002451	-	88	36.032
ENSLACG00000007821	-	70	42.105	ENSLACG00000003145	-	92	42.105
ENSLACG00000007821	-	69	65.366	ENSLACG00000002135	-	88	67.347
ENSLACG00000007821	-	78	35.622	ENSLACG00000010569	-	94	35.622
ENSLACG00000007821	-	76	34.667	ENSLACG00000000673	-	86	34.667
ENSLACG00000007821	-	82	31.873	ENSLACG00000001077	-	99	31.873
ENSLACG00000007821	-	70	42.105	ENSLACG00000000848	-	85	42.105
ENSLACG00000007821	-	77	30.901	ENSLACG00000016396	-	82	30.901
ENSLACG00000007821	-	54	35.542	ENSLACG00000000465	-	65	35.542
ENSLACG00000007821	-	78	33.333	ENSLACG00000001559	-	78	33.333
ENSLACG00000007821	-	86	61.479	ENSLACG00000006473	-	95	61.479
ENSLACG00000007821	-	66	33.333	ENSLACG00000009013	-	60	33.333
ENSLACG00000007821	-	78	31.197	ENSLACG00000013472	-	91	31.197
ENSLACG00000007821	-	73	35.484	ENSLACG00000000876	-	89	35.484
ENSLACG00000007821	-	81	32.500	ENSLACG00000000369	-	84	32.500
ENSLACG00000007821	-	59	37.853	ENSLACG00000001295	-	74	37.853
ENSLACG00000007821	-	68	33.173	ENSLACG00000001298	-	85	33.173
ENSLACG00000007821	-	73	30.631	ENSLACG00000007888	-	90	30.631
ENSLACG00000007821	-	65	35.897	ENSLACG00000000907	-	95	35.897
ENSLACG00000007821	-	66	30.288	ENSLACG00000000903	-	91	30.288
ENSLACG00000007821	-	77	41.667	ENSLACG00000011265	-	91	41.667
ENSLACG00000007821	-	60	32.292	ENSLACG00000007342	-	90	32.292
ENSLACG00000007821	-	67	31.905	ENSLACG00000007340	-	87	31.905
ENSLACG00000007821	-	84	36.364	ENSLACG00000014474	-	95	36.364
ENSLACG00000007821	-	70	30.317	ENSLACG00000011390	-	84	30.317
ENSLACG00000007821	-	81	40.496	ENSLACG00000000077	-	90	40.496
ENSLACG00000007821	-	82	73.770	ENSLACG00000002651	-	100	73.770
ENSLACG00000007821	-	62	39.894	ENSLACG00000001055	-	82	39.894
ENSLACG00000007821	-	73	43.318	ENSLACG00000009393	-	93	43.318
ENSLACG00000007821	-	82	32.377	ENSLACG00000006813	-	93	32.377
ENSLACG00000007821	-	67	36.181	ENSLACG00000005368	-	94	36.181
ENSLACG00000007821	-	78	34.335	ENSLACG00000012357	-	98	34.335
ENSLACG00000007821	-	82	33.061	ENSLACG00000010165	-	92	33.061
ENSLACG00000007821	-	75	35.874	ENSLACG00000000643	-	91	35.874
ENSLACG00000007821	-	67	34.500	ENSLACG00000014732	-	88	34.500
ENSLACG00000007821	-	72	33.488	ENSLACG00000010705	-	88	33.488
ENSLACG00000007821	-	92	58.123	ENSLACG00000011150	-	97	58.123
ENSLACG00000007821	-	74	38.009	ENSLACG00000005009	-	88	38.009
ENSLACG00000007821	-	78	31.646	ENSLACG00000003217	-	84	31.646
ENSLACG00000007821	-	81	31.535	ENSLACG00000014189	-	84	31.535
ENSLACG00000007821	-	78	63.793	ENSLACG00000010092	-	98	63.793
ENSLACG00000007821	-	68	33.981	ENSLACG00000012198	-	85	33.981
ENSLACG00000007821	-	68	30.876	ENSLACG00000012229	-	86	30.876
ENSLACG00000007821	-	81	37.344	ENSLACG00000010019	-	98	37.344
ENSLACG00000007821	-	53	37.107	ENSLACG00000008643	-	92	37.107
ENSLACG00000007821	-	52	40.385	ENSLACG00000010633	-	94	40.000
ENSLACG00000007821	-	88	59.091	ENSLACG00000016955	-	100	59.091
ENSLACG00000007821	-	97	63.322	ENSLACG00000014493	-	97	63.322

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000007821	-	86	30.827	ENSAPEG00000023573	-	84	30.827	Amphiprion_percula
ENSLACG00000007821	-	86	30.827	ENSAPEG00000008945	-	84	30.827	Amphiprion_percula
ENSLACG00000007821	-	65	34.314	ENSAPEG00000001697	-	55	34.314	Amphiprion_percula
ENSLACG00000007821	-	82	30.738	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	88	30.738	Danio_rerio
ENSLACG00000007821	-	74	30.667	ENSFHEG00000006296	-	64	30.667	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000007821	-	73	31.390	ENSKMAG00000012954	-	68	31.390	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000007821	-	62	34.946	ENSMZEG00005024824	-	59	34.946	Maylandia_zebra
ENSLACG00000007821	-	54	33.537	ENSONIG00000021329	-	71	33.537	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000007821	-	81	31.429	ENSORLG00015021275	-	73	31.429	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000007821	-	63	30.319	ENSOMEG00000019152	-	68	30.319	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000007821	-	69	36.408	ENSPKIG00000001458	-	81	36.408	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000007821	-	69	31.401	ENSPKIG00000009100	-	61	31.401	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000007821	-	51	33.117	ENSPMGG00000001874	-	53	33.117	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000007821	-	85	30.385	ENSPFOG00000020665	-	92	30.385	Poecilia_formosa
ENSLACG00000007821	-	84	32.669	ENSPFOG00000020584	-	90	32.669	Poecilia_formosa
ENSLACG00000007821	-	63	31.250	ENSPLAG00000016026	-	69	31.250	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000007821	-	78	33.898	ENSPNYG00000003325	-	78	33.898	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000007821	-	72	34.112	ENSPNAG00000017685	-	63	34.112	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000007821	-	75	35.268	ENSSLDG00000008663	-	88	35.268	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000007821	-	63	30.612	ENSXMAG00000024802	-	61	30.612	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000007821	-	63	30.612	ENSXMAG00000021250	-	59	30.612	Xiphophorus_maculatus