EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000007888 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 770 bases
Position: chrJH127920.1:305873-306642
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000008932	Transposase_22	PF02994.14	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000009001	-	729	-	ENSLACP00000008932	243 (aa)	-	H3AH11

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000007888's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000007888's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000007888	-	91	33.772	ENSLACG00000013472	-	89	33.772
ENSLACG00000007888	-	84	36.946	ENSLACG00000013538	-	92	36.946
ENSLACG00000007888	-	95	31.513	ENSLACG00000016396	-	84	31.513
ENSLACG00000007888	-	81	34.518	ENSLACG00000000465	-	76	34.518
ENSLACG00000007888	-	81	38.384	ENSLACG00000016319	-	75	38.384
ENSLACG00000007888	-	87	34.123	ENSLACG00000013182	-	93	34.123
ENSLACG00000007888	-	91	30.568	ENSLACG00000003957	-	79	30.568
ENSLACG00000007888	-	84	34.804	ENSLACG00000013072	-	83	34.804
ENSLACG00000007888	-	92	30.870	ENSLACG00000014952	-	77	30.870
ENSLACG00000007888	-	93	30.088	ENSLACG00000000077	-	82	30.088
ENSLACG00000007888	-	91	32.456	ENSLACG00000001077	-	93	32.456
ENSLACG00000007888	-	86	36.058	ENSLACG00000001055	-	85	36.058
ENSLACG00000007888	-	86	46.890	ENSLACG00000017411	-	98	46.890
ENSLACG00000007888	-	85	32.367	ENSLACG00000001384	-	100	32.367
ENSLACG00000007888	-	80	31.156	ENSLACG00000006110	-	89	31.156
ENSLACG00000007888	-	95	32.759	ENSLACG00000000643	-	94	32.759
ENSLACG00000007888	-	92	30.263	ENSLACG00000011265	-	90	30.263
ENSLACG00000007888	-	81	31.500	ENSLACG00000006473	-	81	31.280
ENSLACG00000007888	-	72	35.429	ENSLACG00000010080	-	75	35.429
ENSLACG00000007888	-	65	33.962	ENSLACG00000007342	-	77	33.962
ENSLACG00000007888	-	82	32.000	ENSLACG00000007340	-	82	32.000
ENSLACG00000007888	-	77	42.781	ENSLACG00000000425	-	96	42.781
ENSLACG00000007888	-	72	35.632	ENSLACG00000007535	-	99	35.632
ENSLACG00000007888	-	65	35.443	ENSLACG00000008643	-	90	35.443
ENSLACG00000007888	-	88	35.814	ENSLACG00000005266	-	74	35.814
ENSLACG00000007888	-	95	37.021	ENSLACG00000000876	-	98	37.021
ENSLACG00000007888	-	93	31.556	ENSLACG00000002451	-	81	31.556
ENSLACG00000007888	-	84	34.286	ENSLACG00000014769	-	100	34.286
ENSLACG00000007888	-	96	32.189	ENSLACG00000000673	-	89	32.189
ENSLACG00000007888	-	67	32.317	ENSLACG00000010633	-	91	32.515
ENSLACG00000007888	-	90	30.631	ENSLACG00000007821	-	73	30.631
ENSLACG00000007888	-	94	31.140	ENSLACG00000014189	-	78	31.140
ENSLACG00000007888	-	90	30.137	ENSLACG00000012357	-	91	30.137
ENSLACG00000007888	-	87	30.189	ENSLACG00000012198	-	88	30.189
ENSLACG00000007888	-	92	39.013	ENSLACG00000022180	-	88	39.013
ENSLACG00000007888	-	85	31.401	ENSLACG00000005368	-	93	31.401
ENSLACG00000007888	-	87	31.193	ENSLACG00000010165	-	82	31.193
ENSLACG00000007888	-	93	33.188	ENSLACG00000014474	-	84	33.188
ENSLACG00000007888	-	91	30.317	ENSLACG00000013987	-	82	30.317
ENSLACG00000007888	-	96	34.188	ENSLACG00000010144	-	84	34.188
ENSLACG00000007888	-	78	31.795	ENSLACG00000001295	-	77	31.795