EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000008643 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 962 bases
Position: chrJH128177.1:358654-359615
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000009800	Transposase_22	PF02994.14	2.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000009876	-	486	-	ENSLACP00000009800	161 (aa)	-	H3AJH9

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000008643's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000008643's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000008643	-	91	40.491	ENSLACG00000006110	-	73	40.491
ENSLACG00000008643	-	75	31.343	ENSLACG00000022180	-	55	31.343
ENSLACG00000008643	-	83	35.862	ENSLACG00000010705	-	57	35.862
ENSLACG00000008643	-	93	52.830	ENSLACG00000000643	-	65	52.830
ENSLACG00000008643	-	92	31.447	ENSLACG00000010092	-	67	33.333
ENSLACG00000008643	-	93	47.799	ENSLACG00000014732	-	71	47.799
ENSLACG00000008643	-	86	39.474	ENSLACG00000012229	-	61	39.474
ENSLACG00000008643	-	91	41.718	ENSLACG00000014952	-	55	41.718
ENSLACG00000008643	-	91	50.000	ENSLACG00000010165	-	60	50.000
ENSLACG00000008643	-	91	41.104	ENSLACG00000004508	-	60	41.104
ENSLACG00000008643	-	98	46.746	ENSLACG00000012357	-	71	46.746
ENSLACG00000008643	-	85	36.486	ENSLACG00000002135	-	66	36.486
ENSLACG00000008643	-	66	38.532	ENSLACG00000000425	-	56	38.532
ENSLACG00000008643	-	95	51.534	ENSLACG00000014189	-	57	51.534
ENSLACG00000008643	-	82	34.965	ENSLACG00000016955	-	56	34.965
ENSLACG00000008643	-	91	39.877	ENSLACG00000012198	-	70	39.877
ENSLACG00000008643	-	93	34.568	ENSLACG00000000077	-	62	35.802
ENSLACG00000008643	-	78	48.529	ENSLACG00000000907	-	67	48.529
ENSLACG00000008643	-	66	40.741	ENSLACG00000000903	-	50	39.823
ENSLACG00000008643	-	92	48.734	ENSLACG00000002451	-	57	48.734
ENSLACG00000008643	-	81	34.286	ENSLACG00000016517	-	67	34.286
ENSLACG00000008643	-	91	39.264	ENSLACG00000003217	-	59	39.264
ENSLACG00000008643	-	93	36.095	ENSLACG00000010569	-	70	36.095
ENSLACG00000008643	-	87	42.675	ENSLACG00000001298	-	68	42.675
ENSLACG00000008643	-	82	52.113	ENSLACG00000014769	-	69	52.113
ENSLACG00000008643	-	89	55.195	ENSLACG00000001055	-	68	55.195
ENSLACG00000008643	-	93	35.185	ENSLACG00000017727	-	70	35.185
ENSLACG00000008643	-	91	47.771	ENSLACG00000000369	-	55	47.771
ENSLACG00000008643	-	82	35.664	ENSLACG00000003451	-	63	35.664
ENSLACG00000008643	-	83	32.414	ENSLACG00000006865	-	61	32.414
ENSLACG00000008643	-	87	40.764	ENSLACG00000005344	-	57	40.764
ENSLACG00000008643	-	94	49.383	ENSLACG00000000673	-	63	49.383
ENSLACG00000008643	-	92	35.220	ENSLACG00000010346	-	54	35.220
ENSLACG00000008643	-	91	42.105	ENSLACG00000013182	-	69	42.105
ENSLACG00000008643	-	82	35.915	ENSLACG00000004272	-	68	35.915
ENSLACG00000008643	-	94	38.272	ENSLACG00000000848	-	68	36.310
ENSLACG00000008643	-	91	52.866	ENSLACG00000005266	-	55	52.866
ENSLACG00000008643	-	91	39.877	ENSLACG00000003957	-	56	39.877
ENSLACG00000008643	-	92	32.704	ENSLACG00000006473	-	62	33.333
ENSLACG00000008643	-	86	40.789	ENSLACG00000006210	-	59	40.789
ENSLACG00000008643	-	89	33.951	ENSLACG00000002189	-	68	33.951
ENSLACG00000008643	-	93	35.802	ENSLACG00000003145	-	72	35.802
ENSLACG00000008643	-	91	41.975	ENSLACG00000001559	-	55	41.975
ENSLACG00000008643	-	91	41.718	ENSLACG00000011552	-	61	41.718
ENSLACG00000008643	-	86	41.722	ENSLACG00000013072	-	62	41.722
ENSLACG00000008643	-	94	39.881	ENSLACG00000001077	-	69	39.881
ENSLACG00000008643	-	93	45.283	ENSLACG00000007535	-	92	45.283
ENSLACG00000008643	-	89	41.026	ENSLACG00000013987	-	58	41.026
ENSLACG00000008643	-	89	41.026	ENSLACG00000013472	-	61	41.026
ENSLACG00000008643	-	89	46.405	ENSLACG00000001384	-	74	43.791
ENSLACG00000008643	-	92	35.849	ENSLACG00000010900	-	60	35.849
ENSLACG00000008643	-	85	35.811	ENSLACG00000008859	-	58	35.811
ENSLACG00000008643	-	91	39.877	ENSLACG00000000465	-	65	39.877
ENSLACG00000008643	-	94	37.870	ENSLACG00000011390	-	66	37.870
ENSLACG00000008643	-	77	34.559	ENSLACG00000013538	-	64	34.559
ENSLACG00000008643	-	80	49.640	ENSLACG00000005368	-	66	49.640
ENSLACG00000008643	-	86	32.886	ENSLACG00000002651	-	61	32.886
ENSLACG00000008643	-	91	41.104	ENSLACG00000010080	-	70	41.104
ENSLACG00000008643	-	87	37.736	ENSLACG00000011580	-	64	37.736
ENSLACG00000008643	-	92	37.107	ENSLACG00000007821	-	53	37.107
ENSLACG00000008643	-	93	36.420	ENSLACG00000011265	-	65	36.420
ENSLACG00000008643	-	94	39.623	ENSLACG00000009393	-	71	39.623
ENSLACG00000008643	-	92	33.553	ENSLACG00000014493	-	52	33.553
ENSLACG00000008643	-	96	34.756	ENSLACG00000009806	-	60	34.756
ENSLACG00000008643	-	88	36.774	ENSLACG00000005009	-	66	36.774
ENSLACG00000008643	-	92	52.532	ENSLACG00000006813	-	61	52.532
ENSLACG00000008643	-	92	37.107	ENSLACG00000011150	-	58	37.107
ENSLACG00000008643	-	80	47.101	ENSLACG00000013090	-	64	47.101
ENSLACG00000008643	-	91	39.264	ENSLACG00000000668	-	54	39.264
ENSLACG00000008643	-	89	33.758	ENSLACG00000017411	-	74	33.758
ENSLACG00000008643	-	91	41.718	ENSLACG00000010859	-	60	41.718
ENSLACG00000008643	-	91	49.682	ENSLACG00000010144	-	58	49.682
ENSLACG00000008643	-	94	40.476	ENSLACG00000016396	-	60	40.476
ENSLACG00000008643	-	73	33.077	ENSLACG00000016319	-	51	33.077
ENSLACG00000008643	-	90	35.443	ENSLACG00000007888	-	65	35.443
ENSLACG00000008643	-	90	42.593	ENSLACG00000006820	-	60	40.741
ENSLACG00000008643	-	89	38.650	ENSLACG00000000534	-	59	39.241
ENSLACG00000008643	-	89	39.744	ENSLACG00000007342	-	76	39.744
ENSLACG00000008643	-	91	36.810	ENSLACG00000007340	-	69	36.810
ENSLACG00000008643	-	66	53.774	ENSLACG00000010633	-	60	53.774
ENSLACG00000008643	-	68	41.228	ENSLACG00000018384	-	61	41.228
ENSLACG00000008643	-	92	33.962	ENSLACG00000002471	-	53	33.962
ENSLACG00000008643	-	91	70.701	ENSLACG00000014474	-	60	70.701
ENSLACG00000008643	-	92	44.304	ENSLACG00000000876	-	71	44.304
ENSLACG00000008643	-	98	33.721	ENSLACG00000010019	-	71	33.721