EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000009393 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 684 bases
Position: chrJH128459.1:417197-417880
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000010664	Transposase_22	PF02994.14	6.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000010743	-	666	-	ENSLACP00000010664	222 (aa)	-	H3ALZ3

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000009393's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000009393's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000009393	-	99	75.771	ENSLACG00000011580	-	96	75.771
ENSLACG00000009393	-	94	36.771	ENSLACG00000013987	-	82	36.652
ENSLACG00000009393	-	97	42.105	ENSLACG00000010346	-	77	42.105
ENSLACG00000009393	-	92	35.470	ENSLACG00000012357	-	97	35.470
ENSLACG00000009393	-	91	36.161	ENSLACG00000010859	-	85	35.065
ENSLACG00000009393	-	71	39.623	ENSLACG00000008643	-	94	39.623
ENSLACG00000009393	-	94	38.961	ENSLACG00000001559	-	77	38.961
ENSLACG00000009393	-	94	36.245	ENSLACG00000001077	-	93	36.245
ENSLACG00000009393	-	98	37.391	ENSLACG00000006865	-	96	37.118
ENSLACG00000009393	-	88	42.718	ENSLACG00000008859	-	81	42.718
ENSLACG00000009393	-	87	42.233	ENSLACG00000003451	-	91	42.233
ENSLACG00000009393	-	95	72.300	ENSLACG00000000848	-	90	72.300
ENSLACG00000009393	-	95	39.394	ENSLACG00000003957	-	80	39.394
ENSLACG00000009393	-	97	41.048	ENSLACG00000006473	-	89	41.048
ENSLACG00000009393	-	91	39.286	ENSLACG00000011552	-	83	39.286
ENSLACG00000009393	-	95	33.188	ENSLACG00000006813	-	87	33.188
ENSLACG00000009393	-	97	40.175	ENSLACG00000010900	-	86	40.175
ENSLACG00000009393	-	94	37.229	ENSLACG00000003217	-	83	37.229
ENSLACG00000009393	-	86	32.057	ENSLACG00000012896	-	77	32.057
ENSLACG00000009393	-	96	44.444	ENSLACG00000011150	-	82	44.444
ENSLACG00000009393	-	81	37.173	ENSLACG00000000465	-	77	37.173
ENSLACG00000009393	-	95	37.391	ENSLACG00000000668	-	76	37.391
ENSLACG00000009393	-	70	40.491	ENSLACG00000000369	-	57	40.491
ENSLACG00000009393	-	95	36.522	ENSLACG00000016396	-	81	36.522
ENSLACG00000009393	-	92	38.571	ENSLACG00000000876	-	91	38.571
ENSLACG00000009393	-	73	41.477	ENSLACG00000007342	-	86	41.477
ENSLACG00000009393	-	96	36.250	ENSLACG00000011390	-	93	36.250
ENSLACG00000009393	-	95	77.982	ENSLACG00000017727	-	96	77.982
ENSLACG00000009393	-	94	34.703	ENSLACG00000002451	-	79	34.703
ENSLACG00000009393	-	90	32.547	ENSLACG00000017411	-	97	32.547
ENSLACG00000009393	-	99	67.699	ENSLACG00000005009	-	91	67.699
ENSLACG00000009393	-	93	41.284	ENSLACG00000010092	-	96	39.912
ENSLACG00000009393	-	86	39.303	ENSLACG00000009806	-	73	39.303
ENSLACG00000009393	-	95	39.269	ENSLACG00000006110	-	96	39.269
ENSLACG00000009393	-	85	39.196	ENSLACG00000002135	-	89	39.196
ENSLACG00000009393	-	94	66.512	ENSLACG00000010019	-	90	66.512
ENSLACG00000009393	-	84	32.995	ENSLACG00000013090	-	93	32.995
ENSLACG00000009393	-	82	42.932	ENSLACG00000016955	-	74	42.932
ENSLACG00000009393	-	71	40.000	ENSLACG00000000907	-	78	40.000
ENSLACG00000009393	-	72	34.857	ENSLACG00000000903	-	76	34.857
ENSLACG00000009393	-	94	35.841	ENSLACG00000005344	-	81	35.841
ENSLACG00000009393	-	91	41.315	ENSLACG00000012198	-	88	41.315
ENSLACG00000009393	-	92	40.367	ENSLACG00000010144	-	78	41.096
ENSLACG00000009393	-	97	37.387	ENSLACG00000014493	-	76	37.387
ENSLACG00000009393	-	92	74.762	ENSLACG00000002189	-	91	74.762
ENSLACG00000009393	-	95	38.696	ENSLACG00000006210	-	89	38.696
ENSLACG00000009393	-	94	37.069	ENSLACG00000013472	-	89	37.069
ENSLACG00000009393	-	93	36.818	ENSLACG00000000643	-	88	36.818
ENSLACG00000009393	-	85	37.681	ENSLACG00000007340	-	88	37.681
ENSLACG00000009393	-	88	39.901	ENSLACG00000001384	-	100	39.901
ENSLACG00000009393	-	85	42.714	ENSLACG00000010705	-	82	42.714
ENSLACG00000009393	-	95	77.315	ENSLACG00000000077	-	83	78.241
ENSLACG00000009393	-	95	34.052	ENSLACG00000000534	-	86	34.052
ENSLACG00000009393	-	93	36.481	ENSLACG00000012229	-	94	36.481
ENSLACG00000009393	-	91	38.462	ENSLACG00000006820	-	82	38.462
ENSLACG00000009393	-	97	35.398	ENSLACG00000000673	-	87	35.398
ENSLACG00000009393	-	73	32.738	ENSLACG00000022180	-	68	32.738
ENSLACG00000009393	-	97	40.351	ENSLACG00000002471	-	77	40.351
ENSLACG00000009393	-	67	39.216	ENSLACG00000010633	-	88	38.710
ENSLACG00000009393	-	83	36.453	ENSLACG00000014732	-	89	37.931
ENSLACG00000009393	-	66	41.176	ENSLACG00000005368	-	72	41.176
ENSLACG00000009393	-	74	41.379	ENSLACG00000002051	-	84	37.931
ENSLACG00000009393	-	80	40.000	ENSLACG00000010165	-	74	40.000
ENSLACG00000009393	-	93	36.697	ENSLACG00000014474	-	82	36.697
ENSLACG00000009393	-	89	31.373	ENSLACG00000013182	-	93	31.373
ENSLACG00000009393	-	79	39.344	ENSLACG00000010080	-	78	39.344
ENSLACG00000009393	-	73	34.270	ENSLACG00000000425	-	89	34.270
ENSLACG00000009393	-	99	75.664	ENSLACG00000011265	-	92	75.664
ENSLACG00000009393	-	88	40.976	ENSLACG00000004272	-	97	40.976
ENSLACG00000009393	-	82	38.660	ENSLACG00000001055	-	85	38.660
ENSLACG00000009393	-	91	40.758	ENSLACG00000014189	-	72	40.758
ENSLACG00000009393	-	95	36.957	ENSLACG00000014952	-	77	36.957
ENSLACG00000009393	-	85	36.058	ENSLACG00000014769	-	96	36.816
ENSLACG00000009393	-	95	38.528	ENSLACG00000004508	-	86	38.528
ENSLACG00000009393	-	96	69.545	ENSLACG00000003145	-	98	69.545
ENSLACG00000009393	-	78	66.474	ENSLACG00000018384	-	90	66.474
ENSLACG00000009393	-	87	40.488	ENSLACG00000016517	-	96	40.488
ENSLACG00000009393	-	72	42.771	ENSLACG00000007535	-	96	42.771
ENSLACG00000009393	-	94	36.986	ENSLACG00000005266	-	76	36.986
ENSLACG00000009393	-	94	34.703	ENSLACG00000009013	-	64	35.455
ENSLACG00000009393	-	72	36.810	ENSLACG00000002891	-	74	36.810
ENSLACG00000009393	-	96	65.000	ENSLACG00000010569	-	90	65.000
ENSLACG00000009393	-	88	37.561	ENSLACG00000001298	-	87	37.561
ENSLACG00000009393	-	75	39.429	ENSLACG00000001295	-	72	39.429
ENSLACG00000009393	-	87	40.000	ENSLACG00000013072	-	84	40.000
ENSLACG00000009393	-	93	43.318	ENSLACG00000007821	-	73	43.318
ENSLACG00000009393	-	88	40.291	ENSLACG00000002651	-	84	40.291

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000009393	-	70	30.061	ENSAPEG00000008945	-	53	30.061	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009393	-	91	31.527	ENSAPEG00000002130	-	62	31.527	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009393	-	91	32.057	ENSAPEG00000013155	-	63	32.057	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009393	-	88	35.266	ENSAPEG00000022657	-	57	35.266	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009393	-	70	30.061	ENSAPEG00000023573	-	53	30.061	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009393	-	89	31.481	ENSCVAG00000003346	-	61	31.481	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000009393	-	96	34.978	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	80	34.978	Danio_rerio
ENSLACG00000009393	-	100	32.068	ENSFHEG00000006296	-	70	32.068	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000009393	-	74	31.325	ENSKMAG00000012954	-	50	31.325	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000009393	-	93	33.796	ENSLBEG00000017145	-	65	33.796	Labrus_bergylta
ENSLACG00000009393	-	76	31.609	ENSMZEG00005024824	-	54	31.609	Maylandia_zebra
ENSLACG00000009393	-	94	31.982	ENSMZEG00005020773	-	73	31.982	Maylandia_zebra
ENSLACG00000009393	-	70	35.366	ENSONIG00000021329	-	71	35.366	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000009393	-	97	32.051	ENSONIG00000020618	-	93	32.051	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000009393	-	85	33.668	ENSORLG00000020512	-	65	33.668	Oryzias_latipes
ENSLACG00000009393	-	91	31.674	ENSOMEG00000019152	-	82	31.674	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000009393	-	93	32.877	ENSPKIG00000009100	-	65	32.877	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000009393	-	84	41.969	ENSPKIG00000001458	-	75	41.969	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000009393	-	66	38.065	ENSPMGG00000001874	-	53	38.065	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000009393	-	90	36.239	ENSPFOG00000020560	-	81	36.239	Poecilia_formosa
ENSLACG00000009393	-	93	30.973	ENSPFOG00000020665	-	80	30.973	Poecilia_formosa
ENSLACG00000009393	-	91	33.654	ENSPFOG00000020584	-	76	33.654	Poecilia_formosa
ENSLACG00000009393	-	71	32.317	ENSPLAG00000016026	-	59	32.317	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000009393	-	93	30.357	ENSPMEG00000014224	-	76	30.357	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000009393	-	88	31.308	ENSPMEG00000022872	-	66	31.308	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000009393	-	72	34.568	ENSPMEG00000021431	-	52	34.568	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000009393	-	91	41.346	ENSPNYG00000003325	-	67	41.346	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000009393	-	94	39.013	ENSPNAG00000017685	-	65	39.013	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000009393	-	95	40.553	ENSSLDG00000008663	-	84	40.553	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000009393	-	99	31.855	ENSXMAG00000023095	-	66	31.855	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000009393	-	90	33.333	ENSXMAG00000029285	-	72	33.333	Xiphophorus_maculatus