EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000009543 (Gene tree)
Gene ID: 102366734
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 41281 bases
Position: chrJH128254.1:429351-470631
Accession: 102366734
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000010841	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.2e-29	1	2
ENSLACP00000010841	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.2e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000010921	PAPOLG-201	2381	XM_006008072	ENSLACP00000010841	743 (aa)	-	H3AMH0

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000009543's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000009543's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	54.194	ENSLACG00000018136	PAPOLA	99	54.194

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.761	ENSG00000115421	PAPOLG	99	90.558	Homo_sapiens
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.050	ENSAPOG00000004798	papolg	99	66.184	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.565	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	70.565	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.661	ENSACIG00000010546	papolg	99	64.065	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	65.918	ENSAOCG00000010254	papolg	89	66.053	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.050	ENSAPEG00000006944	papolg	89	66.184	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.622	ENSATEG00000009007	papolg	95	68.863	Anabas_testudineus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	65.094	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.094	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000009543	PAPOLG	81	54.605	ENSACAG00000015048	-	100	54.605	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.761	ENSANAG00000024627	PAPOLG	99	70.761	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.844	ENSACLG00000015592	papolg	89	64.935	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	67.772	ENSAMXG00000004611	papolg	99	67.772	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.800	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	99	70.800	Bos_taurus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.895	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	70.895	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.375	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	97	66.502	Canis_familiaris
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.159	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	70.159	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.667	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	70.667	Capra_hircus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.400	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	99	70.400	Carlito_syrichta
ENSLACG00000009543	PAPOLG	51	70.866	ENSCAPG00000014901	-	100	70.866	Cavia_aperea
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.400	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	70.187	Cavia_porcellus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.761	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	70.761	Cebus_capucinus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	89	84.848	ENSCATG00000044395	PAPOLG	98	84.848	Cercocebus_atys
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.920	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	69.920	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.628	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	99	70.628	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	89	68.563	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.563	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000009543	PAPOLG	67	53.635	ENSCING00000024664	-	95	53.635	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	65	55.258	ENSCSAVG00000009085	-	97	55.258	Ciona_savignyi
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.628	ENSCANG00000038120	PAPOLG	99	70.628	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.892	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	69.892	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.892	ENSCGRG00000005552	-	100	69.892	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	65.400	ENSCSEG00000000771	papolg	98	65.536	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	61.568	ENSCVAG00000016602	papolg	89	78.226	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	67.507	ENSDARG00000012141	papolg	99	67.507	Danio_rerio
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	68.267	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	99	68.267	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	57	76.347	ENSDORG00000016228	Papolg	99	76.347	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	55.851	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	56.101	Echinops_telfairi
ENSLACG00000009543	PAPOLG	59	57.895	ENSEBUG00000004020	papolg	90	57.895	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000009543	PAPOLG	63	49.480	ENSEBUG00000005042	-	80	49.480	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.722	ENSEASG00005002038	PAPOLG	99	70.933	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.912	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	70.912	Equus_caballus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	61.924	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	98	61.924	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	68.825	ENSELUG00000014497	papolg	97	68.769	Esox_lucius
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.133	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	99	70.133	Felis_catus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	57.161	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	57.161	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.667	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	70.667	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	66	54.902	ENSFHEG00000019080	papolg	90	54.175	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	84	77.052	ENSGMOG00000018772	papolg	91	77.052	Gadus_morhua
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	63.008	ENSGALG00000007853	PAPOLG	98	63.008	Gallus_gallus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.109	ENSGAFG00000003263	papolg	99	63.241	Gambusia_affinis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	65.765	ENSGACG00000002718	papolg	99	65.765	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.360	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	99	70.360	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.844	ENSHBUG00000004882	papolg	89	65.234	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.375	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	70.375	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.400	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	70.400	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	64.825	ENSHCOG00000006782	papolg	87	64.825	Hippocampus_comes
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	67.188	ENSIPUG00000021642	papolg	100	67.947	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	71.067	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	71.067	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	57	76.112	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	76.112	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	64.550	ENSKMAG00000016439	papolg	96	64.550	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	62.692	ENSLBEG00000023218	papolg	96	63.427	Labrus_bergylta
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.271	ENSLOCG00000016130	papolg	99	69.271	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.814	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	75.644	Loxodonta_africana
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.683	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	99	70.895	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.683	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	99	70.895	Macaca_mulatta
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	62.766	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	99	62.766	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.628	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	99	70.628	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.711	ENSMAMG00000010667	papolg	99	64.305	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.844	ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.214	Maylandia_zebra
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	62.162	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	98	62.162	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.161	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	70.161	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.267	ENSMICG00000010042	PAPOLG	99	70.267	Microcebus_murinus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.133	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	70.133	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	65.691	ENSMMOG00000008020	papolg	99	65.824	Mola_mola
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	71.583	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	71.583	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.088	ENSMALG00000007012	papolg	88	66.312	Monopterus_albus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.267	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	77.176	Mus_caroli
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.867	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	77.176	Mus_musculus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.267	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.296	Mus_pahari
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.733	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	77.176	Mus_spretus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.415	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	70.415	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.799	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	69.799	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.867	ENSNGAG00000001120	Papolg	99	69.867	Nannospalax_galili
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	60.927	ENSNBRG00000011943	papolg	99	61.620	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000009543	PAPOLG	57	76.112	ENSNLEG00000009507	-	99	76.112	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000009543	PAPOLG	79	69.863	ENSMEUG00000013605	-	84	69.863	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.400	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	99	70.400	Ochotona_princeps
ENSLACG00000009543	PAPOLG	57	74.588	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	74.588	Octodon_degus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	62.613	ENSONIG00000002985	papolg	99	62.727	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	72.005	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	72.005	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	71.067	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	99	71.067	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.048	ENSORLG00000001577	papolg	96	64.058	Oryzias_latipes
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.048	ENSORLG00020002482	papolg	96	64.314	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.782	ENSORLG00015008836	papolg	96	63.793	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	65.113	ENSOMEG00000001406	papolg	96	65.073	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000009543	PAPOLG	58	62.929	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	99	62.929	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.455	ENSOARG00000001563	PAPOLG	90	70.455	Ovis_aries
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.761	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	99	70.761	Pan_paniscus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.133	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	99	70.133	Panthera_pardus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.920	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	69.920	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.761	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	99	70.761	Pan_troglodytes
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	66.844	ENSPANG00000014543	PAPOLG	99	66.844	Papio_anubis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	66.401	ENSPKIG00000003313	papolg	99	66.401	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000009543	PAPOLG	94	67.137	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	67.137	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	69.283	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	69.283	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.430	ENSPEMG00000008960	-	100	70.430	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000009543	PAPOLG	66	55.556	ENSPMAG00000004864	-	98	55.556	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	47.409	ENSPMAG00000002961	papolg	99	47.409	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.878	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	70.878	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.289	ENSPFOG00000012909	papolg	99	63.804	Poecilia_formosa
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.505	ENSPLAG00000018445	papolg	99	63.757	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.720	ENSPMEG00000003961	papolg	99	63.720	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	62.861	ENSPREG00000010358	papolg	99	62.861	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.494	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	70.494	Pongo_abelii
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	61.580	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	61.580	Procavia_capensis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	62.800	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	99	62.800	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000009543	PAPOLG	88	74.555	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	74.555	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	65.060	ENSPNYG00000006729	papolg	99	65.060	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	67.643	ENSPNAG00000015521	papolg	99	67.729	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.640	ENSRNOG00000006261	Papolg	99	69.640	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	65.287	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	99	65.287	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.628	ENSRROG00000035954	PAPOLG	99	70.628	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.895	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	70.895	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	94	71.186	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.186	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	65.119	ENSSFOG00015002383	papolg	99	65.119	Scleropages_formosus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	58.768	ENSSFOG00015011874	papolg	99	58.768	Scleropages_formosus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	86	75.090	ENSSMAG00000015598	papolg	96	63.449	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.218	ENSSDUG00000000912	papolg	99	63.490	Seriola_dumerili
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.176	ENSSLDG00000001217	papolg	96	66.176	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	68.157	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	98	68.157	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.883	ENSSPAG00000009004	papolg	99	65.104	Stegastes_partitus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	71.067	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	71.067	Sus_scrofa
ENSLACG00000009543	PAPOLG	72	65.746	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	65.746	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	64.722	ENSTRUG00000006410	papolg	98	64.722	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	59.973	ENSTNIG00000017106	papolg	98	59.973	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.343	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	64.343	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	66.400	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	99	66.400	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.755	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.755	Ursus_americanus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.755	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	70.755	Ursus_maritimus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.839	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.973	Vicugna_pacos
ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.241	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.455	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	68.464	ENSXETG00000002208	papolg	98	68.464	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000009543	PAPOLG	66	77.576	ENSXCOG00000006611	papolg	73	77.576	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000009543	PAPOLG	73	75.000	ENSXMAG00000007383	papolg	91	75.000	Xiphophorus_maculatus