EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000009612 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: NKRF
Alias: ITBA4|NRF
Full Name: NFKB repressing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8738 bases
Position: chrJH127537.1:435487-444224
Accession: 102345959
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000010924	R3H	PF01424.22	1.7e-10	1	1
ENSLACP00000010924	G-patch	PF01585.23	8.6e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000011005	NKRF-201	2567	XM_006003867	ENSLACP00000010924	804 (aa)	XP_006003929	H3AMQ3

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000009612's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000009612's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.200	ENSG00000186416	NKRF	99	51.210	Homo_sapiens
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.015	ENSAPOG00000012969	nkrf	98	47.416	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	50.405	ENSAMEG00000000152	NKRF	99	50.405	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000009612	NKRF	91	45.967	ENSACIG00000013701	nkrf	98	46.598	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000009612	NKRF	91	47.119	ENSAOCG00000011327	nkrf	97	48.333	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.144	ENSAPEG00000005444	nkrf	98	47.927	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009612	NKRF	88	47.347	ENSATEG00000018834	nkrf	98	46.847	Anabas_testudineus
ENSLACG00000009612	NKRF	91	50.000	ENSAPLG00000012272	NKRF	99	50.000	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000009612	NKRF	91	48.026	ENSACAG00000012140	NKRF	99	48.100	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.200	ENSANAG00000025604	NKRF	98	51.200	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000009612	NKRF	85	44.195	ENSACLG00000001752	nkrf	91	44.882	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000009612	NKRF	96	45.261	ENSAMXG00000000131	nkrf	98	44.954	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.229	ENSBTAG00000045744	NKRF	99	51.340	Bos_taurus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	53.061	ENSCJAG00000005088	NKRF	95	51.561	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	51.960	ENSCAFG00000018411	NKRF	95	51.432	Canis_familiaris
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.957	ENSCAFG00020004162	NKRF	99	51.072	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.351	ENSCHIG00000008436	NKRF	99	51.351	Capra_hircus
ENSLACG00000009612	NKRF	91	52.368	ENSTSYG00000000890	NKRF	99	52.387	Carlito_syrichta
ENSLACG00000009612	NKRF	72	81.481	ENSCAPG00000011069	NKRF	89	81.481	Cavia_aperea
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.344	ENSCPOG00000011912	NKRF	99	51.206	Cavia_porcellus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.344	ENSCCAG00000021029	NKRF	99	51.344	Cebus_capucinus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.218	ENSCATG00000031763	NKRF	98	51.333	Cercocebus_atys
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.882	ENSCLAG00000002890	NKRF	99	51.609	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.218	ENSCSAG00000018353	NKRF	95	51.685	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000009612	NKRF	97	51.314	ENSCPBG00000020704	NKRF	95	51.875	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.333	ENSCANG00000028878	NKRF	98	51.333	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.510	ENSCGRG00001001105	Nkrf	95	51.965	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.776	ENSCGRG00000011374	Nkrf	99	51.639	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000009612	NKRF	72	49.431	ENSCSEG00000002024	nkrf	98	45.006	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000009612	NKRF	86	47.207	ENSCVAG00000004926	nkrf	96	47.207	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	48.180	ENSDARG00000100536	nkrf	97	48.214	Danio_rerio
ENSLACG00000009612	NKRF	96	51.707	ENSDNOG00000031378	NKRF	95	51.183	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.978	ENSDORG00000024123	Nkrf	99	51.837	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000009612	NKRF	56	36.100	ENSEBUG00000012286	NKRF	69	36.179	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.357	ENSEASG00005012904	NKRF	95	51.819	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.357	ENSECAG00000022495	NKRF	95	51.819	Equus_caballus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.081	ENSEEUG00000007576	NKRF	86	60.606	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	47.637	ENSELUG00000020577	nkrf	97	47.201	Esox_lucius
ENSLACG00000009612	NKRF	96	51.960	ENSFCAG00000008742	NKRF	98	51.064	Felis_catus
ENSLACG00000009612	NKRF	81	60.612	ENSFALG00000001584	NKRF	88	59.626	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000009612	NKRF	97	52.971	ENSFDAG00000014857	NKRF	99	52.469	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000009612	NKRF	88	45.478	ENSFHEG00000017996	nkrf	98	45.490	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	47.703	ENSGMOG00000001688	nkrf	98	47.703	Gadus_morhua
ENSLACG00000009612	NKRF	97	51.311	ENSGALG00000008645	NKRF	98	51.311	Gallus_gallus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	45.526	ENSGAFG00000000966	nkrf	98	45.921	Gambusia_affinis
ENSLACG00000009612	NKRF	90	46.980	ENSGACG00000017457	nkrf	97	47.383	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.197	ENSGAGG00000001146	NKRF	99	51.793	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.200	ENSGGOG00000006862	NKRF	99	51.210	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000009612	NKRF	88	59.917	ENSHBUG00000017543	nkrf	98	44.937	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000009612	NKRF	90	52.452	ENSHGLG00000013935	NKRF	99	52.316	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000009612	NKRF	90	52.452	ENSHGLG00100004379	NKRF	99	52.316	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000009612	NKRF	88	44.928	ENSHCOG00000017066	nkrf	98	45.153	Hippocampus_comes
ENSLACG00000009612	NKRF	96	49.274	ENSIPUG00000022475	nkrf	97	49.516	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.282	ENSSTOG00000020483	NKRF	99	51.282	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.952	ENSJJAG00000020550	Nkrf	99	51.070	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.736	ENSKMAG00000020188	nkrf	98	46.997	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	44.305	ENSLBEG00000028681	nkrf	97	45.522	Labrus_bergylta
ENSLACG00000009612	NKRF	97	51.665	ENSLOCG00000015232	nkrf	96	51.806	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.072	ENSLAFG00000027138	NKRF	99	51.072	Loxodonta_africana
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.333	ENSMFAG00000031196	NKRF	99	51.344	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.091	ENSMMUG00000022670	NKRF	95	51.561	Macaca_mulatta
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.218	ENSMNEG00000027985	NKRF	98	51.333	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.333	ENSMLEG00000041865	NKRF	99	51.344	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	61.728	ENSMAMG00000019975	nkrf	98	47.517	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000009612	NKRF	91	50.267	ENSMGAG00000007788	NKRF	99	50.267	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.153	ENSMAUG00000021303	Nkrf	99	51.503	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.345	ENSMICG00000004220	NKRF	98	51.467	Microcebus_murinus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	50.611	ENSMOCG00000000942	Nkrf	99	50.746	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000009612	NKRF	88	45.074	ENSMMOG00000004175	nkrf	98	45.749	Mola_mola
ENSLACG00000009612	NKRF	90	50.273	ENSMODG00000024032	-	99	50.273	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000009612	NKRF	92	46.667	ENSMALG00000007869	NF-kb	98	47.922	Monopterus_albus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	52.156	MGP_CAROLIEiJ_G0032995	Nkrf	99	51.682	Mus_caroli
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.887	ENSMUSG00000044149	Nkrf	99	51.413	Mus_musculus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	52.011	MGP_PahariEiJ_G0031539	Nkrf	99	51.872	Mus_pahari
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.482	MGP_SPRETEiJ_G0034148	Nkrf	99	51.560	Mus_spretus
ENSLACG00000009612	NKRF	97	51.432	ENSMPUG00000001548	NKRF	95	51.432	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.817	ENSMLUG00000005621	NKRF	99	51.817	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.639	ENSNGAG00000023851	Nkrf	99	51.639	Nannospalax_galili
ENSLACG00000009612	NKRF	89	45.882	ENSNBRG00000011707	nkrf	97	46.554	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.200	ENSNLEG00000034548	NKRF	98	51.200	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000009612	NKRF	90	50.956	ENSMEUG00000003028	NKRF	99	50.754	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000009612	NKRF	85	52.023	ENSOPRG00000016532	-	99	52.023	Ochotona_princeps
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.478	ENSODEG00000003502	NKRF	99	51.340	Octodon_degus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	46.345	ENSONIG00000002526	nkrf	98	47.013	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000009612	NKRF	70	49.828	ENSOANG00000013932	-	93	49.828	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	50.884	ENSOANG00000002598	-	99	50.884	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000009612	NKRF	53	55.828	ENSOANG00000001806	-	96	55.828	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.436	ENSOCUG00000016741	NKRF	99	51.344	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	47.059	ENSORLG00000022867	nkrf	98	47.273	Oryzias_latipes
ENSLACG00000009612	NKRF	88	47.190	ENSORLG00020003902	nkrf	98	47.403	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.928	ENSORLG00015013035	nkrf	98	47.143	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000009612	NKRF	88	47.347	ENSOMEG00000014617	nkrf	98	47.917	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000009612	NKRF	96	51.833	ENSOGAG00000009703	NKRF	99	51.308	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.216	ENSOARG00000016167	NKRF	99	51.216	Ovis_aries
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.200	ENSPPAG00000002315	NKRF	99	51.210	Pan_paniscus
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.817	ENSPPRG00000023645	NKRF	99	51.832	Panthera_pardus
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.817	ENSPTIG00000015381	NKRF	99	51.832	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.200	ENSPTRG00000022226	NKRF	99	51.210	Pan_troglodytes
ENSLACG00000009612	NKRF	92	51.380	ENSPANG00000010949	NKRF	98	51.333	Papio_anubis
ENSLACG00000009612	NKRF	89	46.518	ENSPKIG00000019002	nkrf	98	46.518	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000009612	NKRF	90	40.836	ENSPKIG00000013989	NKRF	97	40.988	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000009612	NKRF	97	50.868	ENSPSIG00000006177	NKRF	98	51.330	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000009612	NKRF	87	45.794	ENSPMGG00000012086	nkrf	97	45.794	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.093	ENSPLAG00000019829	nkrf	98	46.896	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.471	ENSPMEG00000023417	nkrf	98	46.471	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.042	ENSPREG00000012340	nkrf	98	46.684	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000009612	NKRF	96	51.965	ENSPPYG00000020672	NKRF	95	51.436	Pongo_abelii
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.678	ENSPCOG00000026266	NKRF	99	51.210	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000009612	NKRF	88	51.233	ENSPVAG00000003266	NKRF	100	51.233	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	59.917	ENSPNYG00000009655	nkrf	98	44.994	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000009612	NKRF	96	48.984	ENSPNAG00000018967	nkrf	96	49.821	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.398	ENSRBIG00000033103	NKRF	99	51.398	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000009612	NKRF	91	51.398	ENSRROG00000034488	NKRF	99	51.398	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.344	ENSSBOG00000021175	NKRF	99	51.344	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000009612	NKRF	62	54.980	ENSSHAG00000005164	-	99	54.980	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.023	ENSSHAG00000006903	-	99	51.023	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000009612	NKRF	90	48.168	ENSSHAG00000006028	-	99	48.168	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000009612	NKRF	90	47.334	ENSSFOG00015005460	nkrf	85	47.786	Scleropages_formosus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	48.030	ENSSFOG00015010898	NKRF	96	48.030	Scleropages_formosus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	45.607	ENSSMAG00000012780	nkrf	98	46.461	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.341	ENSSDUG00000005559	nkrf	98	46.983	Seriola_dumerili
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.401	ENSSLDG00000003347	nkrf	98	47.044	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000009612	NKRF	96	48.995	ENSSPUG00000013178	NKRF	98	49.129	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	45.849	ENSSPAG00000010145	nkrf	98	46.863	Stegastes_partitus
ENSLACG00000009612	NKRF	96	52.086	ENSSSCG00000012620	NKRF	95	51.557	Sus_scrofa
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.163	ENSTGUG00000003356	-	99	51.163	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000009612	NKRF	64	61.822	ENSTGUG00000003354	-	98	60.795	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000009612	NKRF	88	46.499	ENSTRUG00000023782	nkrf	98	46.063	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000009612	NKRF	88	45.927	ENSTNIG00000015760	nkrf	98	46.067	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000009612	NKRF	82	66.667	ENSTBEG00000017226	NKRF	90	66.667	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000009612	NKRF	90	51.918	ENSTTRG00000013108	NKRF	99	51.918	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	50.804	ENSUAMG00000028368	NKRF	99	50.804	Ursus_americanus
ENSLACG00000009612	NKRF	90	50.804	ENSUMAG00000002134	NKRF	99	50.804	Ursus_maritimus
ENSLACG00000009612	NKRF	74	65.025	ENSVPAG00000000648	NKRF	83	65.025	Vicugna_pacos
ENSLACG00000009612	NKRF	90	52.092	ENSVVUG00000011528	NKRF	99	51.206	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000009612	NKRF	98	46.875	ENSXETG00000007438	nkrf	98	46.625	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000009612	NKRF	91	45.103	ENSXCOG00000016716	nkrf	98	45.513	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000009612	NKRF	88	45.612	ENSXMAG00000013716	nkrf	98	46.032	Xiphophorus_maculatus