EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000009806 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1682 bases
Position: chrJH127775.1:450724-452405
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000011144	Transposase_22	PF02994.14	1.7e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000011227	-	813	-	ENSLACP00000011144	271 (aa)	-	H3ANC3

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000009806's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000009806's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000009806	-	78	35.047	ENSLACG00000010165	-	82	35.047
ENSLACG00000009806	-	76	35.545	ENSLACG00000002189	-	92	35.545
ENSLACG00000009806	-	79	31.193	ENSLACG00000001559	-	72	31.193
ENSLACG00000009806	-	58	38.272	ENSLACG00000011552	-	61	38.272
ENSLACG00000009806	-	68	32.804	ENSLACG00000004508	-	69	33.155
ENSLACG00000009806	-	65	38.764	ENSLACG00000018384	-	92	38.764
ENSLACG00000009806	-	71	32.653	ENSLACG00000013072	-	80	32.653
ENSLACG00000009806	-	78	33.486	ENSLACG00000014189	-	75	33.486
ENSLACG00000009806	-	59	35.882	ENSLACG00000002891	-	77	35.882
ENSLACG00000009806	-	58	34.568	ENSLACG00000007342	-	79	34.568
ENSLACG00000009806	-	67	32.258	ENSLACG00000001298	-	81	32.258
ENSLACG00000009806	-	65	36.264	ENSLACG00000016955	-	70	36.264
ENSLACG00000009806	-	76	32.569	ENSLACG00000001077	-	89	32.569
ENSLACG00000009806	-	76	33.333	ENSLACG00000013472	-	86	33.333
ENSLACG00000009806	-	73	36.232	ENSLACG00000001384	-	98	34.783
ENSLACG00000009806	-	66	31.522	ENSLACG00000000465	-	73	31.522
ENSLACG00000009806	-	67	34.783	ENSLACG00000016517	-	88	34.783
ENSLACG00000009806	-	66	32.258	ENSLACG00000011390	-	72	32.258
ENSLACG00000009806	-	79	31.222	ENSLACG00000002651	-	91	31.222
ENSLACG00000009806	-	78	32.870	ENSLACG00000010569	-	86	32.870
ENSLACG00000009806	-	72	37.374	ENSLACG00000011265	-	79	37.374
ENSLACG00000009806	-	78	37.383	ENSLACG00000011580	-	89	37.383
ENSLACG00000009806	-	73	39.303	ENSLACG00000009393	-	86	39.303
ENSLACG00000009806	-	83	35.965	ENSLACG00000011150	-	83	35.965
ENSLACG00000009806	-	83	36.564	ENSLACG00000017727	-	97	36.564
ENSLACG00000009806	-	69	32.620	ENSLACG00000013090	-	90	32.620
ENSLACG00000009806	-	73	32.843	ENSLACG00000003451	-	89	32.843
ENSLACG00000009806	-	83	31.330	ENSLACG00000006865	-	95	31.330
ENSLACG00000009806	-	78	30.137	ENSLACG00000000668	-	70	30.137
ENSLACG00000009806	-	70	30.457	ENSLACG00000005344	-	71	30.457
ENSLACG00000009806	-	70	33.161	ENSLACG00000000907	-	88	33.161
ENSLACG00000009806	-	51	39.869	ENSLACG00000000903	-	67	39.869
ENSLACG00000009806	-	78	33.333	ENSLACG00000010346	-	73	33.333
ENSLACG00000009806	-	74	35.377	ENSLACG00000004272	-	98	35.377
ENSLACG00000009806	-	76	37.019	ENSLACG00000005266	-	72	37.019
ENSLACG00000009806	-	85	33.333	ENSLACG00000006473	-	88	33.898
ENSLACG00000009806	-	72	32.039	ENSLACG00000006210	-	81	32.039
ENSLACG00000009806	-	73	34.000	ENSLACG00000003145	-	88	34.000
ENSLACG00000009806	-	77	33.810	ENSLACG00000000876	-	89	33.810
ENSLACG00000009806	-	71	33.846	ENSLACG00000005368	-	92	33.846
ENSLACG00000009806	-	74	34.951	ENSLACG00000014769	-	98	36.667
ENSLACG00000009806	-	60	34.756	ENSLACG00000008643	-	96	34.756
ENSLACG00000009806	-	72	30.806	ENSLACG00000012229	-	84	30.806
ENSLACG00000009806	-	57	39.873	ENSLACG00000007535	-	91	39.873
ENSLACG00000009806	-	89	31.301	ENSLACG00000002471	-	82	31.301
ENSLACG00000009806	-	72	37.688	ENSLACG00000000848	-	81	37.688
ENSLACG00000009806	-	86	33.471	ENSLACG00000010900	-	91	33.471
ENSLACG00000009806	-	86	33.617	ENSLACG00000000643	-	90	33.617
ENSLACG00000009806	-	82	30.263	ENSLACG00000010080	-	98	30.263
ENSLACG00000009806	-	85	35.443	ENSLACG00000007821	-	79	35.443
ENSLACG00000009806	-	79	31.507	ENSLACG00000014493	-	72	31.507
ENSLACG00000009806	-	59	41.104	ENSLACG00000005009	-	70	41.104
ENSLACG00000009806	-	82	33.778	ENSLACG00000012357	-	94	33.778
ENSLACG00000009806	-	67	32.432	ENSLACG00000002135	-	89	30.500
ENSLACG00000009806	-	56	33.951	ENSLACG00000000425	-	81	33.951
ENSLACG00000009806	-	74	34.634	ENSLACG00000006813	-	79	34.634
ENSLACG00000009806	-	71	31.472	ENSLACG00000013987	-	73	31.472
ENSLACG00000009806	-	75	35.023	ENSLACG00000017411	-	98	35.023
ENSLACG00000009806	-	74	35.122	ENSLACG00000008859	-	80	35.122
ENSLACG00000009806	-	75	30.918	ENSLACG00000012198	-	86	30.918
ENSLACG00000009806	-	79	34.722	ENSLACG00000000077	-	82	34.722
ENSLACG00000009806	-	72	30.806	ENSLACG00000010859	-	77	30.806
ENSLACG00000009806	-	77	36.744	ENSLACG00000010144	-	78	36.744
ENSLACG00000009806	-	76	31.651	ENSLACG00000016396	-	77	31.651
ENSLACG00000009806	-	75	34.300	ENSLACG00000002451	-	75	34.300
ENSLACG00000009806	-	69	31.795	ENSLACG00000006820	-	72	31.795
ENSLACG00000009806	-	55	36.184	ENSLACG00000001295	-	64	36.184
ENSLACG00000009806	-	66	30.220	ENSLACG00000007340	-	77	30.220
ENSLACG00000009806	-	72	41.500	ENSLACG00000009013	-	69	38.819
ENSLACG00000009806	-	68	38.378	ENSLACG00000001055	-	81	38.378
ENSLACG00000009806	-	55	37.086	ENSLACG00000010633	-	99	34.483
ENSLACG00000009806	-	78	30.594	ENSLACG00000002051	-	79	31.390
ENSLACG00000009806	-	69	36.170	ENSLACG00000014474	-	72	36.170
ENSLACG00000009806	-	79	33.333	ENSLACG00000000369	-	76	33.333
ENSLACG00000009806	-	78	35.047	ENSLACG00000010019	-	88	35.047
ENSLACG00000009806	-	72	33.010	ENSLACG00000006110	-	93	33.010
ENSLACG00000009806	-	63	30.939	ENSLACG00000022180	-	72	30.939
ENSLACG00000009806	-	80	32.569	ENSLACG00000000673	-	84	32.569
ENSLACG00000009806	-	71	30.256	ENSLACG00000010705	-	77	30.256
ENSLACG00000009806	-	77	35.377	ENSLACG00000010092	-	96	33.766
ENSLACG00000009806	-	77	34.434	ENSLACG00000014732	-	91	34.783
ENSLACG00000009806	-	82	30.769	ENSLACG00000014952	-	78	30.769