EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000009913 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: FTSJ1
Alias: CDLIV|JM23|MRX44|MRX9|SPB1|TRM7|TRMT7
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17125 bases
Position: chrJH127263.1:458407-475531
Accession: 13254
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000011270	FtsJ	PF01728.19	2.9e-59	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000011354	FTSJ1-201	1157	-	ENSLACP00000011270	339 (aa)	-	H3ANP9

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000009913's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000009913's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000009913	FTSJ1	55	46.429	ENSLACG00000016579	MRM2	78	46.429

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSG00000068438	FTSJ1	77	84.848	Homo_sapiens
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	92.537	ENSAPOG00000018541	ftsj1	82	92.537	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSAMEG00000012735	FTSJ1	77	84.848	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	86.957	ENSACIG00000001541	ftsj1	82	95.161	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	79	87.671	ENSAOCG00000009380	ftsj1	82	87.671	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000009913	FTSJ1	79	87.671	ENSAPEG00000020434	ftsj1	82	87.671	Amphiprion_percula
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	95.238	ENSATEG00000008408	ftsj1	82	91.045	Anabas_testudineus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	67	83.871	ENSACAG00000016605	FTSJ1	75	83.871	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	80.303	ENSANAG00000035537	-	83	80.303	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSANAG00000030571	-	77	84.848	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	96.825	ENSACLG00000014226	ftsj1	80	96.825	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	91.045	ENSAMXG00000037663	ftsj1	80	91.045	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	83.333	ENSBTAG00000046593	-	83	83.333	Bos_taurus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSBTAG00000031829	FTSJ1	82	84.848	Bos_taurus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	77.778	WBGene00011281	R74.7	72	77.778	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCJAG00000002256	FTSJ1	77	84.848	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCAFG00000015339	FTSJ1	77	84.848	Canis_familiaris
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCAFG00020021351	FTSJ1	77	84.848	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000009913	FTSJ1	80	75.758	ENSCHIG00000021392	-	84	75.758	Capra_hircus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	77.273	ENSCHIG00000017370	-	78	77.273	Capra_hircus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCHIG00000000441	-	77	84.848	Capra_hircus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSTSYG00000029207	FTSJ1	77	84.848	Carlito_syrichta
ENSLACG00000009913	FTSJ1	58	87.302	ENSCAPG00000011705	FTSJ1	71	87.302	Cavia_aperea
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	83.824	ENSCPOG00000030576	FTSJ1	77	83.824	Cavia_porcellus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCCAG00000027731	FTSJ1	77	84.848	Cebus_capucinus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCATG00000013045	FTSJ1	77	84.848	Cercocebus_atys
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	83.824	ENSCLAG00000011582	FTSJ1	77	83.824	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCSAG00000013278	FTSJ1	77	84.848	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	80.882	ENSCING00000008473	-	80	80.882	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	86.364	ENSCSAVG00000010259	-	82	86.364	Ciona_savignyi
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSCANG00000033841	FTSJ1	77	84.848	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	84.848	ENSCGRG00001023654	Ftsj1	77	84.848	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	84.848	ENSCGRG00000007253	Ftsj1	76	84.848	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000009913	FTSJ1	84	84.507	ENSCSEG00000018843	ftsj1	78	84.507	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	95.238	ENSCVAG00000009618	ftsj1	81	95.238	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	93.651	ENSDARG00000057089	ftsj1	100	92.188	Danio_rerio
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	87.302	ENSDNOG00000047923	-	77	87.302	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	48.768	ENSDNOG00000044320	-	79	48.768	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	86.364	ENSDORG00000000074	Ftsj1	80	86.364	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	77.778	FBgn0038861	CG7009	77	77.778	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000009913	FTSJ1	73	77.778	FBgn0038471	CG5220	81	77.778	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000009913	FTSJ1	73	65.000	ENSETEG00000018343	-	75	65.000	Echinops_telfairi
ENSLACG00000009913	FTSJ1	63	64.516	ENSETEG00000014092	-	64	64.516	Echinops_telfairi
ENSLACG00000009913	FTSJ1	58	75.897	ENSEBUG00000005843	ftsj1	61	75.897	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSECAG00000019260	FTSJ1	77	84.848	Equus_caballus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	84.848	ENSEEUG00000001469	FTSJ1	86	84.848	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	93.651	ENSELUG00000011483	ftsj1	78	93.651	Esox_lucius
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSFCAG00000026453	FTSJ1	77	84.848	Felis_catus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSFDAG00000011250	FTSJ1	76	84.848	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	80	84.000	ENSFHEG00000008464	ftsj1	82	84.000	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	94.030	ENSGMOG00000004562	ftsj1	87	94.030	Gadus_morhua
ENSLACG00000009913	FTSJ1	52	84.181	ENSGAFG00000002036	ftsj1	77	84.181	Gambusia_affinis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	92.537	ENSGACG00000008843	ftsj1	80	92.537	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSGGOG00000028552	FTSJ1	77	84.848	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	96.825	ENSHBUG00000015883	ftsj1	80	96.825	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	83.824	ENSHGLG00000003132	FTSJ1	77	83.824	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	83.824	ENSHGLG00100014682	FTSJ1	77	83.824	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	93.651	ENSHCOG00000010145	ftsj1	79	93.651	Hippocampus_comes
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	91.045	ENSIPUG00000005052	FTSJ1	80	91.045	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSSTOG00000027717	FTSJ1	77	84.848	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	75	84.848	ENSJJAG00000011596	-	82	84.848	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSJJAG00000014517	-	77	84.848	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	91.045	ENSKMAG00000000645	ftsj1	81	91.045	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	84.000	ENSLBEG00000005293	ftsj1	73	84.000	Labrus_bergylta
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	95.238	ENSLOCG00000015688	ftsj1	76	95.238	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	73	85.938	ENSLAFG00000032618	FTSJ1	76	85.938	Loxodonta_africana
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSMFAG00000003467	FTSJ1	77	84.848	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSMMUG00000018894	FTSJ1	77	84.848	Macaca_mulatta
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSMNEG00000044348	FTSJ1	77	84.848	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSMLEG00000016789	FTSJ1	77	84.848	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	92.537	ENSMAMG00000022841	ftsj1	78	92.537	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	96.825	ENSMZEG00005022583	ftsj1	80	96.825	Maylandia_zebra
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	83.333	ENSMAUG00000015442	Ftsj1	77	83.333	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSMICG00000036228	-	85	84.848	Microcebus_murinus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	86.538	ENSMOCG00000020523	-	75	86.538	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000009913	FTSJ1	71	86.364	ENSMOCG00000000507	-	100	86.364	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	84.848	ENSMOCG00000021218	-	76	84.848	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	91.045	ENSMMOG00000018969	ftsj1	82	91.045	Mola_mola
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	88.060	ENSMODG00000011356	FTSJ1	85	88.060	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	88.060	ENSMALG00000014209	ftsj1	81	88.060	Monopterus_albus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	83.333	MGP_CAROLIEiJ_G0032918	Ftsj1	81	83.333	Mus_caroli
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	83.333	ENSMUSG00000031171	Ftsj1	81	83.333	Mus_musculus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	83.333	MGP_PahariEiJ_G0031467	Ftsj1	78	83.333	Mus_pahari
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	83.333	MGP_SPRETEiJ_G0034067	Ftsj1	81	83.333	Mus_spretus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSMPUG00000013493	FTSJ1	77	84.848	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000009913	FTSJ1	73	85.714	ENSMLUG00000003977	FTSJ1	74	85.714	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	77.941	ENSNGAG00000016847	-	77	77.941	Nannospalax_galili
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	83.582	ENSNGAG00000018629	-	77	83.582	Nannospalax_galili
ENSLACG00000009913	FTSJ1	75	96.825	ENSNBRG00000012481	ftsj1	80	96.825	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSNLEG00000007816	FTSJ1	76	84.848	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	83.824	ENSODEG00000009855	FTSJ1	77	83.824	Octodon_degus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	77	95.312	ENSONIG00000003966	ftsj1	82	95.312	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	66	82.759	ENSOANG00000013572	-	72	82.759	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	83.582	ENSOCUG00000023277	-	78	83.582	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	83.333	ENSOCUG00000008009	-	76	83.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	80.597	ENSOCUG00000024620	-	78	80.597	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	92.537	ENSORLG00000028355	ftsj1	83	92.537	Oryzias_latipes
ENSLACG00000009913	FTSJ1	84	91.045	ENSORLG00020007897	ftsj1	83	91.045	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	92.537	ENSOMEG00000018497	ftsj1	75	92.537	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	70.370	ENSOGAG00000016174	-	76	70.370	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	83.333	ENSOGAG00000032641	-	77	83.333	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSOARG00000012432	-	77	84.848	Ovis_aries
ENSLACG00000009913	FTSJ1	75	71.875	ENSOARG00000012099	-	82	71.875	Ovis_aries
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSPPAG00000028540	FTSJ1	77	84.848	Pan_paniscus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSPPRG00000000249	FTSJ1	77	84.848	Panthera_pardus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSPTIG00000017680	FTSJ1	77	84.848	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSPTRG00000049433	FTSJ1	77	84.848	Pan_troglodytes
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSPANG00000010102	FTSJ1	77	84.848	Papio_anubis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	96.825	ENSPKIG00000019318	ftsj1	75	96.491	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000009913	FTSJ1	59	90.769	ENSPSIG00000007020	FTSJ1	77	90.769	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	80	87.302	ENSPEMG00000013262	-	84	85.938	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	84.848	ENSPEMG00000015698	-	77	84.848	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	89.552	ENSPMAG00000006943	FTSJ1	87	89.552	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	86.765	ENSPCIG00000007236	FTSJ1	81	86.765	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	92.063	ENSPFOG00000017003	ftsj1	83	92.063	Poecilia_formosa
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	92.063	ENSPLAG00000016190	ftsj1	90	92.063	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	92.063	ENSPMEG00000021719	ftsj1	81	92.063	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000009913	FTSJ1	84	88.060	ENSPREG00000016616	ftsj1	82	88.060	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	85.075	ENSPCOG00000018822	-	76	85.075	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSPCOG00000022716	-	81	84.848	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	96.825	ENSPNYG00000011144	ftsj1	80	96.825	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	91.045	ENSPNAG00000016330	ftsj1	80	91.045	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000009913	FTSJ1	81	83.333	ENSRNOG00000004776	Ftsj1	77	83.333	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSRBIG00000027511	FTSJ1	77	84.848	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSRROG00000029757	FTSJ1	77	84.848	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	68.571	YBR061C	TRM7	85	68.571	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSSBOG00000028146	FTSJ1	76	84.848	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	80	90.625	ENSSHAG00000012607	FTSJ1	82	90.625	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	89.706	ENSSFOG00015006275	ftsj1	75	93.220	Scleropages_formosus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	78	92.537	ENSSMAG00000001754	ftsj1	82	92.537	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	76	84.848	ENSSDUG00000015226	ftsj1	81	84.848	Seriola_dumerili
ENSLACG00000009913	FTSJ1	74	93.846	ENSSLDG00000019859	ftsj1	80	93.846	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	79	87.500	ENSSARG00000007246	-	97	87.500	Sorex_araneus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSSARG00000007091	-	80	84.848	Sorex_araneus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	79	87.671	ENSSPAG00000022047	ftsj1	82	87.671	Stegastes_partitus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSSSCG00000025599	FTSJ1	77	84.848	Sus_scrofa
ENSLACG00000009913	FTSJ1	77	92.537	ENSTRUG00000016142	ftsj1	81	92.537	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000009913	FTSJ1	77	89.552	ENSTNIG00000010402	ftsj1	83	89.552	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	83.333	ENSTTRG00000009027	FTSJ1	77	83.333	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSUAMG00000013296	FTSJ1	75	84.848	Ursus_americanus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSUMAG00000007966	FTSJ1	76	84.848	Ursus_maritimus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	ENSVVUG00000017640	FTSJ1	77	84.848	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000009913	FTSJ1	83	92.063	ENSXCOG00000003344	ftsj1	77	92.063	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000009913	FTSJ1	84	88.060	ENSXMAG00000009372	ftsj1	83	88.060	Xiphophorus_maculatus