EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000010144 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1478 bases
Position: chrJH128328.1:476743-478220
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000011529	Transposase_22	PF02994.14	7.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000011617	-	819	-	ENSLACP00000011529	273 (aa)	-	H3APF8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000010144's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000010144's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000010144	-	71	46.392	ENSLACG00000012357	-	82	46.392
ENSLACG00000010144	-	77	32.558	ENSLACG00000022180	-	87	32.558
ENSLACG00000010144	-	60	50.307	ENSLACG00000010633	-	93	50.307
ENSLACG00000010144	-	75	44.878	ENSLACG00000014474	-	78	44.878
ENSLACG00000010144	-	75	37.981	ENSLACG00000003145	-	91	37.981
ENSLACG00000010144	-	67	40.984	ENSLACG00000001295	-	74	40.984
ENSLACG00000010144	-	75	40.191	ENSLACG00000001298	-	88	40.191
ENSLACG00000010144	-	58	49.682	ENSLACG00000008643	-	91	49.682
ENSLACG00000010144	-	86	37.288	ENSLACG00000011265	-	93	37.288
ENSLACG00000010144	-	78	37.557	ENSLACG00000003957	-	77	37.557
ENSLACG00000010144	-	88	41.564	ENSLACG00000001559	-	78	42.979
ENSLACG00000010144	-	72	39.109	ENSLACG00000005009	-	86	39.109
ENSLACG00000010144	-	73	31.481	ENSLACG00000012896	-	79	31.481
ENSLACG00000010144	-	73	36.275	ENSLACG00000017411	-	95	37.073
ENSLACG00000010144	-	83	38.326	ENSLACG00000011150	-	82	38.326
ENSLACG00000010144	-	78	41.256	ENSLACG00000006210	-	87	41.256
ENSLACG00000010144	-	81	35.217	ENSLACG00000016396	-	82	35.217
ENSLACG00000010144	-	71	40.394	ENSLACG00000013072	-	83	40.394
ENSLACG00000010144	-	66	49.444	ENSLACG00000014769	-	87	49.444
ENSLACG00000010144	-	78	36.744	ENSLACG00000009806	-	77	36.744
ENSLACG00000010144	-	83	36.681	ENSLACG00000002471	-	77	36.364
ENSLACG00000010144	-	80	33.937	ENSLACG00000010019	-	90	33.937
ENSLACG00000010144	-	70	32.124	ENSLACG00000016319	-	73	32.124
ENSLACG00000010144	-	80	38.158	ENSLACG00000005344	-	82	38.158
ENSLACG00000010144	-	82	30.531	ENSLACG00000006865	-	91	30.876
ENSLACG00000010144	-	77	36.792	ENSLACG00000010092	-	97	35.498
ENSLACG00000010144	-	84	38.865	ENSLACG00000017727	-	97	38.865
ENSLACG00000010144	-	71	42.640	ENSLACG00000002051	-	72	42.640
ENSLACG00000010144	-	84	34.188	ENSLACG00000007888	-	96	34.188
ENSLACG00000010144	-	71	39.409	ENSLACG00000010569	-	89	39.409
ENSLACG00000010144	-	78	35.294	ENSLACG00000001077	-	91	35.294
ENSLACG00000010144	-	75	39.423	ENSLACG00000000848	-	84	39.423
ENSLACG00000010144	-	88	40.741	ENSLACG00000003217	-	83	41.277
ENSLACG00000010144	-	73	36.181	ENSLACG00000003451	-	88	36.181
ENSLACG00000010144	-	79	39.269	ENSLACG00000002189	-	92	39.269
ENSLACG00000010144	-	87	39.331	ENSLACG00000000668	-	65	44.279
ENSLACG00000010144	-	86	38.776	ENSLACG00000014952	-	81	38.934
ENSLACG00000010144	-	73	44.444	ENSLACG00000006813	-	77	44.444
ENSLACG00000010144	-	81	36.522	ENSLACG00000004508	-	86	36.522
ENSLACG00000010144	-	80	45.413	ENSLACG00000013090	-	97	46.262
ENSLACG00000010144	-	66	41.758	ENSLACG00000016955	-	70	41.758
ENSLACG00000010144	-	92	45.600	ENSLACG00000002451	-	82	47.788
ENSLACG00000010144	-	56	44.156	ENSLACG00000000907	-	75	44.156
ENSLACG00000010144	-	62	39.548	ENSLACG00000000903	-	79	39.548
ENSLACG00000010144	-	73	32.673	ENSLACG00000013538	-	92	32.673
ENSLACG00000010144	-	69	41.885	ENSLACG00000000465	-	74	41.885
ENSLACG00000010144	-	75	33.654	ENSLACG00000010705	-	85	33.654
ENSLACG00000010144	-	78	42.130	ENSLACG00000006110	-	94	42.130
ENSLACG00000010144	-	78	41.096	ENSLACG00000009393	-	92	40.367
ENSLACG00000010144	-	80	41.553	ENSLACG00000000369	-	74	42.584
ENSLACG00000010144	-	81	36.522	ENSLACG00000010859	-	85	36.522
ENSLACG00000010144	-	59	61.491	ENSLACG00000007535	-	94	61.491
ENSLACG00000010144	-	68	41.799	ENSLACG00000010080	-	79	41.799
ENSLACG00000010144	-	82	62.500	ENSLACG00000000643	-	92	62.500
ENSLACG00000010144	-	86	36.250	ENSLACG00000010900	-	90	36.250
ENSLACG00000010144	-	80	41.176	ENSLACG00000012229	-	87	41.176
ENSLACG00000010144	-	75	36.585	ENSLACG00000008859	-	81	36.585
ENSLACG00000010144	-	71	44.615	ENSLACG00000010165	-	75	44.615
ENSLACG00000010144	-	85	43.404	ENSLACG00000014189	-	82	43.404
ENSLACG00000010144	-	70	44.503	ENSLACG00000005368	-	91	44.503
ENSLACG00000010144	-	81	40.088	ENSLACG00000000077	-	84	40.088
ENSLACG00000010144	-	76	52.885	ENSLACG00000001384	-	98	52.239
ENSLACG00000010144	-	75	37.321	ENSLACG00000006473	-	81	38.095
ENSLACG00000010144	-	76	50.000	ENSLACG00000013182	-	93	50.000
ENSLACG00000010144	-	85	63.948	ENSLACG00000000673	-	90	63.948
ENSLACG00000010144	-	78	39.462	ENSLACG00000006820	-	83	39.462
ENSLACG00000010144	-	80	35.088	ENSLACG00000011390	-	89	35.088
ENSLACG00000010144	-	69	38.071	ENSLACG00000007340	-	84	38.071
ENSLACG00000010144	-	59	45.062	ENSLACG00000007342	-	79	45.062
ENSLACG00000010144	-	89	35.628	ENSLACG00000010346	-	76	37.333
ENSLACG00000010144	-	81	36.910	ENSLACG00000000534	-	87	36.910
ENSLACG00000010144	-	76	31.401	ENSLACG00000016517	-	99	31.401
ENSLACG00000010144	-	84	38.261	ENSLACG00000011580	-	94	38.261
ENSLACG00000010144	-	65	39.106	ENSLACG00000018384	-	90	37.989
ENSLACG00000010144	-	80	50.000	ENSLACG00000005266	-	76	50.000
ENSLACG00000010144	-	73	38.119	ENSLACG00000009013	-	61	38.119
ENSLACG00000010144	-	73	33.333	ENSLACG00000004272	-	94	33.333
ENSLACG00000010144	-	78	33.645	ENSLACG00000014493	-	75	32.301
ENSLACG00000010144	-	77	36.073	ENSLACG00000013987	-	81	36.073
ENSLACG00000010144	-	79	52.294	ENSLACG00000000876	-	93	52.294
ENSLACG00000010144	-	79	31.797	ENSLACG00000002651	-	89	31.797
ENSLACG00000010144	-	67	37.097	ENSLACG00000002135	-	83	37.097
ENSLACG00000010144	-	81	38.696	ENSLACG00000011552	-	86	38.696
ENSLACG00000010144	-	82	36.123	ENSLACG00000007821	-	76	36.123
ENSLACG00000010144	-	78	37.946	ENSLACG00000013472	-	88	37.946
ENSLACG00000010144	-	75	44.019	ENSLACG00000012198	-	86	44.019
ENSLACG00000010144	-	67	35.106	ENSLACG00000000425	-	93	35.106
ENSLACG00000010144	-	59	32.919	ENSLACG00000002891	-	74	32.919
ENSLACG00000010144	-	62	59.172	ENSLACG00000001055	-	74	59.172
ENSLACG00000010144	-	71	46.907	ENSLACG00000014732	-	86	46.907

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000010144	-	73	30.653	ENSACIG00000013512	-	61	30.653	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000010144	-	69	30.851	ENSAPEG00000008945	-	63	30.851	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010144	-	75	35.407	ENSAPEG00000022657	-	57	35.407	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010144	-	79	30.317	ENSAPEG00000013155	-	67	30.317	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010144	-	69	30.851	ENSAPEG00000023573	-	63	30.851	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010144	-	78	36.486	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	77	36.486	Danio_rerio
ENSLACG00000010144	-	75	31.884	ENSFHEG00000006296	-	60	31.884	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000010144	-	64	30.682	ENSKMAG00000000253	-	51	30.682	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000010144	-	68	31.351	ENSKMAG00000012954	-	58	31.351	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000010144	-	71	35.233	ENSKMAG00000000861	-	72	35.233	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000010144	-	81	39.819	ENSLBEG00000017145	-	66	39.819	Labrus_bergylta
ENSLACG00000010144	-	79	32.719	ENSMZEG00005024824	-	63	32.663	Maylandia_zebra
ENSLACG00000010144	-	86	34.599	ENSMZEG00005020773	-	78	34.599	Maylandia_zebra
ENSLACG00000010144	-	64	32.768	ENSONIG00000021329	-	76	32.768	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000010144	-	69	44.444	ENSORLG00000020512	-	62	44.444	Oryzias_latipes
ENSLACG00000010144	-	64	30.114	ENSORLG00015021275	-	53	30.114	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000010144	-	74	33.333	ENSPKIG00000009100	-	60	33.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000010144	-	71	38.660	ENSPKIG00000001458	-	77	38.660	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000010144	-	56	36.129	ENSPMGG00000001874	-	54	36.129	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000010144	-	81	33.766	ENSPFOG00000020560	-	86	33.766	Poecilia_formosa
ENSLACG00000010144	-	66	33.889	ENSPFOG00000020665	-	65	33.889	Poecilia_formosa
ENSLACG00000010144	-	74	39.109	ENSPFOG00000020584	-	74	39.109	Poecilia_formosa
ENSLACG00000010144	-	78	30.516	ENSPLAG00000016026	-	65	32.609	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000010144	-	66	33.889	ENSPMEG00000014224	-	60	33.889	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000010144	-	64	32.044	ENSPMEG00000021431	-	61	32.044	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000010144	-	66	33.333	ENSPMEG00000022872	-	56	33.333	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000010144	-	81	38.462	ENSPNYG00000003325	-	73	38.462	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000010144	-	78	33.032	ENSPNAG00000017685	-	65	33.032	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000010144	-	71	39.698	ENSSLDG00000008663	-	82	39.698	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000010144	-	84	31.646	ENSXMAG00000029285	-	76	31.760	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000010144	-	68	34.054	ENSXMAG00000021250	-	54	34.054	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000010144	-	64	34.659	ENSXMAG00000024802	-	56	34.054	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000010144	-	68	35.079	ENSXMAG00000023095	-	51	35.079	Xiphophorus_maculatus