EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000010346 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 885 bases
Position: chrJH128249.1:494886-495770
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000011753	Transposase_22	PF02994.14	3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000011843	-	885	-	ENSLACP00000011753	295 (aa)	-	H3AQ32

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000010346's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000010346's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000010346	-	68	35.500	ENSLACG00000014732	-	88	35.500
ENSLACG00000010346	-	78	44.589	ENSLACG00000011580	-	94	44.589
ENSLACG00000010346	-	53	36.538	ENSLACG00000010633	-	94	35.882
ENSLACG00000010346	-	68	44.776	ENSLACG00000003145	-	89	44.776
ENSLACG00000010346	-	69	34.742	ENSLACG00000012229	-	86	34.742
ENSLACG00000010346	-	83	65.041	ENSLACG00000008859	-	93	65.041
ENSLACG00000010346	-	54	35.220	ENSLACG00000008643	-	92	35.220
ENSLACG00000010346	-	87	33.080	ENSLACG00000001559	-	88	33.080
ENSLACG00000010346	-	96	70.213	ENSLACG00000011150	-	99	70.213
ENSLACG00000010346	-	69	32.020	ENSLACG00000013182	-	90	32.020
ENSLACG00000010346	-	72	33.032	ENSLACG00000006210	-	86	33.032
ENSLACG00000010346	-	72	33.333	ENSLACG00000016396	-	78	33.333
ENSLACG00000010346	-	81	32.510	ENSLACG00000006820	-	90	32.510
ENSLACG00000010346	-	77	34.025	ENSLACG00000011390	-	93	34.025
ENSLACG00000010346	-	71	34.135	ENSLACG00000014769	-	95	35.533
ENSLACG00000010346	-	72	33.803	ENSLACG00000005266	-	74	33.803
ENSLACG00000010346	-	76	38.393	ENSLACG00000010019	-	92	38.393
ENSLACG00000010346	-	80	85.169	ENSLACG00000010092	-	99	85.169
ENSLACG00000010346	-	77	44.298	ENSLACG00000017727	-	96	44.298
ENSLACG00000010346	-	71	43.541	ENSLACG00000000848	-	85	44.019
ENSLACG00000010346	-	72	35.747	ENSLACG00000003217	-	80	35.747
ENSLACG00000010346	-	87	31.923	ENSLACG00000000668	-	86	31.923
ENSLACG00000010346	-	66	76.020	ENSLACG00000002135	-	88	76.020
ENSLACG00000010346	-	76	37.333	ENSLACG00000010144	-	89	35.628
ENSLACG00000010346	-	80	32.922	ENSLACG00000005344	-	84	32.922
ENSLACG00000010346	-	98	64.828	ENSLACG00000007821	-	97	64.828
ENSLACG00000010346	-	89	84.791	ENSLACG00000016955	-	100	84.791
ENSLACG00000010346	-	69	36.893	ENSLACG00000012198	-	85	36.893
ENSLACG00000010346	-	82	34.025	ENSLACG00000014474	-	91	34.025
ENSLACG00000010346	-	54	34.375	ENSLACG00000000907	-	78	34.375
ENSLACG00000010346	-	64	32.850	ENSLACG00000000903	-	89	31.863
ENSLACG00000010346	-	69	30.732	ENSLACG00000013538	-	93	30.732
ENSLACG00000010346	-	79	32.068	ENSLACG00000013472	-	92	32.068
ENSLACG00000010346	-	59	35.714	ENSLACG00000000465	-	73	35.714
ENSLACG00000010346	-	71	33.971	ENSLACG00000001384	-	98	33.168
ENSLACG00000010346	-	69	34.483	ENSLACG00000010705	-	83	34.483
ENSLACG00000010346	-	71	64.904	ENSLACG00000004272	-	99	64.904
ENSLACG00000010346	-	77	42.105	ENSLACG00000009393	-	97	42.105
ENSLACG00000010346	-	74	43.119	ENSLACG00000002189	-	92	43.119
ENSLACG00000010346	-	71	32.536	ENSLACG00000001295	-	79	32.536
ENSLACG00000010346	-	78	34.764	ENSLACG00000001298	-	97	34.764
ENSLACG00000010346	-	79	43.348	ENSLACG00000011265	-	92	43.348
ENSLACG00000010346	-	73	33.333	ENSLACG00000009806	-	78	33.333
ENSLACG00000010346	-	83	32.540	ENSLACG00000003957	-	87	32.540
ENSLACG00000010346	-	77	39.474	ENSLACG00000005009	-	91	39.474
ENSLACG00000010346	-	57	37.500	ENSLACG00000007535	-	96	37.500
ENSLACG00000010346	-	55	40.244	ENSLACG00000010080	-	70	40.244
ENSLACG00000010346	-	81	36.134	ENSLACG00000000643	-	97	36.134
ENSLACG00000010346	-	99	86.007	ENSLACG00000002471	-	98	86.007
ENSLACG00000010346	-	82	88.477	ENSLACG00000010900	-	92	88.477
ENSLACG00000010346	-	67	36.318	ENSLACG00000013072	-	82	36.318
ENSLACG00000010346	-	77	34.211	ENSLACG00000012357	-	95	34.222
ENSLACG00000010346	-	83	33.878	ENSLACG00000010165	-	92	33.878
ENSLACG00000010346	-	87	63.424	ENSLACG00000006865	-	100	63.008
ENSLACG00000010346	-	83	31.301	ENSLACG00000014189	-	95	30.292
ENSLACG00000010346	-	67	35.176	ENSLACG00000005368	-	94	35.176
ENSLACG00000010346	-	76	42.601	ENSLACG00000000077	-	85	42.601
ENSLACG00000010346	-	77	32.174	ENSLACG00000002051	-	83	32.174
ENSLACG00000010346	-	81	37.500	ENSLACG00000010569	-	97	37.500
ENSLACG00000010346	-	86	85.375	ENSLACG00000006473	-	93	85.375
ENSLACG00000010346	-	72	32.579	ENSLACG00000001077	-	90	32.579
ENSLACG00000010346	-	78	37.447	ENSLACG00000000673	-	89	37.447
ENSLACG00000010346	-	69	70.732	ENSLACG00000003451	-	90	70.732
ENSLACG00000010346	-	69	34.562	ENSLACG00000007340	-	91	34.562
ENSLACG00000010346	-	53	39.375	ENSLACG00000007342	-	77	39.375
ENSLACG00000010346	-	69	35.294	ENSLACG00000001055	-	89	35.294
ENSLACG00000010346	-	88	33.333	ENSLACG00000014952	-	90	33.333
ENSLACG00000010346	-	82	33.058	ENSLACG00000006813	-	93	33.058
ENSLACG00000010346	-	79	33.471	ENSLACG00000004508	-	90	33.607
ENSLACG00000010346	-	78	32.114	ENSLACG00000000534	-	91	31.301
ENSLACG00000010346	-	73	33.488	ENSLACG00000013090	-	99	33.488
ENSLACG00000010346	-	65	39.267	ENSLACG00000018384	-	97	39.267
ENSLACG00000010346	-	75	34.685	ENSLACG00000009013	-	67	34.685
ENSLACG00000010346	-	88	32.075	ENSLACG00000002451	-	95	32.075
ENSLACG00000010346	-	71	62.981	ENSLACG00000016517	-	99	62.981
ENSLACG00000010346	-	99	73.288	ENSLACG00000014493	-	98	73.288
ENSLACG00000010346	-	74	33.636	ENSLACG00000013987	-	81	33.636
ENSLACG00000010346	-	80	33.191	ENSLACG00000000876	-	98	33.191
ENSLACG00000010346	-	83	64.754	ENSLACG00000002651	-	100	64.754
ENSLACG00000010346	-	81	31.148	ENSLACG00000000369	-	84	31.148
ENSLACG00000010346	-	72	34.685	ENSLACG00000011552	-	82	34.685
ENSLACG00000010346	-	73	34.667	ENSLACG00000006110	-	99	34.667
ENSLACG00000010346	-	72	35.586	ENSLACG00000010859	-	82	35.586

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000010346	-	70	30.288	ENSACIG00000013512	-	64	30.288	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000010346	-	74	31.081	ENSAPEG00000013155	-	67	31.081	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010346	-	74	31.050	ENSAPEG00000022657	-	61	31.050	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010346	-	87	33.074	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	92	33.074	Danio_rerio
ENSLACG00000010346	-	78	32.340	ENSFHEG00000006296	-	67	32.340	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000010346	-	63	30.108	ENSMZEG00005024824	-	59	30.108	Maylandia_zebra
ENSLACG00000010346	-	58	31.792	ENSONIG00000021329	-	75	31.792	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000010346	-	70	31.163	ENSOMEG00000019152	-	80	31.163	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000010346	-	74	33.333	ENSPKIG00000001458	-	88	33.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000010346	-	53	31.250	ENSPMGG00000001874	-	55	31.250	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000010346	-	87	30.233	ENSPFOG00000020584	-	95	30.233	Poecilia_formosa
ENSLACG00000010346	-	75	34.685	ENSPNYG00000003325	-	73	34.685	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000010346	-	91	30.182	ENSPNAG00000017685	-	79	30.182	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000010346	-	80	33.191	ENSSLDG00000008663	-	92	33.191	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000010346	-	78	31.330	ENSXMAG00000029285	-	76	31.330	Xiphophorus_maculatus