EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000010508 (Gene tree)
Gene ID: 102345644
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18049 bases
Position: chrJH126654.1:510435-528483
Accession: 102345644
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000011939	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	8.5e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000012030	TWISTNB-201	4914	XM_005991280	ENSLACP00000011939	349 (aa)	XP_005991342	H3AQL8

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	53.770	ENSG00000105849	TWISTNB	87	52.787	Homo_sapiens
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	44.575	ENSAPOG00000011796	twistnb	85	45.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	99	42.318	ENSACIG00000020400	twistnb	98	43.817	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	44.048	ENSAOCG00000024200	twistnb	89	44.348	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	44.083	ENSAPEG00000016750	twistnb	89	44.638	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010508	TWISTNB	96	43.175	ENSATEG00000017956	twistnb	87	48.624	Anabas_testudineus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	52.104	ENSANAG00000026418	TWISTNB	92	51.250	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	55.204	ENSACLG00000022280	twistnb	92	45.553	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000010508	TWISTNB	50	62.069	ENSAMXG00000035868	twistnb	53	62.069	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	54.403	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	93	55.937	Bos_taurus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	52.443	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	92	51.402	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	57	66.834	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	92	50.313	Canis_familiaris
ENSLACG00000010508	TWISTNB	57	66.834	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	86	50.949	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.682	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	93	54.688	Capra_hircus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	90	50.610	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	93	50.613	Carlito_syrichta
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	51.212	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	95	51.360	Cavia_porcellus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.887	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	91	51.887	Cebus_capucinus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	53.115	ENSCATG00000035621	TWISTNB	87	52.131	Cercocebus_atys
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	50.765	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	92	53.438	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	53.115	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	87	52.131	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	93	53.049	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	98	53.659	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	53.115	ENSCANG00000038759	TWISTNB	87	52.131	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	56	65.347	ENSCGRG00001000499	Twistnb	96	50.789	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000010508	TWISTNB	58	58.738	ENSDARG00000024416	twistnb	53	58.173	Danio_rerio
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.724	ENSDNOG00000006438	-	92	51.757	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	82	54.514	ENSDORG00000007795	Twistnb	90	54.795	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	52.484	ENSEASG00005021702	TWISTNB	88	53.526	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	52.201	ENSECAG00000014563	TWISTNB	88	55.031	Equus_caballus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	99	44.959	ENSELUG00000000098	TWISTNB	99	44.142	Esox_lucius
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	52.188	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	92	54.140	Felis_catus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	83	50.000	ENSFALG00000009761	TWISTNB	99	49.677	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000010508	TWISTNB	88	54.808	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	94	56.308	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	56.054	ENSFHEG00000013318	twistnb	60	56.054	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	88	54.859	ENSGALG00000010863	TWISTNB	78	54.294	Gallus_gallus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	50	59.195	ENSGACG00000006425	twistnb	66	59.195	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	53.443	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	87	53.115	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	55.204	ENSHBUG00000020155	twistnb	92	45.553	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	54.799	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	94	54.799	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000010508	TWISTNB	88	54.777	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	94	54.799	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000010508	TWISTNB	72	48.077	ENSHCOG00000010590	twistnb	99	39.806	Hippocampus_comes
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	43.505	ENSIPUG00000004117	twistnb	90	46.407	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	92	51.682	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	88	53.191	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	52.244	ENSJJAG00000015887	Twistnb	92	51.282	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	51	61.017	ENSKMAG00000001591	twistnb	88	44.311	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	65	52.321	ENSLBEG00000024225	twistnb	98	42.819	Labrus_bergylta
ENSLACG00000010508	TWISTNB	52	66.848	ENSLOCG00000011399	twistnb	55	66.848	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	90	48.182	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	53.797	Loxodonta_africana
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	52.787	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	87	51.803	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	52.787	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	87	51.803	Macaca_mulatta
ENSLACG00000010508	TWISTNB	84	52.824	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	86	51.827	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	53.115	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	87	52.131	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	55.204	ENSMZEG00005007561	twistnb	92	45.553	Maylandia_zebra
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	51.385	ENSMICG00000036489	TWISTNB	94	51.385	Microcebus_murinus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	52	70.330	ENSMOCG00000003458	Twistnb	95	52.885	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000010508	TWISTNB	50	61.272	ENSMMOG00000020085	twistnb	86	44.940	Mola_mola
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	51.155	ENSMODG00000001402	-	68	49.216	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000010508	TWISTNB	53	56.122	ENSMALG00000016407	twistnb	94	41.176	Monopterus_albus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	87	52.769	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	90	54.575	Mus_caroli
ENSLACG00000010508	TWISTNB	52	69.780	ENSMUSG00000020561	Twistnb	90	52.396	Mus_musculus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	87	51.104	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	90	50.974	Mus_pahari
ENSLACG00000010508	TWISTNB	54	67.725	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	90	52.396	Mus_spretus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.713	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	86	50.625	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	49.682	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	99	50.159	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	51	67.778	ENSNGAG00000022455	Twistnb	90	67.778	Nannospalax_galili
ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	54.955	ENSNBRG00000008652	twistnb	98	45.405	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	53.145	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	91	52.516	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000010508	TWISTNB	93	53.982	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	97	52.226	Ochotona_princeps
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	52.201	ENSODEG00000007222	TWISTNB	92	53.459	Octodon_degus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	83	45.425	ENSORLG00020002579	twistnb	87	46.246	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000010508	TWISTNB	51	63.277	ENSORLG00015013403	twistnb	77	44.648	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000010508	TWISTNB	87	53.548	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	89	54.341	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	52.454	ENSOARG00000009803	TWISTNB	92	55.000	Ovis_aries
ENSLACG00000010508	TWISTNB	81	54.325	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	87	52.787	Pan_paniscus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	51.840	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	94	53.939	Panthera_pardus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	86	53.094	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	53.698	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	53.770	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	87	52.787	Pan_troglodytes
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	52.288	ENSPANG00000015736	TWISTNB	87	52.614	Papio_anubis
ENSLACG00000010508	TWISTNB	53	61.957	ENSPKIG00000025635	twistnb	51	61.957	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000010508	TWISTNB	84	48.254	ENSPMGG00000019023	twistnb	81	46.278	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	80	54.355	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	92	51.090	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	52.665	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	87	53.268	Pongo_abelii
ENSLACG00000010508	TWISTNB	54	66.842	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	91	54.167	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000010508	TWISTNB	90	53.438	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	93	54.517	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	55.204	ENSPNYG00000002674	twistnb	98	45.553	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000010508	TWISTNB	86	43.887	ENSPNAG00000011956	twistnb	51	57.923	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000010508	TWISTNB	54	68.783	ENSRNOG00000010750	Twistnb	92	55.034	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	52.201	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	90	51.258	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	52.201	ENSRROG00000040155	TWISTNB	91	51.258	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	52.288	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	92	51.250	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000010508	TWISTNB	82	45.545	ENSSFOG00015012788	twistnb	97	45.048	Scleropages_formosus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	50	62.644	ENSSMAG00000012792	twistnb	87	47.988	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	55.505	ENSSDUG00000007038	twistnb	98	45.187	Seriola_dumerili
ENSLACG00000010508	TWISTNB	85	48.495	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	94	48.495	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	83	47.508	ENSSPAG00000005871	twistnb	87	46.319	Stegastes_partitus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	51.875	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	92	52.564	Sus_scrofa
ENSLACG00000010508	TWISTNB	82	47.945	ENSTNIG00000017778	twistnb	87	47.945	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.125	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	91	52.427	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.603	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	92	51.582	Ursus_americanus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	89	51.282	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	92	51.266	Ursus_maritimus
ENSLACG00000010508	TWISTNB	54	69.149	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	93	50.610	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000010508	TWISTNB	52	62.500	ENSXCOG00000020199	twistnb	52	62.500	Xiphophorus_couchianus