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Description

Ensembl ID: ENSLACG00000010541 (Gene tree)
Gene ID: 102359715
Gene Symbol: PRPF3
Alias: Prp3|RP18|SNRNP90|hPrp3
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 27083 bases
Position: chrJH127746.1:512590-539672
Accession: 102359715
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000011977	PRP3	PF08572.10	6.6e-54	1	1
ENSLACP00000011977	PWI	PF01480.17	5.2e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000012068	PRPF3-201	1984	XM_006005352	ENSLACP00000011977	631 (aa)	-	H3AQQ6

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSG00000117360	PRPF3	93	82.418	Homo_sapiens
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.890	ENSAPOG00000015584	prpf3	93	68.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSAMEG00000001630	PRPF3	93	82.418	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.727	ENSACIG00000007876	prpf3	93	67.121	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.071	ENSAOCG00000011449	prpf3	93	67.939	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.835	ENSATEG00000023583	prpf3	93	67.988	Anabas_testudineus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.203	ENSAPLG00000002440	PRPF3	93	82.418	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	80.938	ENSACAG00000003176	PRPF3	93	81.094	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.019	ENSANAG00000026138	PRPF3	93	88.298	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.056	ENSACLG00000020127	prpf3	93	68.210	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	70.588	ENSAMXG00000007306	prpf3	93	70.588	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.228	ENSBTAG00000013946	PRPF3	93	83.070	Bos_taurus
ENSLACG00000010541	PRPF3	77	35.686	WBGene00010844	prp-3	88	32.846	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.019	ENSCJAG00000009926	PRPF3	93	88.298	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSCAFG00000011820	PRPF3	93	82.418	Canis_familiaris
ENSLACG00000010541	PRPF3	86	81.603	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	81.421	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSCHIG00000015434	PRPF3	93	82.418	Capra_hircus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.176	ENSTSYG00000001383	PRPF3	96	83.197	Carlito_syrichta
ENSLACG00000010541	PRPF3	93	68.547	ENSCAPG00000017812	PRPF3	87	68.718	Cavia_aperea
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSCPOG00000008068	PRPF3	93	82.418	Cavia_porcellus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.759	ENSCCAG00000026380	PRPF3	98	82.764	Cebus_capucinus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	73.281	ENSCATG00000041778	PRPF3	84	87.234	Cercocebus_atys
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.732	ENSCLAG00000015009	PRPF3	93	82.575	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000010541	PRPF3	74	87.705	ENSCHOG00000011645	PRPF3	69	88.115	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSCPBG00000008216	PRPF3	93	82.418	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000010541	PRPF3	59	53.034	ENSCING00000003312	-	90	52.507	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000010541	PRPF3	78	51.200	ENSCSAVG00000008720	-	85	51.200	Ciona_savignyi
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.390	ENSCANG00000036769	PRPF3	98	82.382	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSCGRG00001019100	Prpf3	93	82.418	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSCGRG00000007322	Prpf3	93	82.418	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.421	ENSCSEG00000002532	prpf3	93	67.119	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.884	ENSCVAG00000009318	prpf3	93	68.037	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	69.924	ENSDARG00000086425	prpf3	100	70.000	Danio_rerio
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	77.201	ENSDNOG00000005904	PRPF3	92	77.201	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000010541	PRPF3	92	82.143	ENSDORG00000008664	Prpf3	92	81.973	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000010541	PRPF3	78	49.310	FBgn0036915	Prp3	90	48.509	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSETEG00000019124	PRPF3	93	82.418	Echinops_telfairi
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	59.329	ENSEBUG00000011680	prpf3	93	59.325	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.418	ENSEASG00005001566	PRPF3	93	82.261	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSECAG00000019840	PRPF3	99	81.421	Equus_caballus
ENSLACG00000010541	PRPF3	84	85.106	ENSEEUG00000007338	PRPF3	78	85.816	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	61.043	ENSELUG00000013624	prpf3	92	60.736	Esox_lucius
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSFCAG00000013940	PRPF3	93	82.418	Felis_catus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSFDAG00000010365	PRPF3	93	82.418	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.224	ENSFHEG00000021746	prpf3	93	68.380	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.971	ENSGMOG00000008535	prpf3	93	66.210	Gadus_morhua
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.359	ENSGALG00000028205	PRPF3	93	82.575	Gallus_gallus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.769	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	62.336	Gambusia_affinis
ENSLACG00000010541	PRPF3	99	66.819	ENSGACG00000011792	prpf3	93	66.819	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.418	ENSGAGG00000013765	PRPF3	91	81.873	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000010541	PRPF3	84	85.425	ENSGGOG00000013174	PRPF3	92	85.830	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.056	ENSHBUG00000003493	prpf3	93	68.210	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSHGLG00000016569	PRPF3	93	82.418	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	57.390	ENSHGLG00000016033	-	91	57.233	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSHGLG00100007590	PRPF3	93	82.418	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	57.344	ENSHGLG00100008951	-	86	81.818	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	63.070	ENSHCOG00000014058	prpf3	93	63.374	Hippocampus_comes
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.865	ENSIPUG00000000902	PRPF3	93	69.219	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSSTOG00000001889	PRPF3	93	82.418	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.378	ENSKMAG00000001390	prpf3	93	67.737	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	65.913	ENSLBEG00000026310	prpf3	93	66.214	Labrus_bergylta
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.732	ENSLAFG00000004713	PRPF3	93	82.575	Loxodonta_africana
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.019	ENSMFAG00000039791	PRPF3	98	82.573	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000010541	PRPF3	97	82.792	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	82.573	Macaca_mulatta
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.019	ENSMNEG00000038161	PRPF3	98	82.573	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000010541	PRPF3	99	54.660	ENSMLEG00000041065	-	90	54.186	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000010541	PRPF3	84	85.020	ENSMLEG00000040609	PRPF3	92	85.425	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.845	ENSMAMG00000014968	prpf3	93	68.237	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.169	ENSMZEG00005015970	prpf3	93	67.830	Maylandia_zebra
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.359	ENSMGAG00000000707	PRPF3	93	82.575	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.418	ENSMAUG00000017112	Prpf3	93	82.261	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.862	ENSMICG00000015386	PRPF3	96	82.871	Microcebus_murinus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSMOCG00000000242	Prpf3	93	82.418	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.920	ENSMMOG00000016131	prpf3	93	67.683	Mola_mola
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSMODG00000018774	PRPF3	95	82.410	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.178	ENSMALG00000007257	prpf3	90	69.010	Monopterus_albus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.261	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	93	88.298	Mus_caroli
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.261	ENSMUSG00000015748	Prpf3	93	88.298	Mus_musculus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.418	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	93	88.298	Mus_pahari
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.261	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	93	88.298	Mus_spretus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	80.063	ENSMPUG00000005080	PRPF3	93	79.906	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.732	ENSMLUG00000004646	-	93	82.575	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSNGAG00000000910	Prpf3	93	82.418	Nannospalax_galili
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.016	ENSNBRG00000003462	prpf3	93	67.166	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000010541	PRPF3	99	81.132	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	82.573	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000010541	PRPF3	72	86.344	ENSMEUG00000008733	PRPF3	72	85.903	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.732	ENSOPRG00000010139	PRPF3	93	82.575	Ochotona_princeps
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.418	ENSODEG00000011363	-	93	82.261	Octodon_degus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	61.659	ENSODEG00000014412	-	93	61.346	Octodon_degus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.018	ENSONIG00000006394	prpf3	93	67.830	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	58.190	ENSOANG00000015441	PRPF3	93	58.034	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSOCUG00000011760	PRPF3	93	82.418	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.760	ENSORLG00000010330	prpf3	98	68.300	Oryzias_latipes
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.760	ENSORLG00020009054	prpf3	98	68.300	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.606	ENSORLG00015015016	prpf3	93	68.147	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.381	ENSOMEG00000000940	prpf3	93	67.534	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	77.273	ENSOGAG00000005352	PRPF3	93	77.429	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSOARG00000020798	PRPF3	93	82.418	Ovis_aries
ENSLACG00000010541	PRPF3	99	62.401	ENSPPAG00000043769	-	97	61.803	Pan_paniscus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.418	ENSPPAG00000030983	PRPF3	93	82.261	Pan_paniscus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSPPRG00000000731	PRPF3	93	82.418	Panthera_pardus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSPTIG00000005516	PRPF3	93	82.418	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000010541	PRPF3	99	61.611	ENSPTRG00000047819	-	92	61.137	Pan_troglodytes
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.019	ENSPTRG00000001254	PRPF3	98	83.034	Pan_troglodytes
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.862	ENSPANG00000000499	PRPF3	98	82.871	Papio_anubis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	71.363	ENSPKIG00000010501	prpf3	93	71.363	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.261	ENSPSIG00000014877	PRPF3	93	81.947	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	61.646	ENSPMGG00000007776	prpf3	92	61.957	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSPEMG00000011672	Prpf3	93	82.418	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000010541	PRPF3	60	66.154	ENSPMAG00000005588	prpf3	89	64.691	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSPCIG00000008795	PRPF3	93	82.418	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.867	ENSPFOG00000013638	prpf3	93	67.018	Poecilia_formosa
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.077	ENSPLAG00000018103	prpf3	93	67.231	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.769	ENSPMEG00000023546	prpf3	93	66.923	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.462	ENSPREG00000017216	prpf3	93	66.615	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000010541	PRPF3	81	71.318	ENSPPYG00000018646	-	100	71.124	Pongo_abelii
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	82.418	Pongo_abelii
ENSLACG00000010541	PRPF3	85	81.284	ENSPCAG00000014908	PRPF3	80	81.101	Procavia_capensis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.862	ENSPCOG00000013828	PRPF3	96	82.871	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSPVAG00000013472	PRPF3	93	82.418	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.056	ENSPNYG00000004279	prpf3	93	68.210	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	69.940	ENSPNAG00000001799	prpf3	93	69.940	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.261	ENSRNOG00000025629	Prpf3	96	82.248	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000010541	PRPF3	82	83.871	ENSRBIG00000028854	PRPF3	92	83.871	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSRROG00000027464	PRPF3	98	82.573	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	76.461	ENSSBOG00000033104	PRPF3	93	88.298	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.132	ENSSHAG00000009548	PRPF3	93	81.975	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	70.997	ENSSFOG00015022014	prpf3	93	70.997	Scleropages_formosus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.117	ENSSMAG00000015739	prpf3	93	67.267	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.102	ENSSDUG00000006840	prpf3	92	65.948	Seriola_dumerili
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.114	ENSSLDG00000015423	prpf3	93	68.263	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSSARG00000011064	PRPF3	93	82.418	Sorex_araneus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	80.835	ENSSPUG00000000809	PRPF3	93	80.680	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.389	ENSSPAG00000018721	prpf3	93	68.541	Stegastes_partitus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSSSCG00000030119	PRPF3	99	82.173	Sus_scrofa
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	70.846	ENSTGUG00000004552	PRPF3	93	70.219	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.290	ENSTRUG00000014923	prpf3	93	67.445	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.830	ENSTNIG00000008058	prpf3	93	67.325	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000010541	PRPF3	81	85.124	ENSTBEG00000014072	PRPF3	81	85.950	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	77.638	ENSTTRG00000010616	PRPF3	93	77.480	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000010541	PRPF3	79	81.873	ENSUAMG00000009345	PRPF3	91	81.873	Ursus_americanus
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSUMAG00000003720	PRPF3	93	82.418	Ursus_maritimus
ENSLACG00000010541	PRPF3	88	86.391	ENSVPAG00000005425	PRPF3	82	86.982	Vicugna_pacos
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	ENSVVUG00000007933	PRPF3	98	82.573	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	78.193	ENSXETG00000018654	prpf3	93	78.193	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.615	ENSXMAG00000016347	prpf3	93	66.769	Xiphophorus_maculatus