EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000010900 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1702 bases
Position: chrJH127227.1:544878-546579
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000012379	Transposase_22	PF02994.14	7.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000012472	-	795	-	ENSLACP00000012379	265 (aa)	-	H3ARV8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000010900's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000010900's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000010900	-	82	62.844	ENSLACG00000002651	-	89	62.844
ENSLACG00000010900	-	75	77.000	ENSLACG00000002135	-	89	77.000
ENSLACG00000010900	-	90	36.250	ENSLACG00000010144	-	86	36.250
ENSLACG00000010900	-	94	67.339	ENSLACG00000007821	-	83	67.339
ENSLACG00000010900	-	87	32.618	ENSLACG00000014952	-	78	32.618
ENSLACG00000010900	-	78	63.942	ENSLACG00000016517	-	99	63.942
ENSLACG00000010900	-	72	31.122	ENSLACG00000000425	-	100	31.122
ENSLACG00000010900	-	74	34.518	ENSLACG00000013090	-	93	34.518
ENSLACG00000010900	-	61	31.361	ENSLACG00000002891	-	77	31.361
ENSLACG00000010900	-	77	35.784	ENSLACG00000001055	-	89	35.784
ENSLACG00000010900	-	72	31.472	ENSLACG00000000907	-	96	31.472
ENSLACG00000010900	-	62	32.584	ENSLACG00000000903	-	77	32.584
ENSLACG00000010900	-	76	35.149	ENSLACG00000009013	-	61	35.149
ENSLACG00000010900	-	80	37.383	ENSLACG00000006110	-	93	37.383
ENSLACG00000010900	-	91	76.763	ENSLACG00000014493	-	80	76.763
ENSLACG00000010900	-	76	43.284	ENSLACG00000003145	-	89	43.284
ENSLACG00000010900	-	82	33.636	ENSLACG00000013987	-	81	33.636
ENSLACG00000010900	-	86	41.667	ENSLACG00000002189	-	97	41.667
ENSLACG00000010900	-	67	34.270	ENSLACG00000001295	-	74	34.270
ENSLACG00000010900	-	79	33.953	ENSLACG00000001298	-	93	33.953
ENSLACG00000010900	-	92	42.798	ENSLACG00000011265	-	96	42.798
ENSLACG00000010900	-	95	33.591	ENSLACG00000003957	-	86	33.465
ENSLACG00000010900	-	82	36.818	ENSLACG00000001559	-	72	36.818
ENSLACG00000010900	-	86	41.228	ENSLACG00000005009	-	91	41.228
ENSLACG00000010900	-	66	38.506	ENSLACG00000007535	-	99	38.506
ENSLACG00000010900	-	61	39.881	ENSLACG00000010080	-	70	39.881
ENSLACG00000010900	-	94	86.694	ENSLACG00000002471	-	83	86.694
ENSLACG00000010900	-	75	35.500	ENSLACG00000014732	-	88	35.500
ENSLACG00000010900	-	81	34.419	ENSLACG00000010165	-	82	34.419
ENSLACG00000010900	-	95	63.241	ENSLACG00000006865	-	97	63.180
ENSLACG00000010900	-	80	33.632	ENSLACG00000002051	-	81	33.632
ENSLACG00000010900	-	78	35.749	ENSLACG00000014474	-	76	35.749
ENSLACG00000010900	-	82	35.294	ENSLACG00000012229	-	86	35.294
ENSLACG00000010900	-	78	74.757	ENSLACG00000008859	-	81	74.757
ENSLACG00000010900	-	89	37.657	ENSLACG00000010569	-	96	37.657
ENSLACG00000010900	-	79	32.420	ENSLACG00000001077	-	89	32.420
ENSLACG00000010900	-	60	35.849	ENSLACG00000008643	-	92	35.849
ENSLACG00000010900	-	77	36.715	ENSLACG00000003217	-	73	36.715
ENSLACG00000010900	-	77	74.146	ENSLACG00000003451	-	90	74.146
ENSLACG00000010900	-	75	30.986	ENSLACG00000012896	-	79	30.986
ENSLACG00000010900	-	77	31.527	ENSLACG00000013182	-	90	31.527
ENSLACG00000010900	-	92	88.477	ENSLACG00000010346	-	82	88.477
ENSLACG00000010900	-	92	31.301	ENSLACG00000013472	-	94	31.301
ENSLACG00000010900	-	87	30.705	ENSLACG00000016396	-	85	30.705
ENSLACG00000010900	-	80	32.710	ENSLACG00000000668	-	71	32.710
ENSLACG00000010900	-	57	41.447	ENSLACG00000014769	-	93	34.579
ENSLACG00000010900	-	86	33.333	ENSLACG00000006813	-	88	33.333
ENSLACG00000010900	-	76	32.243	ENSLACG00000005344	-	75	32.243
ENSLACG00000010900	-	87	43.290	ENSLACG00000011580	-	94	43.290
ENSLACG00000010900	-	86	43.668	ENSLACG00000017727	-	96	43.668
ENSLACG00000010900	-	82	35.185	ENSLACG00000002451	-	78	35.185
ENSLACG00000010900	-	82	35.135	ENSLACG00000000876	-	98	35.135
ENSLACG00000010900	-	65	36.364	ENSLACG00000000465	-	73	36.364
ENSLACG00000010900	-	87	32.900	ENSLACG00000000369	-	81	32.900
ENSLACG00000010900	-	80	34.234	ENSLACG00000011552	-	82	34.234
ENSLACG00000010900	-	86	40.175	ENSLACG00000009393	-	97	40.175
ENSLACG00000010900	-	80	83.962	ENSLACG00000016955	-	80	83.962
ENSLACG00000010900	-	88	36.325	ENSLACG00000000643	-	95	36.325
ENSLACG00000010900	-	89	35.443	ENSLACG00000012198	-	96	35.443
ENSLACG00000010900	-	62	37.195	ENSLACG00000010633	-	94	37.349
ENSLACG00000010900	-	92	33.200	ENSLACG00000004508	-	94	33.333
ENSLACG00000010900	-	75	36.181	ENSLACG00000005368	-	94	36.181
ENSLACG00000010900	-	88	40.517	ENSLACG00000000077	-	88	40.517
ENSLACG00000010900	-	86	35.526	ENSLACG00000012357	-	95	35.556
ENSLACG00000010900	-	80	33.649	ENSLACG00000001384	-	98	34.450
ENSLACG00000010900	-	92	73.684	ENSLACG00000011150	-	89	73.684
ENSLACG00000010900	-	96	83.465	ENSLACG00000006473	-	93	83.465
ENSLACG00000010900	-	89	33.195	ENSLACG00000000673	-	92	33.195
ENSLACG00000010900	-	92	30.952	ENSLACG00000006210	-	96	30.952
ENSLACG00000010900	-	86	32.051	ENSLACG00000006820	-	85	33.043
ENSLACG00000010900	-	90	33.735	ENSLACG00000011390	-	94	33.735
ENSLACG00000010900	-	91	33.471	ENSLACG00000009806	-	86	33.471
ENSLACG00000010900	-	78	34.450	ENSLACG00000007340	-	86	34.450
ENSLACG00000010900	-	59	38.650	ENSLACG00000007342	-	77	38.650
ENSLACG00000010900	-	88	38.627	ENSLACG00000010019	-	96	38.627
ENSLACG00000010900	-	77	34.804	ENSLACG00000010705	-	83	34.804
ENSLACG00000010900	-	85	34.956	ENSLACG00000013072	-	91	34.956
ENSLACG00000010900	-	90	88.235	ENSLACG00000010092	-	100	88.235
ENSLACG00000010900	-	92	30.952	ENSLACG00000000534	-	90	30.952
ENSLACG00000010900	-	87	32.773	ENSLACG00000010859	-	96	31.599
ENSLACG00000010900	-	88	34.025	ENSLACG00000014189	-	84	34.025
ENSLACG00000010900	-	79	43.062	ENSLACG00000000848	-	85	43.541
ENSLACG00000010900	-	72	39.791	ENSLACG00000018384	-	97	39.791
ENSLACG00000010900	-	80	34.742	ENSLACG00000005266	-	74	34.742
ENSLACG00000010900	-	78	62.981	ENSLACG00000004272	-	99	62.981

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000010900	-	90	30.612	ENSACIG00000018891	-	72	30.612	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000010900	-	90	30.612	ENSACIG00000014541	-	74	30.612	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000010900	-	81	31.193	ENSAPEG00000013155	-	66	31.193	Amphiprion_percula
ENSLACG00000010900	-	83	35.160	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	79	35.160	Danio_rerio
ENSLACG00000010900	-	80	30.374	ENSFHEG00000006296	-	61	30.374	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000010900	-	82	30.769	ENSKMAG00000000253	-	64	30.769	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000010900	-	70	31.720	ENSMZEG00005024824	-	59	31.720	Maylandia_zebra
ENSLACG00000010900	-	66	33.523	ENSONIG00000021329	-	76	33.523	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000010900	-	74	33.168	ENSORLG00000020512	-	66	33.168	Oryzias_latipes
ENSLACG00000010900	-	88	31.250	ENSORLG00015021275	-	70	31.250	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000010900	-	69	33.155	ENSOMEG00000019152	-	70	33.155	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000010900	-	82	33.937	ENSPKIG00000001458	-	85	33.937	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000010900	-	84	31.169	ENSPKIG00000009100	-	68	31.169	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000010900	-	60	32.919	ENSPMGG00000001874	-	56	32.919	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000010900	-	82	33.945	ENSPFOG00000020584	-	80	33.945	Poecilia_formosa
ENSLACG00000010900	-	63	32.934	ENSPLAG00000016026	-	61	32.934	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000010900	-	75	31.527	ENSPMEG00000021431	-	69	31.527	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000010900	-	90	32.636	ENSPNYG00000003325	-	79	32.636	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000010900	-	90	33.333	ENSPNAG00000017685	-	72	33.333	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000010900	-	84	38.596	ENSSLDG00000008663	-	94	38.596	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000010900	-	82	31.364	ENSXMAG00000024802	-	66	31.364	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000010900	-	82	31.364	ENSXMAG00000021250	-	64	31.364	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000010900	-	82	31.364	ENSXMAG00000026781	-	60	31.364	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000010900	-	80	31.163	ENSXMAG00000029285	-	70	31.163	Xiphophorus_maculatus