EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000011150 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 825 bases
Position: chrJH127627.1:574030-574854
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000012656	Transposase_22	PF02994.14	1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000012750	-	825	-	ENSLACP00000012656	275 (aa)	-	H3ASN5

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000011150's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000011150's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000011150	-	77	32.243	ENSLACG00000006210	-	84	32.243
ENSLACG00000011150	-	89	31.496	ENSLACG00000005767	-	83	31.496
ENSLACG00000011150	-	88	69.919	ENSLACG00000016955	-	96	69.919
ENSLACG00000011150	-	83	33.193	ENSLACG00000014474	-	90	33.193
ENSLACG00000011150	-	88	32.411	ENSLACG00000016396	-	89	32.411
ENSLACG00000011150	-	81	32.889	ENSLACG00000011390	-	88	32.889
ENSLACG00000011150	-	82	46.222	ENSLACG00000017727	-	96	46.222
ENSLACG00000011150	-	89	31.496	ENSLACG00000022508	-	83	31.496
ENSLACG00000011150	-	80	44.344	ENSLACG00000000077	-	84	44.344
ENSLACG00000011150	-	83	32.520	ENSLACG00000006820	-	90	32.520
ENSLACG00000011150	-	75	32.075	ENSLACG00000017411	-	96	32.075
ENSLACG00000011150	-	89	31.955	ENSLACG00000014952	-	87	31.955
ENSLACG00000011150	-	81	73.874	ENSLACG00000010092	-	99	73.305
ENSLACG00000011150	-	75	33.816	ENSLACG00000014769	-	99	33.816
ENSLACG00000011150	-	85	75.107	ENSLACG00000008859	-	92	75.107
ENSLACG00000011150	-	81	40.179	ENSLACG00000010019	-	92	40.179
ENSLACG00000011150	-	76	33.333	ENSLACG00000013090	-	99	33.333
ENSLACG00000011150	-	83	34.348	ENSLACG00000000673	-	89	34.348
ENSLACG00000011150	-	89	31.102	ENSLACG00000010803	-	83	31.102
ENSLACG00000011150	-	82	38.326	ENSLACG00000010144	-	83	38.326
ENSLACG00000011150	-	79	45.161	ENSLACG00000000848	-	88	45.161
ENSLACG00000011150	-	77	36.967	ENSLACG00000005368	-	99	36.967
ENSLACG00000011150	-	89	31.496	ENSLACG00000008432	-	83	31.496
ENSLACG00000011150	-	74	38.916	ENSLACG00000010705	-	83	38.916
ENSLACG00000011150	-	71	64.948	ENSLACG00000004272	-	92	64.948
ENSLACG00000011150	-	77	33.333	ENSLACG00000010859	-	82	33.333
ENSLACG00000011150	-	74	34.804	ENSLACG00000001055	-	89	34.804
ENSLACG00000011150	-	72	33.649	ENSLACG00000012229	-	84	33.649
ENSLACG00000011150	-	59	36.196	ENSLACG00000000465	-	65	36.196
ENSLACG00000011150	-	89	30.709	ENSLACG00000014503	-	83	30.709
ENSLACG00000011150	-	85	32.618	ENSLACG00000001384	-	98	32.673
ENSLACG00000011150	-	89	36.364	ENSLACG00000001559	-	88	35.714
ENSLACG00000011150	-	61	40.120	ENSLACG00000007535	-	95	40.120
ENSLACG00000011150	-	77	32.864	ENSLACG00000005266	-	74	32.864
ENSLACG00000011150	-	79	37.615	ENSLACG00000009013	-	64	37.615
ENSLACG00000011150	-	59	31.953	ENSLACG00000002891	-	77	31.953
ENSLACG00000011150	-	82	35.043	ENSLACG00000001298	-	98	35.043
ENSLACG00000011150	-	97	58.123	ENSLACG00000007821	-	92	58.123
ENSLACG00000011150	-	79	33.333	ENSLACG00000010165	-	82	33.333
ENSLACG00000011150	-	90	56.977	ENSLACG00000006865	-	97	60.345
ENSLACG00000011150	-	74	31.863	ENSLACG00000013182	-	90	31.527
ENSLACG00000011150	-	84	56.846	ENSLACG00000002651	-	99	56.846
ENSLACG00000011150	-	67	38.342	ENSLACG00000010080	-	84	37.879
ENSLACG00000011150	-	83	35.965	ENSLACG00000009806	-	83	35.965
ENSLACG00000011150	-	82	34.483	ENSLACG00000006110	-	98	34.483
ENSLACG00000011150	-	71	73.469	ENSLACG00000002135	-	88	73.469
ENSLACG00000011150	-	89	73.684	ENSLACG00000010900	-	92	73.684
ENSLACG00000011150	-	84	46.121	ENSLACG00000011265	-	92	46.121
ENSLACG00000011150	-	79	34.562	ENSLACG00000000907	-	99	34.562
ENSLACG00000011150	-	60	34.857	ENSLACG00000000903	-	77	34.857
ENSLACG00000011150	-	58	37.107	ENSLACG00000008643	-	92	37.107
ENSLACG00000011150	-	81	34.513	ENSLACG00000014189	-	78	34.513
ENSLACG00000011150	-	79	42.661	ENSLACG00000005009	-	89	42.661
ENSLACG00000011150	-	89	71.311	ENSLACG00000006473	-	94	71.311
ENSLACG00000011150	-	76	35.160	ENSLACG00000001077	-	89	35.160
ENSLACG00000011150	-	79	45.370	ENSLACG00000002189	-	92	45.370
ENSLACG00000011150	-	81	33.482	ENSLACG00000004508	-	83	33.482
ENSLACG00000011150	-	100	70.979	ENSLACG00000002471	-	96	70.979
ENSLACG00000011150	-	67	35.450	ENSLACG00000007340	-	80	35.450
ENSLACG00000011150	-	57	39.623	ENSLACG00000007342	-	77	39.623
ENSLACG00000011150	-	63	44.828	ENSLACG00000018384	-	88	44.828
ENSLACG00000011150	-	77	81.517	ENSLACG00000003451	-	93	81.517
ENSLACG00000011150	-	89	33.466	ENSLACG00000003957	-	86	33.466
ENSLACG00000011150	-	75	61.951	ENSLACG00000016517	-	97	61.951
ENSLACG00000011150	-	96	65.217	ENSLACG00000014493	-	92	65.217
ENSLACG00000011150	-	84	39.394	ENSLACG00000010569	-	92	39.394
ENSLACG00000011150	-	80	31.330	ENSLACG00000000534	-	87	31.330
ENSLACG00000011150	-	65	36.216	ENSLACG00000001295	-	77	36.216
ENSLACG00000011150	-	73	30.392	ENSLACG00000013538	-	92	30.392
ENSLACG00000011150	-	83	30.472	ENSLACG00000006813	-	90	30.472
ENSLACG00000011150	-	82	44.690	ENSLACG00000011580	-	93	44.690
ENSLACG00000011150	-	79	34.862	ENSLACG00000013987	-	81	34.862
ENSLACG00000011150	-	99	70.213	ENSLACG00000010346	-	96	70.213
ENSLACG00000011150	-	79	35.371	ENSLACG00000003217	-	83	35.371
ENSLACG00000011150	-	80	34.389	ENSLACG00000012357	-	93	34.389
ENSLACG00000011150	-	74	38.835	ENSLACG00000012198	-	85	38.835
ENSLACG00000011150	-	77	32.710	ENSLACG00000000668	-	71	32.710
ENSLACG00000011150	-	83	35.242	ENSLACG00000000369	-	78	35.242
ENSLACG00000011150	-	80	32.287	ENSLACG00000013472	-	87	32.287
ENSLACG00000011150	-	67	34.555	ENSLACG00000002051	-	82	32.599
ENSLACG00000011150	-	79	35.586	ENSLACG00000000876	-	98	35.586
ENSLACG00000011150	-	57	35.802	ENSLACG00000000425	-	82	35.802
ENSLACG00000011150	-	76	35.814	ENSLACG00000013072	-	80	35.814
ENSLACG00000011150	-	88	34.156	ENSLACG00000002451	-	88	34.156
ENSLACG00000011150	-	60	36.585	ENSLACG00000010633	-	94	36.747
ENSLACG00000011150	-	77	35.135	ENSLACG00000011552	-	82	35.135
ENSLACG00000011150	-	83	43.612	ENSLACG00000003145	-	99	43.612
ENSLACG00000011150	-	83	36.797	ENSLACG00000000643	-	94	36.797
ENSLACG00000011150	-	74	32.195	ENSLACG00000022180	-	83	32.195
ENSLACG00000011150	-	81	32.661	ENSLACG00000012896	-	92	32.661
ENSLACG00000011150	-	89	31.641	ENSLACG00000005344	-	86	31.641
ENSLACG00000011150	-	73	35.000	ENSLACG00000014732	-	88	35.000
ENSLACG00000011150	-	82	44.444	ENSLACG00000009393	-	96	44.444

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000011150	-	68	34.392	ENSACIG00000013512	-	58	34.392	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000011150	-	92	30.196	ENSACIG00000014541	-	77	30.196	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000011150	-	92	30.196	ENSACIG00000018891	-	75	30.196	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000011150	-	77	30.374	ENSAPEG00000002130	-	63	30.374	Amphiprion_percula
ENSLACG00000011150	-	72	30.151	ENSAPEG00000023573	-	66	30.151	Amphiprion_percula
ENSLACG00000011150	-	73	34.975	ENSAPEG00000022657	-	56	34.975	Amphiprion_percula
ENSLACG00000011150	-	77	32.243	ENSAPEG00000013155	-	64	32.243	Amphiprion_percula
ENSLACG00000011150	-	72	30.151	ENSAPEG00000008945	-	66	30.151	Amphiprion_percula
ENSLACG00000011150	-	86	36.694	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	89	36.694	Danio_rerio
ENSLACG00000011150	-	80	30.667	ENSFHEG00000006296	-	67	30.667	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000011150	-	80	32.751	ENSKMAG00000000861	-	85	32.751	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000011150	-	79	33.486	ENSLBEG00000017145	-	65	33.486	Labrus_bergylta
ENSLACG00000011150	-	67	34.054	ENSMZEG00005024824	-	58	34.054	Maylandia_zebra
ENSLACG00000011150	-	62	33.526	ENSONIG00000021329	-	75	33.526	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000011150	-	85	31.535	ENSONIG00000020618	-	96	31.535	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000011150	-	88	32.432	ENSORLG00000020512	-	85	32.432	Oryzias_latipes
ENSLACG00000011150	-	75	31.455	ENSOMEG00000019152	-	80	31.455	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000011150	-	77	38.679	ENSPKIG00000001458	-	84	38.679	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000011150	-	60	34.503	ENSPMGG00000001874	-	59	34.503	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000011150	-	74	33.171	ENSPFOG00000020665	-	73	33.171	Poecilia_formosa
ENSLACG00000011150	-	84	34.156	ENSPFOG00000020584	-	90	34.156	Poecilia_formosa
ENSLACG00000011150	-	86	32.489	ENSPFOG00000020560	-	88	32.489	Poecilia_formosa
ENSLACG00000011150	-	64	32.768	ENSPLAG00000016026	-	65	32.768	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000011150	-	74	31.707	ENSPMEG00000014224	-	69	31.707	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000011150	-	87	30.502	ENSPMEG00000022872	-	80	30.502	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000011150	-	82	31.197	ENSPMEG00000021431	-	78	31.197	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000011150	-	80	37.727	ENSPNYG00000003325	-	72	37.727	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000011150	-	81	33.784	ENSPNAG00000017685	-	66	33.784	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000011150	-	81	39.286	ENSSLDG00000008663	-	88	39.286	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000011150	-	87	30.833	ENSXMAG00000026781	-	66	30.833	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000011150	-	85	31.064	ENSXMAG00000021250	-	69	31.064	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000011150	-	85	31.064	ENSXMAG00000024802	-	71	31.064	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000011150	-	79	32.444	ENSXMAG00000029285	-	76	32.444	Xiphophorus_maculatus