EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000011247 (Gene tree)
Gene ID: 102358483
Gene Symbol: OVOL2
Alias: CHED|CHED1|HOVO2|ZNF339|bA504H3.3
Full Name: ovo like zinc finger 2
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27145 bases
Position: chrJH126704.1:584385-611529
Accession: 102358483
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000012769	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-20	1	4
ENSLACP00000012769	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-20	2	4
ENSLACP00000012769	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-20	3	4
ENSLACP00000012769	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-20	4	4
ENSLACP00000012769	zf-met	PF12874.7	5e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000012863	OVOL2-201	795	XM_005992919	ENSLACP00000012769	264 (aa)	XP_005992981	H3ASZ8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000011247's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000011247's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000011247	OVOL2	50	39.474	ENSLACG00000000891	ZNF319	65	39.474
ENSLACG00000011247	OVOL2	54	37.374	ENSLACG00000022211	-	68	37.374
ENSLACG00000011247	OVOL2	65	41.558	ENSLACG00000017381	-	68	41.558
ENSLACG00000011247	OVOL2	55	30.496	ENSLACG00000009187	PRDM5	62	31.496
ENSLACG00000011247	OVOL2	53	37.288	ENSLACG00000004191	-	69	33.333
ENSLACG00000011247	OVOL2	64	32.174	ENSLACG00000005413	snai2	58	32.174
ENSLACG00000011247	OVOL2	69	39.744	ENSLACG00000009642	-	98	39.744

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000011247	OVOL2	52	63.768	ENSAPOG00000006365	zgc:171929	63	63.768	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000011247	OVOL2	52	63.768	ENSAOCG00000010460	zgc:171929	57	63.768	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000011247	OVOL2	62	75.610	ENSAPLG00000016199	OVOL2	92	75.610	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000011247	OVOL2	96	66.275	ENSACAG00000014216	OVOL2	96	66.275	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000011247	OVOL2	73	57.843	ENSANAG00000026429	OVOL2	99	58.824	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.000	ENSCAFG00000005453	OVOL2	98	62.313	Canis_familiaris
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.000	ENSCAFG00020027506	OVOL2	98	62.313	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000011247	OVOL2	61	76.398	ENSTSYG00000012790	OVOL2	80	76.398	Carlito_syrichta
ENSLACG00000011247	OVOL2	61	75.000	ENSCAPG00000005775	OVOL2	95	75.000	Cavia_aperea
ENSLACG00000011247	OVOL2	97	63.603	ENSCPBG00000023454	OVOL2	99	63.603	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	59.073	ENSCANG00000033179	OVOL2	97	59.073	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000011247	OVOL2	91	43.320	ENSCVAG00000001397	zgc:171929	90	43.320	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000011247	OVOL2	97	63.197	ENSDORG00000016697	Ovol2	96	62.825	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	61.624	ENSEASG00005001990	OVOL2	95	63.774	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	61.624	ENSECAG00000007899	OVOL2	95	63.774	Equus_caballus
ENSLACG00000011247	OVOL2	66	52.023	ENSELUG00000020356	zgc:171929	57	52.023	Esox_lucius
ENSLACG00000011247	OVOL2	95	61.597	ENSFCAG00000027530	OVOL2	95	63.218	Felis_catus
ENSLACG00000011247	OVOL2	94	62.934	ENSFALG00000007594	OVOL2	95	62.934	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000011247	OVOL2	61	76.398	ENSFDAG00000008730	OVOL2	96	76.398	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000011247	OVOL2	94	64.257	ENSGALG00000008702	OVOL2	94	64.257	Gallus_gallus
ENSLACG00000011247	OVOL2	97	65.568	ENSGAGG00000020202	OVOL2	99	65.568	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.902	ENSHGLG00000016810	OVOL2	97	60.902	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000011247	OVOL2	52	60.145	ENSHCOG00000007100	zgc:171929	76	60.145	Hippocampus_comes
ENSLACG00000011247	OVOL2	99	60.294	ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	60.584	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000011247	OVOL2	95	60.687	ENSJJAG00000014942	Ovol2	97	60.148	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000011247	OVOL2	91	45.136	ENSLBEG00000006082	zgc:171929	90	45.136	Labrus_bergylta
ENSLACG00000011247	OVOL2	91	45.000	ENSMAMG00000021196	zgc:171929	88	45.000	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000011247	OVOL2	58	79.605	ENSMGAG00000006770	OVOL2	91	79.605	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.517	ENSMICG00000032455	OVOL2	97	62.362	Microcebus_murinus
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	62.692	ENSMODG00000005504	OVOL2	98	62.687	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.741	MGP_CAROLIEiJ_G0024381	Ovol2	97	60.370	Mus_caroli
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.370	ENSMUSG00000037279	Ovol2	97	61.852	Mus_musculus
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.370	MGP_PahariEiJ_G0025825	Ovol2	97	60.370	Mus_pahari
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.370	MGP_SPRETEiJ_G0025300	Ovol2	97	61.852	Mus_spretus
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.370	ENSNGAG00000007174	Ovol2	97	60.370	Nannospalax_galili
ENSLACG00000011247	OVOL2	95	65.399	ENSMEUG00000011922	OVOL2	94	65.399	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000011247	OVOL2	91	44.355	ENSONIG00000004778	zgc:171929	89	44.355	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000011247	OVOL2	63	74.545	ENSOANG00000001250	OVOL2	97	74.545	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000011247	OVOL2	69	73.913	ENSOCUG00000012116	OVOL2	72	73.913	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000011247	OVOL2	91	43.952	ENSORLG00015015191	zgc:171929	95	43.952	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	61.798	ENSOGAG00000030325	OVOL2	97	61.798	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	57.529	ENSPPAG00000032300	OVOL2	97	59.846	Pan_paniscus
ENSLACG00000011247	OVOL2	95	60.448	ENSPPRG00000006276	OVOL2	95	61.069	Panthera_pardus
ENSLACG00000011247	OVOL2	85	63.948	ENSPSIG00000006768	OVOL2	99	63.485	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000011247	OVOL2	52	64.493	ENSPMEG00000005347	zgc:171929	69	64.493	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000011247	OVOL2	98	60.148	ENSPCOG00000013518	OVOL2	97	61.993	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000011247	OVOL2	65	76.608	ENSPVAG00000001140	OVOL2	71	76.608	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000011247	OVOL2	95	62.271	ENSSHAG00000018466	OVOL2	95	62.868	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000011247	OVOL2	70	51.064	ENSSMAG00000003204	zgc:171929	80	51.064	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000011247	OVOL2	61	75.776	ENSSARG00000006563	OVOL2	95	75.776	Sorex_araneus
ENSLACG00000011247	OVOL2	63	78.182	ENSSPUG00000001720	OVOL2	84	78.182	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000011247	OVOL2	60	56.962	ENSSPAG00000001700	zgc:171929	86	49.215	Stegastes_partitus
ENSLACG00000011247	OVOL2	94	66.265	ENSTGUG00000005909	OVOL2	94	66.265	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000011247	OVOL2	61	77.019	ENSVVUG00000013094	OVOL2	56	77.019	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000011247	OVOL2	95	49.814	ENSXETG00000020587	ovol1	97	49.814	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000011247	OVOL2	95	63.736	ENSXETG00000024897	ovol2	95	63.736	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000011247	OVOL2	52	64.493	ENSXMAG00000022405	zgc:171929	66	64.493	Xiphophorus_maculatus