EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000011495 (Gene tree)
Gene ID: 102349769
Gene Symbol: PRPF38A
Alias: FLJ14936|Prp38
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19163 bases
Position: chrJH127841.1:607292-626454
Accession: 102349769
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000013048	PRP38	PF03371.15	1.4e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000013144	PRPF38A-201	4741	XM_006005976	ENSLACP00000013048	312 (aa)	XP_006006039	H3ATS7

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000011495's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000011495's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSG00000134748	PRPF38A	100	92.308	Homo_sapiens
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	88.688	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	82.428	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	100	92.308	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000011495	PRPF38A	72	87.168	ENSACIG00000012292	prpf38a	74	87.168	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	88.688	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	82.428	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	88.688	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	82.428	Amphiprion_percula
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.783	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	81.470	Anabas_testudineus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	79	92.713	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	92.713	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.949	ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	92.949	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	61.392	ENSANAG00000029204	-	100	56.329	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSANAG00000027839	PRPF38A	100	92.308	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	81.470	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	83.387	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	83.387	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	100	92.308	Bos_taurus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	63	62.051	WBGene00008380	prp-38	69	58.559	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	100	92.308	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	100	92.308	Canis_familiaris
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	100	92.308	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	100	92.308	Capra_hircus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	86	90.335	ENSTSYG00000031994	-	95	90.335	Carlito_syrichta
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSTSYG00000009868	-	100	92.308	Carlito_syrichta
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	100	92.308	Cavia_porcellus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	91.346	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	100	91.346	Cebus_capucinus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	60.897	ENSCATG00000044190	-	65	59.903	Cercocebus_atys
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCATG00000032296	PRPF38A	100	92.308	Cercocebus_atys
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	100	92.308	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000011495	PRPF38A	78	94.792	ENSCHOG00000008388	PRPF38A	77	94.792	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	93.269	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	100	93.269	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	74	68.534	ENSCSAVG00000009580	-	71	70.046	Ciona_savignyi
ENSLACG00000011495	PRPF38A	74	90.043	ENSCANG00000032608	PRPF38A	75	90.667	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	74	76.623	ENSCGRG00001002557	-	76	77.679	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCGRG00001018502	-	100	92.308	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	100	92.308	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	86.425	ENSCSEG00000001269	prpf38a	77	86.222	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	88.688	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	81.789	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	82.428	ENSDARG00000039213	prpf38a	100	82.428	Danio_rerio
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	100	92.308	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	84	77.186	ENSDORG00000025371	-	77	81.250	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	80.128	ENSDORG00000023857	-	100	96.875	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	84	77.186	ENSDORG00000023691	-	77	81.250	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	63	72.081	FBgn0050342	Prp38	57	73.404	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000011495	PRPF38A	76	81.092	ENSEBUG00000012588	prpf38a	73	81.498	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSEASG00005014427	PRPF38A	100	92.308	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSECAG00000022628	PRPF38A	100	92.308	Equus_caballus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	86.425	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	80.831	Esox_lucius
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	100	92.308	Felis_catus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	87	92.620	ENSFALG00000005598	-	100	92.620	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	99	80.064	ENSFALG00000003612	-	75	84.889	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	91.987	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	100	91.987	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	84	77.652	ENSFHEG00000014317	prpf38a	76	87.556	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	53	93.373	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	93.373	Gadus_morhua
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	93.590	ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	93.590	Gallus_gallus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	89.593	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	82.428	Gambusia_affinis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	86.099	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	80.317	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.949	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	100	92.949	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	100	92.308	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000011495	PRPF38A	61	90.476	ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	76.923	ENSHGLG00000007918	-	100	75.641	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	100	92.308	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	100	92.308	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	76.923	ENSHGLG00100003928	-	100	75.641	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000011495	PRPF38A	87	69.373	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.426	Hippocampus_comes
ENSLACG00000011495	PRPF38A	74	86.207	ENSIPUG00000005757	prpf38a	73	85.841	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	100	92.308	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	100	92.308	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	89.140	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	82.109	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	80.201	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	80.511	Labrus_bergylta
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	80.192	ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	100	92.308	Loxodonta_africana
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	100	92.308	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	87	91.144	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	98	90.809	Macaca_mulatta
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	60.897	ENSMNEG00000040242	-	67	59.155	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	100	92.308	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	100	92.308	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	88.688	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	82.428	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	81.470	Maylandia_zebra
ENSLACG00000011495	PRPF38A	74	91.342	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	75	92.000	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000011495	PRPF38A	85	86.364	ENSMAUG00000018029	-	85	85.778	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSMICG00000014193	PRPF38A	100	92.308	Microcebus_murinus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	100	92.308	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000011495	PRPF38A	83	81.395	ENSMMOG00000016972	prpf38a	79	87.556	Mola_mola
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	90.415	ENSMODG00000000644	PRPF38A	100	90.735	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.783	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.789	Monopterus_albus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	91.987	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	100	91.987	Mus_caroli
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	91.987	ENSMUSG00000063800	Prpf38a	100	91.987	Mus_musculus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	91.987	MGP_PahariEiJ_G0028602	Prpf38a	100	91.987	Mus_pahari
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	91.667	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	100	91.667	Mus_spretus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	100	92.308	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	100	92.308	Nannospalax_galili
ENSLACG00000011495	PRPF38A	72	85.841	ENSNBRG00000004013	prpf38a	73	85.841	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000011495	PRPF38A	93	91.696	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	91.696	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	62.179	ENSNLEG00000033398	-	94	62.179	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000011495	PRPF38A	97	66.556	ENSNLEG00000012592	-	99	66.556	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	89.423	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	100	89.423	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	73	90.351	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	94	90.667	Ochotona_princeps
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSODEG00000005869	PRPF38A	100	92.308	Octodon_degus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	86.425	ENSONIG00000007816	prpf38a	100	80.831	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	61.146	ENSOANG00000009541	-	100	61.146	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	100	92.308	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	82.333	ENSORLG00000013485	prpf38a	99	82.372	Oryzias_latipes
ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	82.333	ENSORLG00020002130	prpf38a	99	82.372	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	82.667	ENSORLG00015021393	prpf38a	99	82.692	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	81.879	ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.789	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSOGAG00000005423	PRPF38A	100	92.308	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSOARG00000005373	PRPF38A	100	92.308	Ovis_aries
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPPAG00000030905	PRPF38A	100	92.308	Pan_paniscus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	72.436	ENSPPAG00000033867	-	100	72.436	Pan_paniscus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPPRG00000013268	PRPF38A	100	92.308	Panthera_pardus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPTIG00000015419	PRPF38A	100	92.308	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPTRG00000000739	PRPF38A	100	92.308	Pan_troglodytes
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPANG00000015483	PRPF38A	100	92.308	Papio_anubis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	79.808	ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	81.410	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.949	ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	92.949	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	81	81.890	ENSPMGG00000021352	prpf38a	77	88.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	85.397	ENSPEMG00000011212	-	100	84.444	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPEMG00000023277	-	100	92.308	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	90.096	ENSPCIG00000022369	-	100	90.415	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	83	80.695	ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	82.428	Poecilia_formosa
ENSLACG00000011495	PRPF38A	92	75.427	ENSPLAG00000010328	prpf38a	100	82.428	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000011495	PRPF38A	84	77.820	ENSPMEG00000011804	prpf38a	100	82.428	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000011495	PRPF38A	95	72.697	ENSPREG00000002835	prpf38a	58	92.021	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	84.227	ENSPPYG00000001348	PRPF38A	100	84.227	Pongo_abelii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.949	ENSPCAG00000013328	PRPF38A	100	92.949	Procavia_capensis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPCOG00000016387	-	100	92.308	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	70.833	ENSPCOG00000020709	-	74	75.336	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSPVAG00000009803	PRPF38A	100	92.308	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	ENSPNYG00000005571	prpf38a	100	81.470	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	82.748	ENSPNAG00000010399	prpf38a	100	82.748	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.628	ENSRNOG00000009451	Prpf38a	100	92.628	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSRBIG00000036442	PRPF38A	100	92.308	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSRROG00000032788	PRPF38A	100	92.308	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000011495	PRPF38A	98	73.203	ENSRROG00000040003	-	73	73.991	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	59.295	ENSRROG00000034606	-	100	56.410	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSSBOG00000019515	PRPF38A	100	92.308	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	87	88.930	ENSSHAG00000006906	-	100	89.299	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	67.881	ENSSHAG00000006029	-	74	77.376	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	80.831	ENSSFOG00015013572	prpf38a	100	81.789	Scleropages_formosus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	86.425	ENSSMAG00000015379	prpf38a	73	86.222	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	ENSSDUG00000001324	prpf38a	100	81.470	Seriola_dumerili
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	81.470	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	75.641	ENSSARG00000014458	PRPF38A	100	75.641	Sorex_araneus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.628	ENSSPUG00000013259	PRPF38A	100	92.628	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	71.493	ENSSPAG00000010449	prpf38a	70	71.681	Stegastes_partitus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSSSCG00000028288	PRPF38A	100	92.308	Sus_scrofa
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	89.744	ENSTGUG00000008995	PRPF38A	100	89.744	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	ENSTRUG00000003374	prpf38a	69	87.111	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	86.547	ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.635	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	91.667	ENSTBEG00000000725	PRPF38A	100	91.667	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSTTRG00000016139	PRPF38A	100	92.308	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSUAMG00000000625	PRPF38A	100	92.308	Ursus_americanus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSUMAG00000022674	PRPF38A	100	92.308	Ursus_maritimus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	74	89.610	ENSVPAG00000000907	PRPF38A	100	86.538	Vicugna_pacos
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	92.308	ENSVVUG00000004475	PRPF38A	100	92.308	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	83.387	ENSXETG00000008060	prpf38a	100	85.623	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000011495	PRPF38A	72	87.281	ENSXCOG00000007393	prpf38a	75	87.281	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	89.593	ENSXMAG00000026143	prpf38a	100	82.428	Xiphophorus_maculatus