EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000011580 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 714 bases
Position: chrJH126826.1:615924-616637
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000013149	Transposase_22	PF02994.14	1.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000013245	-	714	-	ENSLACP00000013149	237 (aa)	-	H3AU28

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000011580's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000011580's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000011580	-	88	34.272	ENSLACG00000002451	-	77	34.272
ENSLACG00000011580	-	84	37.879	ENSLACG00000010165	-	74	37.879
ENSLACG00000011580	-	90	40.845	ENSLACG00000000876	-	89	40.845
ENSLACG00000011580	-	95	88.889	ENSLACG00000017727	-	99	88.889
ENSLACG00000011580	-	76	40.110	ENSLACG00000010080	-	76	40.110
ENSLACG00000011580	-	82	39.594	ENSLACG00000001298	-	83	39.594
ENSLACG00000011580	-	63	38.889	ENSLACG00000001295	-	64	38.889
ENSLACG00000011580	-	89	31.797	ENSLACG00000017411	-	97	31.797
ENSLACG00000011580	-	92	39.381	ENSLACG00000014493	-	75	39.381
ENSLACG00000011580	-	91	37.555	ENSLACG00000005344	-	82	37.555
ENSLACG00000011580	-	94	43.290	ENSLACG00000010900	-	87	43.290
ENSLACG00000011580	-	90	40.553	ENSLACG00000006110	-	95	40.553
ENSLACG00000011580	-	82	43.204	ENSLACG00000016955	-	80	43.204
ENSLACG00000011580	-	64	37.736	ENSLACG00000008643	-	87	37.736
ENSLACG00000011580	-	88	77.033	ENSLACG00000002189	-	90	77.033
ENSLACG00000011580	-	89	42.791	ENSLACG00000007821	-	72	42.791
ENSLACG00000011580	-	96	77.533	ENSLACG00000011265	-	92	77.533
ENSLACG00000011580	-	91	36.709	ENSLACG00000010859	-	87	36.709
ENSLACG00000011580	-	81	36.041	ENSLACG00000009013	-	60	36.041
ENSLACG00000011580	-	89	33.761	ENSLACG00000002051	-	76	34.434
ENSLACG00000011580	-	81	41.709	ENSLACG00000016517	-	93	41.709
ENSLACG00000011580	-	94	39.823	ENSLACG00000012229	-	89	39.823
ENSLACG00000011580	-	94	44.105	ENSLACG00000002471	-	77	44.105
ENSLACG00000011580	-	94	38.261	ENSLACG00000010144	-	84	38.261
ENSLACG00000011580	-	95	72.566	ENSLACG00000005009	-	91	72.566
ENSLACG00000011580	-	91	39.394	ENSLACG00000013987	-	85	39.394
ENSLACG00000011580	-	73	30.168	ENSLACG00000000425	-	86	30.168
ENSLACG00000011580	-	89	36.111	ENSLACG00000000673	-	83	36.111
ENSLACG00000011580	-	91	81.860	ENSLACG00000000077	-	83	81.860
ENSLACG00000011580	-	70	43.114	ENSLACG00000007535	-	96	43.114
ENSLACG00000011580	-	87	40.807	ENSLACG00000006820	-	81	40.807
ENSLACG00000011580	-	79	32.984	ENSLACG00000013090	-	90	32.984
ENSLACG00000011580	-	85	37.561	ENSLACG00000001384	-	100	37.561
ENSLACG00000011580	-	81	42.132	ENSLACG00000010705	-	81	42.132
ENSLACG00000011580	-	89	35.586	ENSLACG00000014474	-	81	35.586
ENSLACG00000011580	-	91	42.342	ENSLACG00000010092	-	97	41.558
ENSLACG00000011580	-	91	37.931	ENSLACG00000014952	-	77	37.931
ENSLACG00000011580	-	88	35.211	ENSLACG00000000369	-	75	35.211
ENSLACG00000011580	-	89	36.111	ENSLACG00000000643	-	88	36.111
ENSLACG00000011580	-	77	31.915	ENSLACG00000022180	-	77	31.915
ENSLACG00000011580	-	86	32.692	ENSLACG00000013182	-	93	32.692
ENSLACG00000011580	-	91	67.593	ENSLACG00000010019	-	90	67.593
ENSLACG00000011580	-	84	41.176	ENSLACG00000008859	-	81	41.176
ENSLACG00000011580	-	69	37.576	ENSLACG00000000907	-	78	37.576
ENSLACG00000011580	-	68	36.000	ENSLACG00000000903	-	77	36.000
ENSLACG00000011580	-	94	37.083	ENSLACG00000013472	-	93	37.083
ENSLACG00000011580	-	80	44.041	ENSLACG00000002135	-	99	41.071
ENSLACG00000011580	-	82	39.899	ENSLACG00000003451	-	87	39.899
ENSLACG00000011580	-	93	44.690	ENSLACG00000011150	-	82	44.690
ENSLACG00000011580	-	90	35.833	ENSLACG00000000534	-	88	35.833
ENSLACG00000011580	-	92	37.445	ENSLACG00000014189	-	79	37.445
ENSLACG00000011580	-	81	30.653	ENSLACG00000013538	-	93	30.653
ENSLACG00000011580	-	90	35.242	ENSLACG00000011390	-	88	35.242
ENSLACG00000011580	-	84	40.196	ENSLACG00000002651	-	84	40.196
ENSLACG00000011580	-	83	30.841	ENSLACG00000012896	-	79	30.841
ENSLACG00000011580	-	70	70.303	ENSLACG00000018384	-	85	70.303
ENSLACG00000011580	-	81	41.117	ENSLACG00000004272	-	92	41.117
ENSLACG00000011580	-	90	39.631	ENSLACG00000003217	-	77	39.631
ENSLACG00000011580	-	86	42.254	ENSLACG00000013072	-	83	42.254
ENSLACG00000011580	-	96	75.771	ENSLACG00000009393	-	99	75.771
ENSLACG00000011580	-	89	73.934	ENSLACG00000000848	-	88	73.934
ENSLACG00000011580	-	79	34.673	ENSLACG00000014769	-	96	35.176
ENSLACG00000011580	-	90	39.631	ENSLACG00000006210	-	83	39.631
ENSLACG00000011580	-	94	44.589	ENSLACG00000010346	-	78	44.589
ENSLACG00000011580	-	89	37.674	ENSLACG00000005266	-	75	37.674
ENSLACG00000011580	-	91	38.528	ENSLACG00000000668	-	76	38.528
ENSLACG00000011580	-	91	38.819	ENSLACG00000011552	-	88	38.819
ENSLACG00000011580	-	94	36.555	ENSLACG00000001077	-	96	36.555
ENSLACG00000011580	-	90	36.073	ENSLACG00000006813	-	85	36.073
ENSLACG00000011580	-	80	36.816	ENSLACG00000014732	-	89	37.313
ENSLACG00000011580	-	88	41.509	ENSLACG00000012198	-	89	41.509
ENSLACG00000011580	-	90	38.249	ENSLACG00000007340	-	89	38.249
ENSLACG00000011580	-	70	43.529	ENSLACG00000007342	-	82	43.529
ENSLACG00000011580	-	93	67.273	ENSLACG00000010569	-	90	67.273
ENSLACG00000011580	-	81	37.436	ENSLACG00000005368	-	92	37.436
ENSLACG00000011580	-	71	39.884	ENSLACG00000000465	-	69	39.884
ENSLACG00000011580	-	90	41.475	ENSLACG00000001559	-	72	41.475
ENSLACG00000011580	-	92	40.517	ENSLACG00000003957	-	80	40.517
ENSLACG00000011580	-	88	40.566	ENSLACG00000006865	-	87	40.580
ENSLACG00000011580	-	94	42.609	ENSLACG00000006473	-	89	42.609
ENSLACG00000011580	-	78	37.563	ENSLACG00000012357	-	83	38.071
ENSLACG00000011580	-	67	37.870	ENSLACG00000002891	-	77	37.870
ENSLACG00000011580	-	93	76.923	ENSLACG00000003145	-	99	76.923
ENSLACG00000011580	-	91	41.553	ENSLACG00000004508	-	79	41.553
ENSLACG00000011580	-	66	39.375	ENSLACG00000010633	-	97	38.596
ENSLACG00000011580	-	94	37.395	ENSLACG00000016396	-	83	37.395
ENSLACG00000011580	-	79	39.691	ENSLACG00000001055	-	85	39.691
ENSLACG00000011580	-	89	37.383	ENSLACG00000009806	-	78	37.383